MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_016818	CGCCAC	2	12	739527	739538	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	383188628
15002	NC_016818	CGC	2	6	739550	739555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188628
15003	NC_016818	CAG	2	6	739605	739610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188628
15004	NC_016818	TCT	2	6	739619	739624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188628
15005	NC_016818	TTC	2	6	739674	739679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188628
15006	NC_016818	ACGCCG	2	12	739753	739764	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383188628
15007	NC_016818	GCC	2	6	739797	739802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188628
15008	NC_016818	TGGT	2	8	739810	739817	0 %	50 %	50 %	0 %	383188628
15009	NC_016818	GAT	2	6	739863	739868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188628
15010	NC_016818	TGC	2	6	739870	739875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188628
15011	NC_016818	CTG	2	6	739945	739950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188628
15012	NC_016818	CTG	2	6	740010	740015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188628
15013	NC_016818	GCG	2	6	740029	740034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188628
15014	NC_016818	CGG	2	6	740118	740123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188628
15015	NC_016818	CGC	2	6	740136	740141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188628
15016	NC_016818	GCTCAG	2	12	740166	740177	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383188628
15017	NC_016818	CAG	2	6	740181	740186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188628
15018	NC_016818	ACA	2	6	740264	740269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15019	NC_016818	ATTC	2	8	740384	740391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15020	NC_016818	ATT	2	6	740412	740417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_016818	GTTT	2	8	740431	740438	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_016818	AAC	2	6	740499	740504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188629
15023	NC_016818	GCT	2	6	740537	740542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188629
15024	NC_016818	TCC	2	6	740556	740561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188629
15025	NC_016818	GCGG	2	8	740563	740570	0 %	0 %	75 %	25 %	383188629
15026	NC_016818	AAC	2	6	740616	740621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188629
15027	NC_016818	CAGA	2	8	740623	740630	50 %	0 %	25 %	25 %	383188629
15028	NC_016818	AGC	2	6	740670	740675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
15029	NC_016818	CGA	2	6	740677	740682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
15030	NC_016818	GCC	2	6	740699	740704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188629
15031	NC_016818	GAC	2	6	740708	740713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
15032	NC_016818	CCG	2	6	740749	740754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188629
15033	NC_016818	CGA	2	6	740776	740781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
15034	NC_016818	TTG	2	6	740814	740819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188629
15035	NC_016818	TGG	2	6	740835	740840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188629
15036	NC_016818	TTC	2	6	740845	740850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188629
15037	NC_016818	TGC	2	6	740880	740885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188629
15038	NC_016818	CAGTT	2	10	740969	740978	20 %	40 %	20 %	20 %	383188629
15039	NC_016818	TGCG	2	8	740982	740989	0 %	25 %	50 %	25 %	383188629
15040	NC_016818	AAC	2	6	741006	741011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188629
15041	NC_016818	AGCAG	2	10	741061	741070	40 %	0 %	40 %	20 %	383188629
15042	NC_016818	CAA	2	6	741077	741082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188629
15043	NC_016818	GCCGG	2	10	741137	741146	0 %	0 %	60 %	40 %	383188629
15044	NC_016818	GCA	2	6	741187	741192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
15045	NC_016818	TG	3	6	741269	741274	0 %	50 %	50 %	0 %	383188629
15046	NC_016818	GAA	2	6	741308	741313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188629
15047	NC_016818	CTG	2	6	741323	741328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188629
15048	NC_016818	GCA	2	6	741340	741345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
15049	NC_016818	A	6	6	741350	741355	100 %	0 %	0 %	0 %	383188629
15050	NC_016818	GGC	2	6	741398	741403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188629
15051	NC_016818	GAA	2	6	741404	741409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188629
15052	NC_016818	GGC	2	6	741424	741429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188629
15053	NC_016818	GGT	2	6	741445	741450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188629
15054	NC_016818	GCT	2	6	741464	741469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188629
15055	NC_016818	GCC	2	6	741549	741554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188629
15056	NC_016818	AAC	2	6	741560	741565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188629
15057	NC_016818	CAG	2	6	741596	741601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
15058	NC_016818	CAGC	2	8	741643	741650	25 %	0 %	25 %	50 %	383188629
15059	NC_016818	CAG	2	6	741719	741724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
15060	NC_016818	GGT	2	6	741802	741807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188629
15061	NC_016818	TCA	2	6	741814	741819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188629
15062	NC_016818	CAT	2	6	741839	741844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188629
15063	NC_016818	GACT	2	8	741916	741923	25 %	25 %	25 %	25 %	383188630
15064	NC_016818	ATC	2	6	741957	741962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188630
15065	NC_016818	GCT	2	6	741972	741977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188630
15066	NC_016818	TGA	2	6	741994	741999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188630
15067	NC_016818	TGC	2	6	742030	742035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188630
15068	NC_016818	CTT	2	6	742052	742057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188630
15069	NC_016818	GAA	2	6	742142	742147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188630
15070	NC_016818	GCT	2	6	742160	742165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188630
15071	NC_016818	AC	3	6	742229	742234	50 %	0 %	0 %	50 %	383188630
15072	NC_016818	CAT	2	6	742238	742243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188630
15073	NC_016818	AATA	2	8	742272	742279	75 %	25 %	0 %	0 %	383188630
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15078	NC_016818	ATCT	2	8	742494	742501	25 %	50 %	0 %	25 %	383188630
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15088	NC_016818	CTG	2	6	742903	742908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188631
15089	NC_016818	GTC	2	6	742958	742963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188631
15090	NC_016818	TGC	2	6	742964	742969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188631
15091	NC_016818	CTG	2	6	743062	743067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188631
15092	NC_016818	TCA	2	6	743150	743155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188631
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15098	NC_016818	GCT	2	6	743505	743510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188631
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15101	NC_016818	GGGC	2	8	743732	743739	0 %	0 %	75 %	25 %	383188631
15102	NC_016818	CGCTGG	2	12	743750	743761	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383188631
15103	NC_016818	AGA	2	6	743805	743810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188631
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15108	NC_016818	GTG	2	6	743974	743979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188631
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15114	NC_016818	TGT	2	6	744292	744297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188632
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15119	NC_016818	TGG	2	6	744558	744563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188632
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15238	NC_016818	CAA	2	6	750011	750016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188640
15239	NC_016818	ATAA	2	8	750060	750067	75 %	25 %	0 %	0 %	383188640
15240	NC_016818	CAAC	2	8	750180	750187	50 %	0 %	0 %	50 %	383188640
15241	NC_016818	TTC	2	6	750203	750208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188640
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15247	NC_016818	ATC	2	6	750492	750497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188640
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15252	NC_016818	CGA	2	6	750592	750597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188640
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15280	NC_016818	ATCAC	2	10	752028	752037	40 %	20 %	0 %	40 %	383188642
15281	NC_016818	CCAG	2	8	752046	752053	25 %	0 %	25 %	50 %	383188642
15282	NC_016818	GGC	2	6	752084	752089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188642
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15324	NC_016818	T	7	7	754430	754436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15325	NC_016818	AAG	2	6	754463	754468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15326	NC_016818	A	6	6	754554	754559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15327	NC_016818	GT	3	6	754562	754567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15331	NC_016818	ATC	2	6	754662	754667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15333	NC_016818	T	8	8	754746	754753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15334	NC_016818	CAT	2	6	754767	754772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15337	NC_016818	CACT	2	8	754955	754962	25 %	25 %	0 %	50 %	383188643
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15341	NC_016818	TGT	2	6	755055	755060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188643
15342	NC_016818	TGA	2	6	755208	755213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188643
15343	NC_016818	TGT	2	6	755214	755219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188643
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15345	NC_016818	TCA	2	6	755550	755555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15347	NC_016818	A	6	6	755701	755706	100 %	0 %	0 %	0 %	383188644
15348	NC_016818	TTA	2	6	755746	755751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188644
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15351	NC_016818	TGC	2	6	756054	756059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188644
15352	NC_016818	TAA	2	6	756105	756110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188644
15353	NC_016818	CAG	2	6	756137	756142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188644
15354	NC_016818	CAAA	2	8	756222	756229	75 %	0 %	0 %	25 %	383188644
15355	NC_016818	CATT	2	8	756263	756270	25 %	50 %	0 %	25 %	383188644
15356	NC_016818	GGT	2	6	756280	756285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188644
15357	NC_016818	TAAA	2	8	756309	756316	75 %	25 %	0 %	0 %	383188644
15358	NC_016818	ATT	2	6	756396	756401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188645
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15360	NC_016818	AAC	3	9	756455	756463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188645
15361	NC_016818	AAC	2	6	756471	756476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188645
15362	NC_016818	ATA	2	6	756488	756493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188645
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15364	NC_016818	TCA	2	6	756611	756616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188645
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15367	NC_016818	GCTG	2	8	756730	756737	0 %	25 %	50 %	25 %	383188645
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15380	NC_016818	TAAAGT	2	12	757284	757295	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383188645
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15391	NC_016818	ATT	2	6	757964	757969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188645
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15393	NC_016818	TAC	2	6	758142	758147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188645
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15399	NC_016818	GCA	2	6	758504	758509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188645
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15403	NC_016818	GCG	2	6	758794	758799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188645
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15427	NC_016818	ATG	2	6	759881	759886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188647
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15449	NC_016818	GCAGGT	2	12	761105	761116	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383188649
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15455	NC_016818	GCCA	2	8	761505	761512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15456	NC_016818	ACGC	2	8	761560	761567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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15463	NC_016818	TGT	2	6	761839	761844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188650
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15466	NC_016818	CAT	2	6	761938	761943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188650
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15476	NC_016818	AATAC	2	10	762257	762266	60 %	20 %	0 %	20 %	383188650
15477	NC_016818	ATA	2	6	762284	762289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188650
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15479	NC_016818	TC	3	6	762346	762351	0 %	50 %	0 %	50 %	383188650
15480	NC_016818	ACG	2	6	762371	762376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188650
15481	NC_016818	ACG	3	9	762455	762463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188650
15482	NC_016818	AGC	2	6	762538	762543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188650
15483	NC_016818	AAT	2	6	762566	762571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188650
15484	NC_016818	ATGG	2	8	762587	762594	25 %	25 %	50 %	0 %	383188650
15485	NC_016818	TTA	2	6	762674	762679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188650
15486	NC_016818	GGT	2	6	762686	762691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188650
15487	NC_016818	CTA	2	6	762723	762728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188650
15488	NC_016818	ATG	2	6	762731	762736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188650
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15490	NC_016818	TGAC	2	8	762783	762790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15491	NC_016818	T	6	6	762854	762859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15492	NC_016818	GTTT	2	8	762873	762880	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15495	NC_016818	TATC	2	8	762900	762907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15496	NC_016818	ATGA	2	8	762948	762955	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15497	NC_016818	ATT	2	6	762995	763000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15498	NC_016818	TA	3	6	763020	763025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15499	NC_016818	TAT	2	6	763044	763049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188651
15500	NC_016818	GCAATT	2	12	763050	763061	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383188651

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