MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_015966	GGC	2	6	569592	569597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302381
13503	NC_015966	GCCC	2	8	569606	569613	0 %	0 %	25 %	75 %	345302381
13504	NC_015966	GAAG	2	8	569648	569655	50 %	0 %	50 %	0 %	345302381
13505	NC_015966	CAG	2	6	569667	569672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302381
13506	NC_015966	CGG	2	6	569756	569761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302381
13507	NC_015966	CGG	2	6	569801	569806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302381
13508	NC_015966	CTA	2	6	569864	569869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302381
13509	NC_015966	TCG	2	6	569887	569892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302381
13510	NC_015966	ACGA	2	8	569901	569908	50 %	0 %	25 %	25 %	345302381
13511	NC_015966	CG	3	6	569989	569994	0 %	0 %	50 %	50 %	345302381
13512	NC_015966	GCG	2	6	570016	570021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302381
13513	NC_015966	CGC	2	6	570058	570063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302381
13514	NC_015966	CTC	2	6	570297	570302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302381
13515	NC_015966	GCT	2	6	570308	570313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302381
13516	NC_015966	TCT	2	6	570320	570325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302381
13517	NC_015966	CG	3	6	570384	570389	0 %	0 %	50 %	50 %	345302381
13518	NC_015966	GCGTCG	2	12	570449	570460	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302381
13519	NC_015966	GAA	2	6	570510	570515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302381
13520	NC_015966	CTG	2	6	570552	570557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302381
13521	NC_015966	CTGG	2	8	570614	570621	0 %	25 %	50 %	25 %	345302381
13522	NC_015966	AGCG	2	8	570622	570629	25 %	0 %	50 %	25 %	345302381
13523	NC_015966	GTT	2	6	570662	570667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302381
13524	NC_015966	GCTGAC	2	12	570731	570742	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345302381
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13526	NC_015966	GC	3	6	570792	570797	0 %	0 %	50 %	50 %	345302381
13527	NC_015966	ACGC	2	8	570818	570825	25 %	0 %	25 %	50 %	345302381
13528	NC_015966	CCG	2	6	570839	570844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302381
13529	NC_015966	GCT	2	6	570848	570853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302381
13530	NC_015966	ATCCG	2	10	570893	570902	20 %	20 %	20 %	40 %	345302381
13531	NC_015966	GCA	2	6	570956	570961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302381
13532	NC_015966	GCC	2	6	570966	570971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302381
13533	NC_015966	GC	3	6	570973	570978	0 %	0 %	50 %	50 %	345302381
13534	NC_015966	GGT	2	6	571004	571009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302381
13535	NC_015966	AGG	2	6	571021	571026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302381
13536	NC_015966	GCT	2	6	571034	571039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302381
13537	NC_015966	CGGC	2	8	571054	571061	0 %	0 %	50 %	50 %	345302381
13538	NC_015966	GTCG	2	8	571064	571071	0 %	25 %	50 %	25 %	345302381
13539	NC_015966	CGA	2	6	571078	571083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302381
13540	NC_015966	GGC	2	6	571084	571089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302381
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13544	NC_015966	GCT	2	6	571361	571366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302381
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13551	NC_015966	CGA	3	9	571700	571708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302381
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13555	NC_015966	CGA	2	6	571793	571798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302381
13556	NC_015966	CG	3	6	571818	571823	0 %	0 %	50 %	50 %	345302381
13557	NC_015966	CAG	2	6	571893	571898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302381
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13577	NC_015966	CGG	2	6	572708	572713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13581	NC_015966	GGTC	2	8	573092	573099	0 %	25 %	50 %	25 %	345302382
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13586	NC_015966	AGCGC	2	10	573245	573254	20 %	0 %	40 %	40 %	345302382
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13596	NC_015966	GCG	2	6	573681	573686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302382
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13600	NC_015966	GGC	2	6	573825	573830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302383
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13602	NC_015966	CG	3	6	573857	573862	0 %	0 %	50 %	50 %	345302383
13603	NC_015966	CAG	2	6	573874	573879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302383
13604	NC_015966	CGG	2	6	573990	573995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302383
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13606	NC_015966	C	6	6	574081	574086	0 %	0 %	0 %	100 %	345302383
13607	NC_015966	GGC	2	6	574114	574119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302383
13608	NC_015966	GC	3	6	574132	574137	0 %	0 %	50 %	50 %	345302383
13609	NC_015966	GCC	2	6	574225	574230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302383
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13853	NC_015966	GC	3	6	584064	584069	0 %	0 %	50 %	50 %	345302391
13854	NC_015966	GGC	2	6	584075	584080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302391
13855	NC_015966	TGCG	2	8	584092	584099	0 %	25 %	50 %	25 %	345302391
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13858	NC_015966	GTC	2	6	584415	584420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302391
13859	NC_015966	ACG	2	6	584536	584541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302391
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13963	NC_015966	CCGC	2	8	588892	588899	0 %	0 %	25 %	75 %	345302393
13964	NC_015966	TCG	3	9	588901	588909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302393
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13970	NC_015966	CACCTG	2	12	589149	589160	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345302394
13971	NC_015966	ATC	2	6	589168	589173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302394
13972	NC_015966	CTG	2	6	589200	589205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302394
13973	NC_015966	GGC	2	6	589225	589230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302394
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13975	NC_015966	TCG	2	6	589327	589332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302394
13976	NC_015966	CGG	2	6	589440	589445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302394
13977	NC_015966	GTG	2	6	589506	589511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302394
13978	NC_015966	GGC	2	6	589530	589535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302394
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13980	NC_015966	CCGGA	2	10	589597	589606	20 %	0 %	40 %	40 %	345302394
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13982	NC_015966	GAA	2	6	589623	589628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302394
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13984	NC_015966	CGT	2	6	589718	589723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302395
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