MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_015966	CCA	2	6	2013153	2013158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303602
47502	NC_015966	TGA	2	6	2013186	2013191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303602
47503	NC_015966	CAG	3	9	2013364	2013372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303602
47504	NC_015966	CGG	2	6	2013385	2013390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303602
47505	NC_015966	ATC	2	6	2013461	2013466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303602
47506	NC_015966	ACG	2	6	2013467	2013472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303602
47507	NC_015966	GCT	2	6	2013483	2013488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303602
47508	NC_015966	GCC	2	6	2013491	2013496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303602
47509	NC_015966	CGC	2	6	2013524	2013529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303602
47510	NC_015966	AGC	2	6	2013545	2013550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303602
47511	NC_015966	TCG	2	6	2013590	2013595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303602
47512	NC_015966	CGG	2	6	2013600	2013605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303602
47513	NC_015966	TGC	2	6	2013660	2013665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303602
47514	NC_015966	TCG	3	9	2013668	2013676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303602
47515	NC_015966	GCC	2	6	2013692	2013697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303602
47516	NC_015966	GTCG	2	8	2013708	2013715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47517	NC_015966	GCG	2	6	2013732	2013737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303603
47518	NC_015966	CG	3	6	2013736	2013741	0 %	0 %	50 %	50 %	345303603
47519	NC_015966	GC	3	6	2013749	2013754	0 %	0 %	50 %	50 %	345303603
47520	NC_015966	GCCCG	2	10	2013862	2013871	0 %	0 %	40 %	60 %	345303603
47521	NC_015966	GCG	2	6	2013883	2013888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303603
47522	NC_015966	GCC	2	6	2013915	2013920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303603
47523	NC_015966	CGG	2	6	2013921	2013926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303603
47524	NC_015966	CGG	2	6	2013934	2013939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303603
47525	NC_015966	CGG	2	6	2013970	2013975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303603
47526	NC_015966	GCC	3	9	2013993	2014001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303603
47527	NC_015966	GTC	2	6	2014010	2014015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303603
47528	NC_015966	CG	3	6	2014126	2014131	0 %	0 %	50 %	50 %	345303603
47529	NC_015966	CAG	2	6	2014139	2014144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303603
47530	NC_015966	GACC	2	8	2014149	2014156	25 %	0 %	25 %	50 %	345303603
47531	NC_015966	CAG	2	6	2014217	2014222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303603
47532	NC_015966	TGC	2	6	2014224	2014229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303603
47533	NC_015966	GCT	2	6	2014234	2014239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303603
47534	NC_015966	CTG	2	6	2014241	2014246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303603
47535	NC_015966	GTA	2	6	2014253	2014258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303603
47536	NC_015966	GAT	2	6	2014268	2014273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303603
47537	NC_015966	GCC	2	6	2014296	2014301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303603
47538	NC_015966	GCT	2	6	2014315	2014320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303603
47539	NC_015966	GGT	2	6	2014330	2014335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303603
47540	NC_015966	CCAG	2	8	2014342	2014349	25 %	0 %	25 %	50 %	345303603
47541	NC_015966	CG	3	6	2014458	2014463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47542	NC_015966	AAC	2	6	2014490	2014495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47543	NC_015966	GCT	2	6	2014597	2014602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47544	NC_015966	GAAC	2	8	2014651	2014658	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47545	NC_015966	GTC	2	6	2014700	2014705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303604
47546	NC_015966	TGC	2	6	2014709	2014714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303604
47547	NC_015966	GTG	2	6	2014753	2014758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303604
47548	NC_015966	CGC	2	6	2014779	2014784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303604
47549	NC_015966	AGGTG	2	10	2014833	2014842	20 %	20 %	60 %	0 %	345303604
47550	NC_015966	CGA	2	6	2014854	2014859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303604
47551	NC_015966	TGG	2	6	2014862	2014867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303604
47552	NC_015966	GAA	2	6	2014908	2014913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303604
47553	NC_015966	GTG	2	6	2014942	2014947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303604
47554	NC_015966	ATCGA	2	10	2014948	2014957	40 %	20 %	20 %	20 %	345303604
47555	NC_015966	GGC	2	6	2014983	2014988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303604
47556	NC_015966	AAG	2	6	2015011	2015016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303604
47557	NC_015966	ATC	2	6	2015020	2015025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303604
47558	NC_015966	GTC	2	6	2015104	2015109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303604
47559	NC_015966	ACG	2	6	2015125	2015130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303604
47560	NC_015966	CGA	2	6	2015160	2015165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303604
47561	NC_015966	GCG	2	6	2015178	2015183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303604
47562	NC_015966	C	6	6	2015237	2015242	0 %	0 %	0 %	100 %	345303604
47563	NC_015966	GCG	2	6	2015253	2015258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303604
47564	NC_015966	CG	3	6	2015263	2015268	0 %	0 %	50 %	50 %	345303604
47565	NC_015966	GCG	3	9	2015266	2015274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303604
47566	NC_015966	CAC	2	6	2015289	2015294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303604
47567	NC_015966	CGTGCC	2	12	2015367	2015378	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345303604
47568	NC_015966	GAG	2	6	2015431	2015436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303604
47569	NC_015966	GGC	2	6	2015457	2015462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303604
47570	NC_015966	TCGTC	2	10	2015507	2015516	0 %	40 %	20 %	40 %	345303604
47571	NC_015966	GCCG	2	8	2015673	2015680	0 %	0 %	50 %	50 %	345303604
47572	NC_015966	TGCC	2	8	2015727	2015734	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47573	NC_015966	CTG	2	6	2015771	2015776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47574	NC_015966	CGA	2	6	2015806	2015811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303605
47575	NC_015966	GAAG	2	8	2015866	2015873	50 %	0 %	50 %	0 %	345303605
47576	NC_015966	GTC	2	6	2015891	2015896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303605
47577	NC_015966	CGA	2	6	2015899	2015904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303605
47578	NC_015966	TGA	2	6	2015970	2015975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303605
47579	NC_015966	GTC	2	6	2015985	2015990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303605
47580	NC_015966	GCT	2	6	2016049	2016054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303605
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47583	NC_015966	ACG	2	6	2016231	2016236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303605
47584	NC_015966	TCGGC	2	10	2016240	2016249	0 %	20 %	40 %	40 %	345303605
47585	NC_015966	CG	3	6	2016254	2016259	0 %	0 %	50 %	50 %	345303605
47586	NC_015966	GGC	2	6	2016298	2016303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303605
47587	NC_015966	TGA	2	6	2016315	2016320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303605
47588	NC_015966	GCC	2	6	2016342	2016347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303605
47589	NC_015966	GGGCG	2	10	2016385	2016394	0 %	0 %	80 %	20 %	345303605
47590	NC_015966	CTG	2	6	2016428	2016433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303605
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47592	NC_015966	GCT	2	6	2016448	2016453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303605
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47594	NC_015966	CG	3	6	2016513	2016518	0 %	0 %	50 %	50 %	345303605
47595	NC_015966	GAA	2	6	2016521	2016526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303605
47596	NC_015966	GC	3	6	2016542	2016547	0 %	0 %	50 %	50 %	345303605
47597	NC_015966	GAG	2	6	2016557	2016562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303605
47598	NC_015966	CTG	2	6	2016578	2016583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303605
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47600	NC_015966	GTC	2	6	2016635	2016640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303605
47601	NC_015966	ACCG	2	8	2016818	2016825	25 %	0 %	25 %	50 %	345303605
47602	NC_015966	GTG	2	6	2016839	2016844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303605
47603	NC_015966	GGC	2	6	2016848	2016853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303605
47604	NC_015966	CGG	3	9	2016913	2016921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303605
47605	NC_015966	ACCTC	2	10	2017001	2017010	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
47606	NC_015966	GCA	2	6	2017063	2017068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303606
47607	NC_015966	ACC	2	6	2017085	2017090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303606
47608	NC_015966	ACTG	2	8	2017096	2017103	25 %	25 %	25 %	25 %	345303606
47609	NC_015966	GTC	2	6	2017130	2017135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303606
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47612	NC_015966	TGC	2	6	2017224	2017229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303606
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47616	NC_015966	GAGC	2	8	2017399	2017406	25 %	0 %	50 %	25 %	345303606
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