MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015966	TGGG	2	8	462212	462219	0 %	25 %	75 %	0 %	345302296
11002	NC_015966	G	6	6	462217	462222	0 %	0 %	100 %	0 %	345302296
11003	NC_015966	TTCA	2	8	462269	462276	25 %	50 %	0 %	25 %	345302296
11004	NC_015966	TTC	2	6	462290	462295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302296
11005	NC_015966	ACA	2	6	462324	462329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302296
11006	NC_015966	TGC	2	6	462330	462335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302296
11007	NC_015966	CCCGT	2	10	462405	462414	0 %	20 %	20 %	60 %	345302296
11008	NC_015966	ACG	2	6	462468	462473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302296
11009	NC_015966	CCGA	2	8	462479	462486	25 %	0 %	25 %	50 %	345302296
11010	NC_015966	ATC	2	6	462587	462592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302296
11011	NC_015966	CTG	3	9	462596	462604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302296
11012	NC_015966	TGG	2	6	462636	462641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302296
11013	NC_015966	ACG	2	6	462648	462653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302296
11014	NC_015966	TGC	2	6	462699	462704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302296
11015	NC_015966	TTTCT	2	10	462713	462722	0 %	80 %	0 %	20 %	345302296
11016	NC_015966	ACA	2	6	462738	462743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302296
11017	NC_015966	GCC	2	6	462788	462793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302296
11018	NC_015966	GCCAGC	2	12	462882	462893	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302296
11019	NC_015966	TCGT	2	8	462899	462906	0 %	50 %	25 %	25 %	345302296
11020	NC_015966	GC	4	8	462907	462914	0 %	0 %	50 %	50 %	345302296
11021	NC_015966	GTGCTC	2	12	462932	462943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302296
11022	NC_015966	ACCGAG	2	12	462968	462979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302296
11023	NC_015966	GCT	2	6	463006	463011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302296
11024	NC_015966	CAT	3	9	463027	463035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302296
11025	NC_015966	GCC	2	6	463190	463195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302296
11026	NC_015966	CCGG	2	8	463215	463222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11027	NC_015966	TCG	2	6	463241	463246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_015966	CGAAA	2	10	463281	463290	60 %	0 %	20 %	20 %	345302297
11029	NC_015966	GCC	2	6	463299	463304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302297
11030	NC_015966	GGA	2	6	463305	463310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302297
11031	NC_015966	GGC	2	6	463317	463322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302297
11032	NC_015966	GCT	2	6	463368	463373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302297
11033	NC_015966	TGG	2	6	463406	463411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302297
11034	NC_015966	TCA	2	6	463475	463480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302297
11035	NC_015966	CTA	2	6	463506	463511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302297
11036	NC_015966	ATG	2	6	463564	463569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302297
11037	NC_015966	GGC	2	6	463630	463635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_015966	TCG	2	6	463790	463795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_015966	CAT	2	6	463834	463839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_015966	CAAC	2	8	463931	463938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11041	NC_015966	CTG	2	6	463957	463962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302298
11042	NC_015966	AGC	2	6	464108	464113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302298
11043	NC_015966	GGT	2	6	464139	464144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302298
11044	NC_015966	GAG	2	6	464146	464151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302298
11045	NC_015966	ACG	2	6	464159	464164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302298
11046	NC_015966	TGA	2	6	464174	464179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302298
11047	NC_015966	CTT	2	6	464181	464186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302298
11048	NC_015966	CGG	2	6	464188	464193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302298
11049	NC_015966	ACG	2	6	464237	464242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302298
11050	NC_015966	TTC	2	6	464254	464259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302298
11051	NC_015966	CGC	2	6	464291	464296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302298
11052	NC_015966	GGC	2	6	464332	464337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302298
11053	NC_015966	TGG	2	6	464345	464350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302298
11054	NC_015966	TTC	2	6	464395	464400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302298
11055	NC_015966	TCT	2	6	464426	464431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302298
11056	NC_015966	CTG	2	6	464470	464475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302298
11057	NC_015966	GCCG	2	8	464487	464494	0 %	0 %	50 %	50 %	345302298
11058	NC_015966	GAG	2	6	464503	464508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302298
11059	NC_015966	GCC	2	6	464530	464535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302298
11060	NC_015966	GTG	2	6	464572	464577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302298
11061	NC_015966	TG	3	6	464576	464581	0 %	50 %	50 %	0 %	345302298
11062	NC_015966	GGC	2	6	464590	464595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302298
11063	NC_015966	TGG	2	6	464627	464632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302298
11064	NC_015966	ATC	2	6	464668	464673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302298
11065	NC_015966	AAG	2	6	464687	464692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302298
11066	NC_015966	CGC	2	6	464735	464740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11067	NC_015966	GAC	2	6	464753	464758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_015966	GCG	2	6	464759	464764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_015966	T	7	7	464770	464776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_015966	CTA	2	6	464777	464782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_015966	ACG	2	6	464853	464858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_015966	CCG	2	6	464906	464911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11073	NC_015966	TTCGGC	2	12	465047	465058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302299
11074	NC_015966	TTC	2	6	465089	465094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302299
11075	NC_015966	GCCG	2	8	465146	465153	0 %	0 %	50 %	50 %	345302299
11076	NC_015966	CTT	3	9	465173	465181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302299
11077	NC_015966	TGA	2	6	465238	465243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302299
11078	NC_015966	TCG	2	6	465255	465260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302299
11079	NC_015966	CGGCG	2	10	465291	465300	0 %	0 %	60 %	40 %	345302299
11080	NC_015966	TTC	2	6	465341	465346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302299
11081	NC_015966	GC	4	8	465358	465365	0 %	0 %	50 %	50 %	345302299
11082	NC_015966	GCACGC	2	12	465367	465378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302299
11083	NC_015966	GCA	2	6	465430	465435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302299
11084	NC_015966	GGCG	2	8	465475	465482	0 %	0 %	75 %	25 %	345302299
11085	NC_015966	GATGGC	2	12	465599	465610	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345302300
11086	NC_015966	ACG	2	6	465611	465616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302300
11087	NC_015966	TCG	2	6	465633	465638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302300
11088	NC_015966	GAAT	2	8	465646	465653	50 %	25 %	25 %	0 %	345302300
11089	NC_015966	ATG	2	6	465699	465704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302300
11090	NC_015966	ATA	2	6	465710	465715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345302300
11091	NC_015966	GGC	2	6	465742	465747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302300
11092	NC_015966	GCCG	2	8	465755	465762	0 %	0 %	50 %	50 %	345302300
11093	NC_015966	TC	3	6	465790	465795	0 %	50 %	0 %	50 %	345302300
11094	NC_015966	GAT	2	6	465806	465811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302300
11095	NC_015966	AGC	2	6	465849	465854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302300
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11097	NC_015966	CA	3	6	466010	466015	50 %	0 %	0 %	50 %	345302300
11098	NC_015966	CTC	2	6	466028	466033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302300
11099	NC_015966	GTC	2	6	466034	466039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302300
11100	NC_015966	GAT	2	6	466067	466072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302300
11101	NC_015966	CGG	2	6	466090	466095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302300
11102	NC_015966	CTT	2	6	466096	466101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302300
11103	NC_015966	CGG	2	6	466146	466151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302300
11104	NC_015966	GGGT	2	8	466229	466236	0 %	25 %	75 %	0 %	345302300
11105	NC_015966	CGC	3	9	466274	466282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302300
11106	NC_015966	CAC	2	6	466311	466316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302300
11107	NC_015966	TGC	2	6	466390	466395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302300
11108	NC_015966	CGG	2	6	466434	466439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302300
11109	NC_015966	A	6	6	466489	466494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_015966	ATG	2	6	466499	466504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_015966	TTG	2	6	466507	466512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_015966	GCC	2	6	466541	466546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11113	NC_015966	CTT	2	6	466572	466577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_015966	GCC	2	6	466608	466613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11115	NC_015966	CT	3	6	466638	466643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11116	NC_015966	GTGCTG	2	12	466705	466716	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345302301
11117	NC_015966	TGGC	2	8	466732	466739	0 %	25 %	50 %	25 %	345302301
11118	NC_015966	CTG	2	6	466765	466770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302301
11119	NC_015966	CTG	2	6	466810	466815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302301
11120	NC_015966	CGTT	2	8	466850	466857	0 %	50 %	25 %	25 %	345302301
11121	NC_015966	ATC	2	6	466873	466878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302301
11122	NC_015966	GCC	2	6	466990	466995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302301
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11124	NC_015966	TCG	2	6	467003	467008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302301
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11127	NC_015966	GCGGG	2	10	467101	467110	0 %	0 %	80 %	20 %	345302301
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11129	NC_015966	CTG	3	9	467191	467199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302301
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11132	NC_015966	CTG	3	9	467260	467268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302301
11133	NC_015966	CTG	2	6	467311	467316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302301
11134	NC_015966	CTG	2	6	467320	467325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302301
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11152	NC_015966	GGC	2	6	468027	468032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302301
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11203	NC_015966	T	6	6	470243	470248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11229	NC_015966	CCG	2	6	471255	471260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302303
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11232	NC_015966	GCA	2	6	471323	471328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302303
11233	NC_015966	CG	4	8	471343	471350	0 %	0 %	50 %	50 %	345302303
11234	NC_015966	CGG	2	6	471385	471390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302303
11235	NC_015966	GATC	2	8	471434	471441	25 %	25 %	25 %	25 %	345302303
11236	NC_015966	GC	3	6	471468	471473	0 %	0 %	50 %	50 %	345302303
11237	NC_015966	CGG	2	6	471475	471480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302303
11238	NC_015966	GCC	2	6	471505	471510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302303
11239	NC_015966	GGCG	2	8	471560	471567	0 %	0 %	75 %	25 %	345302303
11240	NC_015966	GCCA	2	8	471571	471578	25 %	0 %	25 %	50 %	345302303
11241	NC_015966	TTCGGC	2	12	471600	471611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302303
11242	NC_015966	GATC	2	8	471617	471624	25 %	25 %	25 %	25 %	345302303
11243	NC_015966	GCA	2	6	471632	471637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302303
11244	NC_015966	AGG	2	6	471644	471649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302303
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11247	NC_015966	GCT	2	6	471803	471808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302303
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11280	NC_015966	GTG	2	6	473210	473215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302304
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11295	NC_015966	ACG	2	6	473829	473834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302305
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11303	NC_015966	TCGA	2	8	474297	474304	25 %	25 %	25 %	25 %	345302305
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11310	NC_015966	CGG	2	6	474610	474615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
11311	NC_015966	CGG	2	6	474639	474644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
11312	NC_015966	CAGGCC	2	12	474668	474679	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302305
11313	NC_015966	GATC	2	8	474736	474743	25 %	25 %	25 %	25 %	345302305
11314	NC_015966	CCA	2	6	474826	474831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302305
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11317	NC_015966	TCG	2	6	475134	475139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302305
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11320	NC_015966	CGG	2	6	475227	475232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
11321	NC_015966	TCG	2	6	475236	475241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302305
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11328	NC_015966	GTC	2	6	475514	475519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302305
11329	NC_015966	GAA	2	6	475542	475547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302305
11330	NC_015966	GCGTGG	2	12	475579	475590	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	345302305
11331	NC_015966	AGC	2	6	475614	475619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302305
11332	NC_015966	GCGG	2	8	475637	475644	0 %	0 %	75 %	25 %	345302305
11333	NC_015966	GTC	2	6	475649	475654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302305
11334	NC_015966	GCG	2	6	475712	475717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
11335	NC_015966	GCA	2	6	475732	475737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302305
11336	NC_015966	GGTCGA	2	12	475816	475827	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345302305
11337	NC_015966	TCG	2	6	475845	475850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302305
11338	NC_015966	GGC	2	6	475852	475857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
11339	NC_015966	CGG	2	6	475918	475923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
11340	NC_015966	GGC	2	6	475933	475938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
11341	NC_015966	CAG	3	9	475964	475972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302305
11342	NC_015966	ACGT	2	8	475983	475990	25 %	25 %	25 %	25 %	345302305
11343	NC_015966	TGCG	2	8	476013	476020	0 %	25 %	50 %	25 %	345302305
11344	NC_015966	GCC	2	6	476022	476027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302305
11345	NC_015966	AGC	2	6	476082	476087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302305
11346	NC_015966	TCC	2	6	476088	476093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302305
11347	NC_015966	CGT	2	6	476113	476118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302305
11348	NC_015966	CGGCG	2	10	476188	476197	0 %	0 %	60 %	40 %	345302305
11349	NC_015966	GCT	2	6	476206	476211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302305
11350	NC_015966	GGC	3	9	476212	476220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
11351	NC_015966	GC	3	6	476219	476224	0 %	0 %	50 %	50 %	345302305
11352	NC_015966	TTC	2	6	476315	476320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302305
11353	NC_015966	CAC	2	6	476354	476359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302305
11354	NC_015966	CGG	2	6	476413	476418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
11355	NC_015966	GC	3	6	476454	476459	0 %	0 %	50 %	50 %	345302305
11356	NC_015966	GAC	2	6	476504	476509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302305
11357	NC_015966	TGG	2	6	476567	476572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11358	NC_015966	GCA	3	9	476617	476625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11359	NC_015966	ACGGCG	2	12	476636	476647	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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11362	NC_015966	GCCG	2	8	476742	476749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11465	NC_015966	A	6	6	481671	481676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11480	NC_015966	GCT	2	6	482283	482288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302311
11481	NC_015966	AAC	2	6	482431	482436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302311
11482	NC_015966	TGC	2	6	482453	482458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302311
11483	NC_015966	GGC	2	6	482469	482474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302311
11484	NC_015966	ACG	2	6	482476	482481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302311
11485	NC_015966	GAC	2	6	482512	482517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302311
11486	NC_015966	CG	3	6	482540	482545	0 %	0 %	50 %	50 %	345302311
11487	NC_015966	GCG	2	6	482580	482585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302311
11488	NC_015966	CTG	2	6	482599	482604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302311
11489	NC_015966	CTG	2	6	482650	482655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302311
11490	NC_015966	GGC	2	6	482656	482661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302311
11491	NC_015966	GAAC	2	8	482682	482689	50 %	0 %	25 %	25 %	345302311
11492	NC_015966	GCGTGC	2	12	482720	482731	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302311
11493	NC_015966	GGC	2	6	482835	482840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302311
11494	NC_015966	AAG	2	6	482843	482848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302311
11495	NC_015966	ACGG	2	8	483004	483011	25 %	0 %	50 %	25 %	345302311
11496	NC_015966	CGGC	2	8	483014	483021	0 %	0 %	50 %	50 %	345302311
11497	NC_015966	GCC	2	6	483022	483027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302311
11498	NC_015966	G	6	6	483029	483034	0 %	0 %	100 %	0 %	345302311
11499	NC_015966	GGC	2	6	483069	483074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302311
11500	NC_015966	ACC	2	6	483146	483151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302311

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