MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_015966	CG	3	6	313831	313836	0 %	0 %	50 %	50 %	345302172
7502	NC_015966	TCC	2	6	313918	313923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302173
7503	NC_015966	T	6	6	313993	313998	0 %	100 %	0 %	0 %	345302173
7504	NC_015966	CGG	2	6	314004	314009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302173
7505	NC_015966	CTG	2	6	314014	314019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302173
7506	NC_015966	GCTG	2	8	314024	314031	0 %	25 %	50 %	25 %	345302173
7507	NC_015966	CGT	2	6	314061	314066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302173
7508	NC_015966	TGG	2	6	314075	314080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302173
7509	NC_015966	GCT	2	6	314112	314117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302173
7510	NC_015966	CGG	2	6	314131	314136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302173
7511	NC_015966	ACG	2	6	314144	314149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302173
7512	NC_015966	TATT	2	8	314173	314180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_015966	GC	3	6	314241	314246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7514	NC_015966	CGG	2	6	314258	314263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_015966	GC	3	6	314387	314392	0 %	0 %	50 %	50 %	345302174
7516	NC_015966	CGG	2	6	314410	314415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302174
7517	NC_015966	GAT	2	6	314428	314433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302174
7518	NC_015966	GC	3	6	314436	314441	0 %	0 %	50 %	50 %	345302174
7519	NC_015966	TGC	2	6	314445	314450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302174
7520	NC_015966	ACG	2	6	314483	314488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302174
7521	NC_015966	GCT	2	6	314491	314496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302174
7522	NC_015966	GGA	2	6	314498	314503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302174
7523	NC_015966	GT	3	6	314511	314516	0 %	50 %	50 %	0 %	345302174
7524	NC_015966	GATT	2	8	314526	314533	25 %	50 %	25 %	0 %	345302174
7525	NC_015966	AACG	2	8	314568	314575	50 %	0 %	25 %	25 %	345302174
7526	NC_015966	CGT	2	6	314633	314638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
7527	NC_015966	GTT	2	6	314642	314647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302175
7528	NC_015966	GCT	2	6	314666	314671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
7529	NC_015966	GCC	2	6	314673	314678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302175
7530	NC_015966	G	6	6	314690	314695	0 %	0 %	100 %	0 %	345302175
7531	NC_015966	CTC	2	6	314715	314720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302175
7532	NC_015966	CAT	2	6	314721	314726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302175
7533	NC_015966	CTA	2	6	314738	314743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302175
7534	NC_015966	GGC	2	6	314815	314820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302175
7535	NC_015966	CGT	2	6	314896	314901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
7536	NC_015966	CCG	2	6	314902	314907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302175
7537	NC_015966	GGA	2	6	314912	314917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302175
7538	NC_015966	CAT	2	6	314931	314936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302175
7539	NC_015966	CGC	2	6	315020	315025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302175
7540	NC_015966	GCT	2	6	315026	315031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
7541	NC_015966	CAC	2	6	315086	315091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302175
7542	NC_015966	TGC	2	6	315106	315111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
7543	NC_015966	CTG	2	6	315201	315206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
7544	NC_015966	TCT	2	6	315214	315219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302175
7545	NC_015966	TCA	2	6	315313	315318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302175
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7548	NC_015966	GGC	2	6	315470	315475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302175
7549	NC_015966	GGC	2	6	315542	315547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302175
7550	NC_015966	GCT	2	6	315602	315607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
7551	NC_015966	TTCA	2	8	315615	315622	25 %	50 %	0 %	25 %	345302175
7552	NC_015966	GCT	2	6	315638	315643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
7553	NC_015966	CAT	2	6	315690	315695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302175
7554	NC_015966	CTT	2	6	315784	315789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_015966	ACCA	2	8	315812	315819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7556	NC_015966	CGC	2	6	315859	315864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302176
7557	NC_015966	TTG	2	6	315882	315887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302176
7558	NC_015966	GGC	2	6	315919	315924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302176
7559	NC_015966	GGC	2	6	315958	315963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302176
7560	NC_015966	ATC	2	6	315986	315991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302176
7561	NC_015966	GCT	2	6	315995	316000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302176
7562	NC_015966	CTG	2	6	316043	316048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302176
7563	NC_015966	AAGT	2	8	316055	316062	50 %	25 %	25 %	0 %	345302176
7564	NC_015966	G	6	6	316068	316073	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_015966	CTG	2	6	316238	316243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302177
7566	NC_015966	TGC	2	6	316251	316256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302177
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7569	NC_015966	AGCGC	2	10	316408	316417	20 %	0 %	40 %	40 %	345302177
7570	NC_015966	GAG	2	6	316436	316441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302177
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7572	NC_015966	CAG	2	6	316490	316495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302177
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7579	NC_015966	GCAA	2	8	316667	316674	50 %	0 %	25 %	25 %	345302177
7580	NC_015966	GAA	2	6	316739	316744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302178
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7583	NC_015966	A	7	7	316868	316874	100 %	0 %	0 %	0 %	345302178
7584	NC_015966	GGC	2	6	316896	316901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302178
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7588	NC_015966	GGCG	2	8	317053	317060	0 %	0 %	75 %	25 %	345302178
7589	NC_015966	GCA	2	6	317119	317124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302178
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7594	NC_015966	GCG	2	6	317221	317226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302178
7595	NC_015966	GCA	2	6	317247	317252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302178
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7601	NC_015966	CGCGT	2	10	317548	317557	0 %	20 %	40 %	40 %	345302179
7602	NC_015966	CGG	2	6	317639	317644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302179
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7606	NC_015966	TCG	2	6	317815	317820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302179
7607	NC_015966	ATC	2	6	317826	317831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302179
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7611	NC_015966	TCG	2	6	318064	318069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302179
7612	NC_015966	ACG	2	6	318073	318078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302179
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7620	NC_015966	GCC	2	6	318245	318250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302179
7621	NC_015966	GGC	2	6	318276	318281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302179
7622	NC_015966	GGCG	2	8	318314	318321	0 %	0 %	75 %	25 %	345302179
7623	NC_015966	CGA	2	6	318340	318345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302179
7624	NC_015966	ACGG	2	8	318360	318367	25 %	0 %	50 %	25 %	345302179
7625	NC_015966	CCGG	2	8	318407	318414	0 %	0 %	50 %	50 %	345302179
7626	NC_015966	GTGG	2	8	318444	318451	0 %	25 %	75 %	0 %	345302179
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7629	NC_015966	TCG	2	6	318595	318600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302179
7630	NC_015966	GAG	2	6	318639	318644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302179
7631	NC_015966	ATC	2	6	318654	318659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302179
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7633	NC_015966	CGA	2	6	318794	318799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302179
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7635	NC_015966	CTGAG	2	10	318872	318881	20 %	20 %	40 %	20 %	345302179
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7644	NC_015966	ACT	2	6	319272	319277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302180
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7648	NC_015966	CAT	2	6	319498	319503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302180
7649	NC_015966	CGG	2	6	319520	319525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302180
7650	NC_015966	CCGGC	2	10	319534	319543	0 %	0 %	40 %	60 %	345302180
7651	NC_015966	CTG	2	6	319634	319639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302180
7652	NC_015966	CGC	2	6	319648	319653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302180
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7654	NC_015966	TGG	2	6	319671	319676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302180
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7658	NC_015966	GC	3	6	319742	319747	0 %	0 %	50 %	50 %	345302180
7659	NC_015966	GCG	2	6	319785	319790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302180
7660	NC_015966	GGTG	2	8	319887	319894	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7661	NC_015966	CCG	2	6	319922	319927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7662	NC_015966	TCCC	2	8	319958	319965	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7663	NC_015966	TGTT	2	8	320015	320022	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7664	NC_015966	CGGG	2	8	320036	320043	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7665	NC_015966	CGCTT	2	10	320044	320053	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7666	NC_015966	GCC	3	9	320079	320087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7670	NC_015966	CGA	2	6	320288	320293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302181
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7735	NC_015966	GCT	2	6	322742	322747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302181
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7985	NC_015966	TGC	2	6	332319	332324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302190
7986	NC_015966	ACC	2	6	332340	332345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302190
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7988	NC_015966	ATT	2	6	332430	332435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345302190
7989	NC_015966	CAA	2	6	332533	332538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302190
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7993	NC_015966	GA	3	6	332768	332773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7998	NC_015966	GC	3	6	332957	332962	0 %	0 %	50 %	50 %	345302191
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