MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016818	GC	3	6	638835	638840	0 %	0 %	50 %	50 %	383188544
13002	NC_016818	AGCC	2	8	638845	638852	25 %	0 %	25 %	50 %	383188544
13003	NC_016818	AGG	2	6	638893	638898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188544
13004	NC_016818	TGC	2	6	638929	638934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188544
13005	NC_016818	CCAT	2	8	639044	639051	25 %	25 %	0 %	50 %	383188544
13006	NC_016818	CCA	2	6	639106	639111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188544
13007	NC_016818	GAA	2	6	639187	639192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188544
13008	NC_016818	ATC	2	6	639232	639237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188544
13009	NC_016818	GGC	2	6	639250	639255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188544
13010	NC_016818	CAG	2	6	639259	639264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188544
13011	NC_016818	GCA	2	6	639270	639275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188544
13012	NC_016818	CCACAG	2	12	639280	639291	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383188544
13013	NC_016818	ACAA	2	8	639317	639324	75 %	0 %	0 %	25 %	383188544
13014	NC_016818	CCG	3	9	639362	639370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188544
13015	NC_016818	CGA	2	6	639440	639445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188544
13016	NC_016818	CAG	2	6	639450	639455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188544
13017	NC_016818	TAA	2	6	639457	639462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188544
13018	NC_016818	AC	3	6	639474	639479	50 %	0 %	0 %	50 %	383188544
13019	NC_016818	TCA	2	6	639480	639485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188544
13020	NC_016818	GCA	2	6	639508	639513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_016818	ATT	2	6	639520	639525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188545
13022	NC_016818	T	7	7	639531	639537	0 %	100 %	0 %	0 %	383188545
13023	NC_016818	TCA	2	6	639545	639550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188545
13024	NC_016818	TCCAGT	2	12	639599	639610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383188545
13025	NC_016818	AACC	2	8	639612	639619	50 %	0 %	0 %	50 %	383188545
13026	NC_016818	TCG	2	6	639651	639656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188545
13027	NC_016818	GCAGG	2	10	639693	639702	20 %	0 %	60 %	20 %	383188545
13028	NC_016818	ATC	2	6	639722	639727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188545
13029	NC_016818	TTAA	2	8	639728	639735	50 %	50 %	0 %	0 %	383188545
13030	NC_016818	TCA	2	6	639758	639763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188545
13031	NC_016818	GCA	3	9	639785	639793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188545
13032	NC_016818	GAT	2	6	639795	639800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188545
13033	NC_016818	GGA	2	6	639810	639815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188545
13034	NC_016818	GAT	2	6	639958	639963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188545
13035	NC_016818	GGT	2	6	640046	640051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188545
13036	NC_016818	A	7	7	640118	640124	100 %	0 %	0 %	0 %	383188545
13037	NC_016818	GCAGCC	2	12	640142	640153	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383188545
13038	NC_016818	CAAT	2	8	640262	640269	50 %	25 %	0 %	25 %	383188545
13039	NC_016818	TCA	2	6	640301	640306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188545
13040	NC_016818	CGT	2	6	640346	640351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188545
13041	NC_016818	CTG	2	6	640374	640379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188545
13042	NC_016818	T	6	6	640488	640493	0 %	100 %	0 %	0 %	383188546
13043	NC_016818	GCG	2	6	640612	640617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188546
13044	NC_016818	GGT	2	6	640680	640685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188546
13045	NC_016818	TAC	2	6	640782	640787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188546
13046	NC_016818	CGA	2	6	640838	640843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188546
13047	NC_016818	T	6	6	640852	640857	0 %	100 %	0 %	0 %	383188546
13048	NC_016818	GAT	2	6	640911	640916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188546
13049	NC_016818	AAG	2	6	640950	640955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188546
13050	NC_016818	GTA	2	6	640971	640976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188546
13051	NC_016818	A	6	6	640998	641003	100 %	0 %	0 %	0 %	383188546
13052	NC_016818	TGCC	2	8	641019	641026	0 %	25 %	25 %	50 %	383188546
13053	NC_016818	ATC	2	6	641067	641072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188546
13054	NC_016818	GAG	2	6	641146	641151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188546
13055	NC_016818	ACA	2	6	641155	641160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188546
13056	NC_016818	A	6	6	641176	641181	100 %	0 %	0 %	0 %	383188546
13057	NC_016818	TTC	2	6	641215	641220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188546
13058	NC_016818	CAC	2	6	641247	641252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188546
13059	NC_016818	CAGC	2	8	641336	641343	25 %	0 %	25 %	50 %	383188546
13060	NC_016818	CGG	2	6	641344	641349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188546
13061	NC_016818	TCT	2	6	641455	641460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188546
13062	NC_016818	GA	3	6	641463	641468	50 %	0 %	50 %	0 %	383188546
13063	NC_016818	CTG	2	6	641526	641531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188546
13064	NC_016818	GTA	2	6	641553	641558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188546
13065	NC_016818	A	7	7	641565	641571	100 %	0 %	0 %	0 %	383188546
13066	NC_016818	GAA	2	6	641573	641578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188546
13067	NC_016818	CTG	2	6	641632	641637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_016818	TCAGG	2	10	641673	641682	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13069	NC_016818	GGT	2	6	641704	641709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_016818	GAT	2	6	641733	641738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_016818	TTC	2	6	641788	641793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188547
13072	NC_016818	TC	3	6	641942	641947	0 %	50 %	0 %	50 %	383188547
13073	NC_016818	CCCCA	2	10	641956	641965	20 %	0 %	0 %	80 %	383188547
13074	NC_016818	GTT	2	6	642084	642089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188547
13075	NC_016818	CGA	2	6	642095	642100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188547
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13077	NC_016818	C	6	6	642280	642285	0 %	0 %	0 %	100 %	383188547
13078	NC_016818	GCT	2	6	642310	642315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188547
13079	NC_016818	CAAT	2	8	642329	642336	50 %	25 %	0 %	25 %	383188547
13080	NC_016818	ATC	2	6	642403	642408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188547
13081	NC_016818	CG	3	6	642469	642474	0 %	0 %	50 %	50 %	383188547
13082	NC_016818	AT	3	6	642593	642598	50 %	50 %	0 %	0 %	383188547
13083	NC_016818	TCT	2	6	642681	642686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188548
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13087	NC_016818	ACG	2	6	642816	642821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188548
13088	NC_016818	TCA	2	6	642966	642971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188548
13089	NC_016818	GCA	2	6	642976	642981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188548
13090	NC_016818	GTT	2	6	643399	643404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188548
13091	NC_016818	AC	3	6	643411	643416	50 %	0 %	0 %	50 %	383188548
13092	NC_016818	GCA	2	6	643468	643473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188548
13093	NC_016818	GAA	2	6	643485	643490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188548
13094	NC_016818	TCAG	2	8	643494	643501	25 %	25 %	25 %	25 %	383188548
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13097	NC_016818	CT	3	6	643829	643834	0 %	50 %	0 %	50 %	383188549
13098	NC_016818	CAGC	2	8	643996	644003	25 %	0 %	25 %	50 %	383188549
13099	NC_016818	ATCC	2	8	644093	644100	25 %	25 %	0 %	50 %	383188549
13100	NC_016818	TTC	2	6	644186	644191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188549
13101	NC_016818	ACT	2	6	644245	644250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188549
13102	NC_016818	ATC	2	6	644260	644265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188549
13103	NC_016818	ATC	2	6	644284	644289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188549
13104	NC_016818	GAA	2	6	644343	644348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188549
13105	NC_016818	TCTT	2	8	644354	644361	0 %	75 %	0 %	25 %	383188549
13106	NC_016818	AG	3	6	644394	644399	50 %	0 %	50 %	0 %	383188549
13107	NC_016818	TA	3	6	644425	644430	50 %	50 %	0 %	0 %	383188549
13108	NC_016818	A	6	6	644490	644495	100 %	0 %	0 %	0 %	383188549
13109	NC_016818	TA	3	6	644500	644505	50 %	50 %	0 %	0 %	383188549
13110	NC_016818	TTC	2	6	644536	644541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188549
13111	NC_016818	A	7	7	644579	644585	100 %	0 %	0 %	0 %	383188549
13112	NC_016818	ATC	3	9	644665	644673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188549
13113	NC_016818	TGAGA	2	10	644702	644711	40 %	20 %	40 %	0 %	383188549
13114	NC_016818	ATA	2	6	644725	644730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188549
13115	NC_016818	TCG	2	6	644775	644780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188549
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13118	NC_016818	AAT	2	6	644836	644841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188550
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13120	NC_016818	CATT	2	8	644908	644915	25 %	50 %	0 %	25 %	383188550
13121	NC_016818	CATT	2	8	644962	644969	25 %	50 %	0 %	25 %	383188550
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13229	NC_016818	CAT	2	6	650765	650770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188554
13230	NC_016818	TTTC	2	8	650873	650880	0 %	75 %	0 %	25 %	383188554
13231	NC_016818	GAATAA	2	12	650890	650901	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383188554
13232	NC_016818	TAA	2	6	651049	651054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13233	NC_016818	AT	3	6	651121	651126	50 %	50 %	0 %	0 %	383188555
13234	NC_016818	AG	4	8	651137	651144	50 %	0 %	50 %	0 %	383188555
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13238	NC_016818	CTA	2	6	651328	651333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188555
13239	NC_016818	TGT	2	6	651363	651368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188555
13240	NC_016818	CCT	2	6	651456	651461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188555
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13244	NC_016818	CT	3	6	651572	651577	0 %	50 %	0 %	50 %	383188555
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13352	NC_016818	TGGGT	2	10	657922	657931	0 %	40 %	60 %	0 %	383188561
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13359	NC_016818	CGT	2	6	658378	658383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188561
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13366	NC_016818	ATG	2	6	658714	658719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188561
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13475	NC_016818	AGT	2	6	664001	664006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13478	NC_016818	ATT	2	6	664245	664250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13479	NC_016818	GTAT	2	8	664330	664337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13480	NC_016818	GGGCC	2	10	664410	664419	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13481	NC_016818	ATG	2	6	664442	664447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13483	NC_016818	TC	3	6	664512	664517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13489	NC_016818	CGT	2	6	664696	664701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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