MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75001	NC_015966	CGC	2	6	3151904	3151909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304583
75002	NC_015966	CCG	3	9	3151914	3151922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304583
75003	NC_015966	CG	3	6	3151921	3151926	0 %	0 %	50 %	50 %	345304583
75004	NC_015966	TTC	3	9	3151942	3151950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304583
75005	NC_015966	TGG	2	6	3151988	3151993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304583
75006	NC_015966	GCAT	2	8	3152018	3152025	25 %	25 %	25 %	25 %	345304583
75007	NC_015966	ATG	2	6	3152059	3152064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304583
75008	NC_015966	GCA	2	6	3152097	3152102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304583
75009	NC_015966	GC	3	6	3152147	3152152	0 %	0 %	50 %	50 %	345304583
75010	NC_015966	CTG	2	6	3152155	3152160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304583
75011	NC_015966	GCT	2	6	3152163	3152168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304583
75012	NC_015966	TGG	2	6	3152182	3152187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304583
75013	NC_015966	CTG	2	6	3152209	3152214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304583
75014	NC_015966	TGG	2	6	3152219	3152224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304583
75015	NC_015966	CCA	2	6	3152246	3152251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304583
75016	NC_015966	GCC	2	6	3152272	3152277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304583
75017	NC_015966	GCT	4	12	3152283	3152294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304583
75018	NC_015966	CGGC	2	8	3152355	3152362	0 %	0 %	50 %	50 %	345304583
75019	NC_015966	GGCT	2	8	3152372	3152379	0 %	25 %	50 %	25 %	345304583
75020	NC_015966	TCGA	2	8	3152425	3152432	25 %	25 %	25 %	25 %	345304584
75021	NC_015966	GCG	2	6	3152562	3152567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304584
75022	NC_015966	TGCTCC	2	12	3152575	3152586	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	345304584
75023	NC_015966	GCC	2	6	3152595	3152600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304584
75024	NC_015966	CGG	2	6	3152634	3152639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304584
75025	NC_015966	TCG	2	6	3152720	3152725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304584
75026	NC_015966	TGG	2	6	3152744	3152749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304584
75027	NC_015966	AGC	2	6	3152767	3152772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304584
75028	NC_015966	CGT	2	6	3152840	3152845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304584
75029	NC_015966	AGC	2	6	3152857	3152862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304584
75030	NC_015966	GTC	4	12	3152901	3152912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304584
75031	NC_015966	CG	3	6	3152999	3153004	0 %	0 %	50 %	50 %	345304584
75032	NC_015966	TCG	2	6	3153016	3153021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304584
75033	NC_015966	AGC	2	6	3153037	3153042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304584
75034	NC_015966	TCG	2	6	3153046	3153051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304584
75035	NC_015966	CCGT	2	8	3153060	3153067	0 %	25 %	25 %	50 %	345304584
75036	NC_015966	CAC	2	6	3153075	3153080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304584
75037	NC_015966	CTG	2	6	3153102	3153107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304584
75038	NC_015966	CGC	2	6	3153127	3153132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304584
75039	NC_015966	GCT	2	6	3153185	3153190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304584
75040	NC_015966	GCT	2	6	3153310	3153315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75041	NC_015966	TCC	2	6	3153332	3153337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75042	NC_015966	A	6	6	3153343	3153348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75043	NC_015966	CGC	2	6	3153412	3153417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304585
75044	NC_015966	CGA	2	6	3153459	3153464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304585
75045	NC_015966	TGC	3	9	3153533	3153541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304585
75046	NC_015966	CAT	2	6	3153546	3153551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304585
75047	NC_015966	A	6	6	3153671	3153676	100 %	0 %	0 %	0 %	345304585
75048	NC_015966	ATCT	2	8	3153712	3153719	25 %	50 %	0 %	25 %	345304585
75049	NC_015966	GCG	2	6	3153740	3153745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304585
75050	NC_015966	GCG	2	6	3153814	3153819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304586
75051	NC_015966	AGC	2	6	3153903	3153908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304586
75052	NC_015966	GC	3	6	3153907	3153912	0 %	0 %	50 %	50 %	345304586
75053	NC_015966	GCG	2	6	3153988	3153993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304586
75054	NC_015966	GCA	2	6	3154012	3154017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304586
75055	NC_015966	CCA	2	6	3154144	3154149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304586
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75057	NC_015966	GCC	2	6	3154215	3154220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304586
75058	NC_015966	GGC	2	6	3154229	3154234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304586
75059	NC_015966	CGA	2	6	3154244	3154249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304586
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75061	NC_015966	CTG	2	6	3154280	3154285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304586
75062	NC_015966	CTGG	2	8	3154307	3154314	0 %	25 %	50 %	25 %	345304586
75063	NC_015966	CGGC	2	8	3154336	3154343	0 %	0 %	50 %	50 %	345304586
75064	NC_015966	GTA	2	6	3154442	3154447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304586
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75068	NC_015966	GCTCGC	2	12	3154519	3154530	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345304586
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75070	NC_015966	GAA	2	6	3154604	3154609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304586
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75072	NC_015966	CGT	2	6	3154627	3154632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304586
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75077	NC_015966	CCGCC	2	10	3154780	3154789	0 %	0 %	20 %	80 %	345304586
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75080	NC_015966	ACG	2	6	3154875	3154880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304586
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75083	NC_015966	CCCG	2	8	3154937	3154944	0 %	0 %	25 %	75 %	345304586
75084	NC_015966	CAC	2	6	3154961	3154966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304586
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75089	NC_015966	GCC	2	6	3155179	3155184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304586
75090	NC_015966	TCG	2	6	3155203	3155208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304586
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75099	NC_015966	ATG	2	6	3155584	3155589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304587
75100	NC_015966	GCTCGC	2	12	3155684	3155695	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345304587
75101	NC_015966	GC	3	6	3155694	3155699	0 %	0 %	50 %	50 %	345304587
75102	NC_015966	AGCC	2	8	3155700	3155707	25 %	0 %	25 %	50 %	345304587
75103	NC_015966	GGC	2	6	3155727	3155732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304587
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75111	NC_015966	GCA	2	6	3156005	3156010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304587
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75113	NC_015966	CGGC	2	8	3156101	3156108	0 %	0 %	50 %	50 %	345304587
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75115	NC_015966	CCA	2	6	3156134	3156139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304587
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75232	NC_015966	AGG	2	6	3161604	3161609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304591
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75234	NC_015966	GCGG	2	8	3161645	3161652	0 %	0 %	75 %	25 %	345304591
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75334	NC_015966	CCGG	2	8	3165702	3165709	0 %	0 %	50 %	50 %	345304594
75335	NC_015966	CCT	2	6	3165732	3165737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304594
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75338	NC_015966	TCT	2	6	3165804	3165809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304594
75339	NC_015966	GCTCCC	2	12	3165816	3165827	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	345304594
75340	NC_015966	CAC	3	9	3165898	3165906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304594
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75342	NC_015966	GTC	2	6	3166049	3166054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304594
75343	NC_015966	TCC	2	6	3166055	3166060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304594
75344	NC_015966	GC	3	6	3166075	3166080	0 %	0 %	50 %	50 %	345304594
75345	NC_015966	CCT	2	6	3166086	3166091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304594
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75500	NC_015966	GCC	3	9	3173114	3173122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304596

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