MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016818	TGT	2	6	665319	665324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_016818	AAC	2	6	665325	665330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_016818	GTT	2	6	665341	665346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_016818	AAG	2	6	665356	665361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_016818	GAA	2	6	665367	665372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_016818	T	6	6	665373	665378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_016818	AAT	2	6	665384	665389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_016818	AATTA	2	10	665391	665400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_016818	ATTA	2	8	665409	665416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_016818	ATA	2	6	665417	665422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_016818	A	6	6	665456	665461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_016818	A	6	6	665488	665493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_016818	AG	3	6	665517	665522	50 %	0 %	50 %	0 %	383188567
13514	NC_016818	TTG	2	6	665545	665550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188567
13515	NC_016818	GGCA	2	8	665627	665634	25 %	0 %	50 %	25 %	383188567
13516	NC_016818	ATA	2	6	665669	665674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188567
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13518	NC_016818	ATT	2	6	665727	665732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188567
13519	NC_016818	TTG	2	6	665742	665747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188567
13520	NC_016818	A	6	6	665856	665861	100 %	0 %	0 %	0 %	383188567
13521	NC_016818	C	6	6	665898	665903	0 %	0 %	0 %	100 %	383188567
13522	NC_016818	ACC	2	6	666052	666057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188567
13523	NC_016818	ATT	2	6	666074	666079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188567
13524	NC_016818	TTG	2	6	666113	666118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188567
13525	NC_016818	TTA	2	6	666129	666134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188567
13526	NC_016818	CTT	2	6	666168	666173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13527	NC_016818	GAC	2	6	666186	666191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13528	NC_016818	TAA	2	6	666236	666241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_016818	A	6	6	666288	666293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_016818	GCT	2	6	666462	666467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188568
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13532	NC_016818	TGC	2	6	666662	666667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188568
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13534	NC_016818	GTAA	2	8	666726	666733	50 %	25 %	25 %	0 %	383188568
13535	NC_016818	T	6	6	666745	666750	0 %	100 %	0 %	0 %	383188568
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13539	NC_016818	TGT	2	6	667073	667078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_016818	TAT	2	6	667100	667105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_016818	ATT	2	6	667184	667189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_016818	CAAT	2	8	667230	667237	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13543	NC_016818	TTA	2	6	667254	667259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_016818	AT	3	6	667285	667290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_016818	TA	3	6	667324	667329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_016818	AATA	2	8	667347	667354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_016818	TTA	3	9	667394	667402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_016818	T	6	6	667423	667428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_016818	TTGT	2	8	667443	667450	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_016818	G	6	6	667532	667537	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_016818	ATGA	2	8	667543	667550	50 %	25 %	25 %	0 %	383188569
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13554	NC_016818	A	6	6	667710	667715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_016818	A	7	7	667748	667754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_016818	G	6	6	667778	667783	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_016818	GCATTA	2	12	667817	667828	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13558	NC_016818	G	6	6	667831	667836	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_016818	CCT	2	6	667843	667848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13560	NC_016818	GCA	2	6	667849	667854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13561	NC_016818	GCG	2	6	667858	667863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13562	NC_016818	A	7	7	667905	667911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_016818	TGG	2	6	667950	667955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_016818	TGT	2	6	668110	668115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_016818	T	7	7	668126	668132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_016818	AG	3	6	668160	668165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_016818	AAT	2	6	668166	668171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188570
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13574	NC_016818	GGC	2	6	668431	668436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188570
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13607	NC_016818	ATAC	2	8	670279	670286	50 %	25 %	0 %	25 %	383188571
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13625	NC_016818	GGCT	2	8	671016	671023	0 %	25 %	50 %	25 %	383188572
13626	NC_016818	TCC	2	6	671039	671044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188572
13627	NC_016818	CTG	2	6	671398	671403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188572
13628	NC_016818	GCT	2	6	671488	671493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188572
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13634	NC_016818	CGT	2	6	671712	671717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188572
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13655	NC_016818	TGT	2	6	673028	673033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13656	NC_016818	CGCT	2	8	673143	673150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13657	NC_016818	GCG	2	6	673161	673166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13658	NC_016818	TA	3	6	673169	673174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13659	NC_016818	CAAT	2	8	673176	673183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13660	NC_016818	GCA	2	6	673236	673241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13661	NC_016818	TG	3	6	673254	673259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13662	NC_016818	GC	3	6	673267	673272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13663	NC_016818	ATG	2	6	673292	673297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13664	NC_016818	TGCA	2	8	673410	673417	25 %	25 %	25 %	25 %	383188574
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13852	NC_016818	GCA	2	6	682731	682736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188581
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13860	NC_016818	TGGCT	2	10	683155	683164	0 %	40 %	40 %	20 %	383188581
13861	NC_016818	GATTT	2	10	683224	683233	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13862	NC_016818	GTC	2	6	683296	683301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188582
13863	NC_016818	CCGGTG	2	12	683362	683373	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383188582
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13986	NC_016818	GTC	2	6	689507	689512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188587
13987	NC_016818	TGA	2	6	689547	689552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188587
13988	NC_016818	CCG	2	6	689557	689562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188587
13989	NC_016818	CATA	2	8	689635	689642	50 %	25 %	0 %	25 %	383188587
13990	NC_016818	TGC	2	6	689737	689742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188588
13991	NC_016818	GTTT	2	8	689787	689794	0 %	75 %	25 %	0 %	383188588
13992	NC_016818	CGG	2	6	689839	689844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188588
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13994	NC_016818	TCA	2	6	690001	690006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188588
13995	NC_016818	CAT	2	6	690014	690019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188588
13996	NC_016818	TGC	2	6	690046	690051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188588
13997	NC_016818	GCT	2	6	690056	690061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188588
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13999	NC_016818	AC	3	6	690204	690209	50 %	0 %	0 %	50 %	383188588
14000	NC_016818	CAGC	3	12	690288	690299	25 %	0 %	25 %	50 %	383188588

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