MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 32576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_016639	CTA	2	6	627959	627964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319318
16002	NC_016639	ATG	2	6	627970	627975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319318
16003	NC_016639	AGCTTA	2	12	628013	628024	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374319318
16004	NC_016639	ATA	2	6	628078	628083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319318
16005	NC_016639	A	7	7	628162	628168	100 %	0 %	0 %	0 %	374319318
16006	NC_016639	GTA	2	6	628170	628175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319318
16007	NC_016639	AT	3	6	628176	628181	50 %	50 %	0 %	0 %	374319318
16008	NC_016639	TAT	2	6	628200	628205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319318
16009	NC_016639	TAT	2	6	628242	628247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319318
16010	NC_016639	TTA	2	6	628278	628283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319318
16011	NC_016639	AT	3	6	628369	628374	50 %	50 %	0 %	0 %	374319318
16012	NC_016639	CGC	2	6	628425	628430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319318
16013	NC_016639	TGA	2	6	628473	628478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319318
16014	NC_016639	A	6	6	628482	628487	100 %	0 %	0 %	0 %	374319318
16015	NC_016639	GTTT	2	8	628527	628534	0 %	75 %	25 %	0 %	374319318
16016	NC_016639	CCTGCT	2	12	628547	628558	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374319318
16017	NC_016639	AAT	3	9	628561	628569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319318
16018	NC_016639	TAA	2	6	628581	628586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319318
16019	NC_016639	T	6	6	628592	628597	0 %	100 %	0 %	0 %	374319318
16020	NC_016639	A	7	7	628612	628618	100 %	0 %	0 %	0 %	374319318
16021	NC_016639	TTTA	2	8	628627	628634	25 %	75 %	0 %	0 %	374319318
16022	NC_016639	AT	3	6	628660	628665	50 %	50 %	0 %	0 %	374319318
16023	NC_016639	GCT	2	6	628679	628684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319318
16024	NC_016639	TTA	2	6	628701	628706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319318
16025	NC_016639	CTG	2	6	628713	628718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319318
16026	NC_016639	CCG	2	6	628781	628786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319318
16027	NC_016639	CTT	2	6	628791	628796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319318
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16029	NC_016639	ACCGG	2	10	628859	628868	20 %	0 %	40 %	40 %	374319318
16030	NC_016639	TAT	2	6	628873	628878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319318
16031	NC_016639	ACA	2	6	628880	628885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319318
16032	NC_016639	TAT	2	6	628890	628895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319318
16033	NC_016639	AAT	2	6	628947	628952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_016639	TGC	2	6	629053	629058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_016639	TCT	2	6	629069	629074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_016639	AT	3	6	629085	629090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_016639	TTTGT	2	10	629107	629116	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_016639	AAT	2	6	629126	629131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_016639	T	7	7	629136	629142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_016639	TA	3	6	629224	629229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_016639	A	6	6	629279	629284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_016639	ATC	2	6	629327	629332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_016639	TAA	2	6	629399	629404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_016639	ATTA	2	8	629410	629417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_016639	TAA	2	6	629424	629429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_016639	TAT	2	6	629468	629473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_016639	CCT	2	6	629503	629508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16048	NC_016639	T	6	6	629519	629524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_016639	TAA	2	6	629613	629618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_016639	CTG	2	6	629670	629675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_016639	GTT	2	6	629705	629710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_016639	ATCA	2	8	629775	629782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16053	NC_016639	TTCC	2	8	629856	629863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16054	NC_016639	TACAAT	2	12	629878	629889	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16055	NC_016639	T	6	6	629914	629919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_016639	CCTAT	2	10	629930	629939	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16057	NC_016639	AT	3	6	629991	629996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_016639	AATAG	2	10	630000	630009	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_016639	AAT	2	6	630027	630032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_016639	AATT	2	8	630055	630062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_016639	AGA	2	6	630092	630097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_016639	ATG	2	6	630148	630153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_016639	A	6	6	630180	630185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_016639	CA	3	6	630186	630191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16065	NC_016639	ATT	2	6	630194	630199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_016639	CTA	2	6	630200	630205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16067	NC_016639	TTG	2	6	630284	630289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_016639	TAAA	2	8	630338	630345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_016639	AAT	2	6	630371	630376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_016639	TAT	2	6	630392	630397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_016639	T	7	7	630397	630403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_016639	AT	3	6	630612	630617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_016639	ATT	2	6	630648	630653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_016639	AAG	2	6	630690	630695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_016639	AT	3	6	630736	630741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_016639	CAG	2	6	630813	630818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16077	NC_016639	GGT	2	6	630850	630855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_016639	GAA	2	6	630861	630866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_016639	TTA	2	6	630881	630886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_016639	ATG	2	6	630905	630910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_016639	ATG	2	6	630926	630931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_016639	ATTA	2	8	630934	630941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_016639	ATT	2	6	630965	630970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_016639	TATAGT	2	12	630986	630997	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_016639	A	6	6	631054	631059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16089	NC_016639	CTA	2	6	631201	631206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16091	NC_016639	TTA	2	6	631433	631438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_016639	TTA	2	6	631452	631457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_016639	TA	4	8	631514	631521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16094	NC_016639	ATGA	2	8	631569	631576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_016639	TAA	2	6	631609	631614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_016639	TAT	2	6	631632	631637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_016639	ATA	2	6	631655	631660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_016639	AATT	2	8	631686	631693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_016639	AAT	2	6	631747	631752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_016639	TA	3	6	631769	631774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_016639	T	6	6	631860	631865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_016639	AT	3	6	631910	631915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_016639	ATC	2	6	631917	631922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16104	NC_016639	A	6	6	631945	631950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_016639	AAT	2	6	631999	632004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_016639	TA	3	6	632011	632016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_016639	AAAT	2	8	632073	632080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_016639	ATGGG	2	10	632125	632134	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_016639	AAAGCT	2	12	632155	632166	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16110	NC_016639	AAT	2	6	632203	632208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_016639	AAT	2	6	632244	632249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_016639	AGG	2	6	632268	632273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_016639	TAT	2	6	632296	632301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_016639	TAA	2	6	632370	632375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_016639	GAT	2	6	632390	632395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_016639	TTCC	2	8	632433	632440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16117	NC_016639	GAA	2	6	632486	632491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_016639	TAT	2	6	632529	632534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_016639	AAT	2	6	632551	632556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_016639	GAA	2	6	632611	632616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_016639	AT	4	8	632641	632648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_016639	GAG	2	6	632692	632697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_016639	AAT	2	6	632698	632703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_016639	TG	3	6	632799	632804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_016639	GTG	2	6	632831	632836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_016639	AAT	3	9	632884	632892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_016639	ATT	2	6	632893	632898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_016639	TAT	2	6	633039	633044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319319
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