MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

< Previous12...3031323334353637383940...153154Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_015966	TGC	2	6	712037	712042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302500
17002	NC_015966	CGA	2	6	712044	712049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302500
17003	NC_015966	GCA	2	6	712182	712187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302500
17004	NC_015966	CG	3	6	712274	712279	0 %	0 %	50 %	50 %	345302500
17005	NC_015966	ACT	2	6	712313	712318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302500
17006	NC_015966	CGC	2	6	712321	712326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302500
17007	NC_015966	CTG	2	6	712342	712347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302500
17008	NC_015966	CCG	2	6	712372	712377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302500
17009	NC_015966	TGG	2	6	712397	712402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302500
17010	NC_015966	CGG	2	6	712403	712408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302500
17011	NC_015966	TTC	2	6	712441	712446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302500
17012	NC_015966	TG	3	6	712495	712500	0 %	50 %	50 %	0 %	345302500
17013	NC_015966	CTG	2	6	712513	712518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302500
17014	NC_015966	ACCTG	2	10	712583	712592	20 %	20 %	20 %	40 %	345302500
17015	NC_015966	GGC	2	6	712626	712631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302500
17016	NC_015966	TCG	2	6	712794	712799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17017	NC_015966	TGC	2	6	712884	712889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17018	NC_015966	GC	4	8	712894	712901	0 %	0 %	50 %	50 %	345302501
17019	NC_015966	AGG	2	6	713019	713024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302501
17020	NC_015966	GAC	2	6	713039	713044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17021	NC_015966	CTG	2	6	713057	713062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17022	NC_015966	GCT	2	6	713161	713166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17023	NC_015966	GCA	2	6	713206	713211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17024	NC_015966	TCG	2	6	713223	713228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17025	NC_015966	ACG	2	6	713268	713273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17026	NC_015966	GATC	2	8	713371	713378	25 %	25 %	25 %	25 %	345302501
17027	NC_015966	CCGG	2	8	713425	713432	0 %	0 %	50 %	50 %	345302501
17028	NC_015966	CGA	2	6	713455	713460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17029	NC_015966	GCT	2	6	713464	713469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17030	NC_015966	CGGG	2	8	713474	713481	0 %	0 %	75 %	25 %	345302501
17031	NC_015966	TCGC	2	8	713500	713507	0 %	25 %	25 %	50 %	345302501
17032	NC_015966	GCT	2	6	713557	713562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17033	NC_015966	CG	3	6	713685	713690	0 %	0 %	50 %	50 %	345302501
17034	NC_015966	G	6	6	713798	713803	0 %	0 %	100 %	0 %	345302501
17035	NC_015966	GCG	2	6	713819	713824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302501
17036	NC_015966	CGG	2	6	713837	713842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302501
17037	NC_015966	GCG	2	6	713854	713859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302501
17038	NC_015966	CGG	2	6	713861	713866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302501
17039	NC_015966	TTC	2	6	713888	713893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302501
17040	NC_015966	CTG	2	6	713900	713905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17041	NC_015966	GCG	2	6	713944	713949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302501
17042	NC_015966	GCA	3	9	713962	713970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17043	NC_015966	CGG	2	6	713984	713989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302501
17044	NC_015966	GGA	2	6	713992	713997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302501
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17046	NC_015966	CGA	2	6	714043	714048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17047	NC_015966	AGT	2	6	714079	714084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302501
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17049	NC_015966	CGA	2	6	714163	714168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17050	NC_015966	CG	3	6	714171	714176	0 %	0 %	50 %	50 %	345302501
17051	NC_015966	GAA	2	6	714251	714256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302501
17052	NC_015966	GAG	3	9	714299	714307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302501
17053	NC_015966	GTT	2	6	714316	714321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302501
17054	NC_015966	GCA	2	6	714337	714342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17055	NC_015966	CTG	2	6	714416	714421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17056	NC_015966	CCG	2	6	714504	714509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302501
17057	NC_015966	CGA	2	6	714523	714528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302501
17058	NC_015966	TGG	2	6	714539	714544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302501
17059	NC_015966	GAG	2	6	714637	714642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_015966	GTC	2	6	714659	714664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302502
17061	NC_015966	GTC	2	6	714677	714682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302502
17062	NC_015966	CTT	2	6	714788	714793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302502
17063	NC_015966	GAA	2	6	714797	714802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302502
17064	NC_015966	ACGG	2	8	714839	714846	25 %	0 %	50 %	25 %	345302502
17065	NC_015966	GAC	2	6	714920	714925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302502
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17067	NC_015966	CGA	2	6	715030	715035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302502
17068	NC_015966	C	6	6	715045	715050	0 %	0 %	0 %	100 %	345302502
17069	NC_015966	GAC	2	6	715076	715081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17070	NC_015966	TCGG	2	8	715111	715118	0 %	25 %	50 %	25 %	345302503
17071	NC_015966	CG	3	6	715129	715134	0 %	0 %	50 %	50 %	345302503
17072	NC_015966	CGT	2	6	715140	715145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302503
17073	NC_015966	ACGGCC	2	12	715195	715206	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302503
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17078	NC_015966	GGCG	2	8	715343	715350	0 %	0 %	75 %	25 %	345302503
17079	NC_015966	GTCG	2	8	715416	715423	0 %	25 %	50 %	25 %	345302503
17080	NC_015966	GCG	2	6	715424	715429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302503
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17083	NC_015966	TGG	2	6	715487	715492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302503
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17087	NC_015966	GCCC	2	8	715631	715638	0 %	0 %	25 %	75 %	345302503
17088	NC_015966	GTG	2	6	715687	715692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302503
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17091	NC_015966	TCG	2	6	715756	715761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302503
17092	NC_015966	CGT	2	6	715790	715795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302503
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17099	NC_015966	G	7	7	715928	715934	0 %	0 %	100 %	0 %	345302503
17100	NC_015966	CCA	2	6	715958	715963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302503
17101	NC_015966	CCAGGG	2	12	715977	715988	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345302503
17102	NC_015966	GCAG	2	8	715991	715998	25 %	0 %	50 %	25 %	345302503
17103	NC_015966	GCC	4	12	716079	716090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302503
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17105	NC_015966	GCC	2	6	716152	716157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302503
17106	NC_015966	TGG	2	6	716198	716203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302503
17107	NC_015966	GCA	2	6	716204	716209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302503
17108	NC_015966	GGT	2	6	716217	716222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302503
17109	NC_015966	CAGC	2	8	716285	716292	25 %	0 %	25 %	50 %	345302503
17110	NC_015966	GTG	2	6	716296	716301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302503
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17114	NC_015966	CGA	2	6	716399	716404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302503
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17116	NC_015966	GAT	3	9	716520	716528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302503
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17118	NC_015966	GGC	3	9	716577	716585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302503
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17478	NC_015966	GCT	2	6	730437	730442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17479	NC_015966	GCA	2	6	730518	730523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17480	NC_015966	GCTG	2	8	730529	730536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17481	NC_015966	GT	3	6	730566	730571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17482	NC_015966	GACC	2	8	730647	730654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17483	NC_015966	ACC	2	6	730862	730867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17484	NC_015966	GGT	2	6	730899	730904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17485	NC_015966	CTG	2	6	730981	730986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17486	NC_015966	GCGG	2	8	731049	731056	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17487	NC_015966	CTG	2	6	731091	731096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17488	NC_015966	C	6	6	731123	731128	0 %	0 %	0 %	100 %	345302518
17489	NC_015966	GCTG	2	8	731129	731136	0 %	25 %	50 %	25 %	345302518
17490	NC_015966	TGC	2	6	731150	731155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302518
17491	NC_015966	TGG	2	6	731168	731173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302518
17492	NC_015966	TTC	2	6	731176	731181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302518
17493	NC_015966	GCC	2	6	731236	731241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302518
17494	NC_015966	CTG	2	6	731242	731247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302518
17495	NC_015966	GAC	2	6	731252	731257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302518
17496	NC_015966	GCC	2	6	731284	731289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302518
17497	NC_015966	CGG	2	6	731321	731326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17498	NC_015966	TCCG	2	8	731459	731466	0 %	25 %	25 %	50 %	345302519
17499	NC_015966	CGGC	2	8	731548	731555	0 %	0 %	50 %	50 %	345302519
17500	NC_015966	GGT	2	6	731564	731569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302519

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