MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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76002	NC_015966	CGC	2	6	3193160	3193165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304614
76003	NC_015966	TCG	2	6	3193240	3193245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304614
76004	NC_015966	GCA	2	6	3193253	3193258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304614
76005	NC_015966	GCC	3	9	3193284	3193292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304614
76006	NC_015966	ACC	2	6	3193308	3193313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304614
76007	NC_015966	GAG	2	6	3193317	3193322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304614
76008	NC_015966	TCG	2	6	3193347	3193352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304614
76009	NC_015966	GGC	2	6	3193355	3193360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304614
76010	NC_015966	CCA	2	6	3193381	3193386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304614
76011	NC_015966	GAC	2	6	3193394	3193399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304614
76012	NC_015966	CAC	2	6	3193496	3193501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304614
76013	NC_015966	AG	3	6	3193528	3193533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76014	NC_015966	CT	3	6	3193556	3193561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76015	NC_015966	CAG	2	6	3193608	3193613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304615
76016	NC_015966	CTC	2	6	3193635	3193640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304615
76017	NC_015966	TCC	2	6	3193695	3193700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304615
76018	NC_015966	CGG	2	6	3193701	3193706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304615
76019	NC_015966	CCA	2	6	3193715	3193720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304615
76020	NC_015966	CCT	2	6	3193823	3193828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304615
76021	NC_015966	ACCCC	2	10	3193942	3193951	20 %	0 %	0 %	80 %	345304615
76022	NC_015966	CAG	2	6	3193956	3193961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304615
76023	NC_015966	ATC	2	6	3193969	3193974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304615
76024	NC_015966	GC	3	6	3194025	3194030	0 %	0 %	50 %	50 %	345304615
76025	NC_015966	GAA	2	6	3194043	3194048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304615
76026	NC_015966	GTG	2	6	3194157	3194162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304615
76027	NC_015966	GC	3	6	3194169	3194174	0 %	0 %	50 %	50 %	345304615
76028	NC_015966	AGC	2	6	3194233	3194238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304615
76029	NC_015966	GGC	2	6	3194250	3194255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304615
76030	NC_015966	CTT	2	6	3194325	3194330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304615
76031	NC_015966	TCA	2	6	3194363	3194368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304615
76032	NC_015966	CAG	2	6	3194397	3194402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304615
76033	NC_015966	CAC	2	6	3194409	3194414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304615
76034	NC_015966	GGC	2	6	3194415	3194420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304615
76035	NC_015966	CCT	2	6	3194435	3194440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304615
76036	NC_015966	TGGGTT	2	12	3194499	3194510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76037	NC_015966	AT	3	6	3194532	3194537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76038	NC_015966	TGC	2	6	3194607	3194612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304616
76039	NC_015966	GCTT	2	8	3194619	3194626	0 %	50 %	25 %	25 %	345304616
76040	NC_015966	GCG	2	6	3194629	3194634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304616
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76042	NC_015966	CAG	2	6	3194680	3194685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304616
76043	NC_015966	GC	3	6	3194779	3194784	0 %	0 %	50 %	50 %	345304616
76044	NC_015966	CAC	2	6	3194811	3194816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304616
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76046	NC_015966	AGC	2	6	3194873	3194878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304616
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76049	NC_015966	G	6	6	3195007	3195012	0 %	0 %	100 %	0 %	345304616
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76052	NC_015966	CAG	2	6	3195106	3195111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304616
76053	NC_015966	GCT	2	6	3195201	3195206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304616
76054	NC_015966	CCA	2	6	3195220	3195225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304616
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76056	NC_015966	CAG	2	6	3195259	3195264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304616
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76059	NC_015966	CCGCC	2	10	3195407	3195416	0 %	0 %	20 %	80 %	345304616
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76061	NC_015966	GCT	2	6	3195463	3195468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304616
76062	NC_015966	GC	3	6	3195526	3195531	0 %	0 %	50 %	50 %	345304616
76063	NC_015966	CAC	2	6	3195541	3195546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304616
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76067	NC_015966	GTA	2	6	3195810	3195815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304617
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76116	NC_015966	ACTG	2	8	3198093	3198100	25 %	25 %	25 %	25 %	345304617
76117	NC_015966	CAA	2	6	3198187	3198192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76118	NC_015966	TCTCG	3	15	3198195	3198209	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
76119	NC_015966	TTCGA	2	10	3198223	3198232	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76120	NC_015966	CCGG	2	8	3198254	3198261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76121	NC_015966	ACC	2	6	3198305	3198310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76122	NC_015966	GC	4	8	3198384	3198391	0 %	0 %	50 %	50 %	345304618
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76124	NC_015966	GATC	2	8	3198438	3198445	25 %	25 %	25 %	25 %	345304618
76125	NC_015966	CGA	2	6	3198459	3198464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304618
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76127	NC_015966	CTGG	2	8	3198573	3198580	0 %	25 %	50 %	25 %	345304618
76128	NC_015966	GAAC	2	8	3198591	3198598	50 %	0 %	25 %	25 %	345304618
76129	NC_015966	CGA	2	6	3198603	3198608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304618
76130	NC_015966	GCT	2	6	3198657	3198662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304618
76131	NC_015966	GCT	2	6	3198702	3198707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304618
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76140	NC_015966	GCT	3	9	3198891	3198899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304618
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76143	NC_015966	CGA	2	6	3199062	3199067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304618
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76146	NC_015966	GCTG	2	8	3199187	3199194	0 %	25 %	50 %	25 %	345304618
76147	NC_015966	CGT	2	6	3199266	3199271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304618
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76153	NC_015966	TGG	2	6	3199646	3199651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304618
76154	NC_015966	ATTT	2	8	3199669	3199676	25 %	75 %	0 %	0 %	345304618
76155	NC_015966	GCT	2	6	3199707	3199712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304618
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76179	NC_015966	GGT	2	6	3200798	3200803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304620
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76185	NC_015966	AGA	2	6	3200932	3200937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304620
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76190	NC_015966	CG	3	6	3201082	3201087	0 %	0 %	50 %	50 %	345304620
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76200	NC_015966	GCG	2	6	3201497	3201502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304620
76201	NC_015966	GC	3	6	3201515	3201520	0 %	0 %	50 %	50 %	345304620
76202	NC_015966	CGC	3	9	3201567	3201575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304620
76203	NC_015966	CCT	2	6	3201577	3201582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304620
76204	NC_015966	GTT	2	6	3201599	3201604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304620
76205	NC_015966	CG	3	6	3201610	3201615	0 %	0 %	50 %	50 %	345304620
76206	NC_015966	GAC	2	6	3201617	3201622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304620
76207	NC_015966	ACGC	2	8	3201633	3201640	25 %	0 %	25 %	50 %	345304620
76208	NC_015966	GATC	2	8	3201655	3201662	25 %	25 %	25 %	25 %	345304620
76209	NC_015966	CTC	2	6	3201683	3201688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76210	NC_015966	CCA	2	6	3201824	3201829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304621
76211	NC_015966	CTG	3	9	3201915	3201923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304621
76212	NC_015966	CGA	2	6	3201938	3201943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304621
76213	NC_015966	GCCAG	2	10	3201980	3201989	20 %	0 %	40 %	40 %	345304621
76214	NC_015966	GCC	2	6	3202010	3202015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304621
76215	NC_015966	ATG	2	6	3202045	3202050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304621
76216	NC_015966	TCG	2	6	3202099	3202104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304621
76217	NC_015966	GCC	2	6	3202166	3202171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304621
76218	NC_015966	CCT	2	6	3202223	3202228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304621
76219	NC_015966	GGC	2	6	3202232	3202237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304621
76220	NC_015966	GCC	3	9	3202258	3202266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304621
76221	NC_015966	CAG	2	6	3202275	3202280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304621
76222	NC_015966	CCG	2	6	3202348	3202353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304622
76223	NC_015966	GCCAG	2	10	3202357	3202366	20 %	0 %	40 %	40 %	345304622
76224	NC_015966	CCA	2	6	3202423	3202428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304622
76225	NC_015966	CGT	2	6	3202444	3202449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304622
76226	NC_015966	GTG	2	6	3202503	3202508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304622
76227	NC_015966	GAT	2	6	3202520	3202525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304622
76228	NC_015966	TCG	2	6	3202572	3202577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304622
76229	NC_015966	CGC	2	6	3202585	3202590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304622
76230	NC_015966	GAT	2	6	3202601	3202606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304622
76231	NC_015966	TCG	2	6	3202650	3202655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304622
76232	NC_015966	GCA	2	6	3202675	3202680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304622
76233	NC_015966	CCA	2	6	3202699	3202704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304622
76234	NC_015966	ATC	2	6	3202743	3202748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304622
76235	NC_015966	CGC	2	6	3202750	3202755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304622
76236	NC_015966	TCC	2	6	3202797	3202802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304622
76237	NC_015966	CCG	2	6	3202824	3202829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304622
76238	NC_015966	CCGGG	2	10	3202852	3202861	0 %	0 %	60 %	40 %	345304622
76239	NC_015966	GCCC	2	8	3202886	3202893	0 %	0 %	25 %	75 %	345304622
76240	NC_015966	GCG	2	6	3202913	3202918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304622
76241	NC_015966	CG	3	6	3202945	3202950	0 %	0 %	50 %	50 %	345304622
76242	NC_015966	CCA	2	6	3202976	3202981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304622
76243	NC_015966	GCC	2	6	3203000	3203005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304622
76244	NC_015966	CCA	2	6	3203095	3203100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304622
76245	NC_015966	CG	3	6	3203140	3203145	0 %	0 %	50 %	50 %	345304622
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76250	NC_015966	GCGG	2	8	3203331	3203338	0 %	0 %	75 %	25 %	345304622
76251	NC_015966	GGCC	3	12	3203411	3203422	0 %	0 %	50 %	50 %	345304622
76252	NC_015966	CCA	2	6	3203494	3203499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304622
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76254	NC_015966	CGG	3	9	3203522	3203530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304622
76255	NC_015966	GTA	2	6	3203606	3203611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304622
76256	NC_015966	GTC	2	6	3203642	3203647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304622
76257	NC_015966	GTC	2	6	3203678	3203683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304622
76258	NC_015966	TGGT	2	8	3203715	3203722	0 %	50 %	50 %	0 %	345304622
76259	NC_015966	CCGC	2	8	3203723	3203730	0 %	0 %	25 %	75 %	345304622
76260	NC_015966	GCC	2	6	3203804	3203809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304622
76261	NC_015966	CAC	2	6	3203936	3203941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304622
76262	NC_015966	GGC	2	6	3203969	3203974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304622
76263	NC_015966	GCC	2	6	3203978	3203983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304622
76264	NC_015966	CGT	2	6	3204010	3204015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304622
76265	NC_015966	GCT	2	6	3204059	3204064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76266	NC_015966	CAAC	2	8	3204210	3204217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76267	NC_015966	ATC	2	6	3204256	3204261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304623
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76270	NC_015966	TAC	2	6	3204524	3204529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304623
76271	NC_015966	ACC	2	6	3204588	3204593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304623
76272	NC_015966	ACATCC	2	12	3204612	3204623	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	345304623
76273	NC_015966	CCCG	2	8	3204637	3204644	0 %	0 %	25 %	75 %	345304623
76274	NC_015966	AAG	2	6	3204645	3204650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304623
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76294	NC_015966	TGG	2	6	3205362	3205367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304623
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76298	NC_015966	GC	3	6	3205511	3205516	0 %	0 %	50 %	50 %	345304623
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76300	NC_015966	CTT	2	6	3205534	3205539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304623
76301	NC_015966	GGC	2	6	3205618	3205623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304623
76302	NC_015966	GTG	2	6	3205631	3205636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304623
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76304	NC_015966	CCGC	2	8	3205756	3205763	0 %	0 %	25 %	75 %	345304623
76305	NC_015966	GGCG	2	8	3205777	3205784	0 %	0 %	75 %	25 %	345304623
76306	NC_015966	GCACG	2	10	3205798	3205807	20 %	0 %	40 %	40 %	345304623
76307	NC_015966	CAG	2	6	3205832	3205837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304623
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76309	NC_015966	CG	3	6	3205866	3205871	0 %	0 %	50 %	50 %	345304623
76310	NC_015966	ACG	2	6	3206034	3206039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304623
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76312	NC_015966	GCC	2	6	3206123	3206128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304623
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76322	NC_015966	GCT	2	6	3206432	3206437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304624
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76331	NC_015966	TCCG	2	8	3206720	3206727	0 %	25 %	25 %	50 %	345304624
76332	NC_015966	GAA	2	6	3206778	3206783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304624
76333	NC_015966	CG	3	6	3206839	3206844	0 %	0 %	50 %	50 %	345304624
76334	NC_015966	GCC	2	6	3206905	3206910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304624
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76336	NC_015966	CGT	2	6	3206948	3206953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304624
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76338	NC_015966	CGA	2	6	3207128	3207133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304624
76339	NC_015966	GACG	2	8	3207249	3207256	25 %	0 %	50 %	25 %	345304624
76340	NC_015966	ACCCG	2	10	3207267	3207276	20 %	0 %	20 %	60 %	345304624
76341	NC_015966	TGC	2	6	3207300	3207305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304625
76342	NC_015966	GGCC	2	8	3207316	3207323	0 %	0 %	50 %	50 %	345304625
76343	NC_015966	CCA	2	6	3207357	3207362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304625
76344	NC_015966	CGC	2	6	3207363	3207368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304625
76345	NC_015966	ACG	3	9	3207408	3207416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304625
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