MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_015966	CCT	2	6	813141	813146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302589
19503	NC_015966	CGT	2	6	813169	813174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302589
19504	NC_015966	TTC	2	6	813199	813204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302589
19505	NC_015966	GCC	2	6	813226	813231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302589
19506	NC_015966	CTT	2	6	813280	813285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302589
19507	NC_015966	GTA	2	6	813292	813297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302589
19508	NC_015966	TCG	2	6	813350	813355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302589
19509	NC_015966	CGG	2	6	813376	813381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302589
19510	NC_015966	GCCA	2	8	813404	813411	25 %	0 %	25 %	50 %	345302589
19511	NC_015966	TCA	2	6	813420	813425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302589
19512	NC_015966	GCCG	2	8	813430	813437	0 %	0 %	50 %	50 %	345302589
19513	NC_015966	TCC	2	6	813482	813487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302589
19514	NC_015966	GAA	2	6	813490	813495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302589
19515	NC_015966	T	6	6	813553	813558	0 %	100 %	0 %	0 %	345302589
19516	NC_015966	CAT	2	6	813668	813673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302590
19517	NC_015966	GAT	2	6	813749	813754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302590
19518	NC_015966	GGGC	2	8	813812	813819	0 %	0 %	75 %	25 %	345302590
19519	NC_015966	GTA	2	6	813869	813874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302590
19520	NC_015966	CCT	3	9	813877	813885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302590
19521	NC_015966	GAT	2	6	813956	813961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302590
19522	NC_015966	TCC	2	6	813981	813986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302590
19523	NC_015966	TCG	2	6	814050	814055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302590
19524	NC_015966	GCG	2	6	814076	814081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302590
19525	NC_015966	CGC	2	6	814096	814101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302590
19526	NC_015966	CTT	2	6	814141	814146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302590
19527	NC_015966	CGG	2	6	814147	814152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302590
19528	NC_015966	TTG	2	6	814191	814196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302590
19529	NC_015966	TGA	2	6	814201	814206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302590
19530	NC_015966	TTC	2	6	814226	814231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302590
19531	NC_015966	TTC	2	6	814238	814243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302590
19532	NC_015966	GCG	2	6	814250	814255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302590
19533	NC_015966	CGC	2	6	814294	814299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302590
19534	NC_015966	TCG	2	6	814341	814346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302590
19535	NC_015966	CCAG	2	8	814426	814433	25 %	0 %	25 %	50 %	345302590
19536	NC_015966	GTT	2	6	814544	814549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302590
19537	NC_015966	CGGT	2	8	814575	814582	0 %	25 %	50 %	25 %	345302590
19538	NC_015966	GT	3	6	814712	814717	0 %	50 %	50 %	0 %	345302590
19539	NC_015966	ATC	2	6	814746	814751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302590
19540	NC_015966	CGC	2	6	814780	814785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302590
19541	NC_015966	CCAG	2	8	814807	814814	25 %	0 %	25 %	50 %	345302590
19542	NC_015966	CTC	2	6	814967	814972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302591
19543	NC_015966	CGG	3	9	814979	814987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302591
19544	NC_015966	C	6	6	815031	815036	0 %	0 %	0 %	100 %	345302591
19545	NC_015966	GGC	2	6	815046	815051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302591
19546	NC_015966	CAG	2	6	815075	815080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302591
19547	NC_015966	GCGGA	2	10	815093	815102	20 %	0 %	60 %	20 %	345302591
19548	NC_015966	TCC	2	6	815115	815120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302591
19549	NC_015966	CCG	2	6	815132	815137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302591
19550	NC_015966	GCC	2	6	815202	815207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302591
19551	NC_015966	GACG	2	8	815213	815220	25 %	0 %	50 %	25 %	345302591
19552	NC_015966	CAC	2	6	815231	815236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302591
19553	NC_015966	TCC	2	6	815244	815249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302591
19554	NC_015966	GCG	2	6	815279	815284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302591
19555	NC_015966	TCG	2	6	815325	815330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302591
19556	NC_015966	GCC	2	6	815345	815350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302591
19557	NC_015966	CTT	2	6	815380	815385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302591
19558	NC_015966	CGA	2	6	815404	815409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302591
19559	NC_015966	CTT	2	6	815458	815463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302591
19560	NC_015966	CCA	2	6	815497	815502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302591
19561	NC_015966	GGT	2	6	815516	815521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302591
19562	NC_015966	CGTT	2	8	815607	815614	0 %	50 %	25 %	25 %	345302591
19563	NC_015966	GGCG	2	8	815718	815725	0 %	0 %	75 %	25 %	345302592
19564	NC_015966	TCT	2	6	815777	815782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302592
19565	NC_015966	GGGC	2	8	815823	815830	0 %	0 %	75 %	25 %	345302592
19566	NC_015966	CAC	2	6	815877	815882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302592
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19568	NC_015966	GCC	2	6	815901	815906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302592
19569	NC_015966	CAC	2	6	815935	815940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302592
19570	NC_015966	ATC	2	6	816013	816018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302592
19571	NC_015966	CGT	2	6	816071	816076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302592
19572	NC_015966	CAT	2	6	816096	816101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302592
19573	NC_015966	GCA	2	6	816111	816116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302592
19574	NC_015966	GGCATG	2	12	816130	816141	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345302592
19575	NC_015966	CAG	2	6	816165	816170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302592
19576	NC_015966	TCGG	2	8	816224	816231	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19577	NC_015966	GCCC	2	8	816308	816315	0 %	0 %	25 %	75 %	345302593
19578	NC_015966	CCA	2	6	816476	816481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302593
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19580	NC_015966	GGAA	2	8	816646	816653	50 %	0 %	50 %	0 %	345302593
19581	NC_015966	GGT	2	6	816807	816812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302594
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19584	NC_015966	GGC	2	6	816922	816927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302594
19585	NC_015966	GCC	2	6	816947	816952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302594
19586	NC_015966	ATCAGC	2	12	816974	816985	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345302594
19587	NC_015966	GCTG	2	8	816993	817000	0 %	25 %	50 %	25 %	345302594
19588	NC_015966	GTG	2	6	817106	817111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302594
19589	NC_015966	GACG	2	8	817135	817142	25 %	0 %	50 %	25 %	345302594
19590	NC_015966	GCA	2	6	817206	817211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302594
19591	NC_015966	CGA	2	6	817270	817275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302594
19592	NC_015966	CTT	2	6	817299	817304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302594
19593	NC_015966	GCT	2	6	817353	817358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302594
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19595	NC_015966	CGG	2	6	817542	817547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302594
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19597	NC_015966	CAT	2	6	817576	817581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302594
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19599	NC_015966	CGTG	2	8	817635	817642	0 %	25 %	50 %	25 %	345302594
19600	NC_015966	ATC	2	6	817649	817654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302594
19601	NC_015966	CGC	2	6	817679	817684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302594
19602	NC_015966	GCG	2	6	817801	817806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302594
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19604	NC_015966	CGT	2	6	817851	817856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302594
19605	NC_015966	TCT	2	6	817866	817871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302594
19606	NC_015966	TCT	2	6	817928	817933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302594
19607	NC_015966	GGC	2	6	817969	817974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302594
19608	NC_015966	CCT	2	6	818007	818012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302594
19609	NC_015966	A	6	6	818130	818135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19610	NC_015966	GCT	2	6	818144	818149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302595
19611	NC_015966	CTG	2	6	818261	818266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302595
19612	NC_015966	AGC	2	6	818325	818330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302595
19613	NC_015966	GTCG	2	8	818356	818363	0 %	25 %	50 %	25 %	345302595
19614	NC_015966	GGT	2	6	818372	818377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302595
19615	NC_015966	GCG	2	6	818453	818458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302595
19616	NC_015966	TGGT	2	8	818475	818482	0 %	50 %	50 %	0 %	345302595
19617	NC_015966	TGA	2	6	818551	818556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302595
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19619	NC_015966	CG	3	6	818584	818589	0 %	0 %	50 %	50 %	345302595
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19984	NC_015966	CTG	2	6	834629	834634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302610
19985	NC_015966	GGC	2	6	834685	834690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302610
19986	NC_015966	CTGG	2	8	834694	834701	0 %	25 %	50 %	25 %	345302610
19987	NC_015966	CCATC	2	10	834757	834766	20 %	20 %	0 %	60 %	345302610
19988	NC_015966	GACGC	2	10	834788	834797	20 %	0 %	40 %	40 %	345302610
19989	NC_015966	ACG	2	6	834825	834830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302610
19990	NC_015966	GCC	2	6	834835	834840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302610
19991	NC_015966	C	6	6	834866	834871	0 %	0 %	0 %	100 %	345302610
19992	NC_015966	CGA	2	6	834919	834924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302610
19993	NC_015966	CATG	2	8	834940	834947	25 %	25 %	25 %	25 %	345302610
19994	NC_015966	GGC	2	6	834952	834957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302610
19995	NC_015966	CGGC	2	8	834975	834982	0 %	0 %	50 %	50 %	345302610
19996	NC_015966	CTG	2	6	835007	835012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302610
19997	NC_015966	GAG	3	9	835019	835027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302610
19998	NC_015966	CGT	2	6	835087	835092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302610
19999	NC_015966	GGCCT	2	10	835154	835163	0 %	20 %	40 %	40 %	345302610
20000	NC_015966	GTGGAG	2	12	835166	835177	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	345302610

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