MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016818	GC	3	6	23013	23018	0 %	0 %	50 %	50 %	383187987
502	NC_016818	TTA	2	6	23224	23229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016818	CTGC	2	8	23253	23260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
504	NC_016818	GGA	2	6	23312	23317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016818	GCG	2	6	23328	23333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_016818	CAG	3	9	23558	23566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187988
507	NC_016818	GCC	3	9	23586	23594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187988
508	NC_016818	GC	3	6	23644	23649	0 %	0 %	50 %	50 %	383187988
509	NC_016818	CTG	2	6	23657	23662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187988
510	NC_016818	ATC	2	6	23693	23698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187988
511	NC_016818	CGG	2	6	23842	23847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187988
512	NC_016818	GCA	2	6	23853	23858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187988
513	NC_016818	TGA	2	6	23903	23908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187989
514	NC_016818	GCC	2	6	23924	23929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187989
515	NC_016818	TCG	2	6	23949	23954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187989
516	NC_016818	CTTT	2	8	23973	23980	0 %	75 %	0 %	25 %	383187989
517	NC_016818	ATT	2	6	24046	24051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187989
518	NC_016818	GCC	2	6	24064	24069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187989
519	NC_016818	CAC	2	6	24102	24107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187989
520	NC_016818	TAA	2	6	24141	24146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383187989
521	NC_016818	GAT	2	6	24172	24177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187989
522	NC_016818	CGT	2	6	24204	24209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187989
523	NC_016818	ATG	2	6	24244	24249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187989
524	NC_016818	GCA	2	6	24279	24284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187989
525	NC_016818	CTG	2	6	24307	24312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187989
526	NC_016818	ACA	2	6	24324	24329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187989
527	NC_016818	GTC	2	6	24439	24444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_016818	GT	3	6	24474	24479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016818	CCT	2	6	24521	24526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_016818	ATT	2	6	24604	24609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016818	GGCA	2	8	24629	24636	25 %	0 %	50 %	25 %	383187990
532	NC_016818	A	8	8	24636	24643	100 %	0 %	0 %	0 %	383187990
533	NC_016818	TC	4	8	24656	24663	0 %	50 %	0 %	50 %	383187990
534	NC_016818	CAG	2	6	24785	24790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187990
535	NC_016818	AAC	2	6	24822	24827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187990
536	NC_016818	GGC	2	6	24858	24863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187990
537	NC_016818	GGC	3	9	24879	24887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187990
538	NC_016818	CGG	2	6	24956	24961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187990
539	NC_016818	GGC	2	6	24999	25004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187990
540	NC_016818	GGC	3	9	25013	25021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187990
541	NC_016818	CGG	2	6	25045	25050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187990
542	NC_016818	GGC	2	6	25079	25084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187990
543	NC_016818	GTGA	2	8	25092	25099	25 %	25 %	50 %	0 %	383187990
544	NC_016818	CTG	2	6	25194	25199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187990
545	NC_016818	GCA	2	6	25205	25210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187990
546	NC_016818	GGC	2	6	25298	25303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187990
547	NC_016818	GCG	2	6	25308	25313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187990
548	NC_016818	GGC	3	9	25361	25369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187990
549	NC_016818	GGCG	2	8	25391	25398	0 %	0 %	75 %	25 %	383187990
550	NC_016818	ACA	2	6	25414	25419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187990
551	NC_016818	CGG	2	6	25448	25453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187990
552	NC_016818	GTG	2	6	25494	25499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187990
553	NC_016818	CAG	2	6	25598	25603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187990
554	NC_016818	C	6	6	25639	25644	0 %	0 %	0 %	100 %	383187990
555	NC_016818	GTCGCT	2	12	25721	25732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187990
556	NC_016818	CAG	2	6	25770	25775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187990
557	NC_016818	GTCC	2	8	25855	25862	0 %	25 %	25 %	50 %	383187990
558	NC_016818	GGAT	2	8	25909	25916	25 %	25 %	50 %	0 %	383187990
559	NC_016818	GAT	2	6	25937	25942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187990
560	NC_016818	GAT	2	6	25965	25970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187990
561	NC_016818	GAT	2	6	25974	25979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187990
562	NC_016818	GCTC	2	8	26083	26090	0 %	25 %	25 %	50 %	383187990
563	NC_016818	CGC	2	6	26109	26114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187990
564	NC_016818	ACC	2	6	26130	26135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187990
565	NC_016818	ACGG	2	8	26154	26161	25 %	0 %	50 %	25 %	383187990
566	NC_016818	CGG	2	6	26171	26176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187990
567	NC_016818	CAG	2	6	26255	26260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187990
568	NC_016818	CAA	2	6	26285	26290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187990
569	NC_016818	TGGC	2	8	26345	26352	0 %	25 %	50 %	25 %	383187990
570	NC_016818	CAC	2	6	26432	26437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187990
571	NC_016818	CACCCG	2	12	26453	26464	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	383187990
572	NC_016818	ACC	2	6	26475	26480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187990
573	NC_016818	GAC	3	9	26490	26498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187990
574	NC_016818	ACC	2	6	26571	26576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187990
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576	NC_016818	CT	3	6	26763	26768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_016818	ATT	2	6	26852	26857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187991
578	NC_016818	GCA	2	6	26862	26867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187991
579	NC_016818	GC	3	6	26937	26942	0 %	0 %	50 %	50 %	383187991
580	NC_016818	CGC	2	6	26986	26991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187991
581	NC_016818	GCA	2	6	27030	27035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187991
582	NC_016818	TAT	2	6	27037	27042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187991
583	NC_016818	TGA	2	6	27053	27058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187991
584	NC_016818	ACTT	2	8	27235	27242	25 %	50 %	0 %	25 %	383187991
585	NC_016818	CAG	2	6	27244	27249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187991
586	NC_016818	GGC	2	6	27253	27258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187991
587	NC_016818	TCTGG	2	10	27345	27354	0 %	40 %	40 %	20 %	383187991
588	NC_016818	AAG	2	6	27482	27487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187991
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590	NC_016818	CG	3	6	27576	27581	0 %	0 %	50 %	50 %	383187991
591	NC_016818	A	6	6	27731	27736	100 %	0 %	0 %	0 %	383187992
592	NC_016818	TGG	2	6	27743	27748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187992
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595	NC_016818	GCC	2	6	27868	27873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187992
596	NC_016818	GC	3	6	28100	28105	0 %	0 %	50 %	50 %	383187992
597	NC_016818	AAC	2	6	28106	28111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187992
598	NC_016818	TGC	2	6	28112	28117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
599	NC_016818	GAT	2	6	28122	28127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187992
600	NC_016818	CTG	2	6	28219	28224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
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602	NC_016818	CTG	2	6	28462	28467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
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610	NC_016818	ACCG	2	8	28816	28823	25 %	0 %	25 %	50 %	383187992
611	NC_016818	CTGG	2	8	28838	28845	0 %	25 %	50 %	25 %	383187992
612	NC_016818	CTG	2	6	28894	28899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
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616	NC_016818	GAAC	2	8	29013	29020	50 %	0 %	25 %	25 %	383187992
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749	NC_016818	AAT	2	6	34921	34926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383187997
750	NC_016818	T	7	7	35038	35044	0 %	100 %	0 %	0 %	383187998
751	NC_016818	ACG	2	6	35083	35088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187998
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