MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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20120	NC_015966	GGT	3	9	839780	839788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302612
20121	NC_015966	CTG	2	6	839804	839809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612
20122	NC_015966	CGGC	2	8	839810	839817	0 %	0 %	50 %	50 %	345302612
20123	NC_015966	GCA	3	9	839849	839857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302612
20124	NC_015966	CGAGC	2	10	839921	839930	20 %	0 %	40 %	40 %	345302612
20125	NC_015966	GCT	2	6	839954	839959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612
20126	NC_015966	GCT	2	6	839963	839968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612
20127	NC_015966	CGCGGG	2	12	839980	839991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302612
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20129	NC_015966	CGA	2	6	840041	840046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302612
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20134	NC_015966	CG	3	6	840143	840148	0 %	0 %	50 %	50 %	345302612
20135	NC_015966	GCT	2	6	840193	840198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612
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20138	NC_015966	GCGG	2	8	840284	840291	0 %	0 %	75 %	25 %	345302612
20139	NC_015966	CGA	2	6	840293	840298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302612
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20142	NC_015966	ACG	2	6	840351	840356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302612
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20144	NC_015966	CGG	2	6	840376	840381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302612
20145	NC_015966	TTC	2	6	840448	840453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20146	NC_015966	CAA	2	6	840471	840476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20147	NC_015966	TCC	2	6	840479	840484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20148	NC_015966	AGA	2	6	840548	840553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302613
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20167	NC_015966	CCAGG	2	10	841508	841517	20 %	0 %	40 %	40 %	345302613
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20179	NC_015966	CAA	2	6	841913	841918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302613
20180	NC_015966	AAAG	2	8	841973	841980	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20181	NC_015966	T	6	6	842010	842015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20182	NC_015966	AGC	2	6	842023	842028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20183	NC_015966	CGGA	2	8	842033	842040	25 %	0 %	50 %	25 %	345302614
20184	NC_015966	GCG	2	6	842064	842069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302614
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20187	NC_015966	GCA	2	6	842217	842222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302614
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20192	NC_015966	CTG	2	6	842437	842442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302614
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20227	NC_015966	CAG	2	6	843820	843825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302614
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20229	NC_015966	TGG	2	6	843861	843866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20230	NC_015966	GCG	3	9	844069	844077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302615
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20233	NC_015966	GCT	2	6	844120	844125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302615
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20236	NC_015966	CCGGT	2	10	844182	844191	0 %	20 %	40 %	40 %	345302615
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20363	NC_015966	A	6	6	850071	850076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20477	NC_015966	CGA	2	6	854545	854550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302628
20478	NC_015966	TGA	2	6	854571	854576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302628
20479	NC_015966	TCG	2	6	854577	854582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302628
20480	NC_015966	CTG	2	6	854585	854590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302628
20481	NC_015966	CTG	2	6	854608	854613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302628
20482	NC_015966	GACGG	2	10	854692	854701	20 %	0 %	60 %	20 %	345302628
20483	NC_015966	GCA	2	6	854788	854793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302628
20484	NC_015966	G	6	6	854820	854825	0 %	0 %	100 %	0 %	345302628
20485	NC_015966	GAG	2	6	854972	854977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302628
20486	NC_015966	GCTG	2	8	854979	854986	0 %	25 %	50 %	25 %	345302628
20487	NC_015966	GCGG	2	8	855001	855008	0 %	0 %	75 %	25 %	345302628
20488	NC_015966	CCG	2	6	855009	855014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302628
20489	NC_015966	GCT	2	6	855064	855069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302628
20490	NC_015966	CCG	2	6	855099	855104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302628
20491	NC_015966	ACC	2	6	855233	855238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302628
20492	NC_015966	GCCGGA	2	12	855250	855261	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345302628
20493	NC_015966	GGC	2	6	855270	855275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302628
20494	NC_015966	TG	3	6	855278	855283	0 %	50 %	50 %	0 %	345302628
20495	NC_015966	GAC	2	6	855328	855333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302628
20496	NC_015966	CG	3	6	855338	855343	0 %	0 %	50 %	50 %	345302628
20497	NC_015966	GGC	2	6	855352	855357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302628
20498	NC_015966	GCAGGC	2	12	855364	855375	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345302628
20499	NC_015966	GGC	2	6	855462	855467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302628
20500	NC_015966	CGC	2	6	855474	855479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302628

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