MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

< Previous12345678910111213...153154Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2004	NC_015966	GGTCGA	2	12	84553	84564	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345301966
2005	NC_015966	TCG	2	6	84573	84578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301966
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2374	NC_015966	GGC	2	6	99971	99976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301979
2375	NC_015966	TGC	2	6	99991	99996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301979
2376	NC_015966	CGG	2	6	100007	100012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301979
2377	NC_015966	G	6	6	100028	100033	0 %	0 %	100 %	0 %	345301979
2378	NC_015966	CTG	2	6	100035	100040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301979
2379	NC_015966	CCG	2	6	100048	100053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301979
2380	NC_015966	GCC	2	6	100110	100115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301979
2381	NC_015966	CTG	2	6	100119	100124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301979
2382	NC_015966	GCCCG	2	10	100138	100147	0 %	0 %	40 %	60 %	345301979
2383	NC_015966	GCG	2	6	100169	100174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301979
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2386	NC_015966	CGA	2	6	100274	100279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301979
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2392	NC_015966	GAT	2	6	100517	100522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301979
2393	NC_015966	CCATCG	2	12	100597	100608	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345301979
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2400	NC_015966	CGA	2	6	100733	100738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301979
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2402	NC_015966	CGA	2	6	100772	100777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301979
2403	NC_015966	GGCC	2	8	100787	100794	0 %	0 %	50 %	50 %	345301979
2404	NC_015966	CTG	2	6	100836	100841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301979
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2407	NC_015966	CAAAA	2	10	101025	101034	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2408	NC_015966	A	6	6	101031	101036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2409	NC_015966	CGC	2	6	101047	101052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301980
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2425	NC_015966	AACC	2	8	101603	101610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2426	NC_015966	GGA	2	6	101613	101618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2428	NC_015966	GCT	2	6	101673	101678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2429	NC_015966	ATG	2	6	101710	101715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2430	NC_015966	GCT	2	6	101745	101750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2432	NC_015966	CCG	2	6	101888	101893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2433	NC_015966	CGG	2	6	102044	102049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2434	NC_015966	GT	3	6	102148	102153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2435	NC_015966	CAG	2	6	102228	102233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301981
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2454	NC_015966	GGCCCC	2	12	102986	102997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2455	NC_015966	GCT	2	6	103001	103006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301982
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2462	NC_015966	CGT	2	6	103164	103169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301982
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2473	NC_015966	TCCGA	2	10	103665	103674	20 %	20 %	20 %	40 %	345301982
2474	NC_015966	GTGTAG	2	12	103733	103744	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	345301982
2475	NC_015966	CAT	2	6	103771	103776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301982
2476	NC_015966	TAG	2	6	103784	103789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301982
2477	NC_015966	GATC	2	8	103860	103867	25 %	25 %	25 %	25 %	345301982
2478	NC_015966	GAT	2	6	103878	103883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301982
2479	NC_015966	CCA	2	6	103931	103936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301982
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2481	NC_015966	C	6	6	104056	104061	0 %	0 %	0 %	100 %	345301982
2482	NC_015966	ATC	2	6	104074	104079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301982
2483	NC_015966	CAG	2	6	104083	104088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301982
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2485	NC_015966	TGT	2	6	104256	104261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301982
2486	NC_015966	CGT	2	6	104277	104282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301982
2487	NC_015966	GCC	3	9	104324	104332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301982
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2490	NC_015966	CAC	2	6	104383	104388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301982
2491	NC_015966	CGCACC	2	12	104389	104400	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345301982
2492	NC_015966	TCC	2	6	104408	104413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301982
2493	NC_015966	GC	3	6	104415	104420	0 %	0 %	50 %	50 %	345301982
2494	NC_015966	CCG	2	6	104478	104483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301982
2495	NC_015966	CCA	2	6	104510	104515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301982
2496	NC_015966	TCG	2	6	104532	104537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301982
2497	NC_015966	GTGC	2	8	104577	104584	0 %	25 %	50 %	25 %	345301982
2498	NC_015966	CAC	2	6	104589	104594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301982
2499	NC_015966	CAG	2	6	104626	104631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301982
2500	NC_015966	ACC	2	6	104663	104668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301982

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