MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016818	AGC	2	6	490165	490170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188426
10002	NC_016818	TG	3	6	490287	490292	0 %	50 %	50 %	0 %	383188426
10003	NC_016818	CAC	2	6	490319	490324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188426
10004	NC_016818	GTT	2	6	490336	490341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_016818	AAC	2	6	490383	490388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_016818	CA	3	6	490430	490435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10007	NC_016818	GGA	2	6	490440	490445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_016818	TCG	2	6	490453	490458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_016818	TCA	2	6	490494	490499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_016818	CGG	2	6	490543	490548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_016818	CTG	2	6	490630	490635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188427
10012	NC_016818	CGTT	2	8	490713	490720	0 %	50 %	25 %	25 %	383188427
10013	NC_016818	ATC	2	6	490722	490727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188427
10014	NC_016818	ACGG	2	8	490754	490761	25 %	0 %	50 %	25 %	383188427
10015	NC_016818	GCC	2	6	490780	490785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188427
10016	NC_016818	CTA	2	6	490812	490817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188427
10017	NC_016818	CCG	3	9	490852	490860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188427
10018	NC_016818	GTG	2	6	490924	490929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188427
10019	NC_016818	GCG	2	6	491150	491155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188427
10020	NC_016818	TGA	2	6	491202	491207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188427
10021	NC_016818	ATT	2	6	491243	491248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188427
10022	NC_016818	CCG	2	6	491277	491282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188427
10023	NC_016818	CG	3	6	491435	491440	0 %	0 %	50 %	50 %	383188427
10024	NC_016818	GAA	2	6	491454	491459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188427
10025	NC_016818	GCT	2	6	491550	491555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188427
10026	NC_016818	G	6	6	491589	491594	0 %	0 %	100 %	0 %	383188427
10027	NC_016818	CCA	2	6	491633	491638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188427
10028	NC_016818	GGC	2	6	491791	491796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188427
10029	NC_016818	TC	3	6	491830	491835	0 %	50 %	0 %	50 %	383188427
10030	NC_016818	ACC	2	6	491848	491853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188427
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10032	NC_016818	CCG	2	6	491983	491988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188427
10033	NC_016818	TTC	2	6	491998	492003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188427
10034	NC_016818	GCA	2	6	492017	492022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188427
10035	NC_016818	TGA	3	9	492057	492065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188427
10036	NC_016818	CGT	2	6	492083	492088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188427
10037	NC_016818	TGG	2	6	492136	492141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188427
10038	NC_016818	TTG	2	6	492152	492157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188427
10039	NC_016818	CA	3	6	492183	492188	50 %	0 %	0 %	50 %	383188427
10040	NC_016818	GGTG	2	8	492270	492277	0 %	25 %	75 %	0 %	383188427
10041	NC_016818	TTTA	2	8	492332	492339	25 %	75 %	0 %	0 %	383188428
10042	NC_016818	TGG	2	6	492388	492393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188428
10043	NC_016818	CA	3	6	492407	492412	50 %	0 %	0 %	50 %	383188428
10044	NC_016818	TGA	2	6	492427	492432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188428
10045	NC_016818	CCTG	2	8	492577	492584	0 %	25 %	25 %	50 %	383188428
10046	NC_016818	GC	3	6	492592	492597	0 %	0 %	50 %	50 %	383188428
10047	NC_016818	TGG	2	6	492634	492639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188428
10048	NC_016818	GCCG	2	8	492659	492666	0 %	0 %	50 %	50 %	383188428
10049	NC_016818	AAC	2	6	492687	492692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188428
10050	NC_016818	CTG	2	6	492738	492743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188428
10051	NC_016818	GC	3	6	492808	492813	0 %	0 %	50 %	50 %	383188428
10052	NC_016818	GTG	3	9	492969	492977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188428
10053	NC_016818	GTT	2	6	493010	493015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188428
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10055	NC_016818	CCG	2	6	493270	493275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188428
10056	NC_016818	CGC	2	6	493471	493476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188428
10057	NC_016818	TGC	2	6	493627	493632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188428
10058	NC_016818	GGC	2	6	493637	493642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188428
10059	NC_016818	GTG	2	6	493671	493676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188428
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10062	NC_016818	GCAGAT	2	12	493811	493822	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383188428
10063	NC_016818	CGTG	2	8	493880	493887	0 %	25 %	50 %	25 %	383188428
10064	NC_016818	TAA	2	6	493940	493945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188428
10065	NC_016818	CGC	2	6	494002	494007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188428
10066	NC_016818	GTG	2	6	494040	494045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188428
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10069	NC_016818	GGCA	2	8	494122	494129	25 %	0 %	50 %	25 %	383188428
10070	NC_016818	GCG	2	6	494138	494143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188428
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10072	NC_016818	GTC	2	6	494317	494322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188428
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10075	NC_016818	GTG	2	6	494550	494555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188428
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10085	NC_016818	CAA	2	6	495212	495217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188428
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10088	NC_016818	GTT	2	6	495290	495295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188428
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10091	NC_016818	GTC	2	6	495371	495376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188428
10092	NC_016818	TCCG	2	8	495572	495579	0 %	25 %	25 %	50 %	383188428
10093	NC_016818	CCGGC	2	10	495637	495646	0 %	0 %	40 %	60 %	383188428
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10099	NC_016818	CTG	2	6	496298	496303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188429
10100	NC_016818	CAT	2	6	496356	496361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188429
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10104	NC_016818	A	7	7	496579	496585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_016818	CGG	2	6	496596	496601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_016818	T	7	7	496604	496610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_016818	CGG	2	6	496618	496623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_016818	CGG	2	6	496633	496638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_016818	AAG	2	6	496667	496672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188430
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10111	NC_016818	CAGCC	2	10	496703	496712	20 %	0 %	20 %	60 %	383188430
10112	NC_016818	GAA	2	6	496758	496763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188430
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10118	NC_016818	TTG	2	6	497174	497179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188430
10119	NC_016818	TGC	2	6	497207	497212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_016818	TCG	2	6	497250	497255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_016818	GTGC	2	8	497262	497269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10122	NC_016818	CTG	2	6	497285	497290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_016818	CAAA	2	8	497412	497419	75 %	0 %	0 %	25 %	383188431
10124	NC_016818	A	6	6	497417	497422	100 %	0 %	0 %	0 %	383188431
10125	NC_016818	CTG	2	6	497530	497535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188432
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10131	NC_016818	GAT	2	6	497815	497820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188432
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10151	NC_016818	CATT	2	8	499154	499161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10211	NC_016818	GTC	2	6	501878	501883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10216	NC_016818	CGT	2	6	502102	502107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188435
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10225	NC_016818	GTA	2	6	502409	502414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10226	NC_016818	CTT	2	6	502471	502476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10227	NC_016818	CTTCG	2	10	502513	502522	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10228	NC_016818	CTT	2	6	502569	502574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188436
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10231	NC_016818	TGC	2	6	502729	502734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188436
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10233	NC_016818	TCG	2	6	502808	502813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10234	NC_016818	CAC	2	6	502846	502851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10235	NC_016818	TAA	2	6	502938	502943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10236	NC_016818	A	6	6	502955	502960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10237	NC_016818	A	6	6	502966	502971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10238	NC_016818	TGT	2	6	503086	503091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10239	NC_016818	G	6	6	503111	503116	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10240	NC_016818	GCA	2	6	503146	503151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10241	NC_016818	AAGG	2	8	503155	503162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10243	NC_016818	ACG	2	6	503221	503226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10369	NC_016818	GAAA	2	8	508782	508789	75 %	0 %	25 %	0 %	383188444
10370	NC_016818	GCA	2	6	508921	508926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188444
10371	NC_016818	CGG	2	6	509045	509050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188444
10372	NC_016818	CTGT	2	8	509082	509089	0 %	50 %	25 %	25 %	383188444
10373	NC_016818	GCG	2	6	509096	509101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188444
10374	NC_016818	GGC	2	6	509154	509159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188444
10375	NC_016818	GCCTG	2	10	509227	509236	0 %	20 %	40 %	40 %	383188444
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10377	NC_016818	G	6	6	509277	509282	0 %	0 %	100 %	0 %	383188444
10378	NC_016818	TGG	3	9	509289	509297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188444
10379	NC_016818	TGG	2	6	509330	509335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188444
10380	NC_016818	TGA	2	6	509419	509424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188445
10381	NC_016818	CCG	2	6	509476	509481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188445
10382	NC_016818	TGG	2	6	509512	509517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188445
10383	NC_016818	TGA	2	6	509554	509559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188445
10384	NC_016818	AGC	2	6	509630	509635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188445
10385	NC_016818	TCT	2	6	509801	509806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188445
10386	NC_016818	TGC	2	6	509877	509882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188445
10387	NC_016818	CTG	2	6	509946	509951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188445
10388	NC_016818	CGTA	2	8	510007	510014	25 %	25 %	25 %	25 %	383188445
10389	NC_016818	CTG	2	6	510128	510133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188445
10390	NC_016818	CGAT	2	8	510153	510160	25 %	25 %	25 %	25 %	383188445
10391	NC_016818	ATC	2	6	510191	510196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188445
10392	NC_016818	GCTG	2	8	510223	510230	0 %	25 %	50 %	25 %	383188445
10393	NC_016818	TGATC	2	10	510262	510271	20 %	40 %	20 %	20 %	383188445
10394	NC_016818	AGA	2	6	510277	510282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188445
10395	NC_016818	CG	3	6	510291	510296	0 %	0 %	50 %	50 %	383188445
10396	NC_016818	ATT	2	6	510333	510338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188445
10397	NC_016818	CTG	2	6	510348	510353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188445
10398	NC_016818	TGA	2	6	510390	510395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188445
10399	NC_016818	GAA	2	6	510431	510436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188445
10400	NC_016818	GAT	2	6	510467	510472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188445
10401	NC_016818	AAC	2	6	510483	510488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188445
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10403	NC_016818	GAT	2	6	510524	510529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188445
10404	NC_016818	GAC	2	6	510545	510550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188445
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10412	NC_016818	T	7	7	511250	511256	0 %	100 %	0 %	0 %	383188446
10413	NC_016818	CTG	2	6	511336	511341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188446
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10418	NC_016818	GCCAGA	2	12	511659	511670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188446
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10432	NC_016818	GCAT	2	8	512322	512329	25 %	25 %	25 %	25 %	383188447
10433	NC_016818	TCA	2	6	512374	512379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188447
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10436	NC_016818	ACG	2	6	512480	512485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188448
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10439	NC_016818	CAGA	2	8	512590	512597	50 %	0 %	25 %	25 %	383188448
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10442	NC_016818	GCA	2	6	512734	512739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188448
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10451	NC_016818	CGG	2	6	513365	513370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188448
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10453	NC_016818	T	6	6	513482	513487	0 %	100 %	0 %	0 %	383188448
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10457	NC_016818	ATCG	2	8	513704	513711	25 %	25 %	25 %	25 %	383188448
10458	NC_016818	CAGGCG	2	12	513712	513723	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383188448
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10464	NC_016818	T	8	8	514030	514037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10465	NC_016818	AG	4	8	514048	514055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10466	NC_016818	AT	3	6	514137	514142	50 %	50 %	0 %	0 %	383188449
10467	NC_016818	TCG	2	6	514212	514217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188449
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10472	NC_016818	GAT	2	6	514468	514473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188449
10473	NC_016818	GAT	2	6	514546	514551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188449
10474	NC_016818	GTT	3	9	514552	514560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188449
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10476	NC_016818	TTC	2	6	514930	514935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188450
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10478	NC_016818	GTT	2	6	515014	515019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188450
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10480	NC_016818	T	6	6	515099	515104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10481	NC_016818	AAT	2	6	515182	515187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10482	NC_016818	ATG	2	6	515209	515214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10483	NC_016818	GGT	2	6	515246	515251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10484	NC_016818	AAT	2	6	515273	515278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188451
10485	NC_016818	TAA	2	6	515282	515287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188451
10486	NC_016818	A	6	6	515358	515363	100 %	0 %	0 %	0 %	383188451
10487	NC_016818	TGA	2	6	515393	515398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188451
10488	NC_016818	GCA	2	6	515454	515459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188451
10489	NC_016818	TTG	2	6	515545	515550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188451
10490	NC_016818	CTTC	2	8	515558	515565	0 %	50 %	0 %	50 %	383188451
10491	NC_016818	TGA	2	6	515579	515584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188451
10492	NC_016818	GCT	2	6	515600	515605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188451
10493	NC_016818	GGT	2	6	515633	515638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188451
10494	NC_016818	TGA	2	6	515789	515794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188451
10495	NC_016818	TGTT	2	8	515918	515925	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10496	NC_016818	GAA	2	6	515968	515973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188452
10497	NC_016818	TAC	2	6	516064	516069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188452
10498	NC_016818	A	6	6	516140	516145	100 %	0 %	0 %	0 %	383188452
10499	NC_016818	CAG	2	6	516148	516153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188452
10500	NC_016818	GCT	2	6	516202	516207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188452

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