MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016818	A	6	6	214278	214283	100 %	0 %	0 %	0 %	383188164
4502	NC_016818	AGC	2	6	214306	214311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188164
4503	NC_016818	GAT	2	6	214340	214345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188164
4504	NC_016818	TTA	2	6	214350	214355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188164
4505	NC_016818	CGG	2	6	214375	214380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188164
4506	NC_016818	CTG	2	6	214478	214483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188164
4507	NC_016818	GAT	2	6	214499	214504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188164
4508	NC_016818	TCT	2	6	214536	214541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188164
4509	NC_016818	GCTG	2	8	214622	214629	0 %	25 %	50 %	25 %	383188165
4510	NC_016818	CCA	2	6	214634	214639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188165
4511	NC_016818	CGC	2	6	214700	214705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188165
4512	NC_016818	TGC	2	6	214748	214753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4513	NC_016818	CAG	2	6	214767	214772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4514	NC_016818	ATC	2	6	214803	214808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188165
4515	NC_016818	CGT	2	6	214855	214860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4516	NC_016818	CCA	2	6	214907	214912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188165
4517	NC_016818	CGGG	2	8	214921	214928	0 %	0 %	75 %	25 %	383188165
4518	NC_016818	CCG	2	6	214939	214944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188165
4519	NC_016818	CGA	2	6	215195	215200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4520	NC_016818	ATA	2	6	215235	215240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188165
4521	NC_016818	CGG	2	6	215266	215271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188165
4522	NC_016818	GGC	2	6	215357	215362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188165
4523	NC_016818	CGC	2	6	215526	215531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188165
4524	NC_016818	CGCC	2	8	215537	215544	0 %	0 %	25 %	75 %	383188165
4525	NC_016818	CGT	2	6	215555	215560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4526	NC_016818	GC	3	6	215580	215585	0 %	0 %	50 %	50 %	383188165
4527	NC_016818	GCGG	2	8	215654	215661	0 %	0 %	75 %	25 %	383188165
4528	NC_016818	TGC	2	6	215696	215701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4529	NC_016818	CAC	2	6	215718	215723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188165
4530	NC_016818	GGC	2	6	215739	215744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188165
4531	NC_016818	CGCC	2	8	215810	215817	0 %	0 %	25 %	75 %	383188165
4532	NC_016818	CGC	2	6	215878	215883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188165
4533	NC_016818	ATC	2	6	215911	215916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188165
4534	NC_016818	CGAG	2	8	215924	215931	25 %	0 %	50 %	25 %	383188165
4535	NC_016818	CCA	2	6	215957	215962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188165
4536	NC_016818	GAT	2	6	216029	216034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188165
4537	NC_016818	ACC	2	6	216046	216051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188165
4538	NC_016818	CTG	2	6	216234	216239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4539	NC_016818	TCC	2	6	216285	216290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4540	NC_016818	GC	3	6	216316	216321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_016818	TTG	2	6	216384	216389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_016818	TAA	2	6	216407	216412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_016818	CTT	2	6	216452	216457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_016818	CTG	2	6	216487	216492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188166
4545	NC_016818	TC	3	6	216539	216544	0 %	50 %	0 %	50 %	383188166
4546	NC_016818	TGA	2	6	216682	216687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188166
4547	NC_016818	A	6	6	216728	216733	100 %	0 %	0 %	0 %	383188166
4548	NC_016818	GCG	2	6	216769	216774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188166
4549	NC_016818	CTG	2	6	216783	216788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188166
4550	NC_016818	CGC	2	6	216803	216808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188166
4551	NC_016818	GC	3	6	216979	216984	0 %	0 %	50 %	50 %	383188166
4552	NC_016818	GGC	2	6	217011	217016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188166
4553	NC_016818	CAT	2	6	217037	217042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188166
4554	NC_016818	TGG	2	6	217045	217050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188166
4555	NC_016818	CTC	2	6	217062	217067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188166
4556	NC_016818	GCC	2	6	217082	217087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188166
4557	NC_016818	GGT	2	6	217088	217093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188166
4558	NC_016818	ATG	2	6	217155	217160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188166
4559	NC_016818	TCA	2	6	217201	217206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188166
4560	NC_016818	CGC	2	6	217217	217222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188166
4561	NC_016818	TTA	2	6	217290	217295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188166
4562	NC_016818	TGG	2	6	217348	217353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188166
4563	NC_016818	CGG	2	6	217387	217392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188166
4564	NC_016818	GTG	2	6	217461	217466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188166
4565	NC_016818	A	6	6	217473	217478	100 %	0 %	0 %	0 %	383188166
4566	NC_016818	AT	3	6	217596	217601	50 %	50 %	0 %	0 %	383188166
4567	NC_016818	CTG	2	6	217614	217619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188166
4568	NC_016818	GTC	2	6	217641	217646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188166
4569	NC_016818	CCA	2	6	217747	217752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188167
4570	NC_016818	GCA	2	6	217827	217832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188167
4571	NC_016818	GCG	2	6	217899	217904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188167
4572	NC_016818	TGC	2	6	217915	217920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188167
4573	NC_016818	GGC	2	6	217975	217980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188167
4574	NC_016818	CCA	2	6	218017	218022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188167
4575	NC_016818	CCGGC	2	10	218054	218063	0 %	0 %	40 %	60 %	383188167
4576	NC_016818	CTC	2	6	218217	218222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_016818	CCA	2	6	218247	218252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NC_016818	GTTG	2	8	218287	218294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_016818	AAT	2	6	218298	218303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_016818	AATGAT	2	12	218318	218329	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_016818	TAT	2	6	218330	218335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_016818	AGCC	2	8	218425	218432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_016818	T	9	9	218445	218453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_016818	TG	3	6	218517	218522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_016818	T	6	6	218623	218628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_016818	G	6	6	218807	218812	0 %	0 %	100 %	0 %	383188168
4587	NC_016818	ACA	2	6	218936	218941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188168
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4589	NC_016818	CAT	2	6	219003	219008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188168
4590	NC_016818	ATT	2	6	219043	219048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188169
4591	NC_016818	TGCA	2	8	219069	219076	25 %	25 %	25 %	25 %	383188169
4592	NC_016818	CAG	2	6	219091	219096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188169
4593	NC_016818	GCA	2	6	219102	219107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188169
4594	NC_016818	CAC	2	6	219135	219140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188169
4595	NC_016818	TGA	2	6	219182	219187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188169
4596	NC_016818	A	6	6	219187	219192	100 %	0 %	0 %	0 %	383188169
4597	NC_016818	AGC	2	6	219215	219220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188169
4598	NC_016818	GAT	2	6	219225	219230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188169
4599	NC_016818	CTT	2	6	219253	219258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188169
4600	NC_016818	ATT	2	6	219266	219271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188169
4601	NC_016818	ATG	2	6	219290	219295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188169
4602	NC_016818	TGGG	2	8	219341	219348	0 %	25 %	75 %	0 %	383188169
4603	NC_016818	TG	3	6	219360	219365	0 %	50 %	50 %	0 %	383188169
4604	NC_016818	AT	3	6	219439	219444	50 %	50 %	0 %	0 %	383188169
4605	NC_016818	A	6	6	219520	219525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_016818	T	6	6	219544	219549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_016818	CAA	2	6	219701	219706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_016818	ATA	2	6	219724	219729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_016818	CTG	2	6	219798	219803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188170
4610	NC_016818	CGG	2	6	219821	219826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188170
4611	NC_016818	GTT	2	6	219861	219866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188170
4612	NC_016818	CGG	2	6	219884	219889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188170
4613	NC_016818	GGA	2	6	220023	220028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188170
4614	NC_016818	GCG	2	6	220088	220093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188170
4615	NC_016818	ATGC	2	8	220106	220113	25 %	25 %	25 %	25 %	383188170
4616	NC_016818	AATGT	2	10	220144	220153	40 %	40 %	20 %	0 %	383188170
4617	NC_016818	GC	3	6	220181	220186	0 %	0 %	50 %	50 %	383188170
4618	NC_016818	TCC	2	6	220189	220194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188170
4619	NC_016818	GC	3	6	220230	220235	0 %	0 %	50 %	50 %	383188170
4620	NC_016818	CTGA	2	8	220251	220258	25 %	25 %	25 %	25 %	383188170
4621	NC_016818	CGG	2	6	220274	220279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188170
4622	NC_016818	CAC	2	6	220353	220358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188170
4623	NC_016818	TCAC	2	8	220378	220385	25 %	25 %	0 %	50 %	383188170
4624	NC_016818	GTGC	2	8	220390	220397	0 %	25 %	50 %	25 %	383188170
4625	NC_016818	TCA	2	6	220478	220483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188170
4626	NC_016818	ATGCCG	2	12	220592	220603	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383188170
4627	NC_016818	CG	3	6	220621	220626	0 %	0 %	50 %	50 %	383188170
4628	NC_016818	TGC	2	6	220672	220677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188170
4629	NC_016818	TGC	2	6	220732	220737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188170
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4632	NC_016818	TGATC	2	10	220853	220862	20 %	40 %	20 %	20 %	383188170
4633	NC_016818	A	6	6	220875	220880	100 %	0 %	0 %	0 %	383188170
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4636	NC_016818	GAT	2	6	221004	221009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188170
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4640	NC_016818	GGC	2	6	221294	221299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188170
4641	NC_016818	CTGA	2	8	221331	221338	25 %	25 %	25 %	25 %	383188170
4642	NC_016818	TCG	2	6	221371	221376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188170
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4645	NC_016818	GCC	2	6	221532	221537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188170
4646	NC_016818	TTC	2	6	221596	221601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188170
4647	NC_016818	CTGG	2	8	221714	221721	0 %	25 %	50 %	25 %	383188171
4648	NC_016818	ATA	2	6	221744	221749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188171
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4651	NC_016818	GACG	2	8	221771	221778	25 %	0 %	50 %	25 %	383188171
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4654	NC_016818	GGT	2	6	221854	221859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188171
4655	NC_016818	TCACT	2	10	221889	221898	20 %	40 %	0 %	40 %	383188171
4656	NC_016818	CGG	2	6	221958	221963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188171
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4662	NC_016818	TGC	2	6	222282	222287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188171
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4686	NC_016818	T	6	6	223924	223929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4687	NC_016818	GACTA	2	10	223974	223983	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4689	NC_016818	GGCT	2	8	224054	224061	0 %	25 %	50 %	25 %	383188172
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4693	NC_016818	A	6	6	224510	224515	100 %	0 %	0 %	0 %	383188172
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4698	NC_016818	T	6	6	224748	224753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4699	NC_016818	CAT	2	6	224755	224760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4725	NC_016818	CAGG	2	8	225964	225971	25 %	0 %	50 %	25 %	383188173
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4728	NC_016818	TA	3	6	226008	226013	50 %	50 %	0 %	0 %	383188173
4729	NC_016818	ATA	2	6	226041	226046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4730	NC_016818	TATT	2	8	226068	226075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4731	NC_016818	TCT	2	6	226235	226240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4732	NC_016818	TGT	2	6	226444	226449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188174
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4737	NC_016818	GGT	2	6	226575	226580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188174
4738	NC_016818	GCT	2	6	226581	226586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188174
4739	NC_016818	ATG	2	6	226666	226671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188174
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4743	NC_016818	CG	4	8	226940	226947	0 %	0 %	50 %	50 %	383188175
4744	NC_016818	GCTG	2	8	226948	226955	0 %	25 %	50 %	25 %	383188175
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4853	NC_016818	A	7	7	232715	232721	100 %	0 %	0 %	0 %	383188180
4854	NC_016818	A	6	6	232771	232776	100 %	0 %	0 %	0 %	383188180
4855	NC_016818	T	6	6	232851	232856	0 %	100 %	0 %	0 %	383188180
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4867	NC_016818	GCGGTC	2	12	233724	233735	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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4869	NC_016818	GAA	2	6	233829	233834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4870	NC_016818	GGTG	2	8	233856	233863	0 %	25 %	75 %	0 %	383188182
4871	NC_016818	CTG	2	6	233869	233874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188182
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4874	NC_016818	TCG	2	6	234155	234160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188182
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4990	NC_016818	CTG	2	6	240308	240313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188186
4991	NC_016818	GCA	2	6	240319	240324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188186
4992	NC_016818	CGGG	2	8	240426	240433	0 %	0 %	75 %	25 %	383188186
4993	NC_016818	TGAA	2	8	240444	240451	50 %	25 %	25 %	0 %	383188186
4994	NC_016818	CGG	2	6	240459	240464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188186
4995	NC_016818	GTG	2	6	240506	240511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188186
4996	NC_016818	TTA	2	6	240580	240585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188186
4997	NC_016818	ACA	3	9	240609	240617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188186
4998	NC_016818	CTGC	2	8	240679	240686	0 %	25 %	25 %	50 %	383188186
4999	NC_016818	ATGTC	2	10	240703	240712	20 %	40 %	20 %	20 %	383188186
5000	NC_016818	CGC	2	6	240774	240779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188186

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