MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015966	CAC	2	6	41024	41029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301930
1002	NC_015966	ACC	2	6	41127	41132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301930
1003	NC_015966	A	6	6	41147	41152	100 %	0 %	0 %	0 %	345301930
1004	NC_015966	CGG	2	6	41158	41163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301930
1005	NC_015966	CGA	2	6	41203	41208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301930
1006	NC_015966	GC	3	6	41238	41243	0 %	0 %	50 %	50 %	345301930
1007	NC_015966	CGT	2	6	41252	41257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301930
1008	NC_015966	ATC	2	6	41297	41302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301930
1009	NC_015966	GAA	2	6	41363	41368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301930
1010	NC_015966	CGT	3	9	41383	41391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301930
1011	NC_015966	CACG	2	8	41407	41414	25 %	0 %	25 %	50 %	345301930
1012	NC_015966	CCG	2	6	41425	41430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301930
1013	NC_015966	T	7	7	41499	41505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015966	CGA	2	6	41528	41533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301931
1015	NC_015966	CTG	2	6	41708	41713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301932
1016	NC_015966	GGCGCA	2	12	41743	41754	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345301932
1017	NC_015966	CGG	2	6	41793	41798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301932
1018	NC_015966	GGT	2	6	41842	41847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301932
1019	NC_015966	GGT	2	6	41855	41860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301932
1020	NC_015966	GTGTAC	2	12	41891	41902	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345301932
1021	NC_015966	GGC	2	6	41929	41934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301932
1022	NC_015966	GAC	2	6	41948	41953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301932
1023	NC_015966	GCCGT	2	10	41976	41985	0 %	20 %	40 %	40 %	345301932
1024	NC_015966	GGC	2	6	42016	42021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301932
1025	NC_015966	CGC	2	6	42052	42057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301932
1026	NC_015966	CGC	2	6	42111	42116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301932
1027	NC_015966	CAC	2	6	42124	42129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301932
1028	NC_015966	CGT	2	6	42172	42177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301932
1029	NC_015966	CCGGC	2	10	42194	42203	0 %	0 %	40 %	60 %	345301932
1030	NC_015966	GCG	2	6	42215	42220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301932
1031	NC_015966	CAG	2	6	42233	42238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301932
1032	NC_015966	CGG	2	6	42289	42294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301932
1033	NC_015966	CGG	2	6	42304	42309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301932
1034	NC_015966	TGG	2	6	42333	42338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301932
1035	NC_015966	CGT	2	6	42351	42356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301932
1036	NC_015966	CGAT	2	8	42364	42371	25 %	25 %	25 %	25 %	345301932
1037	NC_015966	GTGCT	2	10	42375	42384	0 %	40 %	40 %	20 %	345301932
1038	NC_015966	GGC	2	6	42414	42419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301932
1039	NC_015966	ACG	2	6	42425	42430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301932
1040	NC_015966	GGCGCT	2	12	42457	42468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345301932
1041	NC_015966	CGG	2	6	42472	42477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301932
1042	NC_015966	GCT	2	6	42481	42486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301932
1043	NC_015966	GGTG	2	8	42487	42494	0 %	25 %	75 %	0 %	345301932
1044	NC_015966	GCG	2	6	42516	42521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301932
1045	NC_015966	CCG	2	6	42538	42543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301932
1046	NC_015966	CCTG	2	8	42544	42551	0 %	25 %	25 %	50 %	345301932
1047	NC_015966	TCC	2	6	42583	42588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301932
1048	NC_015966	CGG	2	6	42604	42609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301932
1049	NC_015966	CGA	2	6	42661	42666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301932
1050	NC_015966	GGT	2	6	42697	42702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301932
1051	NC_015966	CG	3	6	42819	42824	0 %	0 %	50 %	50 %	345301932
1052	NC_015966	GCC	2	6	42839	42844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301932
1053	NC_015966	CGC	2	6	42862	42867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301932
1054	NC_015966	CG	4	8	43032	43039	0 %	0 %	50 %	50 %	345301933
1055	NC_015966	TCA	2	6	43103	43108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301933
1056	NC_015966	CTG	2	6	43133	43138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301933
1057	NC_015966	GGCT	2	8	43141	43148	0 %	25 %	50 %	25 %	345301933
1058	NC_015966	TAT	2	6	43230	43235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345301933
1059	NC_015966	AAG	2	6	43243	43248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301933
1060	NC_015966	AGATG	2	10	43321	43330	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015966	CAA	2	6	43373	43378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_015966	TG	3	6	43464	43469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015966	TGA	2	6	43513	43518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015966	GAG	2	6	43553	43558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015966	GA	4	8	43627	43634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015966	GGAG	2	8	43642	43649	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015966	GAAGGG	2	12	43720	43731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301934
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1069	NC_015966	CGTC	2	8	43900	43907	0 %	25 %	25 %	50 %	345301934
1070	NC_015966	CGGG	2	8	43987	43994	0 %	0 %	75 %	25 %	345301934
1071	NC_015966	CAG	3	9	44015	44023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301934
1072	NC_015966	GCC	2	6	44090	44095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301934
1073	NC_015966	CGT	2	6	44149	44154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301934
1074	NC_015966	CCGG	2	8	44189	44196	0 %	0 %	50 %	50 %	345301934
1075	NC_015966	TCA	2	6	44206	44211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301934
1076	NC_015966	CGAA	2	8	44269	44276	50 %	0 %	25 %	25 %	345301934
1077	NC_015966	CAG	2	6	44288	44293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301934
1078	NC_015966	GCC	2	6	44299	44304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301934
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1081	NC_015966	GTGG	2	8	44367	44374	0 %	25 %	75 %	0 %	345301934
1082	NC_015966	AGC	2	6	44382	44387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301934
1083	NC_015966	GCT	2	6	44410	44415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301934
1084	NC_015966	GGC	2	6	44432	44437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301934
1085	NC_015966	AGG	2	6	44445	44450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301934
1086	NC_015966	GGC	2	6	44471	44476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301934
1087	NC_015966	GCCAG	2	10	44536	44545	20 %	0 %	40 %	40 %	345301934
1088	NC_015966	GT	3	6	44560	44565	0 %	50 %	50 %	0 %	345301934
1089	NC_015966	GGT	2	6	44567	44572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301934
1090	NC_015966	ACG	2	6	44574	44579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301934
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1092	NC_015966	CGC	2	6	44644	44649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301934
1093	NC_015966	CCGG	2	8	44840	44847	0 %	0 %	50 %	50 %	345301934
1094	NC_015966	AGCGC	2	10	44869	44878	20 %	0 %	40 %	40 %	345301934
1095	NC_015966	TCCAGC	2	12	44958	44969	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345301934
1096	NC_015966	TCG	2	6	44985	44990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301934
1097	NC_015966	CAG	3	9	45137	45145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301934
1098	NC_015966	CGG	2	6	45181	45186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301934
1099	NC_015966	GCA	2	6	45193	45198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301934
1100	NC_015966	ACC	2	6	45234	45239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301934
1101	NC_015966	GGA	2	6	45243	45248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301934
1102	NC_015966	TCCC	2	8	45269	45276	0 %	25 %	0 %	75 %	345301934
1103	NC_015966	ATT	2	6	45322	45327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345301935
1104	NC_015966	ACG	2	6	45334	45339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301935
1105	NC_015966	GGCG	2	8	45379	45386	0 %	0 %	75 %	25 %	345301935
1106	NC_015966	GGC	2	6	45401	45406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301935
1107	NC_015966	CGC	2	6	45431	45436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301935
1108	NC_015966	TCG	3	9	45465	45473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301935
1109	NC_015966	CCAGC	2	10	45500	45509	20 %	0 %	20 %	60 %	345301935
1110	NC_015966	CGG	2	6	45637	45642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301935
1111	NC_015966	GCA	2	6	45646	45651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301935
1112	NC_015966	TCG	2	6	45666	45671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301935
1113	NC_015966	CG	3	6	45670	45675	0 %	0 %	50 %	50 %	345301935
1114	NC_015966	CGG	2	6	45697	45702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301935
1115	NC_015966	GGGCTC	2	12	45830	45841	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345301935
1116	NC_015966	ACC	2	6	45843	45848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301935
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1118	NC_015966	GTGG	2	8	45929	45936	0 %	25 %	75 %	0 %	345301935
1119	NC_015966	CCA	2	6	45958	45963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301935
1120	NC_015966	GAGC	2	8	46012	46019	25 %	0 %	50 %	25 %	345301935
1121	NC_015966	GCA	2	6	46027	46032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301935
1122	NC_015966	GCC	2	6	46049	46054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301935
1123	NC_015966	CGA	2	6	46068	46073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301935
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1126	NC_015966	CAG	2	6	46235	46240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301935
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1240	NC_015966	TGCCA	2	10	50682	50691	20 %	20 %	20 %	40 %	345301938
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1244	NC_015966	GCGGCC	2	12	50782	50793	0 %	0 %	50 %	50 %	345301939
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1249	NC_015966	GCC	2	6	51039	51044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301939
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1251	NC_015966	GAC	2	6	51081	51086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301939
1252	NC_015966	GC	3	6	51089	51094	0 %	0 %	50 %	50 %	345301939
1253	NC_015966	TGC	2	6	51113	51118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301939
1254	NC_015966	CGGGCA	2	12	51128	51139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345301939
1255	NC_015966	ACGA	2	8	51145	51152	50 %	0 %	25 %	25 %	345301939
1256	NC_015966	CTG	2	6	51178	51183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301939
1257	NC_015966	GCT	2	6	51294	51299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301939
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1260	NC_015966	CAG	2	6	51388	51393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301939
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1262	NC_015966	CTG	2	6	51412	51417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301939
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1265	NC_015966	GGCG	2	8	51636	51643	0 %	0 %	75 %	25 %	345301939
1266	NC_015966	GCC	2	6	51712	51717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301939
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1268	NC_015966	GCT	2	6	51813	51818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301939
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1270	NC_015966	GCTG	2	8	51857	51864	0 %	25 %	50 %	25 %	345301939
1271	NC_015966	CGC	2	6	51908	51913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301939
1272	NC_015966	GC	3	6	51912	51917	0 %	0 %	50 %	50 %	345301939
1273	NC_015966	CGGA	2	8	51942	51949	25 %	0 %	50 %	25 %	345301939
1274	NC_015966	GCC	2	6	51982	51987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301939
1275	NC_015966	CAG	2	6	52018	52023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301939
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1278	NC_015966	CTAC	2	8	52178	52185	25 %	25 %	0 %	50 %	345301939
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1284	NC_015966	CGCCC	2	10	52728	52737	0 %	0 %	20 %	80 %	345301939
1285	NC_015966	GCT	3	9	52761	52769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301939
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1292	NC_015966	GTC	2	6	53215	53220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301939
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1295	NC_015966	CAACTG	2	12	53323	53334	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345301939
1296	NC_015966	CCG	2	6	53355	53360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301939
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1302	NC_015966	GCA	2	6	53534	53539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1327	NC_015966	GTC	2	6	54617	54622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301941
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1335	NC_015966	CGCGA	2	10	55014	55023	20 %	0 %	40 %	40 %	345301942
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1350	NC_015966	GCA	2	6	55912	55917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301943
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1362	NC_015966	CGGA	2	8	56398	56405	25 %	0 %	50 %	25 %	345301943
1363	NC_015966	CCG	2	6	56408	56413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301943
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1368	NC_015966	ACG	2	6	56618	56623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301944
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1370	NC_015966	GCA	2	6	56691	56696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301944
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1373	NC_015966	GCC	2	6	56873	56878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301944
1374	NC_015966	CAG	2	6	56917	56922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301944
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1376	NC_015966	GCA	2	6	56946	56951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301944
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1489	NC_015966	CTA	2	6	62166	62171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301947
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1491	NC_015966	GAG	2	6	62200	62205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301947
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1493	NC_015966	CTG	2	6	62365	62370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301947
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1496	NC_015966	CCG	2	6	62486	62491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301947
1497	NC_015966	GCG	2	6	62529	62534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301947
1498	NC_015966	ACGG	2	8	62569	62576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1499	NC_015966	AGC	2	6	62714	62719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301948
1500	NC_015966	ACG	2	6	62732	62737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301948

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