MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12004	NC_015966	ACG	2	6	504467	504472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302333
12005	NC_015966	GGC	2	6	504508	504513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302333
12006	NC_015966	GCGT	2	8	504519	504526	0 %	25 %	50 %	25 %	345302333
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12011	NC_015966	CGG	2	6	504685	504690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302333
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12241	NC_015966	ACT	2	6	513026	513031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302341
12242	NC_015966	AAC	2	6	513082	513087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302341
12243	NC_015966	TCCA	2	8	513127	513134	25 %	25 %	0 %	50 %	345302341
12244	NC_015966	AAG	2	6	513199	513204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302341
12245	NC_015966	GGC	2	6	513210	513215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302341
12246	NC_015966	GCT	2	6	513246	513251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302341
12247	NC_015966	AGCGA	2	10	513322	513331	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12248	NC_015966	GCG	2	6	513356	513361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12249	NC_015966	TAC	2	6	513377	513382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12250	NC_015966	TC	3	6	513428	513433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12251	NC_015966	AAT	2	6	513446	513451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12252	NC_015966	CGG	2	6	513509	513514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12253	NC_015966	CCG	2	6	513586	513591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12254	NC_015966	GC	3	6	513665	513670	0 %	0 %	50 %	50 %	345302342
12255	NC_015966	GCC	2	6	513761	513766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302342
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12262	NC_015966	GTC	2	6	514030	514035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302342
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12272	NC_015966	CTG	2	6	514354	514359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302342
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12276	NC_015966	TGC	2	6	514488	514493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302342
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12281	NC_015966	CGA	2	6	514865	514870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302343
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12310	NC_015966	GACG	2	8	515863	515870	25 %	0 %	50 %	25 %	345302343
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12314	NC_015966	CATT	2	8	515986	515993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12315	NC_015966	AAAT	2	8	515999	516006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12316	NC_015966	GCTT	2	8	516068	516075	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12317	NC_015966	TAT	2	6	516093	516098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12318	NC_015966	TCGCT	2	10	516103	516112	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12319	NC_015966	CTT	2	6	516212	516217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302344
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12331	NC_015966	GC	3	6	516709	516714	0 %	0 %	50 %	50 %	345302344
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12333	NC_015966	GCT	2	6	516800	516805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302344
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12352	NC_015966	GCC	2	6	517494	517499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302344
12353	NC_015966	CTGGG	2	10	517548	517557	0 %	20 %	60 %	20 %	345302344
12354	NC_015966	GGA	2	6	517589	517594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12355	NC_015966	GGACT	2	10	517623	517632	20 %	20 %	40 %	20 %	345302345
12356	NC_015966	TCCG	2	8	517644	517651	0 %	25 %	25 %	50 %	345302345
12357	NC_015966	TTC	2	6	517729	517734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302345
12358	NC_015966	ATCCG	2	10	517742	517751	20 %	20 %	20 %	40 %	345302345
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12360	NC_015966	CGACA	2	10	517874	517883	40 %	0 %	20 %	40 %	345302345
12361	NC_015966	CGC	2	6	517891	517896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302345
12362	NC_015966	AACG	2	8	517932	517939	50 %	0 %	25 %	25 %	345302345
12363	NC_015966	GCA	2	6	517945	517950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302345
12364	NC_015966	GGC	2	6	518000	518005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302345
12365	NC_015966	CGG	2	6	518057	518062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302345
12366	NC_015966	CGG	2	6	518106	518111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302345
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12369	NC_015966	CGG	2	6	518170	518175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302345
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12380	NC_015966	GGGC	2	8	518455	518462	0 %	0 %	75 %	25 %	345302345
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12478	NC_015966	GCTG	2	8	522739	522746	0 %	25 %	50 %	25 %	345302348
12479	NC_015966	CGG	2	6	522750	522755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
12480	NC_015966	CGG	2	6	522824	522829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
12481	NC_015966	GCC	2	6	522849	522854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302348
12482	NC_015966	CGG	2	6	522872	522877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
12483	NC_015966	GGC	2	6	522951	522956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
12484	NC_015966	GGC	2	6	522989	522994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
12485	NC_015966	CA	3	6	523121	523126	50 %	0 %	0 %	50 %	345302348
12486	NC_015966	GGA	2	6	523145	523150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302348
12487	NC_015966	TG	3	6	523189	523194	0 %	50 %	50 %	0 %	345302348
12488	NC_015966	GTG	3	9	523206	523214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302348
12489	NC_015966	CTG	2	6	523407	523412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302348
12490	NC_015966	GGC	2	6	523442	523447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
12491	NC_015966	CG	3	6	523480	523485	0 %	0 %	50 %	50 %	345302348
12492	NC_015966	AGC	2	6	523516	523521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302348
12493	NC_015966	AGG	2	6	523522	523527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302348
12494	NC_015966	CCG	2	6	523551	523556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302348
12495	NC_015966	GCT	2	6	523730	523735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302348
12496	NC_015966	A	6	6	523786	523791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12497	NC_015966	TTC	2	6	523810	523815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302349
12498	NC_015966	GCG	2	6	523849	523854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302349
12499	NC_015966	GGA	2	6	524100	524105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302349
12500	NC_015966	GGC	2	6	524157	524162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302349

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