MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_015966	GAT	2	6	1749616	1749621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303391
41502	NC_015966	CGT	2	6	1749687	1749692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303391
41503	NC_015966	CCA	2	6	1749825	1749830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303391
41504	NC_015966	TGCG	2	8	1749831	1749838	0 %	25 %	50 %	25 %	345303391
41505	NC_015966	ACCC	2	8	1750074	1750081	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41506	NC_015966	CGA	2	6	1750100	1750105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41507	NC_015966	CGTC	2	8	1750155	1750162	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41508	NC_015966	AAC	2	6	1750202	1750207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41509	NC_015966	TCTG	2	8	1750222	1750229	0 %	50 %	25 %	25 %	345303392
41510	NC_015966	TGT	2	6	1750246	1750251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303392
41511	NC_015966	GCA	2	6	1750274	1750279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303392
41512	NC_015966	CGC	2	6	1750320	1750325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303392
41513	NC_015966	CGT	2	6	1750456	1750461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303392
41514	NC_015966	GAG	2	6	1750467	1750472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303392
41515	NC_015966	GCAACC	2	12	1750567	1750578	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345303392
41516	NC_015966	TGG	2	6	1750597	1750602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303392
41517	NC_015966	GGGT	2	8	1750630	1750637	0 %	25 %	75 %	0 %	345303392
41518	NC_015966	CGG	2	6	1750664	1750669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303392
41519	NC_015966	CGGC	2	8	1750688	1750695	0 %	0 %	50 %	50 %	345303392
41520	NC_015966	CTA	2	6	1750745	1750750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303392
41521	NC_015966	G	6	6	1750773	1750778	0 %	0 %	100 %	0 %	345303392
41522	NC_015966	ATC	2	6	1750803	1750808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303392
41523	NC_015966	CGG	2	6	1750840	1750845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303392
41524	NC_015966	CGT	2	6	1750932	1750937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303392
41525	NC_015966	CGC	2	6	1751003	1751008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303392
41526	NC_015966	CGC	2	6	1751080	1751085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303392
41527	NC_015966	GCA	2	6	1751105	1751110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303392
41528	NC_015966	CTA	2	6	1751279	1751284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303392
41529	NC_015966	CGG	2	6	1751294	1751299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303392
41530	NC_015966	CG	3	6	1751308	1751313	0 %	0 %	50 %	50 %	345303392
41531	NC_015966	CGA	2	6	1751333	1751338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303392
41532	NC_015966	CCT	2	6	1751407	1751412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303392
41533	NC_015966	CTT	2	6	1751435	1751440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303392
41534	NC_015966	CGT	2	6	1751477	1751482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303392
41535	NC_015966	CGA	2	6	1751512	1751517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303392
41536	NC_015966	CGG	2	6	1751558	1751563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303392
41537	NC_015966	TGC	2	6	1751770	1751775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303392
41538	NC_015966	CAC	2	6	1751793	1751798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303392
41539	NC_015966	CCGA	2	8	1751919	1751926	25 %	0 %	25 %	50 %	345303392
41540	NC_015966	GCC	2	6	1751962	1751967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303392
41541	NC_015966	GGC	2	6	1752013	1752018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303392
41542	NC_015966	GAC	2	6	1752027	1752032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303392
41543	NC_015966	CTG	2	6	1752063	1752068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303392
41544	NC_015966	GCC	2	6	1752146	1752151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303392
41545	NC_015966	GCC	2	6	1752185	1752190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303392
41546	NC_015966	GCCG	2	8	1752224	1752231	0 %	0 %	50 %	50 %	345303392
41547	NC_015966	TGC	2	6	1752277	1752282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303392
41548	NC_015966	TCG	2	6	1752325	1752330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303392
41549	NC_015966	GAC	2	6	1752384	1752389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303392
41550	NC_015966	CTA	2	6	1752395	1752400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303392
41551	NC_015966	CGGC	2	8	1752401	1752408	0 %	0 %	50 %	50 %	345303392
41552	NC_015966	CG	3	6	1752617	1752622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41553	NC_015966	CTC	2	6	1752627	1752632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41554	NC_015966	CGAC	2	8	1752635	1752642	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41555	NC_015966	GGGA	2	8	1752644	1752651	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41556	NC_015966	CAGC	2	8	1752697	1752704	25 %	0 %	25 %	50 %	345303393
41557	NC_015966	GGCC	2	8	1752789	1752796	0 %	0 %	50 %	50 %	345303393
41558	NC_015966	GCC	2	6	1752801	1752806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303393
41559	NC_015966	CTG	2	6	1752862	1752867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303393
41560	NC_015966	CAG	2	6	1752931	1752936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303393
41561	NC_015966	GGT	2	6	1752967	1752972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303393
41562	NC_015966	CAG	2	6	1752973	1752978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303393
41563	NC_015966	GAA	2	6	1753048	1753053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303393
41564	NC_015966	ACC	2	6	1753130	1753135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303393
41565	NC_015966	CCCG	2	8	1753141	1753148	0 %	0 %	25 %	75 %	345303393
41566	NC_015966	CCA	2	6	1753173	1753178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303393
41567	NC_015966	TAG	2	6	1753211	1753216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303393
41568	NC_015966	CCG	2	6	1753361	1753366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303393
41569	NC_015966	ATG	2	6	1753394	1753399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303393
41570	NC_015966	TGC	2	6	1753439	1753444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303393
41571	NC_015966	CGG	2	6	1753497	1753502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303393
41572	NC_015966	GCGTG	2	10	1753547	1753556	0 %	20 %	60 %	20 %	345303393
41573	NC_015966	CGT	2	6	1753584	1753589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303393
41574	NC_015966	TGT	2	6	1753626	1753631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303393
41575	NC_015966	AGT	2	6	1753800	1753805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303393
41576	NC_015966	CAG	2	6	1753813	1753818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303393
41577	NC_015966	CG	3	6	1753840	1753845	0 %	0 %	50 %	50 %	345303393
41578	NC_015966	CGG	2	6	1753897	1753902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303393
41579	NC_015966	CTG	2	6	1753903	1753908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303393
41580	NC_015966	GTGCC	2	10	1754090	1754099	0 %	20 %	40 %	40 %	345303393
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41583	NC_015966	ACG	2	6	1754140	1754145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303393
41584	NC_015966	CGC	3	9	1754183	1754191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303394
41585	NC_015966	GTG	2	6	1754229	1754234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303394
41586	NC_015966	CAG	2	6	1754343	1754348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303394
41587	NC_015966	GCT	2	6	1754459	1754464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303394
41588	NC_015966	TGA	2	6	1754597	1754602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303394
41589	NC_015966	TCCA	2	8	1754770	1754777	25 %	25 %	0 %	50 %	345303394
41590	NC_015966	CGA	2	6	1754790	1754795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303394
41591	NC_015966	CGGC	2	8	1754801	1754808	0 %	0 %	50 %	50 %	345303394
41592	NC_015966	CTC	2	6	1754835	1754840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303394
41593	NC_015966	TCG	2	6	1754995	1755000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303394
41594	NC_015966	CCT	2	6	1755029	1755034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303394
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41596	NC_015966	TTC	2	6	1755063	1755068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303394
41597	NC_015966	CCT	2	6	1755299	1755304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303394
41598	NC_015966	GTG	2	6	1755337	1755342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303394
41599	NC_015966	TCG	2	6	1755370	1755375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303394
41600	NC_015966	GTG	2	6	1755376	1755381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303394
41601	NC_015966	CGC	2	6	1755426	1755431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303394
41602	NC_015966	GTCG	2	8	1755468	1755475	0 %	25 %	50 %	25 %	345303394
41603	NC_015966	CGA	2	6	1755494	1755499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303394
41604	NC_015966	CGA	2	6	1755522	1755527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303394
41605	NC_015966	GAA	2	6	1755528	1755533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303394
41606	NC_015966	AGC	2	6	1755581	1755586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303394
41607	NC_015966	CAG	2	6	1755591	1755596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303394
41608	NC_015966	CAGT	2	8	1755602	1755609	25 %	25 %	25 %	25 %	345303394
41609	NC_015966	GTT	2	6	1755669	1755674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41610	NC_015966	GGT	2	6	1755724	1755729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303395
41611	NC_015966	GC	3	6	1755824	1755829	0 %	0 %	50 %	50 %	345303395
41612	NC_015966	CAGC	2	8	1755853	1755860	25 %	0 %	25 %	50 %	345303395
41613	NC_015966	GGA	2	6	1755900	1755905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303395
41614	NC_015966	GTT	2	6	1755946	1755951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303395
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41733	NC_015966	GCG	2	6	1761844	1761849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303399
41734	NC_015966	CCGCT	2	10	1761854	1761863	0 %	20 %	20 %	60 %	345303399
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41845	NC_015966	GCTTCC	2	12	1767135	1767146	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	345303404
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