MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_015966	GCC	2	6	752496	752501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302537
18003	NC_015966	CGGGC	2	10	752511	752520	0 %	0 %	60 %	40 %	345302537
18004	NC_015966	AGGT	2	8	752563	752570	25 %	25 %	50 %	0 %	345302537
18005	NC_015966	GGC	2	6	752646	752651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302537
18006	NC_015966	TCG	2	6	752662	752667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302537
18007	NC_015966	CGG	2	6	752879	752884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302538
18008	NC_015966	CGC	2	6	752897	752902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302538
18009	NC_015966	GGC	2	6	752916	752921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302538
18010	NC_015966	CAG	2	6	752931	752936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302538
18011	NC_015966	CGGCC	2	10	752948	752957	0 %	0 %	40 %	60 %	345302538
18012	NC_015966	GCG	2	6	752973	752978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302538
18013	NC_015966	GTC	2	6	753003	753008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302538
18014	NC_015966	GCCA	2	8	753019	753026	25 %	0 %	25 %	50 %	345302538
18015	NC_015966	GCC	2	6	753034	753039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302538
18016	NC_015966	GGC	2	6	753045	753050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302538
18017	NC_015966	GCC	2	6	753132	753137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302538
18018	NC_015966	GC	4	8	753149	753156	0 %	0 %	50 %	50 %	345302538
18019	NC_015966	GTG	2	6	753181	753186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302538
18020	NC_015966	GCA	2	6	753200	753205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302538
18021	NC_015966	GCA	3	9	753218	753226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302538
18022	NC_015966	GCC	2	6	753258	753263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302538
18023	NC_015966	ACGGCC	2	12	753289	753300	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302538
18024	NC_015966	GC	3	6	753303	753308	0 %	0 %	50 %	50 %	345302538
18025	NC_015966	CAG	2	6	753333	753338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302538
18026	NC_015966	GC	3	6	753349	753354	0 %	0 %	50 %	50 %	345302538
18027	NC_015966	TCG	3	9	753355	753363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302538
18028	NC_015966	GGC	2	6	753366	753371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302538
18029	NC_015966	CCA	2	6	753401	753406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302538
18030	NC_015966	GGC	3	9	753423	753431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302538
18031	NC_015966	CGGC	2	8	753486	753493	0 %	0 %	50 %	50 %	345302538
18032	NC_015966	GCG	2	6	753504	753509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302538
18033	NC_015966	GCG	2	6	753553	753558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302538
18034	NC_015966	CGTGC	2	10	753612	753621	0 %	20 %	40 %	40 %	345302538
18035	NC_015966	CGGC	2	8	753641	753648	0 %	0 %	50 %	50 %	345302538
18036	NC_015966	CGG	2	6	753668	753673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302538
18037	NC_015966	CGGGC	2	10	753800	753809	0 %	0 %	60 %	40 %	345302538
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18040	NC_015966	GCC	2	6	753924	753929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302538
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18043	NC_015966	GATG	2	8	754121	754128	25 %	25 %	50 %	0 %	345302538
18044	NC_015966	CCA	2	6	754166	754171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302538
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18047	NC_015966	TCG	2	6	754228	754233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302538
18048	NC_015966	TCG	2	6	754273	754278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302538
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18052	NC_015966	GC	3	6	754380	754385	0 %	0 %	50 %	50 %	345302538
18053	NC_015966	GCG	2	6	754483	754488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302539
18054	NC_015966	CCA	2	6	754503	754508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302539
18055	NC_015966	CGT	2	6	754533	754538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302539
18056	NC_015966	GCGG	2	8	754543	754550	0 %	0 %	75 %	25 %	345302539
18057	NC_015966	GTC	2	6	754585	754590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302539
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18059	NC_015966	GCA	2	6	754641	754646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302539
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18061	NC_015966	GC	3	6	754741	754746	0 %	0 %	50 %	50 %	345302539
18062	NC_015966	TGGCG	2	10	754776	754785	0 %	20 %	60 %	20 %	345302539
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18069	NC_015966	CGG	2	6	755219	755224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302539
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18091	NC_015966	TGT	2	6	755900	755905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302540
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18113	NC_015966	GGCA	2	8	756611	756618	25 %	0 %	50 %	25 %	345302541
18114	NC_015966	GGC	2	6	756623	756628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302541
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18119	NC_015966	GCT	2	6	756889	756894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302541
18120	NC_015966	CGA	2	6	756895	756900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302541
18121	NC_015966	CGG	2	6	756905	756910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302541
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18199	NC_015966	GC	3	6	759639	759644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18225	NC_015966	TCG	2	6	760723	760728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302544
18226	NC_015966	TCG	2	6	760763	760768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302544
18227	NC_015966	CACG	2	8	760776	760783	25 %	0 %	25 %	50 %	345302544
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18229	NC_015966	CG	3	6	760868	760873	0 %	0 %	50 %	50 %	345302544
18230	NC_015966	CGA	2	6	760881	760886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302544
18231	NC_015966	GCTG	2	8	760892	760899	0 %	25 %	50 %	25 %	345302544
18232	NC_015966	TCG	2	6	760946	760951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302544
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18235	NC_015966	CGA	2	6	761064	761069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302544
18236	NC_015966	GGCG	2	8	761073	761080	0 %	0 %	75 %	25 %	345302544
18237	NC_015966	GTG	2	6	761098	761103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302544
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18239	NC_015966	AAG	2	6	761173	761178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302544
18240	NC_015966	TCG	2	6	761195	761200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302544
18241	NC_015966	GCG	2	6	761235	761240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302544
18242	NC_015966	AACC	2	8	761343	761350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18243	NC_015966	GGC	2	6	761423	761428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302545
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18350	NC_015966	TGGCCG	2	12	765489	765500	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302547
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18354	NC_015966	CAG	2	6	765617	765622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302547
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18358	NC_015966	TCG	2	6	765747	765752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302547
18359	NC_015966	CGC	2	6	765816	765821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302547
18360	NC_015966	CGC	2	6	765843	765848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302547
18361	NC_015966	GC	3	6	765852	765857	0 %	0 %	50 %	50 %	345302547
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18477	NC_015966	TTC	2	6	771820	771825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302554
18478	NC_015966	GAT	2	6	771829	771834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302554
18479	NC_015966	TGC	2	6	771864	771869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302554
18480	NC_015966	GCA	2	6	771888	771893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302554
18481	NC_015966	TTC	3	9	771904	771912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302554
18482	NC_015966	GGC	2	6	771939	771944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302554
18483	NC_015966	GC	3	6	772081	772086	0 %	0 %	50 %	50 %	345302554
18484	NC_015966	GAT	2	6	772111	772116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302554
18485	NC_015966	TGA	2	6	772119	772124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302554
18486	NC_015966	CGAGGT	2	12	772125	772136	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345302554
18487	NC_015966	GC	3	6	772172	772177	0 %	0 %	50 %	50 %	345302554
18488	NC_015966	GGT	2	6	772230	772235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302554
18489	NC_015966	TGAGCG	2	12	772260	772271	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345302554
18490	NC_015966	CGGC	2	8	772276	772283	0 %	0 %	50 %	50 %	345302554
18491	NC_015966	CCA	2	6	772296	772301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302554
18492	NC_015966	CTG	2	6	772318	772323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302554
18493	NC_015966	ACG	2	6	772391	772396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302554
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18498	NC_015966	TGA	2	6	772518	772523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302554
18499	NC_015966	CGGCC	2	10	772535	772544	0 %	0 %	40 %	60 %	345302554
18500	NC_015966	TGCG	2	8	772563	772570	0 %	25 %	50 %	25 %	345302554

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