MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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70503	NC_015966	GCC	2	6	2973415	2973420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304421
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70616	NC_015966	CGG	2	6	2978303	2978308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304425
70617	NC_015966	ACT	2	6	2978398	2978403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304425
70618	NC_015966	GCCGT	2	10	2978431	2978440	0 %	20 %	40 %	40 %	345304425
70619	NC_015966	CGA	2	6	2978474	2978479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304425
70620	NC_015966	GCC	2	6	2978511	2978516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304425
70621	NC_015966	GCC	2	6	2978527	2978532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304425
70622	NC_015966	GCT	2	6	2978558	2978563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304425
70623	NC_015966	CGC	2	6	2978604	2978609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304425
70624	NC_015966	CGG	2	6	2978753	2978758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304425
70625	NC_015966	GCGT	2	8	2978761	2978768	0 %	25 %	50 %	25 %	345304425
70626	NC_015966	GAG	2	6	2978901	2978906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304425
70627	NC_015966	GCC	2	6	2978910	2978915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304425
70628	NC_015966	TCG	2	6	2978940	2978945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304425
70629	NC_015966	CTG	2	6	2978975	2978980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304426
70630	NC_015966	TTC	2	6	2978993	2978998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304426
70631	NC_015966	CGA	2	6	2979007	2979012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304426
70632	NC_015966	TTCT	2	8	2979104	2979111	0 %	75 %	0 %	25 %	345304426
70633	NC_015966	TCGA	2	8	2979131	2979138	25 %	25 %	25 %	25 %	345304426
70634	NC_015966	GGGCGA	2	12	2979181	2979192	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	345304426
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70636	NC_015966	ATC	2	6	2979353	2979358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304426
70637	NC_015966	GCC	2	6	2979407	2979412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304426
70638	NC_015966	C	6	6	2979411	2979416	0 %	0 %	0 %	100 %	345304426
70639	NC_015966	GTC	2	6	2979417	2979422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304426
70640	NC_015966	ACG	2	6	2979475	2979480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304427
70641	NC_015966	CGG	2	6	2979526	2979531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304427
70642	NC_015966	ACGG	2	8	2979577	2979584	25 %	0 %	50 %	25 %	345304427
70643	NC_015966	GCG	2	6	2979656	2979661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304427
70644	NC_015966	CAGT	2	8	2979710	2979717	25 %	25 %	25 %	25 %	345304427
70645	NC_015966	CGCA	2	8	2979729	2979736	25 %	0 %	25 %	50 %	345304427
70646	NC_015966	GCCTG	2	10	2979778	2979787	0 %	20 %	40 %	40 %	345304427
70647	NC_015966	ACG	2	6	2979806	2979811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304427
70648	NC_015966	TGG	2	6	2979812	2979817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304427
70649	NC_015966	CGG	2	6	2979825	2979830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304427
70650	NC_015966	GGCT	2	8	2979836	2979843	0 %	25 %	50 %	25 %	345304427
70651	NC_015966	ACC	2	6	2979863	2979868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304427
70652	NC_015966	TGC	2	6	2979869	2979874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304427
70653	NC_015966	GC	4	8	2979914	2979921	0 %	0 %	50 %	50 %	345304427
70654	NC_015966	GTG	2	6	2980036	2980041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304427
70655	NC_015966	GCT	2	6	2980047	2980052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304427
70656	NC_015966	CG	3	6	2980055	2980060	0 %	0 %	50 %	50 %	345304427
70657	NC_015966	GAA	2	6	2980075	2980080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304427
70658	NC_015966	GT	3	6	2980093	2980098	0 %	50 %	50 %	0 %	345304427
70659	NC_015966	ATG	2	6	2980111	2980116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304427
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70663	NC_015966	GCT	2	6	2980399	2980404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304428
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70667	NC_015966	CGG	2	6	2980581	2980586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304428
70668	NC_015966	CGCC	2	8	2980645	2980652	0 %	0 %	25 %	75 %	345304428
70669	NC_015966	CAA	2	6	2980735	2980740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304428
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70671	NC_015966	CTG	2	6	2980748	2980753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304428
70672	NC_015966	TCA	2	6	2980758	2980763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304428
70673	NC_015966	CCTG	2	8	2980866	2980873	0 %	25 %	25 %	50 %	345304428
70674	NC_015966	GCG	2	6	2980896	2980901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304428
70675	NC_015966	GCT	2	6	2980926	2980931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304428
70676	NC_015966	GAAA	2	8	2980948	2980955	75 %	0 %	25 %	0 %	345304428
70677	NC_015966	GTG	2	6	2980981	2980986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304428
70678	NC_015966	AGC	2	6	2980992	2980997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304428
70679	NC_015966	CGA	2	6	2981070	2981075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304428
70680	NC_015966	CCCAA	2	10	2981079	2981088	40 %	0 %	0 %	60 %	345304428
70681	NC_015966	CAG	2	6	2981097	2981102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70682	NC_015966	TCCGCA	2	12	2981181	2981192	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345304429
70683	NC_015966	ACC	2	6	2981193	2981198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304429
70684	NC_015966	GCC	2	6	2981230	2981235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304429
70685	NC_015966	GCG	2	6	2981361	2981366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304429
70686	NC_015966	GCT	2	6	2981389	2981394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304429
70687	NC_015966	GCG	2	6	2981412	2981417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304429
70688	NC_015966	TGC	2	6	2981451	2981456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304429
70689	NC_015966	CAG	2	6	2981522	2981527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304429
70690	NC_015966	GGC	2	6	2981609	2981614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304429
70691	NC_015966	GAA	2	6	2981636	2981641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304429
70692	NC_015966	TGG	2	6	2981652	2981657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304429
70693	NC_015966	CCGCT	2	10	2981660	2981669	0 %	20 %	20 %	60 %	345304429
70694	NC_015966	GCG	2	6	2981758	2981763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304429
70695	NC_015966	GAC	2	6	2981765	2981770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304429
70696	NC_015966	CGGC	2	8	2981788	2981795	0 %	0 %	50 %	50 %	345304429
70697	NC_015966	GAA	2	6	2981852	2981857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304429
70698	NC_015966	TGG	2	6	2981913	2981918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304429
70699	NC_015966	CGC	2	6	2981958	2981963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304429
70700	NC_015966	GCC	2	6	2981975	2981980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304429
70701	NC_015966	CAT	2	6	2982025	2982030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304429
70702	NC_015966	CGA	2	6	2982061	2982066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304429
70703	NC_015966	CCG	2	6	2982095	2982100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304429
70704	NC_015966	AGC	2	6	2982102	2982107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304429
70705	NC_015966	TCG	2	6	2982111	2982116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304429
70706	NC_015966	CCG	2	6	2982122	2982127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304429
70707	NC_015966	GCC	2	6	2982131	2982136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304429
70708	NC_015966	ACC	2	6	2982177	2982182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304429
70709	NC_015966	CGA	3	9	2982193	2982201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304429
70710	NC_015966	GCC	2	6	2982229	2982234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304429
70711	NC_015966	GAA	2	6	2982260	2982265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304429
70712	NC_015966	TCG	2	6	2982279	2982284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304429
70713	NC_015966	CGA	3	9	2982304	2982312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304429
70714	NC_015966	GGT	2	6	2982408	2982413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304430
70715	NC_015966	GAC	2	6	2982442	2982447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304430
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70720	NC_015966	GCG	2	6	2982592	2982597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304430
70721	NC_015966	GTCC	2	8	2982649	2982656	0 %	25 %	25 %	50 %	345304430
70722	NC_015966	GTC	2	6	2982663	2982668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304430
70723	NC_015966	GTC	2	6	2982691	2982696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304430
70724	NC_015966	CGG	2	6	2982706	2982711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304430
70725	NC_015966	TCGG	2	8	2982713	2982720	0 %	25 %	50 %	25 %	345304430
70726	NC_015966	CGC	2	6	2982727	2982732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304430
70727	NC_015966	AGC	2	6	2982795	2982800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304430
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