MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42231	NC_015966	GCA	2	6	1782307	1782312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303416
42232	NC_015966	GC	5	10	1782338	1782347	0 %	0 %	50 %	50 %	345303416
42233	NC_015966	CAG	3	9	1782391	1782399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303417
42234	NC_015966	TGCT	2	8	1782497	1782504	0 %	50 %	25 %	25 %	345303417
42235	NC_015966	GCA	2	6	1782570	1782575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303417
42236	NC_015966	CAG	2	6	1782580	1782585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303417
42237	NC_015966	CGG	2	6	1782620	1782625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303417
42238	NC_015966	CTG	2	6	1782703	1782708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42239	NC_015966	GCT	2	6	1782806	1782811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42240	NC_015966	GCT	4	12	1782815	1782826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42241	NC_015966	TGG	2	6	1782846	1782851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303418
42242	NC_015966	GCT	2	6	1782881	1782886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42243	NC_015966	CTG	2	6	1782903	1782908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42244	NC_015966	GTGCTG	2	12	1782918	1782929	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345303418
42245	NC_015966	GGC	2	6	1782930	1782935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303418
42246	NC_015966	CGC	3	9	1783027	1783035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303418
42247	NC_015966	GGT	2	6	1783082	1783087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303418
42248	NC_015966	CGC	2	6	1783098	1783103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303418
42249	NC_015966	CTCCA	2	10	1783110	1783119	20 %	20 %	0 %	60 %	345303418
42250	NC_015966	GCC	2	6	1783131	1783136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303418
42251	NC_015966	C	6	6	1783135	1783140	0 %	0 %	0 %	100 %	345303418
42252	NC_015966	CTG	2	6	1783158	1783163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42253	NC_015966	GCT	2	6	1783169	1783174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42254	NC_015966	CGC	2	6	1783245	1783250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303418
42255	NC_015966	CCTG	2	8	1783399	1783406	0 %	25 %	25 %	50 %	345303418
42256	NC_015966	GCC	2	6	1783434	1783439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303418
42257	NC_015966	CGA	2	6	1783448	1783453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42258	NC_015966	TGC	2	6	1783477	1783482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42259	NC_015966	CCGCT	2	10	1783491	1783500	0 %	20 %	20 %	60 %	345303418
42260	NC_015966	ATC	2	6	1783521	1783526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303418
42261	NC_015966	CTG	2	6	1783539	1783544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42262	NC_015966	GCCT	2	8	1783627	1783634	0 %	25 %	25 %	50 %	345303418
42263	NC_015966	CA	3	6	1783691	1783696	50 %	0 %	0 %	50 %	345303418
42264	NC_015966	ACT	2	6	1783697	1783702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303418
42265	NC_015966	CAC	2	6	1783709	1783714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303418
42266	NC_015966	GGA	2	6	1783823	1783828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303418
42267	NC_015966	CTGC	2	8	1783920	1783927	0 %	25 %	25 %	50 %	345303418
42268	NC_015966	CG	3	6	1783937	1783942	0 %	0 %	50 %	50 %	345303418
42269	NC_015966	CTG	2	6	1783968	1783973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42270	NC_015966	CGC	2	6	1783990	1783995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303418
42271	NC_015966	CGA	2	6	1783997	1784002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42272	NC_015966	ACC	2	6	1784046	1784051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303418
42273	NC_015966	CGA	2	6	1784072	1784077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42274	NC_015966	ATC	2	6	1784079	1784084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303418
42275	NC_015966	TCG	2	6	1784104	1784109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303418
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42277	NC_015966	ACC	2	6	1784222	1784227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303418
42278	NC_015966	GAA	2	6	1784232	1784237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303418
42279	NC_015966	AGAA	2	8	1784320	1784327	75 %	0 %	25 %	0 %	345303418
42280	NC_015966	TGC	2	6	1784371	1784376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42281	NC_015966	GGC	2	6	1784378	1784383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303418
42282	NC_015966	GCT	2	6	1784495	1784500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42283	NC_015966	CTG	2	6	1784508	1784513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42284	NC_015966	CAG	2	6	1784568	1784573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303418
42285	NC_015966	GGGGC	2	10	1784614	1784623	0 %	0 %	80 %	20 %	345303419
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42288	NC_015966	ACG	2	6	1784837	1784842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303419
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42290	NC_015966	GCTG	2	8	1785004	1785011	0 %	25 %	50 %	25 %	345303419
42291	NC_015966	CCA	2	6	1785013	1785018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303419
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42295	NC_015966	GCA	2	6	1785172	1785177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303419
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42300	NC_015966	AGTT	2	8	1785459	1785466	25 %	50 %	25 %	0 %	345303420
42301	NC_015966	GCCC	2	8	1785472	1785479	0 %	0 %	25 %	75 %	345303420
42302	NC_015966	CCA	2	6	1785495	1785500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303420
42303	NC_015966	TGG	2	6	1785505	1785510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303420
42304	NC_015966	CTG	3	9	1785529	1785537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303420
42305	NC_015966	GCT	2	6	1785594	1785599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303420
42306	NC_015966	CTG	2	6	1785637	1785642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303420
42307	NC_015966	ACT	2	6	1785660	1785665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303420
42308	NC_015966	CGG	2	6	1785728	1785733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303420
42309	NC_015966	CTG	2	6	1785739	1785744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303420
42310	NC_015966	GCT	2	6	1785753	1785758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303420
42311	NC_015966	CGG	2	6	1785770	1785775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303420
42312	NC_015966	GGC	2	6	1785810	1785815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303420
42313	NC_015966	GCT	2	6	1785858	1785863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303420
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42315	NC_015966	CTG	3	9	1786036	1786044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303420
42316	NC_015966	CTG	2	6	1786057	1786062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303420
42317	NC_015966	CGGAGC	2	12	1786088	1786099	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345303420
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42320	NC_015966	CG	3	6	1786291	1786296	0 %	0 %	50 %	50 %	345303420
42321	NC_015966	CGG	2	6	1786309	1786314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303420
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42327	NC_015966	CCGG	2	8	1786504	1786511	0 %	0 %	50 %	50 %	345303420
42328	NC_015966	CCCG	2	8	1786543	1786550	0 %	0 %	25 %	75 %	345303420
42329	NC_015966	GAA	2	6	1786630	1786635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303420
42330	NC_015966	CTG	2	6	1786645	1786650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303420
42331	NC_015966	GTG	2	6	1786651	1786656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303420
42332	NC_015966	TGG	2	6	1786672	1786677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303420
42333	NC_015966	CG	3	6	1786713	1786718	0 %	0 %	50 %	50 %	345303420
42334	NC_015966	GC	3	6	1786722	1786727	0 %	0 %	50 %	50 %	345303420
42335	NC_015966	CGT	2	6	1786746	1786751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303420
42336	NC_015966	GCC	2	6	1786815	1786820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303420
42337	NC_015966	CGG	2	6	1786822	1786827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303420
42338	NC_015966	CGCC	2	8	1786871	1786878	0 %	0 %	25 %	75 %	345303420
42339	NC_015966	CCT	2	6	1786893	1786898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303420
42340	NC_015966	CTG	2	6	1786912	1786917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303420
42341	NC_015966	TCT	2	6	1786920	1786925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303420
42342	NC_015966	CTG	3	9	1786927	1786935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303420
42343	NC_015966	GCT	2	6	1787009	1787014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303421
42344	NC_015966	CGA	2	6	1787057	1787062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303421
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42346	NC_015966	GCC	2	6	1787133	1787138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303421
42347	NC_015966	CGA	2	6	1787213	1787218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303421
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42373	NC_015966	CGA	2	6	1788395	1788400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303423
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42459	NC_015966	T	6	6	1791929	1791934	0 %	100 %	0 %	0 %	345303427
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42462	NC_015966	CGG	2	6	1791997	1792002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303427
42463	NC_015966	CGT	2	6	1792021	1792026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303427
42464	NC_015966	GAC	2	6	1792028	1792033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303427
42465	NC_015966	GCA	2	6	1792051	1792056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303427
42466	NC_015966	AGT	2	6	1792090	1792095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303427
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42469	NC_015966	CGTT	2	8	1792263	1792270	0 %	50 %	25 %	25 %	345303427
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42482	NC_015966	GGCG	2	8	1792805	1792812	0 %	0 %	75 %	25 %	345303428
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42490	NC_015966	GGC	2	6	1793071	1793076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303428
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42492	NC_015966	CAG	3	9	1793133	1793141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303428
42493	NC_015966	CG	3	6	1793171	1793176	0 %	0 %	50 %	50 %	345303428
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42499	NC_015966	CCT	2	6	1793375	1793380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42500	NC_015966	CGC	2	6	1793411	1793416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303429

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