MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43502	NC_015966	GCG	2	6	1838657	1838662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303466
43503	NC_015966	ACG	2	6	1838679	1838684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303466
43504	NC_015966	CG	3	6	1838722	1838727	0 %	0 %	50 %	50 %	345303466
43505	NC_015966	CCAGCC	2	12	1838740	1838751	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345303466
43506	NC_015966	CTC	2	6	1838774	1838779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303466
43507	NC_015966	GCGCC	2	10	1838782	1838791	0 %	0 %	40 %	60 %	345303466
43508	NC_015966	GCCG	2	8	1838852	1838859	0 %	0 %	50 %	50 %	345303466
43509	NC_015966	CCG	2	6	1838943	1838948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303466
43510	NC_015966	CGC	2	6	1838968	1838973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303466
43511	NC_015966	GGT	2	6	1838990	1838995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303466
43512	NC_015966	GCA	2	6	1839004	1839009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303466
43513	NC_015966	TCA	2	6	1839055	1839060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303466
43514	NC_015966	TCG	2	6	1839063	1839068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303466
43515	NC_015966	AGC	2	6	1839075	1839080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303466
43516	NC_015966	CGG	2	6	1839131	1839136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303466
43517	NC_015966	ATG	2	6	1839171	1839176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303466
43518	NC_015966	CCA	2	6	1839202	1839207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303466
43519	NC_015966	GTT	2	6	1839208	1839213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303466
43520	NC_015966	TGC	2	6	1839219	1839224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303466
43521	NC_015966	TGA	2	6	1839367	1839372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303466
43522	NC_015966	TCGA	2	8	1839456	1839463	25 %	25 %	25 %	25 %	345303466
43523	NC_015966	GC	3	6	1839514	1839519	0 %	0 %	50 %	50 %	345303466
43524	NC_015966	CGAA	2	8	1839520	1839527	50 %	0 %	25 %	25 %	345303466
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43526	NC_015966	CTGTGC	2	12	1839656	1839667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303466
43527	NC_015966	CGG	2	6	1839674	1839679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303466
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43532	NC_015966	TGGAC	2	10	1839809	1839818	20 %	20 %	40 %	20 %	345303467
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43535	NC_015966	TCG	2	6	1839958	1839963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303467
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43538	NC_015966	GGC	2	6	1840027	1840032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303467
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43540	NC_015966	GGTC	2	8	1840187	1840194	0 %	25 %	50 %	25 %	345303467
43541	NC_015966	GTGGA	2	10	1840360	1840369	20 %	20 %	60 %	0 %	345303467
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43544	NC_015966	CGA	2	6	1840406	1840411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303467
43545	NC_015966	GCG	2	6	1840412	1840417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303467
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43553	NC_015966	GCA	2	6	1840643	1840648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303467
43554	NC_015966	ACC	2	6	1840651	1840656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303467
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43557	NC_015966	GCGCCT	2	12	1840787	1840798	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345303467
43558	NC_015966	GCG	2	6	1840820	1840825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303467
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43566	NC_015966	GCCC	2	8	1840991	1840998	0 %	0 %	25 %	75 %	345303467
43567	NC_015966	TCG	2	6	1841083	1841088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303467
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43569	NC_015966	GCG	2	6	1841167	1841172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43570	NC_015966	CGA	2	6	1841213	1841218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43571	NC_015966	CGG	2	6	1841399	1841404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303468
43572	NC_015966	GAG	2	6	1841413	1841418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303468
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43588	NC_015966	GAGG	2	8	1842130	1842137	25 %	0 %	75 %	0 %	345303468
43589	NC_015966	CGT	2	6	1842222	1842227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303468
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43602	NC_015966	ACG	2	6	1842815	1842820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303468
43603	NC_015966	CG	3	6	1842908	1842913	0 %	0 %	50 %	50 %	345303468
43604	NC_015966	TGCGT	2	10	1842936	1842945	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43605	NC_015966	GTA	2	6	1842963	1842968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43606	NC_015966	TGC	2	6	1843052	1843057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43607	NC_015966	ATT	2	6	1843108	1843113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43608	NC_015966	T	6	6	1843182	1843187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43609	NC_015966	CAG	2	6	1843214	1843219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303469
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43611	NC_015966	CGG	2	6	1843299	1843304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303469
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43932	NC_015966	ACCG	2	8	1856338	1856345	25 %	0 %	25 %	50 %	345303480
43933	NC_015966	TGG	2	6	1856365	1856370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303480
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43956	NC_015966	CCGG	2	8	1857361	1857368	0 %	0 %	50 %	50 %	345303480
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43958	NC_015966	CCGG	2	8	1857509	1857516	0 %	0 %	50 %	50 %	345303480
43959	NC_015966	CGGT	2	8	1857532	1857539	0 %	25 %	50 %	25 %	345303480
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