MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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69002	NC_015966	TCT	2	6	2910781	2910786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304370
69003	NC_015966	GCTG	2	8	2910794	2910801	0 %	25 %	50 %	25 %	345304370
69004	NC_015966	GGT	2	6	2910845	2910850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304370
69005	NC_015966	TGG	2	6	2910877	2910882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304370
69006	NC_015966	CTGG	2	8	2910884	2910891	0 %	25 %	50 %	25 %	345304370
69007	NC_015966	CCAT	2	8	2910916	2910923	25 %	25 %	0 %	50 %	345304370
69008	NC_015966	GC	3	6	2910944	2910949	0 %	0 %	50 %	50 %	345304370
69009	NC_015966	ACG	2	6	2910999	2911004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304371
69010	NC_015966	CCGTGC	2	12	2911011	2911022	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345304371
69011	NC_015966	GCG	2	6	2911032	2911037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304371
69012	NC_015966	GAC	2	6	2911099	2911104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304371
69013	NC_015966	GCT	2	6	2911105	2911110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304371
69014	NC_015966	CTG	2	6	2911115	2911120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304371
69015	NC_015966	GC	3	6	2911122	2911127	0 %	0 %	50 %	50 %	345304371
69016	NC_015966	CGGCTC	2	12	2911202	2911213	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345304371
69017	NC_015966	TGC	2	6	2911287	2911292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304371
69018	NC_015966	GGAGCG	2	12	2911309	2911320	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	345304371
69019	NC_015966	CGC	3	9	2911322	2911330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304371
69020	NC_015966	AGC	2	6	2911347	2911352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304371
69021	NC_015966	GCG	2	6	2911395	2911400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304371
69022	NC_015966	CAG	3	9	2911403	2911411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304371
69023	NC_015966	GTGGCC	2	12	2911415	2911426	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345304371
69024	NC_015966	CGA	2	6	2911462	2911467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304371
69025	NC_015966	CGCA	2	8	2911532	2911539	25 %	0 %	25 %	50 %	345304371
69026	NC_015966	TCG	2	6	2911559	2911564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304371
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69031	NC_015966	GCT	3	9	2911662	2911670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304372
69032	NC_015966	GC	3	6	2911780	2911785	0 %	0 %	50 %	50 %	345304372
69033	NC_015966	ACGCTG	2	12	2911786	2911797	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345304372
69034	NC_015966	CGCC	2	8	2911809	2911816	0 %	0 %	25 %	75 %	345304372
69035	NC_015966	CGG	2	6	2911839	2911844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304372
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69039	NC_015966	GTCG	2	8	2912068	2912075	0 %	25 %	50 %	25 %	345304372
69040	NC_015966	T	6	6	2912094	2912099	0 %	100 %	0 %	0 %	345304372
69041	NC_015966	A	6	6	2912135	2912140	100 %	0 %	0 %	0 %	345304372
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69048	NC_015966	TAC	2	6	2912449	2912454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304372
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69053	NC_015966	CTGG	2	8	2912646	2912653	0 %	25 %	50 %	25 %	345304372
69054	NC_015966	GGCT	2	8	2912683	2912690	0 %	25 %	50 %	25 %	345304372
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69061	NC_015966	CAG	3	9	2913078	2913086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304373
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69072	NC_015966	CG	4	8	2913687	2913694	0 %	0 %	50 %	50 %	345304374
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69101	NC_015966	TGA	2	6	2915409	2915414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304375
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69116	NC_015966	TCG	2	6	2915873	2915878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304375
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69221	NC_015966	CCA	2	6	2921039	2921044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304377
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69223	NC_015966	T	7	7	2921139	2921145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69224	NC_015966	ACT	2	6	2921171	2921176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69225	NC_015966	TCC	2	6	2921219	2921224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69226	NC_015966	GCAGGC	2	12	2921240	2921251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345304378
69227	NC_015966	CTG	2	6	2921253	2921258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304378
69228	NC_015966	CG	4	8	2921288	2921295	0 %	0 %	50 %	50 %	345304378
69229	NC_015966	CTG	3	9	2921319	2921327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304378
69230	NC_015966	GCT	2	6	2921351	2921356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304378
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69232	NC_015966	GCT	2	6	2921426	2921431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304378
69233	NC_015966	GCC	2	6	2921436	2921441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304378
69234	NC_015966	CGG	2	6	2921465	2921470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304378
69235	NC_015966	CGG	2	6	2921567	2921572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304378
69236	NC_015966	TGC	2	6	2921635	2921640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304378
69237	NC_015966	CTG	2	6	2921676	2921681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304378
69238	NC_015966	TTG	2	6	2921743	2921748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304378
69239	NC_015966	GCC	2	6	2921804	2921809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304378
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69241	NC_015966	CGG	3	9	2921840	2921848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304378
69242	NC_015966	GC	3	6	2921862	2921867	0 %	0 %	50 %	50 %	345304378
69243	NC_015966	GTG	2	6	2921934	2921939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304378
69244	NC_015966	TCA	2	6	2922028	2922033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304378
69245	NC_015966	CGA	2	6	2922047	2922052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304378
69246	NC_015966	CGG	2	6	2922089	2922094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304378
69247	NC_015966	GCC	2	6	2922117	2922122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304378
69248	NC_015966	TGG	2	6	2922148	2922153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304378
69249	NC_015966	CGC	2	6	2922165	2922170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304378
69250	NC_015966	CCG	2	6	2922200	2922205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304378
69251	NC_015966	CGT	2	6	2922209	2922214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304378
69252	NC_015966	GGCC	2	8	2922258	2922265	0 %	0 %	50 %	50 %	345304378
69253	NC_015966	GCTG	2	8	2922295	2922302	0 %	25 %	50 %	25 %	345304378
69254	NC_015966	CGC	2	6	2922354	2922359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304378
69255	NC_015966	GC	3	6	2922423	2922428	0 %	0 %	50 %	50 %	345304378
69256	NC_015966	ACT	2	6	2922436	2922441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304378
69257	NC_015966	CTT	3	9	2922534	2922542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304379
69258	NC_015966	CTT	2	6	2922567	2922572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304379
69259	NC_015966	CGGC	2	8	2922579	2922586	0 %	0 %	50 %	50 %	345304379
69260	NC_015966	CCT	2	6	2922606	2922611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304379
69261	NC_015966	CGT	2	6	2922629	2922634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304379
69262	NC_015966	GGC	2	6	2922652	2922657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304379
69263	NC_015966	CGC	2	6	2922680	2922685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304379
69264	NC_015966	CAT	2	6	2922706	2922711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304379
69265	NC_015966	CGT	2	6	2922726	2922731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304379
69266	NC_015966	CTT	2	6	2922762	2922767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304379
69267	NC_015966	TGA	2	6	2922780	2922785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304379
69268	NC_015966	GGC	2	6	2922845	2922850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304379
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69270	NC_015966	ACGC	2	8	2922928	2922935	25 %	0 %	25 %	50 %	345304379
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69281	NC_015966	CCA	2	6	2923380	2923385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304379
69282	NC_015966	GCG	2	6	2923449	2923454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304379
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69289	NC_015966	GCA	2	6	2923644	2923649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304379
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69292	NC_015966	CGG	2	6	2923748	2923753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304379
69293	NC_015966	GTC	3	9	2923759	2923767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304379
69294	NC_015966	CGA	2	6	2923782	2923787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304379
69295	NC_015966	CGG	2	6	2923820	2923825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304379
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69297	NC_015966	CGC	2	6	2923851	2923856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304379
69298	NC_015966	GCC	2	6	2923883	2923888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304379
69299	NC_015966	C	6	6	2923922	2923927	0 %	0 %	0 %	100 %	345304379
69300	NC_015966	GC	4	8	2923931	2923938	0 %	0 %	50 %	50 %	345304379
69301	NC_015966	GGT	2	6	2923996	2924001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304379
69302	NC_015966	ACG	2	6	2924027	2924032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304379
69303	NC_015966	TGC	2	6	2924060	2924065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304379
69304	NC_015966	GCA	2	6	2924088	2924093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304379
69305	NC_015966	ACCGTC	2	12	2924150	2924161	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345304379
69306	NC_015966	GGT	2	6	2924173	2924178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69307	NC_015966	TCA	2	6	2924207	2924212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304380
69308	NC_015966	CGA	2	6	2924219	2924224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304380
69309	NC_015966	GGCG	2	8	2924270	2924277	0 %	0 %	75 %	25 %	345304380
69310	NC_015966	TCG	2	6	2924323	2924328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304380
69311	NC_015966	GC	3	6	2924364	2924369	0 %	0 %	50 %	50 %	345304380
69312	NC_015966	GTC	2	6	2924391	2924396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304380
69313	NC_015966	ACC	2	6	2924478	2924483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304380
69314	NC_015966	GCT	2	6	2924514	2924519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304380
69315	NC_015966	GC	3	6	2924531	2924536	0 %	0 %	50 %	50 %	345304380
69316	NC_015966	CAC	2	6	2924577	2924582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304380
69317	NC_015966	CGCC	2	8	2924587	2924594	0 %	0 %	25 %	75 %	345304380
69318	NC_015966	CTG	2	6	2924598	2924603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304380
69319	NC_015966	AGC	2	6	2924614	2924619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304380
69320	NC_015966	GCGG	2	8	2924620	2924627	0 %	0 %	75 %	25 %	345304380
69321	NC_015966	TGGA	2	8	2924655	2924662	25 %	25 %	50 %	0 %	345304380
69322	NC_015966	GGCCA	2	10	2924752	2924761	20 %	0 %	40 %	40 %	345304380
69323	NC_015966	ACC	2	6	2924836	2924841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304380
69324	NC_015966	GGC	2	6	2924859	2924864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304380
69325	NC_015966	GGCG	2	8	2924867	2924874	0 %	0 %	75 %	25 %	345304380
69326	NC_015966	GC	4	8	2924924	2924931	0 %	0 %	50 %	50 %	345304380
69327	NC_015966	GCC	3	9	2924961	2924969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304380
69328	NC_015966	GCC	2	6	2925085	2925090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304381
69329	NC_015966	CG	3	6	2925099	2925104	0 %	0 %	50 %	50 %	345304381
69330	NC_015966	ACG	2	6	2925143	2925148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304381
69331	NC_015966	GCC	2	6	2925214	2925219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304381
69332	NC_015966	GCC	2	6	2925225	2925230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304381
69333	NC_015966	CGCC	2	8	2925243	2925250	0 %	0 %	25 %	75 %	345304381
69334	NC_015966	CGC	2	6	2925318	2925323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304381
69335	NC_015966	TCA	2	6	2925360	2925365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304381
69336	NC_015966	GCA	2	6	2925459	2925464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304381
69337	NC_015966	AGCCC	2	10	2925468	2925477	20 %	0 %	20 %	60 %	345304381
69338	NC_015966	CGA	2	6	2925541	2925546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304381
69339	NC_015966	GGC	2	6	2925639	2925644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304381
69340	NC_015966	AGC	2	6	2925671	2925676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304381
69341	NC_015966	GGC	2	6	2925857	2925862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304381
69342	NC_015966	GGC	2	6	2925925	2925930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304381
69343	NC_015966	TCT	2	6	2925935	2925940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304381
69344	NC_015966	GCG	2	6	2925961	2925966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304381
69345	NC_015966	CAG	2	6	2926030	2926035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304381
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69347	NC_015966	GAA	2	6	2926102	2926107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304381
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69465	NC_015966	C	6	6	2930563	2930568	0 %	0 %	0 %	100 %	345304385
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69492	NC_015966	GC	3	6	2931982	2931987	0 %	0 %	50 %	50 %	345304386
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69500	NC_015966	CTG	2	6	2932397	2932402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304387

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