MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_015966	ACG	2	6	962974	962979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302709
23003	NC_015966	ACG	2	6	963037	963042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302709
23004	NC_015966	CCG	2	6	963104	963109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302709
23005	NC_015966	GATC	2	8	963116	963123	25 %	25 %	25 %	25 %	345302709
23006	NC_015966	GT	3	6	963155	963160	0 %	50 %	50 %	0 %	345302709
23007	NC_015966	GGC	2	6	963231	963236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302709
23008	NC_015966	GCTC	2	8	963242	963249	0 %	25 %	25 %	50 %	345302709
23009	NC_015966	CGT	2	6	963312	963317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302709
23010	NC_015966	GTG	2	6	963331	963336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302709
23011	NC_015966	TCC	2	6	963414	963419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302710
23012	NC_015966	TGA	3	9	963550	963558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302710
23013	NC_015966	GC	3	6	963576	963581	0 %	0 %	50 %	50 %	345302710
23014	NC_015966	TTG	2	6	963585	963590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302710
23015	NC_015966	CG	3	6	963605	963610	0 %	0 %	50 %	50 %	345302710
23016	NC_015966	CAG	2	6	963668	963673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302710
23017	NC_015966	CTT	2	6	963698	963703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302710
23018	NC_015966	GCT	2	6	963736	963741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302710
23019	NC_015966	CCA	2	6	963760	963765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302710
23020	NC_015966	CAG	2	6	963782	963787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302710
23021	NC_015966	TCG	2	6	963933	963938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302710
23022	NC_015966	CAG	2	6	963950	963955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302710
23023	NC_015966	CGT	2	6	963964	963969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302710
23024	NC_015966	CGGC	2	8	964005	964012	0 %	0 %	50 %	50 %	345302710
23025	NC_015966	ATG	2	6	964056	964061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302710
23026	NC_015966	TTC	2	6	964115	964120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302710
23027	NC_015966	CGTG	2	8	964125	964132	0 %	25 %	50 %	25 %	345302710
23028	NC_015966	CAG	2	6	964148	964153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302710
23029	NC_015966	ACA	2	6	964193	964198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23030	NC_015966	CAG	2	6	964240	964245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302711
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23032	NC_015966	GCT	2	6	964347	964352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302711
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23035	NC_015966	GC	3	6	964449	964454	0 %	0 %	50 %	50 %	345302711
23036	NC_015966	CAG	2	6	964468	964473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302711
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23039	NC_015966	GAT	2	6	964579	964584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302711
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23043	NC_015966	CCGA	2	8	964676	964683	25 %	0 %	25 %	50 %	345302711
23044	NC_015966	CGA	2	6	964893	964898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302711
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23052	NC_015966	AGA	2	6	965202	965207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302711
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23054	NC_015966	TCG	2	6	965303	965308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302711
23055	NC_015966	TAG	2	6	965399	965404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302711
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23058	NC_015966	CGTTG	2	10	965705	965714	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23059	NC_015966	ATG	2	6	965770	965775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23060	NC_015966	GTG	2	6	965889	965894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23061	NC_015966	CAG	2	6	965899	965904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23062	NC_015966	AGC	2	6	965912	965917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23063	NC_015966	ATC	2	6	965919	965924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23068	NC_015966	GCTGG	2	10	966070	966079	0 %	20 %	60 %	20 %	345302712
23069	NC_015966	GCAGGA	2	12	966091	966102	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345302712
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23072	NC_015966	TACCTG	2	12	966152	966163	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345302712
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23075	NC_015966	CCTGCG	2	12	966240	966251	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345302712
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23092	NC_015966	GGCC	2	8	966994	967001	0 %	0 %	50 %	50 %	345302713
23093	NC_015966	GC	3	6	967046	967051	0 %	0 %	50 %	50 %	345302713
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23101	NC_015966	AAT	2	6	967458	967463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23102	NC_015966	TGC	2	6	967491	967496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302714
23103	NC_015966	CG	3	6	967507	967512	0 %	0 %	50 %	50 %	345302714
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23105	NC_015966	TGTGG	2	10	967639	967648	0 %	40 %	60 %	0 %	345302714
23106	NC_015966	GGA	2	6	967678	967683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302714
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23109	NC_015966	GTC	2	6	967790	967795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302714
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23114	NC_015966	CGGT	2	8	967900	967907	0 %	25 %	50 %	25 %	345302714
23115	NC_015966	GCG	2	6	967934	967939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302715
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23117	NC_015966	GCC	2	6	967974	967979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302715
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23229	NC_015966	GCC	2	6	971990	971995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302719
23230	NC_015966	GCG	2	6	972016	972021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302719
23231	NC_015966	GCG	2	6	972025	972030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302719
23232	NC_015966	CCT	2	6	972100	972105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23233	NC_015966	GCC	2	6	972141	972146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23234	NC_015966	GCCGTT	2	12	972154	972165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302720
23235	NC_015966	TGG	2	6	972268	972273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302720
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23478	NC_015966	CGG	2	6	982367	982372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302731
23479	NC_015966	CG	3	6	982435	982440	0 %	0 %	50 %	50 %	345302731
23480	NC_015966	TCG	2	6	982449	982454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302731
23481	NC_015966	GGC	2	6	982496	982501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302731
23482	NC_015966	CGA	2	6	982526	982531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302731
23483	NC_015966	ACG	2	6	982540	982545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302731
23484	NC_015966	CAC	2	6	982553	982558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302731
23485	NC_015966	GTC	2	6	982593	982598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302731
23486	NC_015966	CGA	2	6	982637	982642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302731
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23491	NC_015966	CTG	2	6	983031	983036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302731
23492	NC_015966	GCG	2	6	983069	983074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302731
23493	NC_015966	TCG	2	6	983107	983112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302731
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23500	NC_015966	CAT	2	6	983309	983314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302731

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