MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016818	CGA	2	6	540948	540953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188472
11002	NC_016818	GTG	2	6	540964	540969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188472
11003	NC_016818	TGAA	2	8	541106	541113	50 %	25 %	25 %	0 %	383188472
11004	NC_016818	TAC	2	6	541153	541158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188472
11005	NC_016818	CTG	2	6	541178	541183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188472
11006	NC_016818	AGT	2	6	541278	541283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188472
11007	NC_016818	TCAG	2	8	541314	541321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11008	NC_016818	CAA	2	6	541325	541330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_016818	T	6	6	541439	541444	0 %	100 %	0 %	0 %	383188473
11010	NC_016818	CCG	2	6	541483	541488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188473
11011	NC_016818	CAG	2	6	541502	541507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188473
11012	NC_016818	GCTG	2	8	541555	541562	0 %	25 %	50 %	25 %	383188473
11013	NC_016818	CGC	2	6	541566	541571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188473
11014	NC_016818	GTCG	2	8	541577	541584	0 %	25 %	50 %	25 %	383188473
11015	NC_016818	AT	3	6	541623	541628	50 %	50 %	0 %	0 %	383188473
11016	NC_016818	GAAATA	2	12	541669	541680	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_016818	GTG	2	6	541685	541690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_016818	TGAG	2	8	541714	541721	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_016818	TGA	2	6	541787	541792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188474
11020	NC_016818	TG	3	6	541840	541845	0 %	50 %	50 %	0 %	383188474
11021	NC_016818	GAA	3	9	542058	542066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188474
11022	NC_016818	GC	3	6	542073	542078	0 %	0 %	50 %	50 %	383188474
11023	NC_016818	GAA	2	6	542183	542188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188474
11024	NC_016818	CTG	2	6	542190	542195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188474
11025	NC_016818	TGC	2	6	542248	542253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188475
11026	NC_016818	ACT	2	6	542333	542338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188475
11027	NC_016818	ACC	2	6	542381	542386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188475
11028	NC_016818	CAA	2	6	542502	542507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188475
11029	NC_016818	CGC	2	6	542517	542522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188475
11030	NC_016818	TCC	2	6	542542	542547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188475
11031	NC_016818	GCA	3	9	542550	542558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188475
11032	NC_016818	CAT	2	6	542583	542588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188475
11033	NC_016818	T	8	8	542650	542657	0 %	100 %	0 %	0 %	383188475
11034	NC_016818	TGA	2	6	542672	542677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188475
11035	NC_016818	TCA	2	6	542729	542734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188475
11036	NC_016818	TGA	2	6	542736	542741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188475
11037	NC_016818	TCT	2	6	542751	542756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188475
11038	NC_016818	TCC	2	6	542767	542772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11039	NC_016818	GGGC	2	8	542820	542827	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11040	NC_016818	ATC	2	6	542841	542846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_016818	TTC	2	6	542959	542964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188476
11042	NC_016818	TGGG	2	8	542968	542975	0 %	25 %	75 %	0 %	383188476
11043	NC_016818	CTG	2	6	543006	543011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188476
11044	NC_016818	CG	3	6	543022	543027	0 %	0 %	50 %	50 %	383188476
11045	NC_016818	GCC	2	6	543049	543054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188476
11046	NC_016818	GCC	2	6	543062	543067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188476
11047	NC_016818	CTG	2	6	543149	543154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188476
11048	NC_016818	TGG	2	6	543217	543222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188476
11049	NC_016818	AGC	2	6	543236	543241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188476
11050	NC_016818	GC	3	6	543277	543282	0 %	0 %	50 %	50 %	383188476
11051	NC_016818	GCT	2	6	543389	543394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188476
11052	NC_016818	CCG	2	6	543411	543416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188476
11053	NC_016818	AAC	2	6	543427	543432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188476
11054	NC_016818	TGGG	2	8	543532	543539	0 %	25 %	75 %	0 %	383188476
11055	NC_016818	GCC	2	6	543567	543572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188476
11056	NC_016818	GAA	2	6	543579	543584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188476
11057	NC_016818	A	6	6	543636	543641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_016818	CTGC	2	8	543652	543659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11059	NC_016818	CTTT	2	8	543738	543745	0 %	75 %	0 %	25 %	383188477
11060	NC_016818	CCA	2	6	543767	543772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188477
11061	NC_016818	CGC	2	6	543830	543835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188477
11062	NC_016818	CGA	2	6	543844	543849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188477
11063	NC_016818	CAC	2	6	543875	543880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188477
11064	NC_016818	CAT	2	6	543955	543960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188477
11065	NC_016818	GGTA	2	8	544039	544046	25 %	25 %	50 %	0 %	383188477
11066	NC_016818	TCG	2	6	544132	544137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188477
11067	NC_016818	CGG	2	6	544159	544164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188477
11068	NC_016818	GAT	2	6	544196	544201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188477
11069	NC_016818	CTG	2	6	544256	544261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188477
11070	NC_016818	CAGC	2	8	544294	544301	25 %	0 %	25 %	50 %	383188477
11071	NC_016818	ATG	2	6	544314	544319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188477
11072	NC_016818	CAG	2	6	544390	544395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188478
11073	NC_016818	CGT	2	6	544422	544427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188478
11074	NC_016818	CAG	2	6	544432	544437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188478
11075	NC_016818	GC	3	6	544455	544460	0 %	0 %	50 %	50 %	383188478
11076	NC_016818	AC	3	6	544564	544569	50 %	0 %	0 %	50 %	383188478
11077	NC_016818	GCA	2	6	544572	544577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188478
11078	NC_016818	GC	4	8	544614	544621	0 %	0 %	50 %	50 %	383188478
11079	NC_016818	CTG	2	6	544726	544731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188478
11080	NC_016818	GCG	2	6	544732	544737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188478
11081	NC_016818	A	6	6	544741	544746	100 %	0 %	0 %	0 %	383188478
11082	NC_016818	CAG	2	6	544855	544860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188478
11083	NC_016818	CCT	2	6	544916	544921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11084	NC_016818	CG	3	6	545014	545019	0 %	0 %	50 %	50 %	383188479
11085	NC_016818	GTT	2	6	545113	545118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188479
11086	NC_016818	AG	3	6	545176	545181	50 %	0 %	50 %	0 %	383188479
11087	NC_016818	CAG	2	6	545188	545193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188479
11088	NC_016818	CGAG	2	8	545196	545203	25 %	0 %	50 %	25 %	383188479
11089	NC_016818	CGC	2	6	545241	545246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188479
11090	NC_016818	TTC	2	6	545356	545361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188479
11091	NC_016818	CGT	3	9	545379	545387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188479
11092	NC_016818	GCG	2	6	545455	545460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188479
11093	NC_016818	GTC	2	6	545488	545493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188479
11094	NC_016818	CTG	2	6	545497	545502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188479
11095	NC_016818	ATA	2	6	545527	545532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188479
11096	NC_016818	GGT	2	6	545641	545646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188479
11097	NC_016818	CGCAG	2	10	545661	545670	20 %	0 %	40 %	40 %	383188479
11098	NC_016818	TGA	2	6	545715	545720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188479
11099	NC_016818	ATC	2	6	545729	545734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188479
11100	NC_016818	CCG	2	6	545759	545764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188479
11101	NC_016818	CGACGG	2	12	545778	545789	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383188479
11102	NC_016818	GTG	2	6	545801	545806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188479
11103	NC_016818	GCT	2	6	545836	545841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188479
11104	NC_016818	GCG	2	6	545877	545882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188479
11105	NC_016818	GCA	2	6	545928	545933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188479
11106	NC_016818	GCC	2	6	545938	545943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188479
11107	NC_016818	GCT	3	9	545971	545979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188479
11108	NC_016818	CAA	2	6	546027	546032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188479
11109	NC_016818	TCG	2	6	546038	546043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188479
11110	NC_016818	TGA	2	6	546063	546068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188479
11111	NC_016818	TCA	2	6	546142	546147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188480
11112	NC_016818	CG	3	6	546173	546178	0 %	0 %	50 %	50 %	383188480
11113	NC_016818	CAC	2	6	546201	546206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188480
11114	NC_016818	CGC	2	6	546207	546212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188480
11115	NC_016818	CGGT	2	8	546236	546243	0 %	25 %	50 %	25 %	383188480
11116	NC_016818	TGT	2	6	546301	546306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188480
11117	NC_016818	CGC	2	6	546308	546313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188480
11118	NC_016818	GCA	2	6	546368	546373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188480
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11120	NC_016818	CTG	2	6	546549	546554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188480
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11235	NC_016818	CAT	2	6	551421	551426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11236	NC_016818	ATG	2	6	551469	551474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11237	NC_016818	GAA	2	6	551492	551497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11239	NC_016818	AGCTA	2	10	551703	551712	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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11475	NC_016818	TAA	2	6	564878	564883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188492
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11478	NC_016818	ATG	3	9	565000	565008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188492
11479	NC_016818	CTG	2	6	565015	565020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188492
11480	NC_016818	ATG	2	6	565084	565089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188492
11481	NC_016818	ACTGAG	2	12	565197	565208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383188492
11482	NC_016818	ACG	2	6	565209	565214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188492
11483	NC_016818	AAAGT	2	10	565231	565240	60 %	20 %	20 %	0 %	383188492
11484	NC_016818	GCGG	2	8	565245	565252	0 %	0 %	75 %	25 %	383188492
11485	NC_016818	CCG	2	6	565270	565275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188492
11486	NC_016818	TGA	2	6	565285	565290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188492
11487	NC_016818	AGC	2	6	565328	565333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188492
11488	NC_016818	TAATGC	2	12	565415	565426	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383188492
11489	NC_016818	G	6	6	565466	565471	0 %	0 %	100 %	0 %	383188492
11490	NC_016818	TGG	2	6	565523	565528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188492
11491	NC_016818	CTC	2	6	565595	565600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188492
11492	NC_016818	CTT	2	6	565642	565647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188492
11493	NC_016818	TGA	2	6	565658	565663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188492
11494	NC_016818	TGG	2	6	565694	565699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188492
11495	NC_016818	TGA	2	6	565739	565744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188492
11496	NC_016818	AAT	2	6	565884	565889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188492
11497	NC_016818	CAG	2	6	565918	565923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188492
11498	NC_016818	CTT	2	6	565969	565974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188492
11499	NC_016818	ACA	2	6	565975	565980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188492
11500	NC_016818	ACA	2	6	565999	566004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188492

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