MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_015966	CCG	2	6	899848	899853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302658
21502	NC_015966	GTC	2	6	899876	899881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302658
21503	NC_015966	CGA	2	6	899893	899898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302658
21504	NC_015966	GCC	2	6	899911	899916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302658
21505	NC_015966	CAC	2	6	899936	899941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302658
21506	NC_015966	CATCAA	2	12	899968	899979	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	345302658
21507	NC_015966	CGA	2	6	900013	900018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302658
21508	NC_015966	GAG	2	6	900044	900049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302658
21509	NC_015966	TCG	2	6	900131	900136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302658
21510	NC_015966	CGCGCA	2	12	900144	900155	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302658
21511	NC_015966	ACGCG	2	10	900176	900185	20 %	0 %	40 %	40 %	345302658
21512	NC_015966	CG	3	6	900190	900195	0 %	0 %	50 %	50 %	345302658
21513	NC_015966	GAG	2	6	900209	900214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302658
21514	NC_015966	GCG	2	6	900265	900270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302658
21515	NC_015966	TGC	2	6	900276	900281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302658
21516	NC_015966	CGTGC	2	10	900305	900314	0 %	20 %	40 %	40 %	345302658
21517	NC_015966	TGC	2	6	900387	900392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302658
21518	NC_015966	ACC	2	6	900426	900431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302658
21519	NC_015966	ACG	2	6	900432	900437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302658
21520	NC_015966	TGG	2	6	900492	900497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302659
21521	NC_015966	CAT	2	6	900541	900546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302659
21522	NC_015966	ATC	2	6	900566	900571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302659
21523	NC_015966	CGG	2	6	900651	900656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302659
21524	NC_015966	TGG	2	6	900693	900698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302659
21525	NC_015966	GC	3	6	900723	900728	0 %	0 %	50 %	50 %	345302659
21526	NC_015966	CTG	2	6	900731	900736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302659
21527	NC_015966	GCT	2	6	900823	900828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302659
21528	NC_015966	GAG	2	6	900845	900850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302659
21529	NC_015966	TGGCC	2	10	900889	900898	0 %	20 %	40 %	40 %	345302659
21530	NC_015966	GCC	2	6	900955	900960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302659
21531	NC_015966	CTGG	2	8	900970	900977	0 %	25 %	50 %	25 %	345302659
21532	NC_015966	GCT	2	6	900979	900984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302659
21533	NC_015966	GCC	2	6	900997	901002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302659
21534	NC_015966	GTC	2	6	901040	901045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302659
21535	NC_015966	TGG	2	6	901056	901061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302659
21536	NC_015966	CG	3	6	901086	901091	0 %	0 %	50 %	50 %	345302659
21537	NC_015966	GAC	2	6	901099	901104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302659
21538	NC_015966	GAG	2	6	901106	901111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302659
21539	NC_015966	GC	3	6	901238	901243	0 %	0 %	50 %	50 %	345302659
21540	NC_015966	CGGT	2	8	901266	901273	0 %	25 %	50 %	25 %	345302659
21541	NC_015966	GCGG	2	8	901276	901283	0 %	0 %	75 %	25 %	345302659
21542	NC_015966	TCG	2	6	901286	901291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302659
21543	NC_015966	TGA	2	6	901302	901307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302659
21544	NC_015966	GCT	2	6	901318	901323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302659
21545	NC_015966	TGC	2	6	901332	901337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302659
21546	NC_015966	GCT	2	6	901342	901347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302659
21547	NC_015966	TGC	2	6	901362	901367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302659
21548	NC_015966	GGC	2	6	901381	901386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302659
21549	NC_015966	GGTCCG	2	12	901415	901426	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302659
21550	NC_015966	GGT	2	6	901480	901485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302659
21551	NC_015966	CAC	2	6	901517	901522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302659
21552	NC_015966	GCGG	2	8	901556	901563	0 %	0 %	75 %	25 %	345302659
21553	NC_015966	GGT	2	6	901567	901572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302659
21554	NC_015966	CTG	2	6	901601	901606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302659
21555	NC_015966	GCGGG	2	10	901612	901621	0 %	0 %	80 %	20 %	345302659
21556	NC_015966	GCCC	2	8	901673	901680	0 %	0 %	25 %	75 %	345302659
21557	NC_015966	CAA	2	6	901690	901695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302659
21558	NC_015966	AGACG	2	10	901711	901720	40 %	0 %	40 %	20 %	345302659
21559	NC_015966	TGT	2	6	901801	901806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21560	NC_015966	GCC	2	6	901835	901840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302660
21561	NC_015966	TTTC	2	8	901865	901872	0 %	75 %	0 %	25 %	345302660
21562	NC_015966	TG	3	6	901903	901908	0 %	50 %	50 %	0 %	345302660
21563	NC_015966	GAC	2	6	902001	902006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302660
21564	NC_015966	GC	3	6	902016	902021	0 %	0 %	50 %	50 %	345302660
21565	NC_015966	A	6	6	902074	902079	100 %	0 %	0 %	0 %	345302660
21566	NC_015966	CGC	2	6	902085	902090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302660
21567	NC_015966	CAA	2	6	902097	902102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302660
21568	NC_015966	GC	3	6	902180	902185	0 %	0 %	50 %	50 %	345302660
21569	NC_015966	GACGC	2	10	902204	902213	20 %	0 %	40 %	40 %	345302660
21570	NC_015966	CTG	2	6	902223	902228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302660
21571	NC_015966	GCA	2	6	902330	902335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302660
21572	NC_015966	GCT	2	6	902366	902371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302661
21573	NC_015966	GGCG	2	8	902461	902468	0 %	0 %	75 %	25 %	345302661
21574	NC_015966	GGCCG	2	10	902515	902524	0 %	0 %	60 %	40 %	345302661
21575	NC_015966	CGG	2	6	902545	902550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302661
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21579	NC_015966	GGC	2	6	902709	902714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302661
21580	NC_015966	GCC	2	6	902773	902778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302661
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21582	NC_015966	CGG	2	6	902803	902808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302661
21583	NC_015966	CAC	2	6	902827	902832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302661
21584	NC_015966	CAC	2	6	902884	902889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302661
21585	NC_015966	GCA	2	6	902904	902909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302661
21586	NC_015966	TCCT	2	8	902911	902918	0 %	50 %	0 %	50 %	345302661
21587	NC_015966	GCC	3	9	902925	902933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302661
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21590	NC_015966	TTG	2	6	903095	903100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302661
21591	NC_015966	AGAA	2	8	903101	903108	75 %	0 %	25 %	0 %	345302661
21592	NC_015966	CG	3	6	903344	903349	0 %	0 %	50 %	50 %	345302662
21593	NC_015966	GGCT	2	8	903352	903359	0 %	25 %	50 %	25 %	345302662
21594	NC_015966	GGC	2	6	903393	903398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302662
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21599	NC_015966	T	6	6	903634	903639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21600	NC_015966	CGG	2	6	903706	903711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21601	NC_015966	TC	3	6	903796	903801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21602	NC_015966	TCG	2	6	903859	903864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302663
21603	NC_015966	GGCC	2	8	903867	903874	0 %	0 %	50 %	50 %	345302663
21604	NC_015966	CAGG	2	8	904014	904021	25 %	0 %	50 %	25 %	345302663
21605	NC_015966	ACA	2	6	904041	904046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302663
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21607	NC_015966	TTTCC	2	10	904107	904116	0 %	60 %	0 %	40 %	345302663
21608	NC_015966	GCG	2	6	904148	904153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302663
21609	NC_015966	GC	3	6	904209	904214	0 %	0 %	50 %	50 %	345302663
21610	NC_015966	CAG	2	6	904216	904221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302663
21611	NC_015966	GCC	2	6	904254	904259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302663
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21616	NC_015966	GCG	2	6	904467	904472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302663
21617	NC_015966	AGCG	2	8	904506	904513	25 %	0 %	50 %	25 %	345302663
21618	NC_015966	GCC	2	6	904521	904526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302663
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21987	NC_015966	CGG	2	6	921016	921021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302674
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