MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
71501	NC_015966	GCT	2	6	3015342	3015347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304459
71502	NC_015966	CTT	2	6	3015357	3015362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304459
71503	NC_015966	TTC	2	6	3015546	3015551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304460
71504	NC_015966	GCA	2	6	3015573	3015578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304460
71505	NC_015966	GGC	2	6	3015579	3015584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304460
71506	NC_015966	CAG	2	6	3015600	3015605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304460
71507	NC_015966	CCA	2	6	3015657	3015662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304460
71508	NC_015966	CGGGCC	2	12	3015669	3015680	0 %	0 %	50 %	50 %	345304460
71509	NC_015966	TGA	2	6	3015685	3015690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304460
71510	NC_015966	GCC	2	6	3015745	3015750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304460
71511	NC_015966	CGCT	2	8	3015858	3015865	0 %	25 %	25 %	50 %	345304460
71512	NC_015966	GAC	2	6	3015957	3015962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304460
71513	NC_015966	GTCG	2	8	3015965	3015972	0 %	25 %	50 %	25 %	345304460
71514	NC_015966	CGC	2	6	3016021	3016026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304460
71515	NC_015966	CG	5	10	3016103	3016112	0 %	0 %	50 %	50 %	345304460
71516	NC_015966	CGA	2	6	3016139	3016144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304460
71517	NC_015966	GCA	2	6	3016196	3016201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304460
71518	NC_015966	GGCG	2	8	3016211	3016218	0 %	0 %	75 %	25 %	345304460
71519	NC_015966	CGA	2	6	3016244	3016249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304460
71520	NC_015966	CTG	2	6	3016316	3016321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304461
71521	NC_015966	CAG	2	6	3016400	3016405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304461
71522	NC_015966	GCG	2	6	3016447	3016452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304461
71523	NC_015966	GCG	2	6	3016582	3016587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304461
71524	NC_015966	CAC	3	9	3016589	3016597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304461
71525	NC_015966	GCCGGA	2	12	3016668	3016679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345304461
71526	NC_015966	A	6	6	3016685	3016690	100 %	0 %	0 %	0 %	345304461
71527	NC_015966	GCA	2	6	3016726	3016731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304461
71528	NC_015966	GCA	3	9	3016762	3016770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304461
71529	NC_015966	CCGTC	2	10	3016847	3016856	0 %	20 %	20 %	60 %	345304461
71530	NC_015966	CGC	2	6	3016863	3016868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304461
71531	NC_015966	GCAC	2	8	3016897	3016904	25 %	0 %	25 %	50 %	345304461
71532	NC_015966	TCG	2	6	3016914	3016919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304461
71533	NC_015966	CGG	2	6	3016960	3016965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304461
71534	NC_015966	GTCG	2	8	3016978	3016985	0 %	25 %	50 %	25 %	345304461
71535	NC_015966	GCA	3	9	3016999	3017007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304461
71536	NC_015966	TTG	2	6	3017095	3017100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304461
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71538	NC_015966	ACG	2	6	3017133	3017138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71539	NC_015966	TGT	2	6	3017142	3017147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71540	NC_015966	AGT	2	6	3017175	3017180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71541	NC_015966	TTG	2	6	3017275	3017280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304462
71542	NC_015966	CTGTGG	2	12	3017289	3017300	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345304462
71543	NC_015966	CAA	2	6	3017376	3017381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304462
71544	NC_015966	CGG	2	6	3017392	3017397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304462
71545	NC_015966	GCG	2	6	3017427	3017432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304462
71546	NC_015966	GGGT	2	8	3017440	3017447	0 %	25 %	75 %	0 %	345304462
71547	NC_015966	CGG	2	6	3017474	3017479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304462
71548	NC_015966	CGG	2	6	3017512	3017517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304462
71549	NC_015966	CGT	2	6	3017636	3017641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304462
71550	NC_015966	GCC	2	6	3017647	3017652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304462
71551	NC_015966	CGTT	2	8	3017655	3017662	0 %	50 %	25 %	25 %	345304462
71552	NC_015966	CG	4	8	3017720	3017727	0 %	0 %	50 %	50 %	345304462
71553	NC_015966	CGC	2	6	3017755	3017760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304462
71554	NC_015966	ACG	2	6	3017772	3017777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304462
71555	NC_015966	CTG	2	6	3017821	3017826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304462
71556	NC_015966	T	6	6	3017828	3017833	0 %	100 %	0 %	0 %	345304462
71557	NC_015966	TGC	2	6	3017887	3017892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304462
71558	NC_015966	ACG	2	6	3017907	3017912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304462
71559	NC_015966	ACTT	2	8	3017923	3017930	25 %	50 %	0 %	25 %	345304462
71560	NC_015966	TAT	2	6	3017934	3017939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345304462
71561	NC_015966	CGT	2	6	3017984	3017989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304462
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71566	NC_015966	TCG	2	6	3018152	3018157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304462
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71568	NC_015966	GCAG	2	8	3018224	3018231	25 %	0 %	50 %	25 %	345304462
71569	NC_015966	GCC	3	9	3018270	3018278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304462
71570	NC_015966	TCT	2	6	3018362	3018367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304462
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71572	NC_015966	GA	3	6	3018578	3018583	50 %	0 %	50 %	0 %	345304462
71573	NC_015966	CG	3	6	3018653	3018658	0 %	0 %	50 %	50 %	345304462
71574	NC_015966	TAC	2	6	3018660	3018665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304462
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71578	NC_015966	GCC	2	6	3018927	3018932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304462
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71581	NC_015966	CAG	2	6	3018979	3018984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304463
71582	NC_015966	GC	3	6	3018987	3018992	0 %	0 %	50 %	50 %	345304463
71583	NC_015966	CGCC	2	8	3019020	3019027	0 %	0 %	25 %	75 %	345304463
71584	NC_015966	CGG	2	6	3019046	3019051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304463
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71587	NC_015966	C	6	6	3019122	3019127	0 %	0 %	0 %	100 %	345304463
71588	NC_015966	GCG	2	6	3019133	3019138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304463
71589	NC_015966	CTG	2	6	3019162	3019167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304463
71590	NC_015966	CGGC	2	8	3019214	3019221	0 %	0 %	50 %	50 %	345304463
71591	NC_015966	GTG	2	6	3019270	3019275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304463
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71602	NC_015966	CG	3	6	3019696	3019701	0 %	0 %	50 %	50 %	345304463
71603	NC_015966	CGA	2	6	3019710	3019715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304463
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