MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_015966	CAT	2	6	1949537	1949542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303549
46003	NC_015966	CAG	2	6	1949563	1949568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303550
46004	NC_015966	GC	3	6	1949617	1949622	0 %	0 %	50 %	50 %	345303550
46005	NC_015966	CTT	2	6	1949628	1949633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303550
46006	NC_015966	TCA	2	6	1949634	1949639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303550
46007	NC_015966	GAT	2	6	1949680	1949685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303550
46008	NC_015966	CTC	2	6	1949686	1949691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303550
46009	NC_015966	GCACG	2	10	1949694	1949703	20 %	0 %	40 %	40 %	345303550
46010	NC_015966	TCG	2	6	1949711	1949716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303550
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46012	NC_015966	GAT	2	6	1949743	1949748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303550
46013	NC_015966	CTCTTC	2	12	1949755	1949766	0 %	50 %	0 %	50 %	345303550
46014	NC_015966	TCC	2	6	1949780	1949785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303550
46015	NC_015966	CG	3	6	1949794	1949799	0 %	0 %	50 %	50 %	345303550
46016	NC_015966	CGG	2	6	1949819	1949824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303550
46017	NC_015966	GCC	2	6	1949918	1949923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303550
46018	NC_015966	TCG	2	6	1949954	1949959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303550
46019	NC_015966	CG	3	6	1949958	1949963	0 %	0 %	50 %	50 %	345303550
46020	NC_015966	GCC	2	6	1949972	1949977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303550
46021	NC_015966	TTTC	2	8	1949997	1950004	0 %	75 %	0 %	25 %	345303550
46022	NC_015966	T	7	7	1950035	1950041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46023	NC_015966	GCA	2	6	1950053	1950058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46024	NC_015966	CCG	2	6	1950069	1950074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46025	NC_015966	GCC	2	6	1950102	1950107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303551
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46027	NC_015966	GCA	2	6	1950279	1950284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303551
46028	NC_015966	CGT	2	6	1950300	1950305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303551
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46030	NC_015966	CAG	2	6	1950488	1950493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303551
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46032	NC_015966	CGCGA	2	10	1950575	1950584	20 %	0 %	40 %	40 %	345303551
46033	NC_015966	GGCGG	2	10	1950619	1950628	0 %	0 %	80 %	20 %	345303551
46034	NC_015966	GGC	2	6	1950681	1950686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303551
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46039	NC_015966	GAC	2	6	1950888	1950893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303552
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46054	NC_015966	GCCG	2	8	1951325	1951332	0 %	0 %	50 %	50 %	345303552
46055	NC_015966	CCA	2	6	1951349	1951354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303552
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46060	NC_015966	CCGGC	2	10	1951532	1951541	0 %	0 %	40 %	60 %	345303552
46061	NC_015966	CGG	3	9	1951576	1951584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303552
46062	NC_015966	CCA	2	6	1951598	1951603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303552
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46064	NC_015966	G	6	6	1951657	1951662	0 %	0 %	100 %	0 %	345303552
46065	NC_015966	TGGT	2	8	1951741	1951748	0 %	50 %	50 %	0 %	345303552
46066	NC_015966	CAG	2	6	1951752	1951757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303552
46067	NC_015966	CCA	2	6	1951769	1951774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303552
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46089	NC_015966	GC	3	6	1952656	1952661	0 %	0 %	50 %	50 %	345303553
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46101	NC_015966	GCTGAT	2	12	1952936	1952947	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345303553
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46107	NC_015966	CTG	2	6	1953068	1953073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303553
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46114	NC_015966	TCCAGC	2	12	1953594	1953605	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345303553
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46232	NC_015966	GTG	2	6	1958324	1958329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303557
46233	NC_015966	TCCAGC	2	12	1958348	1958359	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345303557
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46317	NC_015966	ACA	2	6	1962426	1962431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46322	NC_015966	TCGA	2	8	1962708	1962715	25 %	25 %	25 %	25 %	345303561
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46329	NC_015966	CG	3	6	1962993	1962998	0 %	0 %	50 %	50 %	345303561
46330	NC_015966	CTGGTT	2	12	1963028	1963039	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345303561
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46334	NC_015966	CCGG	2	8	1963142	1963149	0 %	0 %	50 %	50 %	345303561
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46336	NC_015966	CG	3	6	1963269	1963274	0 %	0 %	50 %	50 %	345303561
46337	NC_015966	GGC	2	6	1963296	1963301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303561
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46339	NC_015966	TGG	2	6	1963507	1963512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303561
46340	NC_015966	GCT	2	6	1963564	1963569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303561
46341	NC_015966	GCCA	2	8	1963582	1963589	25 %	0 %	25 %	50 %	345303561
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46343	NC_015966	ACGC	2	8	1963661	1963668	25 %	0 %	25 %	50 %	345303561
46344	NC_015966	GCCG	2	8	1963703	1963710	0 %	0 %	50 %	50 %	345303561
46345	NC_015966	AACCG	2	10	1963729	1963738	40 %	0 %	20 %	40 %	345303561
46346	NC_015966	CGAT	2	8	1963774	1963781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46347	NC_015966	ATG	2	6	1963792	1963797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46464	NC_015966	CGC	2	6	1969105	1969110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303566
46465	NC_015966	CTG	2	6	1969135	1969140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303566
46466	NC_015966	TGT	2	6	1969182	1969187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303566
46467	NC_015966	CACCAG	2	12	1969237	1969248	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345303566
46468	NC_015966	CTT	2	6	1969285	1969290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303566
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46470	NC_015966	GCA	2	6	1969341	1969346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303566
46471	NC_015966	ATC	2	6	1969361	1969366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303566
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46475	NC_015966	CAG	2	6	1969480	1969485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303566
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46480	NC_015966	TGC	2	6	1969649	1969654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303566
46481	NC_015966	CGGC	2	8	1969701	1969708	0 %	0 %	50 %	50 %	345303566
46482	NC_015966	CAG	2	6	1969744	1969749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303566
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46485	NC_015966	CAG	3	9	1969978	1969986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303566
46486	NC_015966	AGC	2	6	1970027	1970032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303566
46487	NC_015966	CAG	2	6	1970044	1970049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303566
46488	NC_015966	GCA	2	6	1970052	1970057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303566
46489	NC_015966	CGGCG	2	10	1970113	1970122	0 %	0 %	60 %	40 %	345303566
46490	NC_015966	GCC	2	6	1970180	1970185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303566
46491	NC_015966	A	6	6	1970224	1970229	100 %	0 %	0 %	0 %	345303566
46492	NC_015966	CAT	2	6	1970239	1970244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303566
46493	NC_015966	TGG	2	6	1970295	1970300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46494	NC_015966	AAT	2	6	1970339	1970344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46495	NC_015966	CGG	2	6	1970467	1970472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46496	NC_015966	CCG	2	6	1970538	1970543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46497	NC_015966	GGCA	2	8	1970630	1970637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46498	NC_015966	GCG	2	6	1970812	1970817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303567
46499	NC_015966	GCC	2	6	1970819	1970824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303567
46500	NC_015966	TGC	2	6	1970828	1970833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303567

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