MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_015966	GCC	2	6	2033117	2033122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303621
48002	NC_015966	CCA	2	6	2033154	2033159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303621
48003	NC_015966	CAGC	2	8	2033179	2033186	25 %	0 %	25 %	50 %	345303621
48004	NC_015966	AGC	2	6	2033201	2033206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303621
48005	NC_015966	CAG	2	6	2033215	2033220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303621
48006	NC_015966	ATC	2	6	2033294	2033299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303621
48007	NC_015966	GC	3	6	2033310	2033315	0 %	0 %	50 %	50 %	345303621
48008	NC_015966	TCG	2	6	2033316	2033321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303621
48009	NC_015966	TCGA	2	8	2033362	2033369	25 %	25 %	25 %	25 %	345303621
48010	NC_015966	CGGC	2	8	2033374	2033381	0 %	0 %	50 %	50 %	345303621
48011	NC_015966	CAC	2	6	2033392	2033397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303621
48012	NC_015966	CCAG	2	8	2033439	2033446	25 %	0 %	25 %	50 %	345303621
48013	NC_015966	CAG	2	6	2033449	2033454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303621
48014	NC_015966	C	6	6	2033460	2033465	0 %	0 %	0 %	100 %	345303621
48015	NC_015966	CGC	2	6	2033486	2033491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303621
48016	NC_015966	CGC	2	6	2033517	2033522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303621
48017	NC_015966	GCC	2	6	2033548	2033553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303621
48018	NC_015966	CAG	2	6	2033557	2033562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303621
48019	NC_015966	CAC	2	6	2033572	2033577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303621
48020	NC_015966	CCA	2	6	2033607	2033612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303621
48021	NC_015966	TCG	2	6	2033615	2033620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303621
48022	NC_015966	GCC	2	6	2033625	2033630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303621
48023	NC_015966	CAG	2	6	2033638	2033643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303621
48024	NC_015966	CAG	2	6	2033659	2033664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303621
48025	NC_015966	GTG	2	6	2033666	2033671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303621
48026	NC_015966	CCAG	2	8	2033673	2033680	25 %	0 %	25 %	50 %	345303621
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48028	NC_015966	CGG	2	6	2033743	2033748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303621
48029	NC_015966	ATGG	2	8	2033825	2033832	25 %	25 %	50 %	0 %	345303622
48030	NC_015966	CAG	2	6	2033863	2033868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303622
48031	NC_015966	GGCCG	2	10	2033916	2033925	0 %	0 %	60 %	40 %	345303622
48032	NC_015966	TCG	2	6	2033930	2033935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303622
48033	NC_015966	GCC	2	6	2033955	2033960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303622
48034	NC_015966	CCT	2	6	2034018	2034023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303622
48035	NC_015966	TCG	2	6	2034029	2034034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303622
48036	NC_015966	CGT	2	6	2034071	2034076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303622
48037	NC_015966	TGC	2	6	2034194	2034199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303622
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48039	NC_015966	TCC	2	6	2034257	2034262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303622
48040	NC_015966	AAC	2	6	2034394	2034399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48041	NC_015966	CGGC	2	8	2034406	2034413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48042	NC_015966	GGCC	2	8	2034422	2034429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48043	NC_015966	GGC	2	6	2034487	2034492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303623
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48050	NC_015966	CGA	2	6	2034863	2034868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303623
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48053	NC_015966	CCCG	2	8	2035053	2035060	0 %	0 %	25 %	75 %	345303623
48054	NC_015966	CTA	2	6	2035075	2035080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303623
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48057	NC_015966	CAT	2	6	2035130	2035135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303623
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48066	NC_015966	CGG	2	6	2035482	2035487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303624
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48089	NC_015966	GAT	2	6	2036086	2036091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303625
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48092	NC_015966	CGA	2	6	2036132	2036137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303625
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48100	NC_015966	CAG	2	6	2036431	2036436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303625
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48102	NC_015966	CTG	2	6	2036485	2036490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303625
48103	NC_015966	CAG	3	9	2036509	2036517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303625
48104	NC_015966	CACC	2	8	2036524	2036531	25 %	0 %	0 %	75 %	345303625
48105	NC_015966	CCG	2	6	2036543	2036548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303625
48106	NC_015966	GTC	2	6	2036550	2036555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303625
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48113	NC_015966	CTGCGC	2	12	2036842	2036853	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345303626
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48115	NC_015966	CG	3	6	2036927	2036932	0 %	0 %	50 %	50 %	345303626
48116	NC_015966	GCG	2	6	2037013	2037018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303626
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48119	NC_015966	CCA	2	6	2037072	2037077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303626
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48128	NC_015966	CGATC	2	10	2037321	2037330	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48129	NC_015966	CAT	2	6	2037335	2037340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48132	NC_015966	CTG	2	6	2037405	2037410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303627
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48231	NC_015966	CAG	2	6	2041895	2041900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303631
48232	NC_015966	CAT	2	6	2041901	2041906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303631
48233	NC_015966	CTT	2	6	2041942	2041947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303631
48234	NC_015966	CCAG	2	8	2041987	2041994	25 %	0 %	25 %	50 %	345303631
48235	NC_015966	GC	3	6	2041996	2042001	0 %	0 %	50 %	50 %	345303631
48236	NC_015966	ACG	2	6	2042010	2042015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303631
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48238	NC_015966	CAC	2	6	2042069	2042074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303631
48239	NC_015966	GCCGTC	2	12	2042092	2042103	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345303631
48240	NC_015966	CG	3	6	2042124	2042129	0 %	0 %	50 %	50 %	345303631
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48242	NC_015966	CTTT	2	8	2042168	2042175	0 %	75 %	0 %	25 %	345303632
48243	NC_015966	GAT	2	6	2042185	2042190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303632
48244	NC_015966	CAG	2	6	2042200	2042205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303632
48245	NC_015966	GAC	2	6	2042263	2042268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303632
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48247	NC_015966	GCC	2	6	2042369	2042374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303632
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48250	NC_015966	GCC	2	6	2042447	2042452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303632
48251	NC_015966	CAC	3	9	2042455	2042463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303632
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48253	NC_015966	AGCG	2	8	2042516	2042523	25 %	0 %	50 %	25 %	345303632
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48283	NC_015966	CGC	2	6	2043537	2043542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303633
48284	NC_015966	GTC	2	6	2043565	2043570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303633
48285	NC_015966	GGC	2	6	2043619	2043624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303633
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48291	NC_015966	TTTG	2	8	2044164	2044171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48292	NC_015966	CGG	2	6	2044249	2044254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48293	NC_015966	CCT	2	6	2044285	2044290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48294	NC_015966	CGT	2	6	2044336	2044341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303634
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48300	NC_015966	ACT	2	6	2044532	2044537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303634
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48322	NC_015966	TCG	2	6	2045624	2045629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303634
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48330	NC_015966	GC	3	6	2045898	2045903	0 %	0 %	50 %	50 %	345303634
48331	NC_015966	ACCCCT	2	12	2045939	2045950	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	345303634
48332	NC_015966	GGC	2	6	2046048	2046053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303634
48333	NC_015966	GGC	2	6	2046070	2046075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303634
48334	NC_015966	GACGTG	2	12	2046169	2046180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345303634
48335	NC_015966	GCC	2	6	2046226	2046231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303634
48336	NC_015966	AAC	2	6	2046286	2046291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303634
48337	NC_015966	GC	3	6	2046297	2046302	0 %	0 %	50 %	50 %	345303634
48338	NC_015966	CCGG	2	8	2046304	2046311	0 %	0 %	50 %	50 %	345303634
48339	NC_015966	TCGG	2	8	2046331	2046338	0 %	25 %	50 %	25 %	345303635
48340	NC_015966	GCACGC	2	12	2046359	2046370	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303635
48341	NC_015966	GCA	2	6	2046446	2046451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303635
48342	NC_015966	GCG	2	6	2046476	2046481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303635
48343	NC_015966	GGT	2	6	2046507	2046512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303635
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48345	NC_015966	GAC	2	6	2046657	2046662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303635
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48347	NC_015966	GCG	2	6	2046695	2046700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303635
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48462	NC_015966	CGC	2	6	2051046	2051051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303640
48463	NC_015966	TTC	2	6	2051060	2051065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303640
48464	NC_015966	CAG	2	6	2051075	2051080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303640
48465	NC_015966	TTG	2	6	2051082	2051087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303640
48466	NC_015966	TCG	2	6	2051139	2051144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303640
48467	NC_015966	TAC	2	6	2051387	2051392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48468	NC_015966	GGCC	2	8	2051441	2051448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48469	NC_015966	TCG	2	6	2051559	2051564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303641
48470	NC_015966	TGA	2	6	2051616	2051621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303641
48471	NC_015966	CGT	2	6	2051641	2051646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303641
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48473	NC_015966	TTC	2	6	2051675	2051680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303641
48474	NC_015966	CACCGT	2	12	2051710	2051721	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345303641
48475	NC_015966	ACC	3	9	2051747	2051755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303641
48476	NC_015966	GGC	2	6	2051761	2051766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303641
48477	NC_015966	CCA	2	6	2051817	2051822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303641
48478	NC_015966	GC	3	6	2051904	2051909	0 %	0 %	50 %	50 %	345303641
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48481	NC_015966	GAA	2	6	2052001	2052006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303641
48482	NC_015966	TTTCGG	2	12	2052027	2052038	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345303641
48483	NC_015966	TCG	2	6	2052134	2052139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303641
48484	NC_015966	CAG	2	6	2052160	2052165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303641
48485	NC_015966	CTT	2	6	2052172	2052177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303641
48486	NC_015966	GGCG	2	8	2052228	2052235	0 %	0 %	75 %	25 %	345303641
48487	NC_015966	TCG	2	6	2052332	2052337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303641
48488	NC_015966	TCG	2	6	2052380	2052385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303641
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48490	NC_015966	CAG	2	6	2052409	2052414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303641
48491	NC_015966	GTA	2	6	2052463	2052468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303641
48492	NC_015966	CGTA	2	8	2052530	2052537	25 %	25 %	25 %	25 %	345303641
48493	NC_015966	GCAC	2	8	2052585	2052592	25 %	0 %	25 %	50 %	345303641
48494	NC_015966	CAG	2	6	2052631	2052636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303641
48495	NC_015966	GGT	2	6	2052645	2052650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303641
48496	NC_015966	CGC	2	6	2052666	2052671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303641
48497	NC_015966	CG	3	6	2052716	2052721	0 %	0 %	50 %	50 %	345303641
48498	NC_015966	GCC	2	6	2052728	2052733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303641
48499	NC_015966	TTCG	2	8	2052745	2052752	0 %	50 %	25 %	25 %	345303641
48500	NC_015966	GAA	2	6	2052754	2052759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303641

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