MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015966	GCC	2	6	548077	548082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302363
13002	NC_015966	ACT	2	6	548085	548090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302363
13003	NC_015966	TGG	2	6	548102	548107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302363
13004	NC_015966	CGA	2	6	548109	548114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302363
13005	NC_015966	GAC	2	6	548139	548144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302363
13006	NC_015966	CTG	2	6	548146	548151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302363
13007	NC_015966	GGC	2	6	548175	548180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302363
13008	NC_015966	GCT	2	6	548193	548198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302363
13009	NC_015966	GC	3	6	548224	548229	0 %	0 %	50 %	50 %	345302363
13010	NC_015966	CGA	2	6	548240	548245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302363
13011	NC_015966	CCA	2	6	548257	548262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302363
13012	NC_015966	CGA	2	6	548268	548273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302363
13013	NC_015966	AC	3	6	548302	548307	50 %	0 %	0 %	50 %	345302363
13014	NC_015966	GCC	2	6	548318	548323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302363
13015	NC_015966	CCGG	2	8	548354	548361	0 %	0 %	50 %	50 %	345302363
13016	NC_015966	GCA	2	6	548430	548435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302363
13017	NC_015966	ATC	2	6	548461	548466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302363
13018	NC_015966	GCG	2	6	548515	548520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302363
13019	NC_015966	CGA	2	6	548523	548528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302363
13020	NC_015966	GCT	3	9	548535	548543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302363
13021	NC_015966	CAT	2	6	548569	548574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302363
13022	NC_015966	GCC	2	6	548611	548616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302363
13023	NC_015966	GCC	2	6	548662	548667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302363
13024	NC_015966	TGC	3	9	548741	548749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302363
13025	NC_015966	CG	3	6	548775	548780	0 %	0 %	50 %	50 %	345302363
13026	NC_015966	GT	3	6	548809	548814	0 %	50 %	50 %	0 %	345302363
13027	NC_015966	CGG	2	6	548828	548833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302363
13028	NC_015966	CCG	2	6	548979	548984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302363
13029	NC_015966	GCT	2	6	549109	549114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_015966	AGC	3	9	549123	549131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_015966	CGC	2	6	549176	549181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13032	NC_015966	CG	3	6	549206	549211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13033	NC_015966	AAG	2	6	549227	549232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_015966	AAC	2	6	549239	549244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_015966	ATC	2	6	549263	549268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302364
13036	NC_015966	GAC	2	6	549278	549283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302364
13037	NC_015966	GCGT	2	8	549321	549328	0 %	25 %	50 %	25 %	345302364
13038	NC_015966	GCC	2	6	549381	549386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302364
13039	NC_015966	GCT	2	6	549415	549420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302364
13040	NC_015966	GCA	2	6	549430	549435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302364
13041	NC_015966	CG	3	6	549563	549568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13042	NC_015966	ACG	2	6	549571	549576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_015966	CGCAT	2	10	549607	549616	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13044	NC_015966	CCG	2	6	549688	549693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13045	NC_015966	CAG	2	6	549794	549799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302365
13046	NC_015966	GAT	2	6	549814	549819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302365
13047	NC_015966	AGA	2	6	549834	549839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302365
13048	NC_015966	TTC	2	6	549914	549919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302365
13049	NC_015966	AAGC	2	8	549935	549942	50 %	0 %	25 %	25 %	345302365
13050	NC_015966	TCC	2	6	549984	549989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302365
13051	NC_015966	GGTC	2	8	549997	550004	0 %	25 %	50 %	25 %	345302365
13052	NC_015966	AAC	2	6	550008	550013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302365
13053	NC_015966	CCG	2	6	550018	550023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302365
13054	NC_015966	CTC	2	6	550028	550033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302365
13055	NC_015966	CAG	2	6	550082	550087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302365
13056	NC_015966	CCGG	2	8	550156	550163	0 %	0 %	50 %	50 %	345302365
13057	NC_015966	ATG	2	6	550206	550211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302365
13058	NC_015966	TCC	2	6	550214	550219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13059	NC_015966	CGG	2	6	550239	550244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_015966	ACC	2	6	550349	550354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13061	NC_015966	GACTT	2	10	550383	550392	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13062	NC_015966	TCA	2	6	550432	550437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_015966	A	6	6	550471	550476	100 %	0 %	0 %	0 %	345302366
13064	NC_015966	GATGCT	2	12	550485	550496	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345302366
13065	NC_015966	CTT	2	6	550596	550601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302366
13066	NC_015966	GCG	2	6	550668	550673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302366
13067	NC_015966	CGCC	2	8	550812	550819	0 %	0 %	25 %	75 %	345302366
13068	NC_015966	TGG	2	6	550861	550866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302366
13069	NC_015966	CGG	2	6	550899	550904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302366
13070	NC_015966	ATT	2	6	550916	550921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345302366
13071	NC_015966	CCG	2	6	550937	550942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302366
13072	NC_015966	GCC	2	6	550948	550953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302366
13073	NC_015966	ACC	2	6	551089	551094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302366
13074	NC_015966	TGG	2	6	551114	551119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302366
13075	NC_015966	ACA	2	6	551159	551164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302366
13076	NC_015966	CGGG	2	8	551190	551197	0 %	0 %	75 %	25 %	345302366
13077	NC_015966	GCC	2	6	551206	551211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302366
13078	NC_015966	TGC	2	6	551282	551287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302366
13079	NC_015966	GCC	2	6	551310	551315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302366
13080	NC_015966	GCC	2	6	551317	551322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302366
13081	NC_015966	CAA	2	6	551337	551342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302366
13082	NC_015966	GCG	2	6	551381	551386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302366
13083	NC_015966	GCG	2	6	551422	551427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302366
13084	NC_015966	CGCC	2	8	551522	551529	0 %	0 %	25 %	75 %	345302366
13085	NC_015966	TGA	2	6	551543	551548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302366
13086	NC_015966	CG	3	6	551576	551581	0 %	0 %	50 %	50 %	345302366
13087	NC_015966	AGGC	2	8	551588	551595	25 %	0 %	50 %	25 %	345302366
13088	NC_015966	CG	3	6	551640	551645	0 %	0 %	50 %	50 %	345302366
13089	NC_015966	CGAC	2	8	551693	551700	25 %	0 %	25 %	50 %	345302366
13090	NC_015966	CCG	2	6	551707	551712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302366
13091	NC_015966	GGGT	2	8	551741	551748	0 %	25 %	75 %	0 %	345302366
13092	NC_015966	GGC	2	6	551816	551821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302366
13093	NC_015966	ACCG	2	8	551879	551886	25 %	0 %	25 %	50 %	345302366
13094	NC_015966	CCGG	2	8	551985	551992	0 %	0 %	50 %	50 %	345302366
13095	NC_015966	CGT	2	6	551994	551999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302366
13096	NC_015966	CTG	2	6	552034	552039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302366
13097	NC_015966	GGC	2	6	552042	552047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302366
13098	NC_015966	TCTA	2	8	552092	552099	25 %	50 %	0 %	25 %	345302366
13099	NC_015966	TGC	2	6	552128	552133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302366
13100	NC_015966	CGC	2	6	552137	552142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302366
13101	NC_015966	GGT	2	6	552180	552185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302366
13102	NC_015966	CTGG	2	8	552230	552237	0 %	25 %	50 %	25 %	345302366
13103	NC_015966	GCG	2	6	552247	552252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302366
13104	NC_015966	TGGG	2	8	552269	552276	0 %	25 %	75 %	0 %	345302366
13105	NC_015966	CCG	2	6	552298	552303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302366
13106	NC_015966	CGA	2	6	552378	552383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302366
13107	NC_015966	GCCG	2	8	552412	552419	0 %	0 %	50 %	50 %	345302366
13108	NC_015966	TGC	2	6	552464	552469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302366
13109	NC_015966	CGC	2	6	552478	552483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302366
13110	NC_015966	GCT	3	9	552495	552503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302366
13111	NC_015966	CCGA	2	8	552547	552554	25 %	0 %	25 %	50 %	345302366
13112	NC_015966	CCGG	2	8	552560	552567	0 %	0 %	50 %	50 %	345302366
13113	NC_015966	CGTG	2	8	552697	552704	0 %	25 %	50 %	25 %	345302366
13114	NC_015966	GCG	2	6	552714	552719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302366
13115	NC_015966	GCT	2	6	552837	552842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302366
13116	NC_015966	CCG	2	6	552856	552861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302366
13117	NC_015966	GAC	2	6	552882	552887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302366
13118	NC_015966	CG	4	8	552890	552897	0 %	0 %	50 %	50 %	345302366
13119	NC_015966	GATC	2	8	552903	552910	25 %	25 %	25 %	25 %	345302366
13120	NC_015966	TCG	2	6	553027	553032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302367
13121	NC_015966	GGC	2	6	553059	553064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302367
13122	NC_015966	GCT	2	6	553160	553165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302367
13123	NC_015966	GGA	2	6	553190	553195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302367
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13127	NC_015966	GC	3	6	553260	553265	0 %	0 %	50 %	50 %	345302367
13128	NC_015966	CGA	2	6	553271	553276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302367
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13134	NC_015966	TCG	2	6	553439	553444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302367
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13151	NC_015966	CGT	2	6	554108	554113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302367
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13153	NC_015966	ACG	2	6	554164	554169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302367
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13156	NC_015966	CAG	2	6	554272	554277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302368
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13200	NC_015966	TGA	2	6	555806	555811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13229	NC_015966	GCTT	2	8	556859	556866	0 %	50 %	25 %	25 %	345302369
13230	NC_015966	TGAA	2	8	556992	556999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13231	NC_015966	GCCC	2	8	557016	557023	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13232	NC_015966	TGC	2	6	557278	557283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302370
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13235	NC_015966	CTG	2	6	557436	557441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302370
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13237	NC_015966	CGG	2	6	557555	557560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13238	NC_015966	CGT	2	6	557585	557590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13239	NC_015966	GGC	2	6	557665	557670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13241	NC_015966	AT	3	6	557713	557718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13362	NC_015966	CTGC	2	8	562820	562827	0 %	25 %	25 %	50 %	345302375
13363	NC_015966	TGC	2	6	562864	562869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302375
13364	NC_015966	CGGA	2	8	562893	562900	25 %	0 %	50 %	25 %	345302375
13365	NC_015966	CGT	2	6	562904	562909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302375
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13369	NC_015966	CGT	2	6	562996	563001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302375
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13481	NC_015966	CGC	2	6	568630	568635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302380
13482	NC_015966	TGGGA	2	10	568638	568647	20 %	20 %	60 %	0 %	345302380
13483	NC_015966	AAC	2	6	568651	568656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302380
13484	NC_015966	GCAT	2	8	568657	568664	25 %	25 %	25 %	25 %	345302380
13485	NC_015966	CGC	2	6	568692	568697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302380
13486	NC_015966	ACG	2	6	568704	568709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302380
13487	NC_015966	TACCTG	2	12	568755	568766	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345302380
13488	NC_015966	ACG	2	6	568792	568797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302380
13489	NC_015966	GC	3	6	568800	568805	0 %	0 %	50 %	50 %	345302380
13490	NC_015966	CGC	2	6	568889	568894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302380
13491	NC_015966	CGA	2	6	568904	568909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302380
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