MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015966	CTGA	2	8	483188	483195	25 %	25 %	25 %	25 %	345302311
11502	NC_015966	GGC	2	6	483256	483261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302312
11503	NC_015966	GGC	2	6	483291	483296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302312
11504	NC_015966	ATCT	2	8	483322	483329	25 %	50 %	0 %	25 %	345302312
11505	NC_015966	GAAA	2	8	483333	483340	75 %	0 %	25 %	0 %	345302312
11506	NC_015966	CAC	2	6	483347	483352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302312
11507	NC_015966	GAT	2	6	483465	483470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302312
11508	NC_015966	GGC	2	6	483502	483507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302312
11509	NC_015966	GCTC	2	8	483512	483519	0 %	25 %	25 %	50 %	345302312
11510	NC_015966	GCGG	2	8	483531	483538	0 %	0 %	75 %	25 %	345302312
11511	NC_015966	CCG	2	6	483539	483544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302312
11512	NC_015966	GC	3	6	483712	483717	0 %	0 %	50 %	50 %	345302312
11513	NC_015966	CGAA	2	8	483776	483783	50 %	0 %	25 %	25 %	345302312
11514	NC_015966	GCT	2	6	483822	483827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302312
11515	NC_015966	CGA	2	6	483846	483851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302312
11516	NC_015966	ATCG	2	8	483859	483866	25 %	25 %	25 %	25 %	345302312
11517	NC_015966	GAA	2	6	483870	483875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302312
11518	NC_015966	GAT	2	6	483906	483911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302312
11519	NC_015966	TGG	2	6	483935	483940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302312
11520	NC_015966	AGC	2	6	483941	483946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302312
11521	NC_015966	GAA	2	6	483949	483954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302312
11522	NC_015966	CG	3	6	484046	484051	0 %	0 %	50 %	50 %	345302312
11523	NC_015966	CTG	2	6	484081	484086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302312
11524	NC_015966	GAG	2	6	484147	484152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302312
11525	NC_015966	ATCG	2	8	484159	484166	25 %	25 %	25 %	25 %	345302312
11526	NC_015966	GTG	2	6	484168	484173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302312
11527	NC_015966	GCA	2	6	484175	484180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302312
11528	NC_015966	GCC	2	6	484199	484204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302312
11529	NC_015966	GCA	2	6	484212	484217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302312
11530	NC_015966	GCT	2	6	484233	484238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302312
11531	NC_015966	GCT	2	6	484242	484247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302312
11532	NC_015966	GCGG	2	8	484284	484291	0 %	0 %	75 %	25 %	345302312
11533	NC_015966	CTT	2	6	484390	484395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302313
11534	NC_015966	T	7	7	484407	484413	0 %	100 %	0 %	0 %	345302313
11535	NC_015966	GGT	2	6	484444	484449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302313
11536	NC_015966	GGC	2	6	484493	484498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302313
11537	NC_015966	GGC	2	6	484505	484510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302313
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11539	NC_015966	TTC	2	6	484640	484645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302313
11540	NC_015966	GCG	2	6	484721	484726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302313
11541	NC_015966	CAG	3	9	484754	484762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302313
11542	NC_015966	CCG	2	6	484782	484787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302313
11543	NC_015966	GCC	2	6	484833	484838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302313
11544	NC_015966	CGC	2	6	484927	484932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302313
11545	NC_015966	AGGCG	2	10	484948	484957	20 %	0 %	60 %	20 %	345302313
11546	NC_015966	GCCCG	2	10	484978	484987	0 %	0 %	40 %	60 %	345302313
11547	NC_015966	CG	3	6	485031	485036	0 %	0 %	50 %	50 %	345302313
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11551	NC_015966	GGC	2	6	485106	485111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302313
11552	NC_015966	ACTT	2	8	485174	485181	25 %	50 %	0 %	25 %	345302313
11553	NC_015966	GGCTTC	2	12	485192	485203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302313
11554	NC_015966	CGA	2	6	485227	485232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302313
11555	NC_015966	TCCG	2	8	485246	485253	0 %	25 %	25 %	50 %	345302313
11556	NC_015966	GCA	2	6	485320	485325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302313
11557	NC_015966	GATC	2	8	485386	485393	25 %	25 %	25 %	25 %	345302313
11558	NC_015966	TCCGC	2	10	485402	485411	0 %	20 %	20 %	60 %	345302313
11559	NC_015966	GCA	2	6	485434	485439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302313
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11571	NC_015966	TGGG	2	8	486137	486144	0 %	25 %	75 %	0 %	345302314
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11593	NC_015966	GGCG	2	8	486783	486790	0 %	0 %	75 %	25 %	345302314
11594	NC_015966	CGT	2	6	486792	486797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302314
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11602	NC_015966	GTCCG	2	10	487049	487058	0 %	20 %	40 %	40 %	345302315
11603	NC_015966	GT	3	6	487092	487097	0 %	50 %	50 %	0 %	345302315
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11741	NC_015966	GCA	2	6	493806	493811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302323
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11962	NC_015966	GCT	3	9	502600	502608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302332
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11974	NC_015966	CGAC	2	8	503220	503227	25 %	0 %	25 %	50 %	345302332
11975	NC_015966	CG	3	6	503257	503262	0 %	0 %	50 %	50 %	345302332
11976	NC_015966	TTC	2	6	503264	503269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302332
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11978	NC_015966	GC	3	6	503366	503371	0 %	0 %	50 %	50 %	345302332
11979	NC_015966	AAC	2	6	503393	503398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302332
11980	NC_015966	AGC	2	6	503412	503417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302332
11981	NC_015966	AGC	2	6	503430	503435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302332
11982	NC_015966	GCT	2	6	503491	503496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302332
11983	NC_015966	GCG	2	6	503502	503507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302332
11984	NC_015966	TGA	2	6	503514	503519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302332
11985	NC_015966	CAT	2	6	503521	503526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302332
11986	NC_015966	CG	3	6	503550	503555	0 %	0 %	50 %	50 %	345302332
11987	NC_015966	CGG	2	6	503641	503646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302332
11988	NC_015966	TGC	2	6	503658	503663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302332
11989	NC_015966	ACG	2	6	503720	503725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302332
11990	NC_015966	GCC	2	6	503792	503797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302332
11991	NC_015966	GCTAC	2	10	503818	503827	20 %	20 %	20 %	40 %	345302332
11992	NC_015966	GCT	2	6	503908	503913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302333
11993	NC_015966	ATC	2	6	503939	503944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302333
11994	NC_015966	GTC	2	6	504007	504012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302333
11995	NC_015966	TCA	2	6	504132	504137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302333
11996	NC_015966	CTC	2	6	504206	504211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302333
11997	NC_015966	CGA	2	6	504217	504222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302333
11998	NC_015966	TCA	2	6	504267	504272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302333
11999	NC_015966	CG	3	6	504292	504297	0 %	0 %	50 %	50 %	345302333
12000	NC_015966	GAG	2	6	504329	504334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302333

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