MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 32576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016639	TAC	2	6	530275	530280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319230
13502	NC_016639	AATC	2	8	530346	530353	50 %	25 %	0 %	25 %	374319230
13503	NC_016639	CAT	2	6	530355	530360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319230
13504	NC_016639	GAAT	2	8	530381	530388	50 %	25 %	25 %	0 %	374319230
13505	NC_016639	AAT	2	6	530392	530397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319231
13506	NC_016639	AAATA	2	10	530466	530475	80 %	20 %	0 %	0 %	374319231
13507	NC_016639	GTT	2	6	530497	530502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319231
13508	NC_016639	GCA	2	6	530503	530508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319231
13509	NC_016639	TAT	2	6	530544	530549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319231
13510	NC_016639	T	7	7	530558	530564	0 %	100 %	0 %	0 %	374319231
13511	NC_016639	TAA	2	6	530588	530593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319231
13512	NC_016639	TAT	2	6	530641	530646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319231
13513	NC_016639	TAA	2	6	530657	530662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319231
13514	NC_016639	TTG	2	6	530666	530671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319231
13515	NC_016639	ACTT	2	8	530816	530823	25 %	50 %	0 %	25 %	374319231
13516	NC_016639	GTA	2	6	530851	530856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319231
13517	NC_016639	CAA	2	6	530867	530872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319231
13518	NC_016639	TAT	2	6	530891	530896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319231
13519	NC_016639	AAG	2	6	530961	530966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319231
13520	NC_016639	AAG	2	6	530984	530989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319231
13521	NC_016639	TGA	2	6	531015	531020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319231
13522	NC_016639	ATT	2	6	531040	531045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319231
13523	NC_016639	ATT	2	6	531091	531096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319231
13524	NC_016639	AAT	2	6	531097	531102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319231
13525	NC_016639	A	7	7	531118	531124	100 %	0 %	0 %	0 %	374319231
13526	NC_016639	ATGGT	2	10	531190	531199	20 %	40 %	40 %	0 %	374319231
13527	NC_016639	T	6	6	531252	531257	0 %	100 %	0 %	0 %	374319231
13528	NC_016639	CTT	2	6	531260	531265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319231
13529	NC_016639	AAG	2	6	531320	531325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319231
13530	NC_016639	AGC	3	9	531330	531338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319231
13531	NC_016639	TTA	2	6	531374	531379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319231
13532	NC_016639	TA	3	6	531410	531415	50 %	50 %	0 %	0 %	374319231
13533	NC_016639	AT	3	6	531474	531479	50 %	50 %	0 %	0 %	374319231
13534	NC_016639	ATT	2	6	531505	531510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319231
13535	NC_016639	TTA	2	6	531556	531561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319231
13536	NC_016639	GAAG	2	8	531583	531590	50 %	0 %	50 %	0 %	374319231
13537	NC_016639	TAAT	2	8	531596	531603	50 %	50 %	0 %	0 %	374319231
13538	NC_016639	ATTT	2	8	531674	531681	25 %	75 %	0 %	0 %	374319231
13539	NC_016639	AGA	2	6	531732	531737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319231
13540	NC_016639	AAT	2	6	531738	531743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319231
13541	NC_016639	AGC	2	6	531747	531752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319231
13542	NC_016639	TAT	2	6	531777	531782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319231
13543	NC_016639	G	6	6	531814	531819	0 %	0 %	100 %	0 %	374319231
13544	NC_016639	GAC	2	6	531825	531830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319231
13545	NC_016639	GTCAGC	2	12	531842	531853	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374319231
13546	NC_016639	CAA	2	6	531911	531916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319231
13547	NC_016639	ATT	2	6	531991	531996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319231
13548	NC_016639	ATA	2	6	532028	532033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319231
13549	NC_016639	TAA	2	6	532119	532124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319231
13550	NC_016639	TATT	2	8	532167	532174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_016639	ATT	3	9	532176	532184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_016639	ACA	2	6	532185	532190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_016639	A	6	6	532246	532251	100 %	0 %	0 %	0 %	374319232
13554	NC_016639	T	7	7	532261	532267	0 %	100 %	0 %	0 %	374319232
13555	NC_016639	ATT	2	6	532268	532273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319232
13556	NC_016639	TCA	2	6	532285	532290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319232
13557	NC_016639	CTC	2	6	532307	532312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319232
13558	NC_016639	ATT	2	6	532372	532377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319233
13559	NC_016639	ATTT	2	8	532384	532391	25 %	75 %	0 %	0 %	374319233
13560	NC_016639	T	6	6	532425	532430	0 %	100 %	0 %	0 %	374319233
13561	NC_016639	TTA	2	6	532476	532481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319233
13562	NC_016639	T	6	6	532558	532563	0 %	100 %	0 %	0 %	374319233
13563	NC_016639	TAT	2	6	532596	532601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319233
13564	NC_016639	CTT	2	6	532665	532670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319233
13565	NC_016639	T	6	6	532675	532680	0 %	100 %	0 %	0 %	374319233
13566	NC_016639	TAT	2	6	532686	532691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319233
13567	NC_016639	TGCGT	2	10	532729	532738	0 %	40 %	40 %	20 %	374319233
13568	NC_016639	TTA	2	6	532812	532817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319233
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13570	NC_016639	AACT	2	8	532866	532873	50 %	25 %	0 %	25 %	374319233
13571	NC_016639	TAA	2	6	532917	532922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319233
13572	NC_016639	A	6	6	532950	532955	100 %	0 %	0 %	0 %	374319233
13573	NC_016639	ATT	2	6	532961	532966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319233
13574	NC_016639	TAAT	2	8	532992	532999	50 %	50 %	0 %	0 %	374319233
13575	NC_016639	T	6	6	533011	533016	0 %	100 %	0 %	0 %	374319233
13576	NC_016639	TGC	2	6	533029	533034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319233
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13578	NC_016639	ATGCT	2	10	533073	533082	20 %	40 %	20 %	20 %	374319233
13579	NC_016639	TA	3	6	533105	533110	50 %	50 %	0 %	0 %	374319233
13580	NC_016639	AAT	2	6	533140	533145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319233
13581	NC_016639	GATT	2	8	533160	533167	25 %	50 %	25 %	0 %	374319233
13582	NC_016639	CGG	2	6	533179	533184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319233
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13584	NC_016639	ATTT	2	8	533272	533279	25 %	75 %	0 %	0 %	374319233
13585	NC_016639	ATC	2	6	533286	533291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319233
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13588	NC_016639	TGC	2	6	533341	533346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319233
13589	NC_016639	AT	3	6	533374	533379	50 %	50 %	0 %	0 %	374319233
13590	NC_016639	TAA	2	6	533392	533397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319233
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13592	NC_016639	TAG	2	6	533428	533433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319233
13593	NC_016639	TAG	2	6	533437	533442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319233
13594	NC_016639	ATG	2	6	533489	533494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319233
13595	NC_016639	T	6	6	533506	533511	0 %	100 %	0 %	0 %	374319233
13596	NC_016639	TAA	2	6	533563	533568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319233
13597	NC_016639	GTA	2	6	533581	533586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319233
13598	NC_016639	TAT	2	6	533589	533594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_016639	TCATTG	2	12	533597	533608	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13600	NC_016639	ATA	2	6	533643	533648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_016639	A	7	7	533648	533654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_016639	T	6	6	533664	533669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_016639	AAT	2	6	533739	533744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319234
13604	NC_016639	TTTA	2	8	533747	533754	25 %	75 %	0 %	0 %	374319234
13605	NC_016639	TTA	2	6	533772	533777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319234
13606	NC_016639	A	7	7	533825	533831	100 %	0 %	0 %	0 %	374319234
13607	NC_016639	A	6	6	533837	533842	100 %	0 %	0 %	0 %	374319234
13608	NC_016639	CCT	2	6	533853	533858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319234
13609	NC_016639	CTT	2	6	533938	533943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319234
13610	NC_016639	A	6	6	534009	534014	100 %	0 %	0 %	0 %	374319234
13611	NC_016639	ATTA	2	8	534107	534114	50 %	50 %	0 %	0 %	374319234
13612	NC_016639	ATG	2	6	534127	534132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319234
13613	NC_016639	CTG	2	6	534133	534138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319234
13614	NC_016639	AATG	2	8	534188	534195	50 %	25 %	25 %	0 %	374319234
13615	NC_016639	GAA	2	6	534218	534223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319234
13616	NC_016639	GCA	2	6	534263	534268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319234
13617	NC_016639	AG	3	6	534310	534315	50 %	0 %	50 %	0 %	374319234
13618	NC_016639	GTA	2	6	534372	534377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319234
13619	NC_016639	ATA	2	6	534385	534390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319234
13620	NC_016639	ACT	2	6	534465	534470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319234
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