MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_015966	CTG	2	6	1859740	1859745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303482
44003	NC_015966	GGC	2	6	1859823	1859828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303482
44004	NC_015966	CCGG	2	8	1859895	1859902	0 %	0 %	50 %	50 %	345303482
44005	NC_015966	GGT	2	6	1859970	1859975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303482
44006	NC_015966	AGC	2	6	1859979	1859984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303482
44007	NC_015966	CGGC	2	8	1860113	1860120	0 %	0 %	50 %	50 %	345303483
44008	NC_015966	CAGAC	2	10	1860127	1860136	40 %	0 %	20 %	40 %	345303483
44009	NC_015966	CTG	2	6	1860231	1860236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303483
44010	NC_015966	CAC	2	6	1860250	1860255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303483
44011	NC_015966	CCG	2	6	1860329	1860334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303483
44012	NC_015966	TTC	2	6	1860387	1860392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303483
44013	NC_015966	CAC	2	6	1860425	1860430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303483
44014	NC_015966	GCT	2	6	1860433	1860438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303483
44015	NC_015966	GGA	2	6	1860470	1860475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303483
44016	NC_015966	CGC	2	6	1860497	1860502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303483
44017	NC_015966	CGA	2	6	1860554	1860559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303483
44018	NC_015966	GCC	2	6	1860567	1860572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303483
44019	NC_015966	TGC	2	6	1860586	1860591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303483
44020	NC_015966	GCT	2	6	1860707	1860712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303483
44021	NC_015966	GCGT	2	8	1860781	1860788	0 %	25 %	50 %	25 %	345303483
44022	NC_015966	TCG	2	6	1860883	1860888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303483
44023	NC_015966	GCC	2	6	1860900	1860905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303483
44024	NC_015966	TCG	2	6	1860947	1860952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303484
44025	NC_015966	CCGC	2	8	1861047	1861054	0 %	0 %	25 %	75 %	345303484
44026	NC_015966	GATC	2	8	1861140	1861147	25 %	25 %	25 %	25 %	345303484
44027	NC_015966	GC	3	6	1861208	1861213	0 %	0 %	50 %	50 %	345303484
44028	NC_015966	GCG	2	6	1861227	1861232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303484
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44031	NC_015966	CGG	2	6	1861315	1861320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303484
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44033	NC_015966	AGCGC	2	10	1861419	1861428	20 %	0 %	40 %	40 %	345303484
44034	NC_015966	GGCG	2	8	1861434	1861441	0 %	0 %	75 %	25 %	345303484
44035	NC_015966	GCT	2	6	1861476	1861481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303484
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44040	NC_015966	GCGA	2	8	1861632	1861639	25 %	0 %	50 %	25 %	345303484
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44042	NC_015966	TGC	2	6	1861667	1861672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303484
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44044	NC_015966	CGGGA	2	10	1861781	1861790	20 %	0 %	60 %	20 %	345303484
44045	NC_015966	GCA	2	6	1861839	1861844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303484
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44049	NC_015966	GCC	3	9	1861907	1861915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303484
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44051	NC_015966	GCC	2	6	1862012	1862017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303484
44052	NC_015966	CAG	2	6	1862029	1862034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303484
44053	NC_015966	CGG	2	6	1862171	1862176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303484
44054	NC_015966	GCA	2	6	1862178	1862183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303484
44055	NC_015966	GCTG	2	8	1862226	1862233	0 %	25 %	50 %	25 %	345303484
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44060	NC_015966	GTA	2	6	1862506	1862511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303484
44061	NC_015966	GTG	2	6	1862537	1862542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303484
44062	NC_015966	GCTTCG	2	12	1862555	1862566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303484
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44066	NC_015966	CG	3	6	1862667	1862672	0 %	0 %	50 %	50 %	345303484
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44071	NC_015966	GTG	2	6	1862800	1862805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303484
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44077	NC_015966	GTC	2	6	1863050	1863055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303484
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44084	NC_015966	GGT	2	6	1863245	1863250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303485
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44087	NC_015966	ATGTAG	2	12	1863348	1863359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303485
44088	NC_015966	CGGC	2	8	1863361	1863368	0 %	0 %	50 %	50 %	345303485
44089	NC_015966	CGA	2	6	1863400	1863405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303485
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44098	NC_015966	CTG	3	9	1863728	1863736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303485
44099	NC_015966	GCCC	2	8	1863746	1863753	0 %	0 %	25 %	75 %	345303485
44100	NC_015966	GTC	2	6	1863812	1863817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303485
44101	NC_015966	GACC	2	8	1863931	1863938	25 %	0 %	25 %	50 %	345303485
44102	NC_015966	GAC	2	6	1863940	1863945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303485
44103	NC_015966	GC	3	6	1863980	1863985	0 %	0 %	50 %	50 %	345303485
44104	NC_015966	GTT	2	6	1864057	1864062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303485
44105	NC_015966	CTG	2	6	1864079	1864084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303485
44106	NC_015966	CGA	2	6	1864116	1864121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303485
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44110	NC_015966	CGG	2	6	1864299	1864304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303485
44111	NC_015966	GAT	2	6	1864307	1864312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303485
44112	NC_015966	TGAG	2	8	1864366	1864373	25 %	25 %	50 %	0 %	345303485
44113	NC_015966	GC	3	6	1864448	1864453	0 %	0 %	50 %	50 %	345303485
44114	NC_015966	CGTCG	2	10	1864486	1864495	0 %	20 %	40 %	40 %	345303485
44115	NC_015966	GGC	2	6	1864522	1864527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303485
44116	NC_015966	CTC	2	6	1864568	1864573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303485
44117	NC_015966	GCG	2	6	1864603	1864608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303485
44118	NC_015966	TCG	2	6	1864629	1864634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303485
44119	NC_015966	GAA	2	6	1864643	1864648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303485
44120	NC_015966	GGTA	2	8	1864672	1864679	25 %	25 %	50 %	0 %	345303485
44121	NC_015966	CGC	2	6	1864693	1864698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303485
44122	NC_015966	CGA	2	6	1864804	1864809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303485
44123	NC_015966	CCT	2	6	1864819	1864824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303485
44124	NC_015966	CAG	2	6	1864841	1864846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303485
44125	NC_015966	GCT	2	6	1864849	1864854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303485
44126	NC_015966	CTG	2	6	1864871	1864876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303485
44127	NC_015966	CGTC	2	8	1864897	1864904	0 %	25 %	25 %	50 %	345303485
44128	NC_015966	TCG	2	6	1864932	1864937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303485
44129	NC_015966	GTA	2	6	1864970	1864975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303485
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44131	NC_015966	TTC	3	9	1864991	1864999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303485
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44137	NC_015966	AGC	2	6	1865125	1865130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303485
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44139	NC_015966	TCG	2	6	1865223	1865228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303485
44140	NC_015966	GCCCG	2	10	1865257	1865266	0 %	0 %	40 %	60 %	345303485
44141	NC_015966	CGAG	2	8	1865275	1865282	25 %	0 %	50 %	25 %	345303485
44142	NC_015966	GCG	2	6	1865302	1865307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303485
44143	NC_015966	GGC	3	9	1865322	1865330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303485
44144	NC_015966	CGGG	2	8	1865343	1865350	0 %	0 %	75 %	25 %	345303485
44145	NC_015966	GTG	2	6	1865364	1865369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303485
44146	NC_015966	GGCT	2	8	1865370	1865377	0 %	25 %	50 %	25 %	345303485
44147	NC_015966	CGA	2	6	1865389	1865394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303485
44148	NC_015966	CAG	2	6	1865414	1865419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303485
44149	NC_015966	CAC	2	6	1865500	1865505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44150	NC_015966	CT	3	6	1865516	1865521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44151	NC_015966	AT	3	6	1865532	1865537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44152	NC_015966	CG	3	6	1865583	1865588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44153	NC_015966	C	6	6	1865631	1865636	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44154	NC_015966	CAG	2	6	1865645	1865650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44155	NC_015966	T	7	7	1865683	1865689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44156	NC_015966	CGG	2	6	1865737	1865742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303486
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44161	NC_015966	TGA	2	6	1865884	1865889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303486
44162	NC_015966	GCCTCG	2	12	1865916	1865927	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345303486
44163	NC_015966	CGAA	2	8	1865941	1865948	50 %	0 %	25 %	25 %	345303486
44164	NC_015966	ATC	2	6	1865949	1865954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303486
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44170	NC_015966	TGC	2	6	1866303	1866308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303486
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44179	NC_015966	GGC	2	6	1866739	1866744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303486
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44184	NC_015966	GC	3	6	1866871	1866876	0 %	0 %	50 %	50 %	345303486
44185	NC_015966	TCA	3	9	1866907	1866915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303486
44186	NC_015966	CGGC	2	8	1866949	1866956	0 %	0 %	50 %	50 %	345303486
44187	NC_015966	TTTGGT	2	12	1866960	1866971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303486
44188	NC_015966	GGTT	2	8	1866996	1867003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44189	NC_015966	GCCC	2	8	1867060	1867067	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44190	NC_015966	CT	3	6	1867092	1867097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44191	NC_015966	CTT	2	6	1867150	1867155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44192	NC_015966	GCTC	2	8	1867207	1867214	0 %	25 %	25 %	50 %	345303487
44193	NC_015966	GCC	2	6	1867260	1867265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303487
44194	NC_015966	GAA	2	6	1867286	1867291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303487
44195	NC_015966	GGGAC	2	10	1867307	1867316	20 %	0 %	60 %	20 %	345303487
44196	NC_015966	AG	3	6	1867338	1867343	50 %	0 %	50 %	0 %	345303487
44197	NC_015966	GCA	2	6	1867345	1867350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303487
44198	NC_015966	GCA	2	6	1867362	1867367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303487
44199	NC_015966	GCC	2	6	1867371	1867376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303487
44200	NC_015966	TGA	2	6	1867468	1867473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303487
44201	NC_015966	GTC	2	6	1867490	1867495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303487
44202	NC_015966	GCC	2	6	1867524	1867529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303487
44203	NC_015966	GCC	2	6	1867574	1867579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303487
44204	NC_015966	GTCGTA	2	12	1867595	1867606	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345303487
44205	NC_015966	GAT	2	6	1867613	1867618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303487
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44207	NC_015966	CGT	2	6	1867733	1867738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303487
44208	NC_015966	GTG	2	6	1867746	1867751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303487
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44211	NC_015966	A	6	6	1867820	1867825	100 %	0 %	0 %	0 %	345303487
44212	NC_015966	CGT	2	6	1867867	1867872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303487
44213	NC_015966	GATCT	2	10	1867904	1867913	20 %	40 %	20 %	20 %	345303487
44214	NC_015966	GCG	2	6	1867999	1868004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303487
44215	NC_015966	AGC	2	6	1868013	1868018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303487
44216	NC_015966	GCCAGC	2	12	1868019	1868030	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303487
44217	NC_015966	GCC	2	6	1868035	1868040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303487
44218	NC_015966	GTC	2	6	1868056	1868061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303487
44219	NC_015966	CGA	2	6	1868185	1868190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303488
44220	NC_015966	TGC	2	6	1868210	1868215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303488
44221	NC_015966	AGG	2	6	1868259	1868264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303488
44222	NC_015966	CCA	2	6	1868291	1868296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303488
44223	NC_015966	GCC	2	6	1868335	1868340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303488
44224	NC_015966	GGC	2	6	1868351	1868356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303488
44225	NC_015966	GCG	2	6	1868359	1868364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303488
44226	NC_015966	GC	3	6	1868440	1868445	0 %	0 %	50 %	50 %	345303488
44227	NC_015966	ACG	2	6	1868446	1868451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303488
44228	NC_015966	CTGG	2	8	1868505	1868512	0 %	25 %	50 %	25 %	345303488
44229	NC_015966	GCC	2	6	1868674	1868679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303488
44230	NC_015966	GCCTGG	2	12	1868735	1868746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345303488
44231	NC_015966	ACC	2	6	1868750	1868755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303488
44232	NC_015966	GCT	2	6	1868772	1868777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303488
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44235	NC_015966	CGGC	2	8	1868894	1868901	0 %	0 %	50 %	50 %	345303488
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44240	NC_015966	CTG	2	6	1869025	1869030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303489
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