MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_015966	CGG	2	6	379086	379091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302222
9002	NC_015966	GCA	2	6	379101	379106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302222
9003	NC_015966	CGC	2	6	379119	379124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302222
9004	NC_015966	TTC	2	6	379132	379137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302222
9005	NC_015966	CGA	2	6	379143	379148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302222
9006	NC_015966	GTACC	2	10	379179	379188	20 %	20 %	20 %	40 %	345302222
9007	NC_015966	CGG	2	6	379230	379235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302222
9008	NC_015966	GGT	2	6	379489	379494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302222
9009	NC_015966	GTG	2	6	379513	379518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302222
9010	NC_015966	CAG	3	9	379537	379545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302222
9011	NC_015966	A	6	6	379625	379630	100 %	0 %	0 %	0 %	345302222
9012	NC_015966	CAG	3	9	379654	379662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302222
9013	NC_015966	A	10	10	379806	379815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_015966	CTG	3	9	379869	379877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302223
9015	NC_015966	CGG	2	6	379891	379896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302223
9016	NC_015966	CAG	2	6	379897	379902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302223
9017	NC_015966	GCC	2	6	379914	379919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302223
9018	NC_015966	AGG	2	6	379927	379932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302223
9019	NC_015966	AGG	2	6	380014	380019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302223
9020	NC_015966	GCC	2	6	380028	380033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302223
9021	NC_015966	CAT	2	6	380132	380137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302223
9022	NC_015966	ATG	2	6	380155	380160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302223
9023	NC_015966	GGA	2	6	380207	380212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302223
9024	NC_015966	CAG	2	6	380219	380224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302223
9025	NC_015966	ATG	2	6	380292	380297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302223
9026	NC_015966	CGCC	2	8	380338	380345	0 %	0 %	25 %	75 %	345302223
9027	NC_015966	GAG	2	6	380346	380351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302223
9028	NC_015966	GAC	2	6	380394	380399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302223
9029	NC_015966	GCC	2	6	380406	380411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302223
9030	NC_015966	GGGC	2	8	380457	380464	0 %	0 %	75 %	25 %	345302223
9031	NC_015966	AAC	2	6	380469	380474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302223
9032	NC_015966	GCC	2	6	380499	380504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302223
9033	NC_015966	TGA	2	6	380557	380562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302223
9034	NC_015966	ATG	2	6	380577	380582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302223
9035	NC_015966	CGG	2	6	380630	380635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302223
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9037	NC_015966	TAC	2	6	380676	380681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302223
9038	NC_015966	TGA	2	6	380755	380760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302223
9039	NC_015966	TCA	2	6	380785	380790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302223
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9041	NC_015966	TGG	2	6	380854	380859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302223
9042	NC_015966	CCG	2	6	380862	380867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302223
9043	NC_015966	CAG	2	6	380886	380891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302223
9044	NC_015966	CGC	2	6	380898	380903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302223
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9048	NC_015966	CGG	2	6	381049	381054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302223
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9052	NC_015966	GCT	2	6	381182	381187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302223
9053	NC_015966	GCC	2	6	381192	381197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302223
9054	NC_015966	CGG	2	6	381221	381226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302223
9055	NC_015966	GCC	2	6	381248	381253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302223
9056	NC_015966	GCC	3	9	381260	381268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302223
9057	NC_015966	GCGG	2	8	381310	381317	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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9059	NC_015966	GCA	2	6	381379	381384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_015966	TCG	2	6	381399	381404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_015966	GCA	2	6	381406	381411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9064	NC_015966	AAG	2	6	381510	381515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302224
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9088	NC_015966	CCAG	2	8	382372	382379	25 %	0 %	25 %	50 %	345302224
9089	NC_015966	GCG	3	9	382407	382415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302224
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9092	NC_015966	TCGCC	2	10	382504	382513	0 %	20 %	20 %	60 %	345302224
9093	NC_015966	TCG	2	6	382557	382562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302224
9094	NC_015966	CGA	2	6	382590	382595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302224
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9097	NC_015966	G	6	6	382702	382707	0 %	0 %	100 %	0 %	345302224
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9107	NC_015966	GCCG	2	8	383286	383293	0 %	0 %	50 %	50 %	345302225
9108	NC_015966	GCG	2	6	383366	383371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302225
9109	NC_015966	CGAAC	2	10	383379	383388	40 %	0 %	20 %	40 %	345302225
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9116	NC_015966	CCCAG	2	10	383720	383729	20 %	0 %	20 %	60 %	345302225
9117	NC_015966	CAG	2	6	383745	383750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302225
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9121	NC_015966	GCC	2	6	383975	383980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302225
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9245	NC_015966	GGA	2	6	388863	388868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302229
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9266	NC_015966	CCGG	2	8	389794	389801	0 %	0 %	50 %	50 %	345302229
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9362	NC_015966	GCC	2	6	393875	393880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302231
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9487	NC_015966	GTG	2	6	398927	398932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302234
9488	NC_015966	TCA	2	6	398946	398951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302234
9489	NC_015966	GAT	2	6	399001	399006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302234
9490	NC_015966	CTGG	2	8	399034	399041	0 %	25 %	50 %	25 %	345302234
9491	NC_015966	GAA	2	6	399088	399093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302234
9492	NC_015966	GCA	2	6	399130	399135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302234
9493	NC_015966	GGC	2	6	399157	399162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302234
9494	NC_015966	TGG	2	6	399194	399199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302234
9495	NC_015966	GGT	3	9	399238	399246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302234
9496	NC_015966	CGA	2	6	399252	399257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302234
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9499	NC_015966	CTG	2	6	399428	399433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302234
9500	NC_015966	TGG	2	6	399513	399518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302235

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