MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 32796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_016050	AT	3	6	605879	605884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_016050	TAA	3	9	605896	605904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_016050	TAA	2	6	605920	605925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_016050	AATA	2	8	605926	605933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_016050	TCA	2	6	605949	605954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273517
15507	NC_016050	AATCTT	2	12	606024	606035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	350273517
15508	NC_016050	GAT	2	6	606087	606092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273517
15509	NC_016050	TGATA	2	10	606107	606116	40 %	40 %	20 %	0 %	350273517
15510	NC_016050	AGC	2	6	606126	606131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273517
15511	NC_016050	A	6	6	606147	606152	100 %	0 %	0 %	0 %	350273517
15512	NC_016050	TAG	2	6	606157	606162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273517
15513	NC_016050	TAC	3	9	606242	606250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273517
15514	NC_016050	T	6	6	606263	606268	0 %	100 %	0 %	0 %	350273517
15515	NC_016050	GTA	2	6	606331	606336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273517
15516	NC_016050	AAAT	2	8	606337	606344	75 %	25 %	0 %	0 %	350273517
15517	NC_016050	ACTC	2	8	606378	606385	25 %	25 %	0 %	50 %	350273517
15518	NC_016050	GCAA	2	8	606398	606405	50 %	0 %	25 %	25 %	350273517
15519	NC_016050	GAG	2	6	606492	606497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350273517
15520	NC_016050	TTGT	2	8	606535	606542	0 %	75 %	25 %	0 %	350273517
15521	NC_016050	TAA	2	6	606560	606565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273517
15522	NC_016050	TAG	2	6	606604	606609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273517
15523	NC_016050	GTA	2	6	606636	606641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273517
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15525	NC_016050	TGC	2	6	606689	606694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273517
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15528	NC_016050	TGC	2	6	606752	606757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273517
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15539	NC_016050	CATC	2	8	607059	607066	25 %	25 %	0 %	50 %	350273517
15540	NC_016050	A	6	6	607081	607086	100 %	0 %	0 %	0 %	350273517
15541	NC_016050	CAGT	2	8	607185	607192	25 %	25 %	25 %	25 %	350273517
15542	NC_016050	GTAGT	2	10	607207	607216	20 %	40 %	40 %	0 %	350273517
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15550	NC_016050	GCT	2	6	607418	607423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273517
15551	NC_016050	A	7	7	607505	607511	100 %	0 %	0 %	0 %	350273517
15552	NC_016050	TAA	2	6	607580	607585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273517
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15554	NC_016050	AGT	2	6	607645	607650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_016050	CAAGC	2	10	607713	607722	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15556	NC_016050	A	6	6	607754	607759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_016050	GGGA	2	8	607799	607806	25 %	0 %	75 %	0 %	350273518
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15565	NC_016050	ATT	2	6	608039	608044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273518
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15589	NC_016050	TA	3	6	609178	609183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_016050	AAT	2	6	609201	609206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_016050	TGA	2	6	609219	609224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15594	NC_016050	A	7	7	609310	609316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_016050	ATA	2	6	609331	609336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15596	NC_016050	ATAA	2	8	609345	609352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_016050	ATTT	2	8	609418	609425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_016050	TGA	2	6	609431	609436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15600	NC_016050	AT	3	6	609480	609485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15614	NC_016050	TTTA	2	8	610024	610031	25 %	75 %	0 %	0 %	350273519
15615	NC_016050	T	6	6	610057	610062	0 %	100 %	0 %	0 %	350273519
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15618	NC_016050	ATGGTG	2	12	610109	610120	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	350273519
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15620	NC_016050	TCTAT	2	10	610195	610204	20 %	60 %	0 %	20 %	350273519
15621	NC_016050	TTAT	2	8	610220	610227	25 %	75 %	0 %	0 %	350273519
15622	NC_016050	ACT	2	6	610285	610290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273519
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15989	NC_016050	ATT	2	6	625365	625370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15990	NC_016050	TAA	2	6	625371	625376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15994	NC_016050	TAA	2	6	625655	625660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15997	NC_016050	CT	3	6	625753	625758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15998	NC_016050	ATAA	2	8	625788	625795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15999	NC_016050	TAC	2	6	625796	625801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16000	NC_016050	GTA	3	9	625846	625854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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