MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015966	ACCG	2	8	670473	670480	25 %	0 %	25 %	50 %	345302464
16002	NC_015966	CCG	2	6	670522	670527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302464
16003	NC_015966	GGC	2	6	670535	670540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302464
16004	NC_015966	GCC	2	6	670555	670560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302464
16005	NC_015966	CGC	2	6	670697	670702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302465
16006	NC_015966	CTG	2	6	670818	670823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302465
16007	NC_015966	GC	4	8	670967	670974	0 %	0 %	50 %	50 %	345302465
16008	NC_015966	GC	3	6	671090	671095	0 %	0 %	50 %	50 %	345302465
16009	NC_015966	TGA	2	6	671150	671155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302465
16010	NC_015966	TCC	2	6	671158	671163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302465
16011	NC_015966	CAG	2	6	671175	671180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302465
16012	NC_015966	GAG	2	6	671242	671247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302465
16013	NC_015966	TGA	2	6	671270	671275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302465
16014	NC_015966	TCG	2	6	671377	671382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302465
16015	NC_015966	GCCAC	2	10	671518	671527	20 %	0 %	20 %	60 %	345302465
16016	NC_015966	GCCA	2	8	671536	671543	25 %	0 %	25 %	50 %	345302465
16017	NC_015966	GCC	2	6	671545	671550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302465
16018	NC_015966	GCC	2	6	671565	671570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302465
16019	NC_015966	TGA	2	6	671627	671632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302465
16020	NC_015966	TCGCC	2	10	671773	671782	0 %	20 %	20 %	60 %	345302465
16021	NC_015966	GCG	2	6	671802	671807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302465
16022	NC_015966	CACG	2	8	671810	671817	25 %	0 %	25 %	50 %	345302465
16023	NC_015966	TCC	2	6	671854	671859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302465
16024	NC_015966	GCG	2	6	671939	671944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302465
16025	NC_015966	CAG	2	6	672033	672038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302465
16026	NC_015966	CTG	2	6	672039	672044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302465
16027	NC_015966	GCCG	2	8	672088	672095	0 %	0 %	50 %	50 %	345302465
16028	NC_015966	ACA	2	6	672101	672106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302465
16029	NC_015966	GGT	2	6	672126	672131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302465
16030	NC_015966	A	6	6	672201	672206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_015966	TGGCG	2	10	672461	672470	0 %	20 %	60 %	20 %	345302466
16032	NC_015966	GAA	2	6	672518	672523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302466
16033	NC_015966	GTG	2	6	672552	672557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302466
16034	NC_015966	CGG	2	6	672560	672565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302466
16035	NC_015966	GTG	3	9	672573	672581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302466
16036	NC_015966	GAG	2	6	672609	672614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302466
16037	NC_015966	GAC	2	6	672623	672628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302466
16038	NC_015966	GGC	2	6	672629	672634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302466
16039	NC_015966	GGC	2	6	672641	672646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302466
16040	NC_015966	TTCC	2	8	672701	672708	0 %	50 %	0 %	50 %	345302466
16041	NC_015966	GCT	2	6	672734	672739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302466
16042	NC_015966	GGC	2	6	672746	672751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302466
16043	NC_015966	TCA	2	6	672772	672777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302466
16044	NC_015966	CGG	2	6	672919	672924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302466
16045	NC_015966	CCA	2	6	672925	672930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302466
16046	NC_015966	TGA	2	6	672943	672948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302466
16047	NC_015966	GGT	2	6	673058	673063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302466
16048	NC_015966	AGA	2	6	673069	673074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302466
16049	NC_015966	CACGG	2	10	673104	673113	20 %	0 %	40 %	40 %	345302466
16050	NC_015966	GCGG	2	8	673142	673149	0 %	0 %	75 %	25 %	345302466
16051	NC_015966	GGC	2	6	673154	673159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302466
16052	NC_015966	TGG	2	6	673177	673182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302466
16053	NC_015966	CCGGT	2	10	673357	673366	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16054	NC_015966	GCCGG	2	10	673387	673396	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16055	NC_015966	CG	3	6	673419	673424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16056	NC_015966	TG	3	6	673467	673472	0 %	50 %	50 %	0 %	345302467
16057	NC_015966	GCC	2	6	673502	673507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302467
16058	NC_015966	CGGC	2	8	673557	673564	0 %	0 %	50 %	50 %	345302467
16059	NC_015966	GTG	2	6	673571	673576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302467
16060	NC_015966	CGGC	2	8	673582	673589	0 %	0 %	50 %	50 %	345302467
16061	NC_015966	GGC	2	6	673627	673632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302467
16062	NC_015966	CACG	2	8	673690	673697	25 %	0 %	25 %	50 %	345302467
16063	NC_015966	ACG	2	6	673707	673712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302467
16064	NC_015966	CAG	2	6	673732	673737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302467
16065	NC_015966	CAT	2	6	673768	673773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302467
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16067	NC_015966	GCA	2	6	673804	673809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302467
16068	NC_015966	CGA	2	6	673864	673869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302467
16069	NC_015966	GCGCC	2	10	673873	673882	0 %	0 %	40 %	60 %	345302467
16070	NC_015966	CTGCCG	2	12	673889	673900	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345302467
16071	NC_015966	GGT	2	6	673927	673932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302467
16072	NC_015966	CTG	2	6	673976	673981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302467
16073	NC_015966	CGC	2	6	673984	673989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302467
16074	NC_015966	GGCGAG	2	12	674021	674032	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	345302467
16075	NC_015966	GGT	2	6	674080	674085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302467
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16077	NC_015966	GGT	2	6	674104	674109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302467
16078	NC_015966	CGC	2	6	674117	674122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302467
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16080	NC_015966	GGC	2	6	674210	674215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302467
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16082	NC_015966	CTGC	2	8	674269	674276	0 %	25 %	25 %	50 %	345302467
16083	NC_015966	GCA	2	6	674293	674298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302467
16084	NC_015966	GGGC	2	8	674314	674321	0 %	0 %	75 %	25 %	345302467
16085	NC_015966	GGC	2	6	674347	674352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302467
16086	NC_015966	CAT	3	9	674359	674367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302467
16087	NC_015966	TGG	2	6	674400	674405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302467
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16089	NC_015966	TGC	2	6	674484	674489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302467
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16094	NC_015966	GACG	2	8	674626	674633	25 %	0 %	50 %	25 %	345302467
16095	NC_015966	CGA	2	6	674824	674829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302467
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16101	NC_015966	CGCCGG	2	12	675168	675179	0 %	0 %	50 %	50 %	345302467
16102	NC_015966	CGC	2	6	675189	675194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302467
16103	NC_015966	CTG	2	6	675218	675223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302467
16104	NC_015966	GTTC	2	8	675318	675325	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16105	NC_015966	AGC	2	6	675334	675339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16106	NC_015966	GCGCT	2	10	675349	675358	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16107	NC_015966	GGA	2	6	675380	675385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302468
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16110	NC_015966	GC	3	6	675488	675493	0 %	0 %	50 %	50 %	345302468
16111	NC_015966	CGT	2	6	675494	675499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302468
16112	NC_015966	CTG	2	6	675525	675530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302468
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16115	NC_015966	GCCG	2	8	675629	675636	0 %	0 %	50 %	50 %	345302468
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16119	NC_015966	GCG	2	6	675898	675903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302468
16120	NC_015966	GCC	2	6	675960	675965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302468
16121	NC_015966	TGC	2	6	675976	675981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302468
16122	NC_015966	CGG	2	6	676055	676060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302468
16123	NC_015966	TCG	2	6	676117	676122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302468
16124	NC_015966	A	6	6	676138	676143	100 %	0 %	0 %	0 %	345302468
16125	NC_015966	GC	5	10	676181	676190	0 %	0 %	50 %	50 %	345302468
16126	NC_015966	ACGCG	2	10	676226	676235	20 %	0 %	40 %	40 %	345302468
16127	NC_015966	GACC	2	8	676310	676317	25 %	0 %	25 %	50 %	345302468
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16131	NC_015966	CCCG	2	8	676512	676519	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16132	NC_015966	CGG	2	6	676521	676526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16133	NC_015966	CAT	2	6	676605	676610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302469
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16152	NC_015966	GGA	2	6	676989	676994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302469
16153	NC_015966	TCG	2	6	677005	677010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16155	NC_015966	GCT	2	6	677205	677210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302470
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16168	NC_015966	CGTT	2	8	677778	677785	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16222	NC_015966	GGCT	2	8	679726	679733	0 %	25 %	50 %	25 %	345302472
16223	NC_015966	GAA	2	6	679740	679745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302472
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16230	NC_015966	GCTG	2	8	679981	679988	0 %	25 %	50 %	25 %	345302473
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16236	NC_015966	GGCGCT	2	12	680141	680152	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302473
16237	NC_015966	GGC	2	6	680171	680176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302473
16238	NC_015966	ATC	2	6	680184	680189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302473
16239	NC_015966	TGC	2	6	680233	680238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
16240	NC_015966	TGC	3	9	680341	680349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
16241	NC_015966	GCG	2	6	680353	680358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302473
16242	NC_015966	TGC	2	6	680380	680385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
16243	NC_015966	GCT	2	6	680411	680416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
16244	NC_015966	GCTAC	2	10	680429	680438	20 %	20 %	20 %	40 %	345302473
16245	NC_015966	AGC	2	6	680459	680464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302473
16246	NC_015966	CGG	2	6	680479	680484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302473
16247	NC_015966	CTG	2	6	680532	680537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
16248	NC_015966	GCC	2	6	680538	680543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302473
16249	NC_015966	CTG	3	9	680658	680666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
16250	NC_015966	CGCTGG	2	12	680698	680709	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302473
16251	NC_015966	GCG	2	6	680757	680762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302473
16252	NC_015966	GCC	2	6	680763	680768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302473
16253	NC_015966	TGGG	2	8	680769	680776	0 %	25 %	75 %	0 %	345302473
16254	NC_015966	CGG	2	6	680856	680861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302473
16255	NC_015966	GC	3	6	680917	680922	0 %	0 %	50 %	50 %	345302473
16256	NC_015966	GTC	2	6	681016	681021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
16257	NC_015966	GCG	2	6	681041	681046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302474
16258	NC_015966	AGC	2	6	681048	681053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
16259	NC_015966	AGAA	2	8	681057	681064	75 %	0 %	25 %	0 %	345302474
16260	NC_015966	CGC	2	6	681070	681075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302474
16261	NC_015966	GAC	2	6	681086	681091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
16262	NC_015966	AGC	2	6	681117	681122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
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16264	NC_015966	CAG	2	6	681164	681169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
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16267	NC_015966	CAG	2	6	681305	681310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
16268	NC_015966	GGCT	2	8	681347	681354	0 %	25 %	50 %	25 %	345302474
16269	NC_015966	CAG	4	12	681362	681373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
16270	NC_015966	AGC	2	6	681405	681410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
16271	NC_015966	CAG	2	6	681413	681418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
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16273	NC_015966	GAAC	2	8	681464	681471	50 %	0 %	25 %	25 %	345302474
16274	NC_015966	CAG	2	6	681473	681478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
16275	NC_015966	GGCGA	2	10	681513	681522	20 %	0 %	60 %	20 %	345302474
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16277	NC_015966	CGC	2	6	681568	681573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302474
16278	NC_015966	CAG	3	9	681575	681583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
16279	NC_015966	CAG	2	6	681641	681646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
16280	NC_015966	GCC	2	6	681660	681665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302474
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16292	NC_015966	GCAG	2	8	682071	682078	25 %	0 %	50 %	25 %	345302475
16293	NC_015966	GCA	2	6	682080	682085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302475
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16295	NC_015966	CGGC	2	8	682167	682174	0 %	0 %	50 %	50 %	345302475
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16320	NC_015966	A	6	6	683085	683090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16322	NC_015966	T	6	6	683243	683248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16323	NC_015966	GAA	2	6	683259	683264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16324	NC_015966	ACGAA	2	10	683291	683300	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16325	NC_015966	GAA	2	6	683310	683315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16326	NC_015966	GGC	2	6	683339	683344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16327	NC_015966	TG	3	6	683471	683476	0 %	50 %	50 %	0 %	345302476
16328	NC_015966	TGG	2	6	683481	683486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302476
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16348	NC_015966	G	6	6	684173	684178	0 %	0 %	100 %	0 %	345302476
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16355	NC_015966	CGTG	2	8	684544	684551	0 %	25 %	50 %	25 %	345302476
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