MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 32576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20501	NC_016639	CAA	2	6	802279	802284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319479
20502	NC_016639	TTA	2	6	802375	802380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20503	NC_016639	TGA	2	6	802436	802441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20504	NC_016639	TTA	2	6	802538	802543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20505	NC_016639	TCT	2	6	802577	802582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20506	NC_016639	T	6	6	802582	802587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20507	NC_016639	T	6	6	802677	802682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20508	NC_016639	AGG	2	6	802687	802692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20509	NC_016639	CT	3	6	802741	802746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20510	NC_016639	TTC	2	6	802795	802800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20511	NC_016639	CTTT	2	8	802829	802836	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20512	NC_016639	CAAG	2	8	802839	802846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20513	NC_016639	TCTT	2	8	802847	802854	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20514	NC_016639	TATT	2	8	802886	802893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20515	NC_016639	ATTT	2	8	802896	802903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20516	NC_016639	T	7	7	802908	802914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20517	NC_016639	GCTCC	2	10	802960	802969	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20518	NC_016639	TCC	3	9	802967	802975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20519	NC_016639	GCTT	2	8	803018	803025	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20520	NC_016639	CTA	2	6	803029	803034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20521	NC_016639	GTA	2	6	803052	803057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20522	NC_016639	AGT	2	6	803195	803200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20523	NC_016639	ACT	2	6	803202	803207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20524	NC_016639	TGCT	2	8	803213	803220	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20525	NC_016639	T	6	6	803251	803256	0 %	100 %	0 %	0 %	374319480
20526	NC_016639	TCTA	2	8	803260	803267	25 %	50 %	0 %	25 %	374319480
20527	NC_016639	TCT	2	6	803276	803281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319480
20528	NC_016639	AAAG	2	8	803327	803334	75 %	0 %	25 %	0 %	374319480
20529	NC_016639	GCA	2	6	803336	803341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319480
20530	NC_016639	CGC	2	6	803388	803393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319480
20531	NC_016639	TAC	2	6	803421	803426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319480
20532	NC_016639	TGC	2	6	803458	803463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319480
20533	NC_016639	CAC	2	6	803469	803474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319480
20534	NC_016639	TTTA	2	8	803491	803498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20535	NC_016639	CTA	2	6	803619	803624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20536	NC_016639	CCT	2	6	803656	803661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20537	NC_016639	AAC	2	6	803705	803710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319481
20538	NC_016639	CTG	2	6	803755	803760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319481
20539	NC_016639	TGC	2	6	803812	803817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319481
20540	NC_016639	TATT	2	8	803844	803851	25 %	75 %	0 %	0 %	374319481
20541	NC_016639	TTA	2	6	803864	803869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319481
20542	NC_016639	TCT	2	6	803870	803875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319481
20543	NC_016639	T	6	6	803882	803887	0 %	100 %	0 %	0 %	374319481
20544	NC_016639	CTT	2	6	803892	803897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319481
20545	NC_016639	GAT	2	6	803912	803917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319481
20546	NC_016639	AAAC	2	8	804028	804035	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20547	NC_016639	CTAG	2	8	804094	804101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20548	NC_016639	T	6	6	804155	804160	0 %	100 %	0 %	0 %	374319482
20549	NC_016639	ATT	2	6	804172	804177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319482
20550	NC_016639	AAT	2	6	804222	804227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319482
20551	NC_016639	A	6	6	804231	804236	100 %	0 %	0 %	0 %	374319482
20552	NC_016639	TAT	2	6	804237	804242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319482
20553	NC_016639	TCA	2	6	804248	804253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319482
20554	NC_016639	ATA	2	6	804266	804271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319482
20555	NC_016639	ATT	2	6	804316	804321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319482
20556	NC_016639	ACTA	2	8	804322	804329	50 %	25 %	0 %	25 %	374319482
20557	NC_016639	TG	3	6	804394	804399	0 %	50 %	50 %	0 %	374319482
20558	NC_016639	CTA	2	6	804470	804475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319482
20559	NC_016639	CTT	2	6	804540	804545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319482
20560	NC_016639	AGC	2	6	804568	804573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319482
20561	NC_016639	AGA	2	6	804580	804585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319482
20562	NC_016639	GCA	2	6	804627	804632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319482
20563	NC_016639	TAAT	2	8	804786	804793	50 %	50 %	0 %	0 %	374319482
20564	NC_016639	ATC	2	6	804814	804819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319482
20565	NC_016639	AGT	2	6	804834	804839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319482
20566	NC_016639	ATT	2	6	804868	804873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319482
20567	NC_016639	ATT	2	6	804895	804900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319482
20568	NC_016639	T	7	7	804921	804927	0 %	100 %	0 %	0 %	374319482
20569	NC_016639	CAGCGT	2	12	804960	804971	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374319482
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20571	NC_016639	CTA	2	6	805008	805013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319482
20572	NC_016639	AT	3	6	805015	805020	50 %	50 %	0 %	0 %	374319482
20573	NC_016639	AT	3	6	805059	805064	50 %	50 %	0 %	0 %	374319482
20574	NC_016639	GCG	2	6	805092	805097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319482
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20577	NC_016639	TAG	2	6	805161	805166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319482
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20579	NC_016639	CTTCTA	2	12	805257	805268	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	374319482
20580	NC_016639	TGC	2	6	805329	805334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319482
20581	NC_016639	CT	3	6	805357	805362	0 %	50 %	0 %	50 %	374319482
20582	NC_016639	TGTTT	2	10	805394	805403	0 %	80 %	20 %	0 %	374319482
20583	NC_016639	TTG	2	6	805441	805446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319483
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20588	NC_016639	TTA	2	6	805606	805611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319483
20589	NC_016639	AAAT	2	8	805615	805622	75 %	25 %	0 %	0 %	374319483
20590	NC_016639	AAT	2	6	805628	805633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319483
20591	NC_016639	A	7	7	805638	805644	100 %	0 %	0 %	0 %	374319483
20592	NC_016639	ATCGTC	2	12	805689	805700	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374319483
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20594	NC_016639	TCGC	2	8	805794	805801	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20595	NC_016639	ACG	2	6	805803	805808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20596	NC_016639	TA	4	8	805833	805840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20597	NC_016639	ATTA	2	8	805872	805879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20598	NC_016639	AAT	2	6	805890	805895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20599	NC_016639	A	7	7	805960	805966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20600	NC_016639	CTTT	2	8	805972	805979	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20601	NC_016639	TA	3	6	805997	806002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20602	NC_016639	T	6	6	806050	806055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20603	NC_016639	TAA	2	6	806065	806070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20604	NC_016639	A	6	6	806079	806084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20605	NC_016639	A	8	8	806102	806109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20606	NC_016639	GCA	2	6	806121	806126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20607	NC_016639	A	6	6	806126	806131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20608	NC_016639	TAG	2	6	806226	806231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319484
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20610	NC_016639	TGC	2	6	806260	806265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319484
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20612	NC_016639	A	7	7	806416	806422	100 %	0 %	0 %	0 %	374319484
20613	NC_016639	TAA	2	6	806442	806447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319484
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20617	NC_016639	TAA	2	6	806527	806532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319484
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20624	NC_016639	TCAA	2	8	806826	806833	50 %	25 %	0 %	25 %	374319484
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