MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_015966	GCT	2	6	399589	399594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302235
9502	NC_015966	GCT	2	6	399658	399663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302235
9503	NC_015966	TGG	3	9	399672	399680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302235
9504	NC_015966	GCC	2	6	399722	399727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302235
9505	NC_015966	GAT	2	6	399790	399795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302235
9506	NC_015966	CTG	4	12	399806	399817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302235
9507	NC_015966	AC	3	6	399828	399833	50 %	0 %	0 %	50 %	345302235
9508	NC_015966	TGG	2	6	399834	399839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302235
9509	NC_015966	GCT	2	6	399862	399867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302235
9510	NC_015966	ATG	2	6	399887	399892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302235
9511	NC_015966	TGATC	2	10	399943	399952	20 %	40 %	20 %	20 %	345302235
9512	NC_015966	GCG	2	6	399975	399980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302235
9513	NC_015966	ATC	2	6	400001	400006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302235
9514	NC_015966	GCT	2	6	400042	400047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302235
9515	NC_015966	GTG	2	6	400091	400096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302235
9516	NC_015966	TGG	2	6	400128	400133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302235
9517	NC_015966	GCG	2	6	400149	400154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302235
9518	NC_015966	GGC	3	9	400183	400191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302235
9519	NC_015966	CTG	2	6	400196	400201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302235
9520	NC_015966	TTC	2	6	400229	400234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302235
9521	NC_015966	CGA	2	6	400296	400301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9522	NC_015966	T	6	6	400323	400328	0 %	100 %	0 %	0 %	345302236
9523	NC_015966	GGC	3	9	400334	400342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302236
9524	NC_015966	CCGTC	2	10	400367	400376	0 %	20 %	20 %	60 %	345302236
9525	NC_015966	GTG	2	6	400428	400433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302236
9526	NC_015966	TAC	2	6	400447	400452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302236
9527	NC_015966	GAC	2	6	400497	400502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9528	NC_015966	CGA	2	6	400505	400510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9529	NC_015966	GAC	2	6	400527	400532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9530	NC_015966	GGC	2	6	400541	400546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302236
9531	NC_015966	CGA	2	6	400580	400585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9532	NC_015966	GGC	2	6	400586	400591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302236
9533	NC_015966	GCG	2	6	400592	400597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302236
9534	NC_015966	GCT	2	6	400610	400615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9535	NC_015966	ACG	2	6	400692	400697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9536	NC_015966	TGG	2	6	400728	400733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302236
9537	NC_015966	CGG	2	6	400762	400767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302236
9538	NC_015966	TGC	2	6	400774	400779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9539	NC_015966	GGC	2	6	400808	400813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302236
9540	NC_015966	CGG	2	6	400816	400821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302236
9541	NC_015966	CGG	2	6	400824	400829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302236
9542	NC_015966	CTGG	2	8	400853	400860	0 %	25 %	50 %	25 %	345302236
9543	NC_015966	GCT	3	9	400946	400954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9544	NC_015966	GC	3	6	401031	401036	0 %	0 %	50 %	50 %	345302236
9545	NC_015966	GC	3	6	401055	401060	0 %	0 %	50 %	50 %	345302236
9546	NC_015966	GC	3	6	401071	401076	0 %	0 %	50 %	50 %	345302236
9547	NC_015966	GCT	2	6	401189	401194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9548	NC_015966	GAC	2	6	401226	401231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9549	NC_015966	TG	3	6	401277	401282	0 %	50 %	50 %	0 %	345302236
9550	NC_015966	GCTG	2	8	401356	401363	0 %	25 %	50 %	25 %	345302236
9551	NC_015966	CAA	2	6	401369	401374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302236
9552	NC_015966	GGCG	2	8	401378	401385	0 %	0 %	75 %	25 %	345302236
9553	NC_015966	ACG	2	6	401419	401424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9554	NC_015966	CCGGC	2	10	401517	401526	0 %	0 %	40 %	60 %	345302236
9555	NC_015966	CACG	2	8	401564	401571	25 %	0 %	25 %	50 %	345302236
9556	NC_015966	GACGC	2	10	401616	401625	20 %	0 %	40 %	40 %	345302236
9557	NC_015966	CGT	2	6	401636	401641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9558	NC_015966	GCT	2	6	401669	401674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302236
9559	NC_015966	ACC	2	6	401712	401717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302236
9560	NC_015966	CAC	2	6	401727	401732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302236
9561	NC_015966	GTT	2	6	401776	401781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302237
9562	NC_015966	ACG	2	6	401865	401870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302237
9563	NC_015966	GC	4	8	401871	401878	0 %	0 %	50 %	50 %	345302237
9564	NC_015966	GCG	2	6	401895	401900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302237
9565	NC_015966	GCCG	2	8	401902	401909	0 %	0 %	50 %	50 %	345302237
9566	NC_015966	TCCG	2	8	402020	402027	0 %	25 %	25 %	50 %	345302237
9567	NC_015966	CGA	2	6	402100	402105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302237
9568	NC_015966	ACG	2	6	402233	402238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302237
9569	NC_015966	TGC	2	6	402288	402293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302237
9570	NC_015966	TCCA	2	8	402308	402315	25 %	25 %	0 %	50 %	345302237
9571	NC_015966	CGA	2	6	402328	402333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302237
9572	NC_015966	AGC	2	6	402339	402344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302237
9573	NC_015966	CCG	2	6	402353	402358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302237
9574	NC_015966	CGT	2	6	402400	402405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302237
9575	NC_015966	GCTG	2	8	402477	402484	0 %	25 %	50 %	25 %	345302237
9576	NC_015966	GCA	2	6	402508	402513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302237
9577	NC_015966	GCATGG	2	12	402522	402533	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345302237
9578	NC_015966	GCT	2	6	402535	402540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302237
9579	NC_015966	GTG	2	6	402656	402661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302237
9580	NC_015966	CGA	2	6	402667	402672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302237
9581	NC_015966	CTG	2	6	402674	402679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302237
9582	NC_015966	CTA	2	6	402682	402687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302237
9583	NC_015966	GGC	2	6	402691	402696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302237
9584	NC_015966	GT	3	6	402768	402773	0 %	50 %	50 %	0 %	345302237
9585	NC_015966	GTA	2	6	402795	402800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9586	NC_015966	ATG	2	6	402867	402872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302238
9587	NC_015966	GTC	2	6	402873	402878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302238
9588	NC_015966	GCC	2	6	402935	402940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302238
9589	NC_015966	TGGC	2	8	402971	402978	0 %	25 %	50 %	25 %	345302238
9590	NC_015966	GTG	3	9	403034	403042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302238
9591	NC_015966	TGA	2	6	403113	403118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302238
9592	NC_015966	GCG	2	6	403166	403171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302238
9593	NC_015966	CG	3	6	403212	403217	0 %	0 %	50 %	50 %	345302238
9594	NC_015966	CTA	2	6	403249	403254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302238
9595	NC_015966	ACA	2	6	403374	403379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302238
9596	NC_015966	GACG	2	8	403409	403416	25 %	0 %	50 %	25 %	345302238
9597	NC_015966	GCT	3	9	403420	403428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302238
9598	NC_015966	CCGGA	2	10	403443	403452	20 %	0 %	40 %	40 %	345302238
9599	NC_015966	GGCCGA	2	12	403471	403482	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345302238
9600	NC_015966	CGG	2	6	403567	403572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302238
9601	NC_015966	TGA	2	6	403605	403610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302238
9602	NC_015966	CG	3	6	403644	403649	0 %	0 %	50 %	50 %	345302238
9603	NC_015966	GGC	3	9	403660	403668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302238
9604	NC_015966	CTG	2	6	403670	403675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302238
9605	NC_015966	GGAG	2	8	403686	403693	25 %	0 %	75 %	0 %	345302238
9606	NC_015966	GGT	2	6	403699	403704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302238
9607	NC_015966	GCGA	2	8	403743	403750	25 %	0 %	50 %	25 %	345302238
9608	NC_015966	AGC	2	6	403899	403904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302238
9609	NC_015966	CTG	2	6	404110	404115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302239
9610	NC_015966	GAG	2	6	404128	404133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302239
9611	NC_015966	GCG	2	6	404154	404159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302239
9612	NC_015966	GGA	2	6	404196	404201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302239
9613	NC_015966	ACC	2	6	404329	404334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302239
9614	NC_015966	TCCGA	2	10	404383	404392	20 %	20 %	20 %	40 %	345302239
9615	NC_015966	CGC	2	6	404394	404399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302239
9616	NC_015966	CAG	2	6	404413	404418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302239
9617	NC_015966	GTCG	2	8	404529	404536	0 %	25 %	50 %	25 %	345302239
9618	NC_015966	GCG	2	6	404643	404648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302239
9619	NC_015966	GGGC	2	8	404687	404694	0 %	0 %	75 %	25 %	345302239
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9621	NC_015966	AGCG	2	8	404950	404957	25 %	0 %	50 %	25 %	345302239
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9724	NC_015966	CG	3	6	409275	409280	0 %	0 %	50 %	50 %	345302243
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9983	NC_015966	GCAGG	2	10	421418	421427	20 %	0 %	60 %	20 %	345302254
9984	NC_015966	GGA	2	6	421454	421459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302254
9985	NC_015966	A	6	6	421459	421464	100 %	0 %	0 %	0 %	345302254
9986	NC_015966	ATC	2	6	421501	421506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302254
9987	NC_015966	GCC	2	6	421535	421540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302254
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9991	NC_015966	ACG	2	6	421744	421749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302255
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