MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

< Previous12...2526272829303132333435...153154Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_015966	CGT	2	6	612829	612834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302411
14502	NC_015966	CGT	2	6	612938	612943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302411
14503	NC_015966	GC	3	6	613007	613012	0 %	0 %	50 %	50 %	345302411
14504	NC_015966	GC	3	6	613104	613109	0 %	0 %	50 %	50 %	345302412
14505	NC_015966	CGA	2	6	613115	613120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302412
14506	NC_015966	GCT	2	6	613130	613135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302412
14507	NC_015966	CGA	2	6	613148	613153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302412
14508	NC_015966	CGG	2	6	613169	613174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302412
14509	NC_015966	GCT	2	6	613220	613225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302412
14510	NC_015966	GCT	2	6	613328	613333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302412
14511	NC_015966	TGC	2	6	613351	613356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302412
14512	NC_015966	CAA	2	6	613394	613399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302412
14513	NC_015966	GCC	2	6	613437	613442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302412
14514	NC_015966	CGT	2	6	613454	613459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302412
14515	NC_015966	GCC	2	6	613501	613506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302412
14516	NC_015966	GC	3	6	613518	613523	0 %	0 %	50 %	50 %	345302412
14517	NC_015966	CAC	2	6	613544	613549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302412
14518	NC_015966	GCT	2	6	613568	613573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302412
14519	NC_015966	CG	3	6	613576	613581	0 %	0 %	50 %	50 %	345302412
14520	NC_015966	GCC	2	6	613598	613603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302412
14521	NC_015966	GCC	2	6	613614	613619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302412
14522	NC_015966	GTG	2	6	613656	613661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302412
14523	NC_015966	GGC	2	6	613667	613672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302412
14524	NC_015966	CGA	2	6	613691	613696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302412
14525	NC_015966	CGG	2	6	613735	613740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302412
14526	NC_015966	TCG	2	6	613774	613779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302412
14527	NC_015966	CGA	2	6	613790	613795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302412
14528	NC_015966	GCC	2	6	613806	613811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302412
14529	NC_015966	CGA	2	6	613835	613840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302412
14530	NC_015966	GCC	2	6	613857	613862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302412
14531	NC_015966	GCG	2	6	613901	613906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302412
14532	NC_015966	GC	3	6	613932	613937	0 %	0 %	50 %	50 %	345302412
14533	NC_015966	GCC	2	6	614020	614025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302413
14534	NC_015966	GCC	2	6	614061	614066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302413
14535	NC_015966	GGC	2	6	614154	614159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302413
14536	NC_015966	ACG	2	6	614221	614226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302413
14537	NC_015966	GGC	2	6	614232	614237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302413
14538	NC_015966	GCC	2	6	614292	614297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302413
14539	NC_015966	GC	4	8	614330	614337	0 %	0 %	50 %	50 %	345302413
14540	NC_015966	CAG	2	6	614471	614476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302414
14541	NC_015966	GTGC	2	8	614477	614484	0 %	25 %	50 %	25 %	345302414
14542	NC_015966	CTG	2	6	614567	614572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302414
14543	NC_015966	GCC	2	6	614636	614641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302414
14544	NC_015966	AGC	2	6	614691	614696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302414
14545	NC_015966	T	6	6	614711	614716	0 %	100 %	0 %	0 %	345302414
14546	NC_015966	CAC	2	6	614738	614743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302414
14547	NC_015966	CAC	2	6	614795	614800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302414
14548	NC_015966	GGC	3	9	614936	614944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302414
14549	NC_015966	GGT	2	6	614987	614992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302414
14550	NC_015966	CGT	2	6	615149	615154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302414
14551	NC_015966	GGC	2	6	615204	615209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302414
14552	NC_015966	GCG	3	9	615210	615218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302414
14553	NC_015966	CG	3	6	615265	615270	0 %	0 %	50 %	50 %	345302414
14554	NC_015966	A	6	6	615287	615292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_015966	CGT	2	6	615526	615531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14556	NC_015966	GGT	2	6	615560	615565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302415
14557	NC_015966	GGC	2	6	615566	615571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302415
14558	NC_015966	TTC	2	6	615572	615577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302415
14559	NC_015966	GCA	2	6	615628	615633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302415
14560	NC_015966	AGT	2	6	615655	615660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302415
14561	NC_015966	GGTG	2	8	615682	615689	0 %	25 %	75 %	0 %	345302415
14562	NC_015966	TCGAT	2	10	615712	615721	20 %	40 %	20 %	20 %	345302415
14563	NC_015966	ATC	2	6	615749	615754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302415
14564	NC_015966	ACG	2	6	615771	615776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302415
14565	NC_015966	AAG	2	6	615789	615794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302415
14566	NC_015966	CAG	2	6	615878	615883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302415
14567	NC_015966	TCG	2	6	615895	615900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302415
14568	NC_015966	TCGG	2	8	615921	615928	0 %	25 %	50 %	25 %	345302415
14569	NC_015966	CGT	2	6	616033	616038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302415
14570	NC_015966	TGA	2	6	616039	616044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302415
14571	NC_015966	GTC	2	6	616058	616063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302415
14572	NC_015966	TCA	2	6	616117	616122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302415
14573	NC_015966	GTC	2	6	616124	616129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302415
14574	NC_015966	TTGC	2	8	616148	616155	0 %	50 %	25 %	25 %	345302415
14575	NC_015966	GC	3	6	616190	616195	0 %	0 %	50 %	50 %	345302415
14576	NC_015966	GGT	2	6	616199	616204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302415
14577	NC_015966	CA	3	6	616331	616336	50 %	0 %	0 %	50 %	345302415
14578	NC_015966	GC	3	6	616405	616410	0 %	0 %	50 %	50 %	345302415
14579	NC_015966	CAT	2	6	616411	616416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302415
14580	NC_015966	CAG	2	6	616424	616429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302415
14581	NC_015966	AGA	2	6	616453	616458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302415
14582	NC_015966	GGT	2	6	616514	616519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302415
14583	NC_015966	CAG	2	6	616520	616525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302415
14584	NC_015966	GCC	2	6	616527	616532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302415
14585	NC_015966	CTG	2	6	616574	616579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302415
14586	NC_015966	CAG	2	6	616592	616597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302415
14587	NC_015966	GTT	2	6	616663	616668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_015966	TAAGG	2	10	616695	616704	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14589	NC_015966	GCAA	2	8	616708	616715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14590	NC_015966	AAC	2	6	616764	616769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14591	NC_015966	GC	3	6	616842	616847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14592	NC_015966	GTC	2	6	616865	616870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14593	NC_015966	GCC	2	6	616881	616886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14594	NC_015966	CCA	2	6	616905	616910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14595	NC_015966	CGC	2	6	616945	616950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14596	NC_015966	TGGAC	2	10	616956	616965	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14597	NC_015966	GAG	2	6	616979	616984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_015966	GTG	3	9	617003	617011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_015966	GGAA	2	8	617020	617027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_015966	CG	3	6	617088	617093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14601	NC_015966	GGGC	2	8	617150	617157	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14602	NC_015966	GCC	2	6	617168	617173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14603	NC_015966	ATCGT	2	10	617187	617196	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14604	NC_015966	CCG	2	6	617204	617209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14605	NC_015966	GAC	2	6	617297	617302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14606	NC_015966	ATC	2	6	617375	617380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302416
14607	NC_015966	GCG	2	6	617423	617428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302416
14608	NC_015966	TGA	2	6	617447	617452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302416
14609	NC_015966	CG	3	6	617507	617512	0 %	0 %	50 %	50 %	345302416
14610	NC_015966	GTC	2	6	617562	617567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302416
14611	NC_015966	TGC	2	6	617623	617628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302416
14612	NC_015966	ACC	2	6	617680	617685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302416
14613	NC_015966	CG	4	8	617689	617696	0 %	0 %	50 %	50 %	345302416
14614	NC_015966	CCA	2	6	617735	617740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302416
14615	NC_015966	CCT	2	6	617818	617823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14616	NC_015966	GCA	2	6	617835	617840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14617	NC_015966	A	6	6	617874	617879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_015966	CATGC	2	10	617942	617951	20 %	20 %	20 %	40 %	345302417
14619	NC_015966	GCT	2	6	618052	618057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302417
14620	NC_015966	GAA	2	6	618074	618079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302417
14621	NC_015966	TGA	2	6	618183	618188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302417
14622	NC_015966	TTC	2	6	618191	618196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302417
14623	NC_015966	GCT	2	6	618259	618264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302417
14624	NC_015966	GGC	2	6	618322	618327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
14625	NC_015966	GGC	2	6	618355	618360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
14626	NC_015966	GGC	2	6	618367	618372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
14627	NC_015966	CGG	2	6	618384	618389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
14628	NC_015966	GC	3	6	618428	618433	0 %	0 %	50 %	50 %	345302417
14629	NC_015966	TCG	2	6	618453	618458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302417
14630	NC_015966	GGC	3	9	618496	618504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
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14632	NC_015966	GGC	2	6	618586	618591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
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14637	NC_015966	GCTG	2	8	618744	618751	0 %	25 %	50 %	25 %	345302417
14638	NC_015966	TGG	2	6	618792	618797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302417
14639	NC_015966	GCT	2	6	618823	618828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302417
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14643	NC_015966	GGT	2	6	618964	618969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302417
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14645	NC_015966	TGC	2	6	618990	618995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302417
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14650	NC_015966	GTC	2	6	619239	619244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302417
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14654	NC_015966	CGG	2	6	619359	619364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
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14676	NC_015966	AGG	2	6	619959	619964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302417
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14710	NC_015966	GCT	2	6	621049	621054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14712	NC_015966	CAC	2	6	621113	621118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14717	NC_015966	ACGCA	2	10	621384	621393	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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14721	NC_015966	TGG	2	6	621460	621465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14726	NC_015966	GCG	2	6	621630	621635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14727	NC_015966	CTG	2	6	621639	621644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14730	NC_015966	TCG	2	6	621745	621750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14731	NC_015966	GGC	2	6	621795	621800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14732	NC_015966	ATG	2	6	621902	621907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14734	NC_015966	CAC	2	6	622012	622017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14735	NC_015966	AG	3	6	622041	622046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14736	NC_015966	AAG	2	6	622047	622052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14737	NC_015966	ATG	2	6	622084	622089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14738	NC_015966	AGG	2	6	622165	622170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302419
14739	NC_015966	CAG	2	6	622179	622184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302419
14740	NC_015966	CAG	2	6	622257	622262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302419
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14978	NC_015966	CAG	2	6	631714	631719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302426
14979	NC_015966	TGT	2	6	631798	631803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14980	NC_015966	CGCTC	2	10	631816	631825	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14981	NC_015966	TAC	2	6	631833	631838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14982	NC_015966	CCGT	2	8	631842	631849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14983	NC_015966	TCG	2	6	631855	631860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14984	NC_015966	GCA	2	6	631903	631908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14985	NC_015966	TTC	2	6	631912	631917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14986	NC_015966	CAG	2	6	632000	632005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302427
14987	NC_015966	GCG	3	9	632066	632074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302427
14988	NC_015966	GCA	2	6	632275	632280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302427
14989	NC_015966	TCG	2	6	632283	632288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302427
14990	NC_015966	CAC	2	6	632324	632329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302427
14991	NC_015966	CGG	2	6	632337	632342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302427
14992	NC_015966	GTGCG	2	10	632385	632394	0 %	20 %	60 %	20 %	345302427
14993	NC_015966	CAG	2	6	632435	632440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302427
14994	NC_015966	GCTT	2	8	632458	632465	0 %	50 %	25 %	25 %	345302427
14995	NC_015966	G	6	6	632469	632474	0 %	0 %	100 %	0 %	345302427
14996	NC_015966	TCG	2	6	632493	632498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302427
14997	NC_015966	GCA	2	6	632530	632535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302427
14998	NC_015966	GCC	2	6	632553	632558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302427
14999	NC_015966	CGGTAG	2	12	632595	632606	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345302427
15000	NC_015966	TCC	2	6	632655	632660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302427

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