MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015966	TCG	2	6	632724	632729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302427
15002	NC_015966	TGA	2	6	632800	632805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302427
15003	NC_015966	CGA	2	6	632812	632817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302427
15004	NC_015966	GAC	2	6	633173	633178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302428
15005	NC_015966	CTG	2	6	633191	633196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302428
15006	NC_015966	TCGAAC	2	12	633204	633215	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345302428
15007	NC_015966	AGA	2	6	633258	633263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302428
15008	NC_015966	AGA	2	6	633274	633279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302428
15009	NC_015966	AGG	2	6	633371	633376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_015966	CT	3	6	633478	633483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15011	NC_015966	TGA	2	6	633534	633539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302429
15012	NC_015966	TCC	2	6	633557	633562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302429
15013	NC_015966	CTG	2	6	633616	633621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302429
15014	NC_015966	CAG	2	6	633631	633636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302429
15015	NC_015966	ACCG	2	8	633697	633704	25 %	0 %	25 %	50 %	345302429
15016	NC_015966	GATT	2	8	633739	633746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_015966	ACCG	2	8	633773	633780	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15018	NC_015966	GCT	2	6	633790	633795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15019	NC_015966	TCG	2	6	633853	633858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_015966	CGTAT	2	10	633922	633931	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15021	NC_015966	TCG	2	6	633964	633969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_015966	GAA	2	6	634025	634030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_015966	TGT	2	6	634041	634046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_015966	TTC	2	6	634062	634067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15025	NC_015966	GTC	2	6	634115	634120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15026	NC_015966	G	6	6	634138	634143	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_015966	GATC	2	8	634195	634202	25 %	25 %	25 %	25 %	345302430
15028	NC_015966	CCT	2	6	634219	634224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302430
15029	NC_015966	ATCG	2	8	634337	634344	25 %	25 %	25 %	25 %	345302430
15030	NC_015966	GGAA	2	8	634456	634463	50 %	0 %	50 %	0 %	345302430
15031	NC_015966	CGT	2	6	634507	634512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302431
15032	NC_015966	AAC	2	6	634605	634610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302431
15033	NC_015966	GCG	2	6	634618	634623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302431
15034	NC_015966	TTC	2	6	634631	634636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302431
15035	NC_015966	GCT	2	6	634684	634689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302431
15036	NC_015966	CAGG	2	8	634693	634700	25 %	0 %	50 %	25 %	345302431
15037	NC_015966	GC	3	6	634720	634725	0 %	0 %	50 %	50 %	345302431
15038	NC_015966	AC	3	6	634764	634769	50 %	0 %	0 %	50 %	345302431
15039	NC_015966	GCG	2	6	634819	634824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302431
15040	NC_015966	CGT	2	6	634868	634873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302431
15041	NC_015966	GCG	2	6	635049	635054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302432
15042	NC_015966	GCG	2	6	635065	635070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302432
15043	NC_015966	CG	3	6	635101	635106	0 %	0 %	50 %	50 %	345302432
15044	NC_015966	GCC	2	6	635148	635153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302432
15045	NC_015966	CGA	2	6	635198	635203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302432
15046	NC_015966	GTG	2	6	635229	635234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302432
15047	NC_015966	CA	4	8	635240	635247	50 %	0 %	0 %	50 %	345302432
15048	NC_015966	GCC	2	6	635266	635271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302432
15049	NC_015966	CGA	2	6	635285	635290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302432
15050	NC_015966	GCC	2	6	635355	635360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302432
15051	NC_015966	CTG	2	6	635367	635372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302432
15052	NC_015966	TGA	2	6	635374	635379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302432
15053	NC_015966	TCG	2	6	635419	635424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302432
15054	NC_015966	GAG	2	6	635451	635456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302432
15055	NC_015966	GTGCGC	2	12	635457	635468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302432
15056	NC_015966	GAC	2	6	635481	635486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302432
15057	NC_015966	CG	3	6	635565	635570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15058	NC_015966	CGG	2	6	635609	635614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_015966	T	6	6	635626	635631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_015966	GAA	2	6	635632	635637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_015966	GCT	3	9	635698	635706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302433
15062	NC_015966	AGG	2	6	635733	635738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302433
15063	NC_015966	CGG	2	6	635791	635796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302433
15064	NC_015966	GTG	2	6	635816	635821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302433
15065	NC_015966	GACC	2	8	635830	635837	25 %	0 %	25 %	50 %	345302433
15066	NC_015966	CCG	2	6	635927	635932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302433
15067	NC_015966	TCG	2	6	636027	636032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302434
15068	NC_015966	GAC	2	6	636058	636063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302434
15069	NC_015966	ACG	2	6	636105	636110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302434
15070	NC_015966	CGA	2	6	636112	636117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302434
15071	NC_015966	CCG	2	6	636125	636130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302434
15072	NC_015966	CTGG	2	8	636187	636194	0 %	25 %	50 %	25 %	345302434
15073	NC_015966	GCA	2	6	636217	636222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302434
15074	NC_015966	AGGA	2	8	636228	636235	50 %	0 %	50 %	0 %	345302434
15075	NC_015966	CGT	2	6	636244	636249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302434
15076	NC_015966	TGC	2	6	636285	636290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302434
15077	NC_015966	GGC	2	6	636325	636330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302434
15078	NC_015966	CCG	2	6	636346	636351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302434
15079	NC_015966	CGG	2	6	636365	636370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302434
15080	NC_015966	TTC	2	6	636377	636382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302434
15081	NC_015966	CGA	2	6	636409	636414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302434
15082	NC_015966	CGA	2	6	636433	636438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302434
15083	NC_015966	ACCCG	2	10	636458	636467	20 %	0 %	20 %	60 %	345302434
15084	NC_015966	GC	3	6	636481	636486	0 %	0 %	50 %	50 %	345302434
15085	NC_015966	ATC	2	6	636488	636493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302434
15086	NC_015966	ACC	2	6	636532	636537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302435
15087	NC_015966	AGC	3	9	636544	636552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302435
15088	NC_015966	CCAG	2	8	636644	636651	25 %	0 %	25 %	50 %	345302435
15089	NC_015966	CGG	2	6	636689	636694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302435
15090	NC_015966	CAG	2	6	636717	636722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302435
15091	NC_015966	CGG	2	6	636767	636772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302435
15092	NC_015966	GGC	2	6	636813	636818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302435
15093	NC_015966	CAC	2	6	636840	636845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302435
15094	NC_015966	GGC	2	6	636861	636866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302435
15095	NC_015966	GCT	2	6	636869	636874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302435
15096	NC_015966	CGA	2	6	636902	636907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302435
15097	NC_015966	CCCG	2	8	636924	636931	0 %	0 %	25 %	75 %	345302435
15098	NC_015966	CAG	2	6	636942	636947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302435
15099	NC_015966	CAG	2	6	637023	637028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302435
15100	NC_015966	CAG	2	6	637038	637043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302435
15101	NC_015966	AGC	2	6	637078	637083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302435
15102	NC_015966	GCG	2	6	637088	637093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302435
15103	NC_015966	GCC	2	6	637129	637134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302435
15104	NC_015966	CCG	2	6	637214	637219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302435
15105	NC_015966	TCG	2	6	637222	637227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302435
15106	NC_015966	GGCG	2	8	637256	637263	0 %	0 %	75 %	25 %	345302435
15107	NC_015966	CCCA	2	8	637287	637294	25 %	0 %	0 %	75 %	345302435
15108	NC_015966	CCCAG	2	10	637337	637346	20 %	0 %	20 %	60 %	345302435
15109	NC_015966	CAG	2	6	637356	637361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302435
15110	NC_015966	GACCG	2	10	637374	637383	20 %	0 %	40 %	40 %	345302435
15111	NC_015966	CGG	2	6	637389	637394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302435
15112	NC_015966	GCCG	2	8	637419	637426	0 %	0 %	50 %	50 %	345302435
15113	NC_015966	GTA	2	6	637440	637445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302435
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15115	NC_015966	GTGCG	2	10	637462	637471	0 %	20 %	60 %	20 %	345302435
15116	NC_015966	GAA	2	6	637515	637520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302435
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15118	NC_015966	CAGCGC	2	12	637548	637559	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302435
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15120	NC_015966	GCC	2	6	637617	637622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302435
15121	NC_015966	CAC	2	6	637665	637670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302435
15122	NC_015966	GCC	2	6	637689	637694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302435
15123	NC_015966	GCA	2	6	637706	637711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302435
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15125	NC_015966	GCC	2	6	637737	637742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302435
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15129	NC_015966	GTA	2	6	638026	638031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_015966	GTA	2	6	638101	638106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15131	NC_015966	CGCTT	2	10	638153	638162	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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15133	NC_015966	CGC	2	6	638289	638294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302436
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15152	NC_015966	CCG	2	6	639284	639289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15224	NC_015966	GCTGG	2	10	642063	642072	0 %	20 %	60 %	20 %	345302439
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15226	NC_015966	ATCG	2	8	642100	642107	25 %	25 %	25 %	25 %	345302439
15227	NC_015966	CAA	2	6	642108	642113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302439
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15231	NC_015966	CCG	2	6	642300	642305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302439
15232	NC_015966	GCG	2	6	642315	642320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302439
15233	NC_015966	AGT	2	6	642348	642353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302439
15234	NC_015966	CGG	2	6	642388	642393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302439
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15237	NC_015966	GAA	2	6	642599	642604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302440
15238	NC_015966	GAG	2	6	642605	642610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302440
15239	NC_015966	CG	3	6	642675	642680	0 %	0 %	50 %	50 %	345302440
15240	NC_015966	CGT	2	6	642733	642738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302440
15241	NC_015966	ACT	2	6	642795	642800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302440
15242	NC_015966	GCT	2	6	642847	642852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302441
15243	NC_015966	CGGCAT	2	12	642934	642945	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345302441
15244	NC_015966	CTGC	2	8	642951	642958	0 %	25 %	25 %	50 %	345302441
15245	NC_015966	TGC	2	6	642962	642967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302441
15246	NC_015966	T	6	6	642985	642990	0 %	100 %	0 %	0 %	345302441
15247	NC_015966	CTG	2	6	643177	643182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302441
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15249	NC_015966	CTG	2	6	643228	643233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302441
15250	NC_015966	CTGG	2	8	643245	643252	0 %	25 %	50 %	25 %	345302441
15251	NC_015966	GGGC	2	8	643277	643284	0 %	0 %	75 %	25 %	345302441
15252	NC_015966	GGC	2	6	643290	643295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302441
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15254	NC_015966	CTGG	2	8	643380	643387	0 %	25 %	50 %	25 %	345302441
15255	NC_015966	GCG	2	6	643410	643415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302441
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15263	NC_015966	TGG	2	6	643526	643531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302441
15264	NC_015966	GCC	2	6	643540	643545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302441
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15272	NC_015966	CTG	2	6	643867	643872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302441
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15310	NC_015966	GCCC	2	8	645156	645163	0 %	0 %	25 %	75 %	345302441
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15345	NC_015966	GCA	2	6	646126	646131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302442
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15357	NC_015966	GAA	2	6	646638	646643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302442
15358	NC_015966	GCA	2	6	646671	646676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302442
15359	NC_015966	TCA	2	6	646698	646703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302443
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15476	NC_015966	ACG	2	6	650927	650932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302447
15477	NC_015966	CGG	2	6	650962	650967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302447
15478	NC_015966	TAC	2	6	650972	650977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302447
15479	NC_015966	CGT	2	6	651010	651015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302447
15480	NC_015966	GCTGGT	2	12	651049	651060	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345302447
15481	NC_015966	GTG	2	6	651077	651082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302447
15482	NC_015966	TGG	2	6	651105	651110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302447
15483	NC_015966	TGC	2	6	651165	651170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302447
15484	NC_015966	CTG	2	6	651188	651193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302447
15485	NC_015966	GGCT	2	8	651194	651201	0 %	25 %	50 %	25 %	345302447
15486	NC_015966	GGC	2	6	651235	651240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302447
15487	NC_015966	GCG	2	6	651249	651254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302447
15488	NC_015966	TGC	2	6	651264	651269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302447
15489	NC_015966	AGC	2	6	651324	651329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302447
15490	NC_015966	AGGCG	2	10	651334	651343	20 %	0 %	60 %	20 %	345302447
15491	NC_015966	CCG	2	6	651352	651357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302447
15492	NC_015966	GGC	2	6	651383	651388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302447
15493	NC_015966	ACG	2	6	651420	651425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302447
15494	NC_015966	CTG	2	6	651500	651505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302447
15495	NC_015966	CGT	2	6	651574	651579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302447
15496	NC_015966	GGC	2	6	651580	651585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302447
15497	NC_015966	TGG	2	6	651614	651619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302447
15498	NC_015966	CGT	2	6	651658	651663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302447
15499	NC_015966	GGA	2	6	651683	651688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302447
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