MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016818	TCA	2	6	566016	566021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188492
11502	NC_016818	ATG	2	6	566119	566124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188492
11503	NC_016818	GTG	2	6	566140	566145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188492
11504	NC_016818	GC	3	6	566156	566161	0 %	0 %	50 %	50 %	383188492
11505	NC_016818	A	6	6	566167	566172	100 %	0 %	0 %	0 %	383188492
11506	NC_016818	CTT	2	6	566176	566181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188492
11507	NC_016818	CTG	2	6	566218	566223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188492
11508	NC_016818	TGCCGG	2	12	566246	566257	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383188492
11509	NC_016818	G	6	6	566277	566282	0 %	0 %	100 %	0 %	383188492
11510	NC_016818	ACC	2	6	566322	566327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188492
11511	NC_016818	CTG	2	6	566401	566406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188492
11512	NC_016818	AAC	2	6	566457	566462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188492
11513	NC_016818	AAC	2	6	566507	566512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188492
11514	NC_016818	TATTCC	2	12	566525	566536	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383188492
11515	NC_016818	AC	3	6	566609	566614	50 %	0 %	0 %	50 %	383188492
11516	NC_016818	GTG	2	6	566641	566646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188492
11517	NC_016818	CGA	2	6	566678	566683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188492
11518	NC_016818	TGGCGG	3	18	566762	566779	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383188492
11519	NC_016818	AT	3	6	566808	566813	50 %	50 %	0 %	0 %	383188492
11520	NC_016818	ACC	2	6	566877	566882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188492
11521	NC_016818	ATG	2	6	567010	567015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188492
11522	NC_016818	AAACCA	2	12	567036	567047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188492
11523	NC_016818	ACG	2	6	567054	567059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188492
11524	NC_016818	GAT	2	6	567339	567344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188492
11525	NC_016818	GAC	2	6	567432	567437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188492
11526	NC_016818	GAC	2	6	567450	567455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188492
11527	NC_016818	GAC	2	6	567468	567473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188492
11528	NC_016818	A	6	6	567513	567518	100 %	0 %	0 %	0 %	383188492
11529	NC_016818	CCG	2	6	567621	567626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188492
11530	NC_016818	GTG	2	6	567676	567681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188492
11531	NC_016818	TAC	2	6	567698	567703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188492
11532	NC_016818	A	6	6	567759	567764	100 %	0 %	0 %	0 %	383188492
11533	NC_016818	ATA	2	6	567792	567797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188492
11534	NC_016818	TAA	2	6	567818	567823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188492
11535	NC_016818	CGC	2	6	567841	567846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188492
11536	NC_016818	AAT	2	6	567861	567866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188492
11537	NC_016818	T	8	8	568094	568101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_016818	TTG	2	6	568132	568137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_016818	A	7	7	568142	568148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_016818	A	6	6	568192	568197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_016818	CTG	2	6	568346	568351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188493
11542	NC_016818	TCCACA	2	12	568384	568395	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383188493
11543	NC_016818	TAA	2	6	568430	568435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188493
11544	NC_016818	CGC	2	6	568474	568479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188493
11545	NC_016818	GAT	2	6	568529	568534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188493
11546	NC_016818	CTGC	2	8	568546	568553	0 %	25 %	25 %	50 %	383188493
11547	NC_016818	GCC	2	6	568576	568581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188493
11548	NC_016818	TGT	2	6	568591	568596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188493
11549	NC_016818	TGA	2	6	568683	568688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188493
11550	NC_016818	CTT	2	6	568745	568750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188494
11551	NC_016818	ACGG	2	8	568769	568776	25 %	0 %	50 %	25 %	383188494
11552	NC_016818	CGG	2	6	568807	568812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188494
11553	NC_016818	TGAC	2	8	568814	568821	25 %	25 %	25 %	25 %	383188494
11554	NC_016818	ATCG	2	8	568914	568921	25 %	25 %	25 %	25 %	383188494
11555	NC_016818	TGC	2	6	568993	568998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188494
11556	NC_016818	CCG	2	6	569029	569034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188494
11557	NC_016818	TCT	2	6	569090	569095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188494
11558	NC_016818	CCA	2	6	569147	569152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188494
11559	NC_016818	CAA	2	6	569276	569281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188494
11560	NC_016818	CTGG	2	8	569304	569311	0 %	25 %	50 %	25 %	383188494
11561	NC_016818	GTC	3	9	569418	569426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188494
11562	NC_016818	CGC	2	6	569441	569446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188494
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11564	NC_016818	T	6	6	569523	569528	0 %	100 %	0 %	0 %	383188494
11565	NC_016818	CAA	2	6	569535	569540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188494
11566	NC_016818	TCG	2	6	569545	569550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188494
11567	NC_016818	TTG	2	6	569629	569634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188494
11568	NC_016818	ATC	2	6	569647	569652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188494
11569	NC_016818	TTC	2	6	569661	569666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188494
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11572	NC_016818	CTG	2	6	569916	569921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188494
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11584	NC_016818	AAT	2	6	570341	570346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188494
11585	NC_016818	CGC	2	6	570368	570373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188494
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11590	NC_016818	T	6	6	570612	570617	0 %	100 %	0 %	0 %	383188494
11591	NC_016818	CAA	2	6	570701	570706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188494
11592	NC_016818	CGG	2	6	570746	570751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188494
11593	NC_016818	GTCT	2	8	570869	570876	0 %	50 %	25 %	25 %	383188494
11594	NC_016818	CGC	2	6	570912	570917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11595	NC_016818	TG	3	6	570937	570942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_016818	TA	3	6	570961	570966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_016818	TTGGG	2	10	570967	570976	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_016818	AC	3	6	570987	570992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11599	NC_016818	T	7	7	571049	571055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_016818	GAA	2	6	571060	571065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_016818	TGA	2	6	571067	571072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_016818	TGT	2	6	571103	571108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_016818	A	6	6	571126	571131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_016818	TGAC	2	8	571153	571160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11605	NC_016818	CGC	2	6	571266	571271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188495
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11607	NC_016818	TCCG	2	8	571336	571343	0 %	25 %	25 %	50 %	383188495
11608	NC_016818	GCA	2	6	571380	571385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188495
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11619	NC_016818	CGG	2	6	572039	572044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188495
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11621	NC_016818	CGG	2	6	572162	572167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188495
11622	NC_016818	CTG	2	6	572197	572202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188495
11623	NC_016818	TTC	2	6	572273	572278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188495
11624	NC_016818	CGG	2	6	572293	572298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188495
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11864	NC_016818	CCG	2	6	584038	584043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188504
11865	NC_016818	CTT	2	6	584044	584049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188504
11866	NC_016818	TGC	2	6	584077	584082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188504
11867	NC_016818	CGG	2	6	584117	584122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188504
11868	NC_016818	CAC	2	6	584156	584161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188504
11869	NC_016818	CTG	2	6	584162	584167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188504
11870	NC_016818	ACG	2	6	584219	584224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188504
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11872	NC_016818	ATC	2	6	584283	584288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188504
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11874	NC_016818	GCTGGG	2	12	584475	584486	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383188505
11875	NC_016818	GTG	2	6	584511	584516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188505
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11878	NC_016818	ATC	2	6	584635	584640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188505
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11882	NC_016818	TGA	2	6	584839	584844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188505
11883	NC_016818	GC	3	6	584895	584900	0 %	0 %	50 %	50 %	383188505
11884	NC_016818	CAC	2	6	584953	584958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188505
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11888	NC_016818	CGC	2	6	585121	585126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188505
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11891	NC_016818	TGA	2	6	585397	585402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188506
11892	NC_016818	TGT	2	6	585443	585448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188506
11893	NC_016818	TTCTTT	2	12	585450	585461	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383188506
11894	NC_016818	CAC	2	6	585480	585485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188506
11895	NC_016818	GC	3	6	585509	585514	0 %	0 %	50 %	50 %	383188506
11896	NC_016818	GCC	2	6	585561	585566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188506
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11898	NC_016818	GGT	2	6	585711	585716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188506
11899	NC_016818	CG	3	6	585909	585914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11900	NC_016818	A	6	6	585944	585949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11901	NC_016818	GAG	2	6	585999	586004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11902	NC_016818	GAAACC	2	12	586022	586033	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383188507
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11922	NC_016818	ACG	2	6	587096	587101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188507
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11925	NC_016818	T	7	7	587216	587222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11926	NC_016818	CTG	2	6	587226	587231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11932	NC_016818	CTT	2	6	587405	587410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188508
11933	NC_016818	CCG	2	6	587437	587442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188508
11934	NC_016818	GTC	2	6	587478	587483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188508
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11942	NC_016818	GT	3	6	587945	587950	0 %	50 %	50 %	0 %	383188509
11943	NC_016818	CGGG	2	8	587954	587961	0 %	0 %	75 %	25 %	383188509
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11949	NC_016818	ACA	2	6	588252	588257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188509
11950	NC_016818	CCG	2	6	588282	588287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188509
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11955	NC_016818	ATC	2	6	588706	588711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188509
11956	NC_016818	GCG	2	6	588735	588740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188509
11957	NC_016818	G	6	6	588747	588752	0 %	0 %	100 %	0 %	383188509
11958	NC_016818	TCAA	2	8	588761	588768	50 %	25 %	0 %	25 %	383188509
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11963	NC_016818	G	6	6	589243	589248	0 %	0 %	100 %	0 %	383188510
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11966	NC_016818	TCG	2	6	589369	589374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188510
11967	NC_016818	TAG	2	6	589465	589470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188510
11968	NC_016818	CGGG	2	8	589471	589478	0 %	0 %	75 %	25 %	383188510
11969	NC_016818	TGCG	2	8	589543	589550	0 %	25 %	50 %	25 %	383188510
11970	NC_016818	GCT	2	6	589598	589603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188510
11971	NC_016818	AG	3	6	589666	589671	50 %	0 %	50 %	0 %	383188510
11972	NC_016818	AATGT	2	10	589934	589943	40 %	40 %	20 %	0 %	383188510
11973	NC_016818	CAA	2	6	590013	590018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188510
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11975	NC_016818	GGC	2	6	590526	590531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188510
11976	NC_016818	GT	3	6	590602	590607	0 %	50 %	50 %	0 %	383188511
11977	NC_016818	CAT	2	6	590632	590637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188511
11978	NC_016818	TGGC	2	8	590644	590651	0 %	25 %	50 %	25 %	383188511
11979	NC_016818	GGA	2	6	590652	590657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188511
11980	NC_016818	CAG	2	6	590819	590824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188511
11981	NC_016818	TGCC	2	8	590869	590876	0 %	25 %	25 %	50 %	383188511
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