MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_015966	CGC	2	6	877227	877232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302647
21003	NC_015966	GCC	2	6	877271	877276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302647
21004	NC_015966	CGG	3	9	877363	877371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302647
21005	NC_015966	CACC	2	8	877381	877388	25 %	0 %	0 %	75 %	345302647
21006	NC_015966	GAA	2	6	877433	877438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302647
21007	NC_015966	A	6	6	877443	877448	100 %	0 %	0 %	0 %	345302647
21008	NC_015966	CGGC	2	8	877449	877456	0 %	0 %	50 %	50 %	345302647
21009	NC_015966	AGCC	2	8	877516	877523	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21010	NC_015966	TCC	2	6	877593	877598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21012	NC_015966	CGGCC	2	10	877749	877758	0 %	0 %	40 %	60 %	345302648
21013	NC_015966	GTC	2	6	877779	877784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302648
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21020	NC_015966	CTG	2	6	878091	878096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302648
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21022	NC_015966	GCG	2	6	878197	878202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302648
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21053	NC_015966	TGG	2	6	879400	879405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302648
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21088	NC_015966	AG	3	6	881345	881350	50 %	0 %	50 %	0 %	345302649
21089	NC_015966	ACA	2	6	881369	881374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302649
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21121	NC_015966	CAG	2	6	883025	883030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302650
21122	NC_015966	ACC	2	6	883179	883184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302650
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21221	NC_015966	ACG	2	6	888424	888429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302652
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21225	NC_015966	CAGC	2	8	888581	888588	25 %	0 %	25 %	50 %	345302652
21226	NC_015966	GC	3	6	888613	888618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21227	NC_015966	T	10	10	888663	888672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21228	NC_015966	TTG	2	6	888720	888725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21229	NC_015966	CTG	2	6	888762	888767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302653
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21231	NC_015966	GC	4	8	888803	888810	0 %	0 %	50 %	50 %	345302653
21232	NC_015966	CTG	2	6	888852	888857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302653
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21234	NC_015966	TCGG	2	8	888893	888900	0 %	25 %	50 %	25 %	345302653
21235	NC_015966	CG	3	6	888935	888940	0 %	0 %	50 %	50 %	345302653
21236	NC_015966	GTGC	2	8	888945	888952	0 %	25 %	50 %	25 %	345302653
21237	NC_015966	GGC	2	6	888967	888972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302653
21238	NC_015966	TGC	2	6	889057	889062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302653
21239	NC_015966	CGC	2	6	889084	889089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302653
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21241	NC_015966	AGA	2	6	889144	889149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302653
21242	NC_015966	TGC	2	6	889150	889155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302653
21243	NC_015966	GCA	2	6	889208	889213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302653
21244	NC_015966	GCA	2	6	889223	889228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302653
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21252	NC_015966	TGG	2	6	889426	889431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302653
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21260	NC_015966	CTG	2	6	890073	890078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21267	NC_015966	GACG	3	12	890361	890372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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21271	NC_015966	GGA	2	6	890411	890416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21273	NC_015966	GGA	2	6	890486	890491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21283	NC_015966	TGA	2	6	890932	890937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21362	NC_015966	ACC	2	6	894560	894565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302654
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21365	NC_015966	GGA	2	6	894712	894717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21488	NC_015966	CGC	3	9	899377	899385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302657
21489	NC_015966	CGG	2	6	899406	899411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302657
21490	NC_015966	CTG	3	9	899435	899443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302657
21491	NC_015966	GTG	2	6	899510	899515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302657
21492	NC_015966	CTG	2	6	899573	899578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302657
21493	NC_015966	CTG	3	9	899585	899593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302657
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21500	NC_015966	TCG	2	6	899835	899840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302658

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