MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_015966	CAG	2	6	3112840	3112845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304547
74002	NC_015966	CG	3	6	3112860	3112865	0 %	0 %	50 %	50 %	345304547
74003	NC_015966	TCG	2	6	3112871	3112876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304547
74004	NC_015966	GTC	2	6	3113041	3113046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304547
74005	NC_015966	TCC	2	6	3113120	3113125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304547
74006	NC_015966	AGC	3	9	3113129	3113137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304547
74007	NC_015966	GCG	2	6	3113168	3113173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304547
74008	NC_015966	CGC	2	6	3113216	3113221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304547
74009	NC_015966	AGC	2	6	3113285	3113290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304547
74010	NC_015966	GCC	2	6	3113333	3113338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304547
74011	NC_015966	ATGA	2	8	3113362	3113369	50 %	25 %	25 %	0 %	345304547
74012	NC_015966	GGCT	2	8	3113426	3113433	0 %	25 %	50 %	25 %	345304547
74013	NC_015966	CCG	2	6	3113453	3113458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304547
74014	NC_015966	CAC	2	6	3113470	3113475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304547
74015	NC_015966	TCG	2	6	3113522	3113527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304547
74016	NC_015966	ATG	2	6	3113528	3113533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304547
74017	NC_015966	CAC	2	6	3113539	3113544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304547
74018	NC_015966	GCTC	2	8	3113573	3113580	0 %	25 %	25 %	50 %	345304547
74019	NC_015966	TGA	2	6	3113586	3113591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304547
74020	NC_015966	CCGG	2	8	3113605	3113612	0 %	0 %	50 %	50 %	345304547
74021	NC_015966	GTT	2	6	3113620	3113625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304547
74022	NC_015966	CTGG	2	8	3113629	3113636	0 %	25 %	50 %	25 %	345304547
74023	NC_015966	GCC	2	6	3113640	3113645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304547
74024	NC_015966	GGC	2	6	3113805	3113810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304547
74025	NC_015966	GCT	2	6	3113900	3113905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74026	NC_015966	GCG	2	6	3113915	3113920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74027	NC_015966	ACC	2	6	3113980	3113985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74028	NC_015966	CTG	2	6	3114048	3114053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74029	NC_015966	CCG	2	6	3114117	3114122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304548
74030	NC_015966	CG	4	8	3114128	3114135	0 %	0 %	50 %	50 %	345304548
74031	NC_015966	GAA	2	6	3114151	3114156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304548
74032	NC_015966	GCCG	2	8	3114174	3114181	0 %	0 %	50 %	50 %	345304548
74033	NC_015966	CGCC	2	8	3114248	3114255	0 %	0 %	25 %	75 %	345304548
74034	NC_015966	CCA	2	6	3114332	3114337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304549
74035	NC_015966	GTA	2	6	3114417	3114422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304549
74036	NC_015966	AGC	2	6	3114430	3114435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304549
74037	NC_015966	AGC	2	6	3114484	3114489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304549
74038	NC_015966	GCCAG	2	10	3114491	3114500	20 %	0 %	40 %	40 %	345304549
74039	NC_015966	CAG	2	6	3114570	3114575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304549
74040	NC_015966	CTG	2	6	3114618	3114623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304549
74041	NC_015966	GCC	2	6	3114645	3114650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304549
74042	NC_015966	TGA	2	6	3114668	3114673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304549
74043	NC_015966	GCC	2	6	3114681	3114686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304549
74044	NC_015966	GCA	2	6	3114692	3114697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304549
74045	NC_015966	CG	3	6	3114698	3114703	0 %	0 %	50 %	50 %	345304549
74046	NC_015966	GCA	2	6	3114713	3114718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304549
74047	NC_015966	GTC	2	6	3114801	3114806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304549
74048	NC_015966	CGA	2	6	3114893	3114898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304549
74049	NC_015966	CGG	2	6	3114916	3114921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304549
74050	NC_015966	GTA	2	6	3114927	3114932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304549
74051	NC_015966	TCGG	2	8	3114978	3114985	0 %	25 %	50 %	25 %	345304549
74052	NC_015966	CGTA	2	8	3115021	3115028	25 %	25 %	25 %	25 %	345304549
74053	NC_015966	GCA	2	6	3115052	3115057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304549
74054	NC_015966	A	6	6	3115062	3115067	100 %	0 %	0 %	0 %	345304549
74055	NC_015966	GCA	2	6	3115076	3115081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304549
74056	NC_015966	ACGC	2	8	3115202	3115209	25 %	0 %	25 %	50 %	345304550
74057	NC_015966	CTC	2	6	3115232	3115237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304550
74058	NC_015966	A	6	6	3115242	3115247	100 %	0 %	0 %	0 %	345304550
74059	NC_015966	ACG	2	6	3115251	3115256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304550
74060	NC_015966	CGG	2	6	3115283	3115288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304550
74061	NC_015966	CAC	2	6	3115316	3115321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304550
74062	NC_015966	CAC	3	9	3115346	3115354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304550
74063	NC_015966	CCG	3	9	3115429	3115437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304550
74064	NC_015966	ACC	2	6	3115449	3115454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304550
74065	NC_015966	CGTGCA	2	12	3115477	3115488	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345304550
74066	NC_015966	CCG	2	6	3115534	3115539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304550
74067	NC_015966	CGCC	2	8	3115552	3115559	0 %	0 %	25 %	75 %	345304550
74068	NC_015966	CAG	2	6	3115610	3115615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304550
74069	NC_015966	GCG	2	6	3115634	3115639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304550
74070	NC_015966	GAA	2	6	3115649	3115654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304550
74071	NC_015966	GC	3	6	3115694	3115699	0 %	0 %	50 %	50 %	345304550
74072	NC_015966	GGC	2	6	3116018	3116023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304550
74073	NC_015966	GGC	2	6	3116063	3116068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304550
74074	NC_015966	CGGCTC	2	12	3116087	3116098	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345304550
74075	NC_015966	GACC	2	8	3116239	3116246	25 %	0 %	25 %	50 %	345304550
74076	NC_015966	CGG	2	6	3116290	3116295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304551
74077	NC_015966	CTC	2	6	3116299	3116304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304551
74078	NC_015966	ACC	2	6	3116306	3116311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304551
74079	NC_015966	GAT	2	6	3116344	3116349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304551
74080	NC_015966	AGC	2	6	3116360	3116365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304551
74081	NC_015966	ATC	2	6	3116396	3116401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304551
74082	NC_015966	CAG	4	12	3116410	3116421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304551
74083	NC_015966	CAG	2	6	3116686	3116691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304551
74084	NC_015966	CAC	2	6	3116734	3116739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304551
74085	NC_015966	GAA	2	6	3116815	3116820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304551
74086	NC_015966	CGG	2	6	3116842	3116847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304551
74087	NC_015966	GGC	2	6	3116853	3116858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304551
74088	NC_015966	TTC	2	6	3116861	3116866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304551
74089	NC_015966	CAG	2	6	3116896	3116901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304551
74090	NC_015966	GTC	2	6	3116929	3116934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304551
74091	NC_015966	CGT	2	6	3117099	3117104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304551
74092	NC_015966	GAAGC	2	10	3117174	3117183	40 %	0 %	40 %	20 %	345304551
74093	NC_015966	TCG	2	6	3117188	3117193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304551
74094	NC_015966	GAC	2	6	3117202	3117207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304551
74095	NC_015966	AGC	2	6	3117232	3117237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74096	NC_015966	CGTTC	2	10	3117272	3117281	0 %	40 %	20 %	40 %	345304552
74097	NC_015966	CGG	2	6	3117292	3117297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304552
74098	NC_015966	CGG	2	6	3117338	3117343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304552
74099	NC_015966	CCG	2	6	3117344	3117349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304552
74100	NC_015966	CTG	2	6	3117366	3117371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304552
74101	NC_015966	TGG	2	6	3117395	3117400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304552
74102	NC_015966	GCT	2	6	3117410	3117415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304552
74103	NC_015966	TCC	2	6	3117484	3117489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304552
74104	NC_015966	CTC	2	6	3117504	3117509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304552
74105	NC_015966	GCG	2	6	3117557	3117562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304552
74106	NC_015966	GATGTA	2	12	3117570	3117581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304552
74107	NC_015966	GCC	2	6	3117582	3117587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304552
74108	NC_015966	CGA	2	6	3117590	3117595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304552
74109	NC_015966	AGA	2	6	3117614	3117619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304552
74110	NC_015966	AGC	2	6	3117628	3117633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304552
74111	NC_015966	ATG	3	9	3117673	3117681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304552
74112	NC_015966	GGT	2	6	3117683	3117688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304552
74113	NC_015966	TCC	2	6	3117712	3117717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304552
74114	NC_015966	GGT	2	6	3117720	3117725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304552
74115	NC_015966	GGA	2	6	3117830	3117835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304552
74116	NC_015966	GCCG	2	8	3117876	3117883	0 %	0 %	50 %	50 %	345304552
74117	NC_015966	CCA	2	6	3117893	3117898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304552
74118	NC_015966	GCGG	2	8	3118005	3118012	0 %	0 %	75 %	25 %	345304552
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74142	NC_015966	GCCC	2	8	3118838	3118845	0 %	0 %	25 %	75 %	345304552
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74147	NC_015966	TCG	2	6	3119032	3119037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304552
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74198	NC_015966	T	7	7	3121216	3121222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74203	NC_015966	CG	3	6	3121445	3121450	0 %	0 %	50 %	50 %	345304555
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74216	NC_015966	AGC	2	6	3122086	3122091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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74223	NC_015966	TCCAGC	2	12	3122337	3122348	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345304556
74224	NC_015966	GCTTCG	2	12	3122349	3122360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304556
74225	NC_015966	GCC	2	6	3122374	3122379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304556
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74227	NC_015966	GCA	2	6	3122455	3122460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304556
74228	NC_015966	GTCT	2	8	3122476	3122483	0 %	50 %	25 %	25 %	345304556
74229	NC_015966	TTG	2	6	3122487	3122492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304556
74230	NC_015966	AAG	2	6	3122498	3122503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304556
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74232	NC_015966	CCA	2	6	3122587	3122592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304556
74233	NC_015966	AGC	2	6	3122598	3122603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304556
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74324	NC_015966	CGT	2	6	3126284	3126289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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74329	NC_015966	CA	3	6	3126519	3126524	50 %	0 %	0 %	50 %	345304559
74330	NC_015966	TCG	2	6	3126590	3126595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304559
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74333	NC_015966	AGCGC	2	10	3126729	3126738	20 %	0 %	40 %	40 %	345304559
74334	NC_015966	TCG	2	6	3126758	3126763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304559
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74337	NC_015966	CTG	2	6	3126823	3126828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304559
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74340	NC_015966	GCG	2	6	3127006	3127011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304559
74341	NC_015966	GCA	2	6	3127020	3127025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304559
74342	NC_015966	GC	3	6	3127037	3127042	0 %	0 %	50 %	50 %	345304559
74343	NC_015966	TCG	2	6	3127055	3127060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304559
74344	NC_015966	TGA	2	6	3127068	3127073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304559
74345	NC_015966	CAG	2	6	3127078	3127083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304559
74346	NC_015966	CAGG	2	8	3127110	3127117	25 %	0 %	50 %	25 %	345304559
74347	NC_015966	TTCG	2	8	3127154	3127161	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74348	NC_015966	TTC	3	9	3127316	3127324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304560
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74462	NC_015966	CGGG	2	8	3132377	3132384	0 %	0 %	75 %	25 %	345304566
74463	NC_015966	CATC	2	8	3132396	3132403	25 %	25 %	0 %	50 %	345304566
74464	NC_015966	TGG	2	6	3132428	3132433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304566
74465	NC_015966	GC	3	6	3132434	3132439	0 %	0 %	50 %	50 %	345304566
74466	NC_015966	CGA	2	6	3132450	3132455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304566
74467	NC_015966	CG	3	6	3132476	3132481	0 %	0 %	50 %	50 %	345304566
74468	NC_015966	TCG	3	9	3132539	3132547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304566
74469	NC_015966	ACG	2	6	3132551	3132556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304566
74470	NC_015966	CCG	2	6	3132567	3132572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304566
74471	NC_015966	GCG	3	9	3132614	3132622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304566
74472	NC_015966	GTC	2	6	3132625	3132630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304566
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74474	NC_015966	GCC	2	6	3132695	3132700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304566
74475	NC_015966	CGC	2	6	3132724	3132729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304566
74476	NC_015966	GAA	2	6	3132739	3132744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304566
74477	NC_015966	GTG	2	6	3132754	3132759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304566
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74479	NC_015966	ACG	2	6	3132908	3132913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304566
74480	NC_015966	GC	3	6	3132929	3132934	0 %	0 %	50 %	50 %	345304566
74481	NC_015966	ACG	2	6	3132935	3132940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304566
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74483	NC_015966	GATC	2	8	3132960	3132967	25 %	25 %	25 %	25 %	345304566
74484	NC_015966	GCT	2	6	3133056	3133061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304566
74485	NC_015966	GC	3	6	3133078	3133083	0 %	0 %	50 %	50 %	345304566
74486	NC_015966	CGG	2	6	3133125	3133130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304566
74487	NC_015966	TCG	2	6	3133334	3133339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304566
74488	NC_015966	TGC	2	6	3133352	3133357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304566
74489	NC_015966	CCA	2	6	3133397	3133402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304566
74490	NC_015966	GCGCA	2	10	3133420	3133429	20 %	0 %	40 %	40 %	345304566
74491	NC_015966	GGC	2	6	3133437	3133442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304566
74492	NC_015966	CAA	2	6	3133455	3133460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304566
74493	NC_015966	CAC	2	6	3133494	3133499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304566
74494	NC_015966	CGA	2	6	3133512	3133517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304566
74495	NC_015966	GGCC	2	8	3133557	3133564	0 %	0 %	50 %	50 %	345304566
74496	NC_015966	TCG	3	9	3133574	3133582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304566
74497	NC_015966	GGC	2	6	3133639	3133644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304566
74498	NC_015966	CGG	2	6	3133650	3133655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304566
74499	NC_015966	CGC	2	6	3133689	3133694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304566
74500	NC_015966	CCG	2	6	3133749	3133754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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