MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20502	NC_015966	TGC	2	6	855522	855527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302628
20503	NC_015966	GAA	2	6	855545	855550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302628
20504	NC_015966	GAA	2	6	855706	855711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302629
20505	NC_015966	CGA	2	6	855717	855722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302629
20506	NC_015966	CCG	2	6	855727	855732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302629
20507	NC_015966	CGA	2	6	855771	855776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302629
20508	NC_015966	GCT	2	6	855780	855785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302629
20509	NC_015966	GTG	2	6	855826	855831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302629
20510	NC_015966	TACCTG	2	12	855847	855858	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345302629
20511	NC_015966	GCGG	2	8	855896	855903	0 %	0 %	75 %	25 %	345302629
20512	NC_015966	CGA	2	6	855918	855923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302629
20513	NC_015966	CCCA	2	8	855994	856001	25 %	0 %	0 %	75 %	345302629
20514	NC_015966	GTGC	2	8	856002	856009	0 %	25 %	50 %	25 %	345302629
20515	NC_015966	GGC	2	6	856020	856025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302629
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20517	NC_015966	T	6	6	856066	856071	0 %	100 %	0 %	0 %	345302629
20518	NC_015966	CG	3	6	856095	856100	0 %	0 %	50 %	50 %	345302629
20519	NC_015966	GCT	2	6	856137	856142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302629
20520	NC_015966	GCC	2	6	856216	856221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302629
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20524	NC_015966	GCC	2	6	856371	856376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302629
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20552	NC_015966	GAT	2	6	857544	857549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302629
20553	NC_015966	AGG	2	6	857552	857557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302629
20554	NC_015966	T	6	6	857615	857620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20555	NC_015966	ACGC	2	8	857679	857686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20556	NC_015966	GGC	2	6	857745	857750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302630
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20562	NC_015966	GGC	2	6	857965	857970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302630
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20583	NC_015966	GTGGG	2	10	858895	858904	0 %	20 %	80 %	0 %	345302630
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20589	NC_015966	AACC	2	8	859176	859183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20590	NC_015966	T	6	6	859237	859242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20591	NC_015966	CTG	2	6	859245	859250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20608	NC_015966	GCT	2	6	859844	859849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302631
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20615	NC_015966	CGGC	2	8	860206	860213	0 %	0 %	50 %	50 %	345302631
20616	NC_015966	GGA	2	6	860225	860230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302631
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20619	NC_015966	CGA	2	6	860303	860308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302631
20620	NC_015966	AC	3	6	860309	860314	50 %	0 %	0 %	50 %	345302631
20621	NC_015966	GCT	2	6	860357	860362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302631
20622	NC_015966	CGG	2	6	860405	860410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302631
20623	NC_015966	CGA	2	6	860450	860455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302631
20624	NC_015966	ACC	2	6	860500	860505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302631
20625	NC_015966	GCT	2	6	860581	860586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302632
20626	NC_015966	GGT	2	6	860587	860592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302632
20627	NC_015966	GTT	2	6	860604	860609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302632
20628	NC_015966	GCA	2	6	860722	860727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302632
20629	NC_015966	TTTTC	2	10	860735	860744	0 %	80 %	0 %	20 %	345302632
20630	NC_015966	CAG	2	6	860755	860760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302632
20631	NC_015966	GGC	2	6	860815	860820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302632
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20634	NC_015966	CTA	2	6	861066	861071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302633
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20639	NC_015966	CGA	2	6	861263	861268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302633
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20642	NC_015966	CAC	2	6	861411	861416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302633
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20646	NC_015966	GCCGC	2	10	861753	861762	0 %	0 %	40 %	60 %	345302633
20647	NC_015966	GCCCG	2	10	861802	861811	0 %	0 %	40 %	60 %	345302633
20648	NC_015966	GCG	2	6	861846	861851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302633
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20651	NC_015966	GAC	2	6	861904	861909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302633
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20654	NC_015966	ACC	2	6	861967	861972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302633
20655	NC_015966	TGC	2	6	862112	862117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302633
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20658	NC_015966	GC	3	6	862204	862209	0 %	0 %	50 %	50 %	345302633
20659	NC_015966	TCGCC	2	10	862226	862235	0 %	20 %	20 %	60 %	345302633
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20663	NC_015966	TGA	2	6	862373	862378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302633
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20667	NC_015966	CGC	2	6	862516	862521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302634
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20672	NC_015966	TGG	3	9	862722	862730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302634
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20682	NC_015966	CGAG	2	8	863023	863030	25 %	0 %	50 %	25 %	345302634
20683	NC_015966	GTG	2	6	863049	863054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302634
20684	NC_015966	TCG	3	9	863076	863084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302634
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20686	NC_015966	CGTG	2	8	863134	863141	0 %	25 %	50 %	25 %	345302634
20687	NC_015966	GCTG	2	8	863146	863153	0 %	25 %	50 %	25 %	345302634
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20698	NC_015966	CTG	2	6	863849	863854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302634
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20701	NC_015966	GCGAA	2	10	863958	863967	40 %	0 %	40 %	20 %	345302634
20702	NC_015966	GCC	3	9	863978	863986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302634
20703	NC_015966	CAC	2	6	864011	864016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302634
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20706	NC_015966	CAG	2	6	864182	864187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302634
20707	NC_015966	ACCAGC	2	12	864202	864213	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345302634
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20709	NC_015966	A	6	6	864406	864411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20710	NC_015966	CTG	2	6	864481	864486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302635
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20718	NC_015966	GCCG	2	8	864892	864899	0 %	0 %	50 %	50 %	345302636
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20722	NC_015966	T	6	6	865066	865071	0 %	100 %	0 %	0 %	345302636
20723	NC_015966	GCA	2	6	865149	865154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302636
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20729	NC_015966	GGGA	2	8	865672	865679	25 %	0 %	75 %	0 %	345302636
20730	NC_015966	TG	3	6	865751	865756	0 %	50 %	50 %	0 %	345302636
20731	NC_015966	CGGC	2	8	865827	865834	0 %	0 %	50 %	50 %	345302636
20732	NC_015966	CAGC	2	8	865843	865850	25 %	0 %	25 %	50 %	345302636
20733	NC_015966	GAT	2	6	865852	865857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302636
20734	NC_015966	AAGC	2	8	865867	865874	50 %	0 %	25 %	25 %	345302636
20735	NC_015966	GATCA	2	10	865917	865926	40 %	20 %	20 %	20 %	345302637
20736	NC_015966	TGG	2	6	865954	865959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302637
20737	NC_015966	TCG	2	6	866017	866022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302637
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