MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_015966	GGCG	2	8	651696	651703	0 %	0 %	75 %	25 %	345302447
15502	NC_015966	GCTC	2	8	651745	651752	0 %	25 %	25 %	50 %	345302447
15503	NC_015966	CTGGCG	2	12	651770	651781	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302447
15504	NC_015966	TGG	3	9	651858	651866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302447
15505	NC_015966	GAA	2	6	651887	651892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302447
15506	NC_015966	CG	3	6	652013	652018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15507	NC_015966	GCT	2	6	652051	652056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302448
15508	NC_015966	GCA	2	6	652057	652062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302448
15509	NC_015966	TCA	2	6	652131	652136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302448
15510	NC_015966	GCC	2	6	652234	652239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302448
15511	NC_015966	CCG	2	6	652262	652267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302448
15512	NC_015966	CCG	2	6	652328	652333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302448
15513	NC_015966	ACC	2	6	652373	652378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302448
15514	NC_015966	G	6	6	652398	652403	0 %	0 %	100 %	0 %	345302448
15515	NC_015966	CGT	2	6	652417	652422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302448
15516	NC_015966	CG	3	6	652452	652457	0 %	0 %	50 %	50 %	345302448
15517	NC_015966	CGG	2	6	652463	652468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302448
15518	NC_015966	CGC	2	6	652500	652505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302448
15519	NC_015966	CACG	2	8	652507	652514	25 %	0 %	25 %	50 %	345302448
15520	NC_015966	CCG	2	6	652526	652531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302448
15521	NC_015966	CG	3	6	652530	652535	0 %	0 %	50 %	50 %	345302448
15522	NC_015966	GTG	2	6	652787	652792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302448
15523	NC_015966	CGTGCG	2	12	652810	652821	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302448
15524	NC_015966	GGC	2	6	652849	652854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302448
15525	NC_015966	CTT	2	6	652870	652875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302448
15526	NC_015966	ACC	2	6	652910	652915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302448
15527	NC_015966	CAT	2	6	652930	652935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302448
15528	NC_015966	TAC	2	6	652994	652999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302448
15529	NC_015966	T	6	6	653084	653089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_015966	GAGC	2	8	653147	653154	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15531	NC_015966	CGC	2	6	653222	653227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302449
15532	NC_015966	CGG	2	6	653240	653245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302449
15533	NC_015966	GCT	2	6	653274	653279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302449
15534	NC_015966	CTC	2	6	653299	653304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302449
15535	NC_015966	CTG	2	6	653326	653331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302449
15536	NC_015966	TGGC	2	8	653347	653354	0 %	25 %	50 %	25 %	345302449
15537	NC_015966	GCT	2	6	653364	653369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302449
15538	NC_015966	GCT	2	6	653391	653396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302449
15539	NC_015966	TGGCGC	2	12	653429	653440	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302449
15540	NC_015966	TTC	2	6	653477	653482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302449
15541	NC_015966	GGC	2	6	653532	653537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302449
15542	NC_015966	GAC	2	6	653573	653578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302449
15543	NC_015966	ATGG	2	8	653589	653596	25 %	25 %	50 %	0 %	345302449
15544	NC_015966	TGC	2	6	653705	653710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302449
15545	NC_015966	TCC	2	6	653720	653725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302449
15546	NC_015966	GCG	2	6	653728	653733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302449
15547	NC_015966	AGG	2	6	653777	653782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302449
15548	NC_015966	ATGC	2	8	653829	653836	25 %	25 %	25 %	25 %	345302450
15549	NC_015966	CG	3	6	653958	653963	0 %	0 %	50 %	50 %	345302450
15550	NC_015966	GCG	2	6	654009	654014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302450
15551	NC_015966	CG	3	6	654013	654018	0 %	0 %	50 %	50 %	345302450
15552	NC_015966	TTC	2	6	654064	654069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302450
15553	NC_015966	GGT	2	6	654072	654077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302450
15554	NC_015966	GAA	2	6	654085	654090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302450
15555	NC_015966	CCT	2	6	654127	654132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302450
15556	NC_015966	CGACTA	2	12	654177	654188	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345302450
15557	NC_015966	CGG	2	6	654198	654203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302450
15558	NC_015966	CG	3	6	654229	654234	0 %	0 %	50 %	50 %	345302450
15559	NC_015966	CCA	2	6	654261	654266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302450
15560	NC_015966	CTG	2	6	654316	654321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302450
15561	NC_015966	ATC	2	6	654389	654394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302450
15562	NC_015966	GGA	2	6	654450	654455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302450
15563	NC_015966	AGC	2	6	654456	654461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302450
15564	NC_015966	GAC	2	6	654466	654471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302450
15565	NC_015966	GGC	2	6	654489	654494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302450
15566	NC_015966	CGG	2	6	654514	654519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302451
15567	NC_015966	GGA	2	6	654548	654553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302451
15568	NC_015966	GGC	2	6	654570	654575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302451
15569	NC_015966	CGG	2	6	654582	654587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302451
15570	NC_015966	CGTCG	2	10	654632	654641	0 %	20 %	40 %	40 %	345302451
15571	NC_015966	CTG	2	6	654648	654653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302451
15572	NC_015966	CTGG	2	8	654656	654663	0 %	25 %	50 %	25 %	345302451
15573	NC_015966	CTG	2	6	654741	654746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302451
15574	NC_015966	CGG	2	6	654833	654838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302451
15575	NC_015966	CGCAC	2	10	654866	654875	20 %	0 %	20 %	60 %	345302451
15576	NC_015966	GCGAA	2	10	654928	654937	40 %	0 %	40 %	20 %	345302451
15577	NC_015966	TCG	2	6	654997	655002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302451
15578	NC_015966	CG	4	8	655109	655116	0 %	0 %	50 %	50 %	345302451
15579	NC_015966	CCG	2	6	655130	655135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302451
15580	NC_015966	GCT	2	6	655208	655213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302451
15581	NC_015966	GCT	2	6	655240	655245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302451
15582	NC_015966	TAC	2	6	655254	655259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302451
15583	NC_015966	CGA	2	6	655379	655384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302451
15584	NC_015966	CGCC	2	8	655385	655392	0 %	0 %	25 %	75 %	345302451
15585	NC_015966	GCC	2	6	655395	655400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302451
15586	NC_015966	GCT	2	6	655403	655408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302451
15587	NC_015966	CGC	2	6	655425	655430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302451
15588	NC_015966	CAG	2	6	655446	655451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302451
15589	NC_015966	TCG	2	6	655456	655461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302451
15590	NC_015966	GGC	2	6	655531	655536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302451
15591	NC_015966	GAC	2	6	655558	655563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302451
15592	NC_015966	CGGC	2	8	655566	655573	0 %	0 %	50 %	50 %	345302451
15593	NC_015966	GC	3	6	655585	655590	0 %	0 %	50 %	50 %	345302451
15594	NC_015966	GCCG	2	8	655613	655620	0 %	0 %	50 %	50 %	345302451
15595	NC_015966	CGG	2	6	655622	655627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302451
15596	NC_015966	GGCT	2	8	655704	655711	0 %	25 %	50 %	25 %	345302451
15597	NC_015966	TGG	2	6	655756	655761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302451
15598	NC_015966	CTGTAC	2	12	655773	655784	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345302451
15599	NC_015966	TCG	2	6	655919	655924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
15600	NC_015966	GCG	2	6	655940	655945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302452
15601	NC_015966	GCG	2	6	655993	655998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302452
15602	NC_015966	ACG	2	6	656036	656041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302452
15603	NC_015966	CGC	2	6	656094	656099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302452
15604	NC_015966	CAC	2	6	656106	656111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302452
15605	NC_015966	CGT	2	6	656145	656150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
15606	NC_015966	AGCC	2	8	656154	656161	25 %	0 %	25 %	50 %	345302452
15607	NC_015966	CTG	3	9	656176	656184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
15608	NC_015966	CCG	2	6	656200	656205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302452
15609	NC_015966	TGCCCG	2	12	656285	656296	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345302452
15610	NC_015966	CGGC	2	8	656366	656373	0 %	0 %	50 %	50 %	345302452
15611	NC_015966	GCC	2	6	656515	656520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302452
15612	NC_015966	TGC	2	6	656522	656527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
15613	NC_015966	GC	3	6	656536	656541	0 %	0 %	50 %	50 %	345302452
15614	NC_015966	GCG	2	6	656578	656583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302452
15615	NC_015966	GCC	2	6	656584	656589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302452
15616	NC_015966	GCT	2	6	656622	656627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
15617	NC_015966	GCT	3	9	656691	656699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
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15619	NC_015966	TGC	2	6	656726	656731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
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15739	NC_015966	CA	5	10	660789	660798	50 %	0 %	0 %	50 %	345302454
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15741	NC_015966	GGC	3	9	660833	660841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
15742	NC_015966	GCGAA	2	10	660893	660902	40 %	0 %	40 %	20 %	345302454
15743	NC_015966	GGC	3	9	660903	660911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
15744	NC_015966	GCG	2	6	660941	660946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
15745	NC_015966	GGC	2	6	660959	660964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
15746	NC_015966	GCG	2	6	661044	661049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
15747	NC_015966	GGT	2	6	661052	661057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302454
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15749	NC_015966	CGT	2	6	661100	661105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302454
15750	NC_015966	CGT	2	6	661127	661132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302454
15751	NC_015966	CGG	2	6	661217	661222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
15752	NC_015966	GCC	2	6	661277	661282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302454
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15754	NC_015966	GCC	2	6	661393	661398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302454
15755	NC_015966	TTCC	2	8	661445	661452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15756	NC_015966	AGC	2	6	661455	661460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15758	NC_015966	AGG	2	6	661489	661494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302455
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15761	NC_015966	GCTG	2	8	661589	661596	0 %	25 %	50 %	25 %	345302455
15762	NC_015966	GGC	3	9	661613	661621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302455
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15764	NC_015966	CTG	2	6	661710	661715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302455
15765	NC_015966	CGG	2	6	661804	661809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302455
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15774	NC_015966	CTG	2	6	662121	662126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302455
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15788	NC_015966	GCTG	2	8	662536	662543	0 %	25 %	50 %	25 %	345302456
15789	NC_015966	GTGCAG	2	12	662544	662555	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345302456
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15847	NC_015966	CGGC	2	8	664527	664534	0 %	0 %	50 %	50 %	345302457
15848	NC_015966	GCG	2	6	664620	664625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302457
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15852	NC_015966	GCC	2	6	664756	664761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302457
15853	NC_015966	GGCG	2	8	664802	664809	0 %	0 %	75 %	25 %	345302457
15854	NC_015966	CTGGCC	2	12	664854	664865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345302457
15855	NC_015966	AGA	2	6	664911	664916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302457
15856	NC_015966	CGG	2	6	664921	664926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302457
15857	NC_015966	GCTCA	2	10	664976	664985	20 %	20 %	20 %	40 %	345302458
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15859	NC_015966	GAA	2	6	664999	665004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302458
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