MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_016818	GCC	2	6	615456	615461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188525
12502	NC_016818	TTTCA	2	10	615491	615500	20 %	60 %	0 %	20 %	383188525
12503	NC_016818	GCCA	2	8	615555	615562	25 %	0 %	25 %	50 %	383188525
12504	NC_016818	GCC	2	6	615615	615620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188525
12505	NC_016818	TTC	2	6	615626	615631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188525
12506	NC_016818	TGC	2	6	615672	615677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12507	NC_016818	GCA	2	6	615691	615696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12508	NC_016818	ATG	2	6	615722	615727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188525
12509	NC_016818	GCCA	2	8	615753	615760	25 %	0 %	25 %	50 %	383188525
12510	NC_016818	CGG	2	6	615766	615771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188525
12511	NC_016818	GGCA	2	8	615785	615792	25 %	0 %	50 %	25 %	383188525
12512	NC_016818	CGC	2	6	615865	615870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188525
12513	NC_016818	TGA	2	6	615886	615891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188525
12514	NC_016818	GCA	2	6	615979	615984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12515	NC_016818	AGC	2	6	615988	615993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12516	NC_016818	AGG	2	6	615996	616001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188525
12517	NC_016818	CCA	2	6	616042	616047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188525
12518	NC_016818	TGGC	2	8	616062	616069	0 %	25 %	50 %	25 %	383188525
12519	NC_016818	TGCG	2	8	616087	616094	0 %	25 %	50 %	25 %	383188525
12520	NC_016818	CTG	2	6	616097	616102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12521	NC_016818	GAG	2	6	616116	616121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188525
12522	NC_016818	CA	3	6	616186	616191	50 %	0 %	0 %	50 %	383188525
12523	NC_016818	GCT	2	6	616196	616201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12524	NC_016818	CAG	2	6	616292	616297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12525	NC_016818	CAC	2	6	616352	616357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188525
12526	NC_016818	A	6	6	616389	616394	100 %	0 %	0 %	0 %	383188525
12527	NC_016818	GAT	2	6	616429	616434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188525
12528	NC_016818	TCG	2	6	616437	616442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12529	NC_016818	CAG	3	9	616448	616456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12530	NC_016818	CGC	2	6	616561	616566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188525
12531	NC_016818	CTG	2	6	616571	616576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12532	NC_016818	GCA	2	6	616581	616586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12533	NC_016818	TCA	2	6	616626	616631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188525
12534	NC_016818	CTG	2	6	616660	616665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12535	NC_016818	CCA	2	6	616675	616680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188525
12536	NC_016818	CGT	2	6	616682	616687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12537	NC_016818	CAG	2	6	616754	616759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12538	NC_016818	TGC	2	6	616782	616787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188525
12539	NC_016818	GGC	2	6	616795	616800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188525
12540	NC_016818	T	7	7	616822	616828	0 %	100 %	0 %	0 %	383188525
12541	NC_016818	TTAT	2	8	616860	616867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_016818	TAAT	2	8	616879	616886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_016818	TCC	2	6	616901	616906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12544	NC_016818	ATTG	2	8	616915	616922	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_016818	CTT	2	6	616969	616974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_016818	CCCT	2	8	617003	617010	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12547	NC_016818	CTC	2	6	617011	617016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12548	NC_016818	TCC	2	6	617034	617039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12549	NC_016818	GAT	2	6	617058	617063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_016818	AC	3	6	617075	617080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12551	NC_016818	GCA	2	6	617213	617218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188526
12552	NC_016818	GTG	2	6	617243	617248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188526
12553	NC_016818	CCA	2	6	617254	617259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188526
12554	NC_016818	AAC	2	6	617275	617280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188526
12555	NC_016818	CAA	2	6	617305	617310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188526
12556	NC_016818	GTCA	2	8	617406	617413	25 %	25 %	25 %	25 %	383188526
12557	NC_016818	ACA	2	6	617606	617611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188526
12558	NC_016818	GTCG	2	8	617672	617679	0 %	25 %	50 %	25 %	383188526
12559	NC_016818	GGC	2	6	617691	617696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188526
12560	NC_016818	GGT	2	6	617774	617779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188526
12561	NC_016818	TTC	2	6	617872	617877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188526
12562	NC_016818	GCC	2	6	617901	617906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188526
12563	NC_016818	CGCCTG	2	12	617955	617966	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383188526
12564	NC_016818	GCA	2	6	617969	617974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188526
12565	NC_016818	GCC	2	6	618013	618018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188526
12566	NC_016818	CTG	2	6	618108	618113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188526
12567	NC_016818	CGA	2	6	618125	618130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188526
12568	NC_016818	ACCA	2	8	618186	618193	50 %	0 %	0 %	50 %	383188526
12569	NC_016818	CTG	2	6	618246	618251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188526
12570	NC_016818	A	6	6	618294	618299	100 %	0 %	0 %	0 %	383188526
12571	NC_016818	GTG	2	6	618300	618305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188526
12572	NC_016818	CAAG	2	8	618362	618369	50 %	0 %	25 %	25 %	383188526
12573	NC_016818	TGG	2	6	618439	618444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188526
12574	NC_016818	CTG	2	6	618471	618476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188526
12575	NC_016818	CGC	2	6	618519	618524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188526
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12577	NC_016818	TGAT	2	8	618559	618566	25 %	50 %	25 %	0 %	383188526
12578	NC_016818	CGA	2	6	618629	618634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188526
12579	NC_016818	CTG	2	6	618792	618797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188526
12580	NC_016818	TTA	2	6	618890	618895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188526
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12582	NC_016818	TGA	2	6	619018	619023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188526
12583	NC_016818	AAG	2	6	619066	619071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188526
12584	NC_016818	AAGA	2	8	619251	619258	75 %	0 %	25 %	0 %	383188526
12585	NC_016818	CTT	2	6	619298	619303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188526
12586	NC_016818	GCG	3	9	619354	619362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188526
12587	NC_016818	GCTG	2	8	619376	619383	0 %	25 %	50 %	25 %	383188526
12588	NC_016818	CAG	2	6	619518	619523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188526
12589	NC_016818	TTA	2	6	619612	619617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188527
12590	NC_016818	CAG	2	6	619632	619637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188527
12591	NC_016818	GGC	2	6	619688	619693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188527
12592	NC_016818	CCG	2	6	619697	619702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188527
12593	NC_016818	CGG	2	6	619769	619774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188527
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12595	NC_016818	GCT	2	6	619967	619972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188527
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12597	NC_016818	CGG	2	6	620090	620095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188527
12598	NC_016818	CAGC	2	8	620149	620156	25 %	0 %	25 %	50 %	383188527
12599	NC_016818	CGC	2	6	620175	620180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188527
12600	NC_016818	AGA	2	6	620216	620221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188527
12601	NC_016818	GTG	2	6	620249	620254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188527
12602	NC_016818	GC	3	6	620291	620296	0 %	0 %	50 %	50 %	383188527
12603	NC_016818	GGCT	2	8	620350	620357	0 %	25 %	50 %	25 %	383188527
12604	NC_016818	GCG	2	6	620428	620433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188527
12605	NC_016818	GAAA	2	8	620483	620490	75 %	0 %	25 %	0 %	383188527
12606	NC_016818	GCTGG	2	10	620501	620510	0 %	20 %	60 %	20 %	383188527
12607	NC_016818	ATG	2	6	620533	620538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188527
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12609	NC_016818	TGGC	2	8	620610	620617	0 %	25 %	50 %	25 %	383188527
12610	NC_016818	CCAG	2	8	620647	620654	25 %	0 %	25 %	50 %	383188527
12611	NC_016818	GGTG	2	8	620759	620766	0 %	25 %	75 %	0 %	383188527
12612	NC_016818	CCG	2	6	620769	620774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188527
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12618	NC_016818	CTG	2	6	620997	621002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188527
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12620	NC_016818	GCG	2	6	621100	621105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188527
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12731	NC_016818	TGG	2	6	626107	626112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12741	NC_016818	TGTT	2	8	626669	626676	0 %	75 %	25 %	0 %	383188532
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12749	NC_016818	ATG	2	6	626912	626917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188532
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12843	NC_016818	CTG	2	6	631220	631225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188535
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12846	NC_016818	GA	3	6	631367	631372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12847	NC_016818	CTC	2	6	631390	631395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12848	NC_016818	A	7	7	631448	631454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12849	NC_016818	TTTTGA	2	12	631463	631474	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12850	NC_016818	ACCCC	2	10	631482	631491	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
12851	NC_016818	GCC	2	6	631517	631522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12852	NC_016818	GTG	2	6	631725	631730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188536
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12854	NC_016818	GCA	2	6	631746	631751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188536
12855	NC_016818	TG	3	6	631844	631849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12856	NC_016818	GAC	2	6	631882	631887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12857	NC_016818	CCA	2	6	631986	631991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12858	NC_016818	ATC	2	6	632062	632067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12859	NC_016818	GCG	2	6	632122	632127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12860	NC_016818	AACC	2	8	632154	632161	50 %	0 %	0 %	50 %	383188537
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12862	NC_016818	TC	4	8	632228	632235	0 %	50 %	0 %	50 %	383188537
12863	NC_016818	GCC	2	6	632254	632259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188537
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12865	NC_016818	TGT	2	6	632323	632328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12971	NC_016818	TA	3	6	637513	637518	50 %	50 %	0 %	0 %	383188543
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12976	NC_016818	ATG	2	6	637859	637864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188543
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12978	NC_016818	TCA	3	9	637941	637949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188543
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12980	NC_016818	GGC	2	6	638002	638007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188543
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12982	NC_016818	CAG	2	6	638063	638068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188543
12983	NC_016818	A	7	7	638076	638082	100 %	0 %	0 %	0 %	383188543
12984	NC_016818	CCAC	2	8	638091	638098	25 %	0 %	0 %	75 %	383188543
12985	NC_016818	ACA	2	6	638101	638106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188543
12986	NC_016818	ATA	2	6	638124	638129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188543
12987	NC_016818	GAA	2	6	638143	638148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188543
12988	NC_016818	AAAC	2	8	638275	638282	75 %	0 %	0 %	25 %	383188543
12989	NC_016818	CAT	2	6	638344	638349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188543
12990	NC_016818	GCC	2	6	638366	638371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188543
12991	NC_016818	ATC	2	6	638388	638393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188543
12992	NC_016818	GAG	2	6	638447	638452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188543
12993	NC_016818	T	6	6	638489	638494	0 %	100 %	0 %	0 %	383188543
12994	NC_016818	TCA	2	6	638497	638502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188543
12995	NC_016818	TTC	2	6	638505	638510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188544
12996	NC_016818	CTG	2	6	638639	638644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188544
12997	NC_016818	TG	3	6	638700	638705	0 %	50 %	50 %	0 %	383188544
12998	NC_016818	GCC	2	6	638727	638732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188544
12999	NC_016818	ACA	2	6	638762	638767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188544
13000	NC_016818	ATCAGC	2	12	638825	638836	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383188544

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