MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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70002	NC_015966	C	6	6	2952350	2952355	0 %	0 %	0 %	100 %	345304400
70003	NC_015966	GCC	2	6	2952412	2952417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304400
70004	NC_015966	CGGAAC	2	12	2952446	2952457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304400
70005	NC_015966	CCA	2	6	2952471	2952476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304400
70006	NC_015966	GGC	2	6	2952546	2952551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304400
70007	NC_015966	CCAG	2	8	2952597	2952604	25 %	0 %	25 %	50 %	345304400
70008	NC_015966	CTTC	2	8	2952698	2952705	0 %	50 %	0 %	50 %	345304400
70009	NC_015966	CAG	2	6	2952730	2952735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304400
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70011	NC_015966	GGA	2	6	2952852	2952857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304400
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70017	NC_015966	GCA	2	6	2953074	2953079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304400
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70030	NC_015966	ACCCG	2	10	2953627	2953636	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70031	NC_015966	TCC	2	6	2953652	2953657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304401
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70052	NC_015966	CGCC	2	8	2954235	2954242	0 %	0 %	25 %	75 %	345304401
70053	NC_015966	GCCTG	2	10	2954248	2954257	0 %	20 %	40 %	40 %	345304401
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70058	NC_015966	ACGCGT	2	12	2954499	2954510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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70062	NC_015966	CATT	2	8	2954807	2954814	25 %	50 %	0 %	25 %	345304402
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70118	NC_015966	T	6	6	2957265	2957270	0 %	100 %	0 %	0 %	345304405
70119	NC_015966	GGC	2	6	2957336	2957341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304405
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70121	NC_015966	TCG	2	6	2957404	2957409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304405
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70123	NC_015966	CGC	2	6	2957513	2957518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304405
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70216	NC_015966	CTG	2	6	2961574	2961579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304407
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70219	NC_015966	GC	3	6	2961605	2961610	0 %	0 %	50 %	50 %	345304407
70220	NC_015966	CTGCGC	2	12	2961691	2961702	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345304407
70221	NC_015966	CTG	2	6	2961742	2961747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304407
70222	NC_015966	CAG	2	6	2961748	2961753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304407
70223	NC_015966	TGCG	2	8	2961758	2961765	0 %	25 %	50 %	25 %	345304407
70224	NC_015966	GAT	2	6	2961776	2961781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304407
70225	NC_015966	AT	3	6	2961780	2961785	50 %	50 %	0 %	0 %	345304407
70226	NC_015966	GAA	2	6	2961829	2961834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70227	NC_015966	TTCGG	2	10	2961869	2961878	0 %	40 %	40 %	20 %	345304408
70228	NC_015966	TCT	2	6	2961885	2961890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304408
70229	NC_015966	GGC	2	6	2961913	2961918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304408
70230	NC_015966	TCG	2	6	2961930	2961935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304408
70231	NC_015966	GTG	2	6	2961968	2961973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304408
70232	NC_015966	TGG	2	6	2962029	2962034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304408
70233	NC_015966	AC	3	6	2962122	2962127	50 %	0 %	0 %	50 %	345304408
70234	NC_015966	CGC	2	6	2962309	2962314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304409
70235	NC_015966	TCG	2	6	2962339	2962344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304409
70236	NC_015966	CTGG	2	8	2962376	2962383	0 %	25 %	50 %	25 %	345304409
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70250	NC_015966	CGA	2	6	2962941	2962946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304410
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70258	NC_015966	ATG	2	6	2963322	2963327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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70261	NC_015966	CG	3	6	2963621	2963626	0 %	0 %	50 %	50 %	345304411
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70297	NC_015966	CGC	2	6	2965117	2965122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304413
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70337	NC_015966	CG	3	6	2966528	2966533	0 %	0 %	50 %	50 %	345304413
70338	NC_015966	ATC	2	6	2966557	2966562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304413
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70341	NC_015966	CGG	2	6	2966600	2966605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304413
70342	NC_015966	GCGCC	2	10	2966691	2966700	0 %	0 %	40 %	60 %	345304413
70343	NC_015966	CTT	2	6	2966730	2966735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304413
70344	NC_015966	C	6	6	2966741	2966746	0 %	0 %	0 %	100 %	345304413
70345	NC_015966	GCCGG	2	10	2966890	2966899	0 %	0 %	60 %	40 %	345304414
70346	NC_015966	GCG	2	6	2966911	2966916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304414
70347	NC_015966	CGC	2	6	2967027	2967032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304414
70348	NC_015966	GC	4	8	2967039	2967046	0 %	0 %	50 %	50 %	345304414
70349	NC_015966	GCTGCG	2	12	2967048	2967059	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345304414
70350	NC_015966	GCA	2	6	2967072	2967077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304414
70351	NC_015966	CGT	2	6	2967108	2967113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304414
70352	NC_015966	GACG	2	8	2967121	2967128	25 %	0 %	50 %	25 %	345304414
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70452	NC_015966	A	7	7	2971015	2971021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70453	NC_015966	TG	3	6	2971048	2971053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70454	NC_015966	GGGA	2	8	2971061	2971068	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70455	NC_015966	GAT	2	6	2971157	2971162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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70458	NC_015966	CGTT	2	8	2971241	2971248	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70459	NC_015966	GC	3	6	2971311	2971316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70460	NC_015966	CGG	2	6	2971362	2971367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70461	NC_015966	CTC	2	6	2971402	2971407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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70463	NC_015966	T	6	6	2971509	2971514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70464	NC_015966	TCA	2	6	2971543	2971548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70465	NC_015966	GGC	2	6	2971665	2971670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304419
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70467	NC_015966	TGC	2	6	2971694	2971699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304419
70468	NC_015966	ACG	2	6	2971702	2971707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304419
70469	NC_015966	TGG	2	6	2971712	2971717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304419
70470	NC_015966	CTG	2	6	2971765	2971770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304419
70471	NC_015966	CTG	2	6	2971795	2971800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304419
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70474	NC_015966	GGC	2	6	2971905	2971910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304419
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70479	NC_015966	GCT	2	6	2972061	2972066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304419
70480	NC_015966	CTG	2	6	2972116	2972121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304419
70481	NC_015966	CTG	2	6	2972200	2972205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304419
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70486	NC_015966	CCG	2	6	2972388	2972393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304420
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70488	NC_015966	CGGC	2	8	2972480	2972487	0 %	0 %	50 %	50 %	345304420
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70490	NC_015966	CGA	2	6	2972547	2972552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304420
70491	NC_015966	TCTG	2	8	2972657	2972664	0 %	50 %	25 %	25 %	345304420
70492	NC_015966	CAA	2	6	2972739	2972744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304420
70493	NC_015966	CAA	2	6	2972962	2972967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70494	NC_015966	GCC	2	6	2973030	2973035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70495	NC_015966	CCA	2	6	2973046	2973051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70496	NC_015966	CAT	2	6	2973063	2973068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304421
70497	NC_015966	GACG	2	8	2973120	2973127	25 %	0 %	50 %	25 %	345304421
70498	NC_015966	GC	3	6	2973148	2973153	0 %	0 %	50 %	50 %	345304421
70499	NC_015966	GGC	2	6	2973298	2973303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304421
70500	NC_015966	GC	4	8	2973308	2973315	0 %	0 %	50 %	50 %	345304421

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