MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68001	NC_015966	GCC	2	6	2868406	2868411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304330
68002	NC_015966	CGT	2	6	2868516	2868521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304330
68003	NC_015966	CGA	2	6	2868534	2868539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304330
68004	NC_015966	ACA	2	6	2868566	2868571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304330
68005	NC_015966	ACC	2	6	2868593	2868598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304330
68006	NC_015966	GCG	3	9	2868634	2868642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304330
68007	NC_015966	CTG	2	6	2868643	2868648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304330
68008	NC_015966	CTT	2	6	2868654	2868659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304330
68009	NC_015966	GCGCC	2	10	2868666	2868675	0 %	0 %	40 %	60 %	345304330
68010	NC_015966	AAC	2	6	2868767	2868772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68011	NC_015966	GTC	2	6	2868783	2868788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304331
68012	NC_015966	ATC	2	6	2868789	2868794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304331
68013	NC_015966	GCG	2	6	2868836	2868841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304331
68014	NC_015966	GC	3	6	2868871	2868876	0 %	0 %	50 %	50 %	345304331
68015	NC_015966	CGA	2	6	2868901	2868906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304331
68016	NC_015966	TTC	2	6	2868915	2868920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304331
68017	NC_015966	CGG	2	6	2868944	2868949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304331
68018	NC_015966	CG	3	6	2868964	2868969	0 %	0 %	50 %	50 %	345304331
68019	NC_015966	TAC	2	6	2869002	2869007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304331
68020	NC_015966	CCG	2	6	2869021	2869026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304331
68021	NC_015966	GGT	2	6	2869091	2869096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304331
68022	NC_015966	GTG	2	6	2869131	2869136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304331
68023	NC_015966	ACT	2	6	2869204	2869209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304331
68024	NC_015966	CGG	2	6	2869253	2869258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304331
68025	NC_015966	CGG	2	6	2869267	2869272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304331
68026	NC_015966	GGC	2	6	2869277	2869282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304331
68027	NC_015966	TCCG	2	8	2869435	2869442	0 %	25 %	25 %	50 %	345304331
68028	NC_015966	CTG	2	6	2869449	2869454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304331
68029	NC_015966	AGC	2	6	2869540	2869545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304331
68030	NC_015966	CGA	2	6	2869562	2869567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304331
68031	NC_015966	GCG	2	6	2869645	2869650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304331
68032	NC_015966	CGGC	2	8	2869682	2869689	0 %	0 %	50 %	50 %	345304331
68033	NC_015966	CGCGC	2	10	2869694	2869703	0 %	0 %	40 %	60 %	345304331
68034	NC_015966	CGG	2	6	2869771	2869776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304331
68035	NC_015966	ATC	2	6	2869873	2869878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304332
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68037	NC_015966	TTC	2	6	2870144	2870149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304332
68038	NC_015966	GGA	2	6	2870263	2870268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304333
68039	NC_015966	CCA	2	6	2870404	2870409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304333
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68041	NC_015966	GAT	2	6	2870585	2870590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304334
68042	NC_015966	GC	4	8	2870644	2870651	0 %	0 %	50 %	50 %	345304334
68043	NC_015966	CAT	2	6	2870723	2870728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304334
68044	NC_015966	TCG	2	6	2870733	2870738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304334
68045	NC_015966	GCG	2	6	2870740	2870745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304334
68046	NC_015966	GGC	2	6	2870755	2870760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304334
68047	NC_015966	CAC	2	6	2870774	2870779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304334
68048	NC_015966	TGA	2	6	2870815	2870820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304334
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68050	NC_015966	CTG	2	6	2870843	2870848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304334
68051	NC_015966	GTGC	2	8	2870853	2870860	0 %	25 %	50 %	25 %	345304334
68052	NC_015966	GTAGCC	2	12	2870861	2870872	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345304334
68053	NC_015966	GCT	2	6	2870893	2870898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304334
68054	NC_015966	TGC	2	6	2870941	2870946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304334
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68057	NC_015966	CGT	2	6	2871040	2871045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304334
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68059	NC_015966	GAA	2	6	2871077	2871082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304334
68060	NC_015966	GCC	2	6	2871087	2871092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304334
68061	NC_015966	CGGGTT	2	12	2871105	2871116	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68062	NC_015966	GCC	2	6	2871231	2871236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304335
68063	NC_015966	GAT	2	6	2871240	2871245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304335
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68066	NC_015966	TGA	2	6	2871329	2871334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304335
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68070	NC_015966	CGC	2	6	2871455	2871460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304335
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68076	NC_015966	C	6	6	2871861	2871866	0 %	0 %	0 %	100 %	345304335
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68081	NC_015966	GGTT	2	8	2872022	2872029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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68087	NC_015966	AGC	2	6	2872303	2872308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304336
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68091	NC_015966	GCCG	2	8	2872395	2872402	0 %	0 %	50 %	50 %	345304336
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68115	NC_015966	A	6	6	2873452	2873457	100 %	0 %	0 %	0 %	345304336
68116	NC_015966	ATG	2	6	2873533	2873538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304336
68117	NC_015966	CGA	2	6	2873578	2873583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304337
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68119	NC_015966	GCT	2	6	2873595	2873600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304337
68120	NC_015966	GCGTCG	2	12	2873601	2873612	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345304337
68121	NC_015966	CG	3	6	2873621	2873626	0 %	0 %	50 %	50 %	345304337
68122	NC_015966	CTG	2	6	2873638	2873643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304337
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68127	NC_015966	GGC	2	6	2873874	2873879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68128	NC_015966	GCCG	2	8	2873885	2873892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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68131	NC_015966	TCT	2	6	2874024	2874029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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68229	NC_015966	CCA	2	6	2877577	2877582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304343
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68231	NC_015966	C	6	6	2877707	2877712	0 %	0 %	0 %	100 %	345304343
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68344	NC_015966	TTGG	2	8	2884100	2884107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68345	NC_015966	TGGT	2	8	2884123	2884130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68346	NC_015966	A	6	6	2884206	2884211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68459	NC_015966	GAT	2	6	2889395	2889400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304350
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68465	NC_015966	ACC	2	6	2889702	2889707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304350
68466	NC_015966	CCG	2	6	2889730	2889735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304350
68467	NC_015966	GGC	2	6	2889737	2889742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304350
68468	NC_015966	CAG	2	6	2889768	2889773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304350
68469	NC_015966	TCG	2	6	2889835	2889840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304350
68470	NC_015966	CGGC	2	8	2889853	2889860	0 %	0 %	50 %	50 %	345304350
68471	NC_015966	CTG	2	6	2889897	2889902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304350
68472	NC_015966	CGAT	2	8	2889955	2889962	25 %	25 %	25 %	25 %	345304350
68473	NC_015966	CGC	2	6	2889966	2889971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304350
68474	NC_015966	GCC	2	6	2889973	2889978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304350
68475	NC_015966	GCGCT	2	10	2890010	2890019	0 %	20 %	40 %	40 %	345304351
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68477	NC_015966	AGC	2	6	2890051	2890056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304351
68478	NC_015966	CCGG	2	8	2890104	2890111	0 %	0 %	50 %	50 %	345304351
68479	NC_015966	A	6	6	2890145	2890150	100 %	0 %	0 %	0 %	345304351
68480	NC_015966	CAG	2	6	2890186	2890191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304351
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68482	NC_015966	CAA	2	6	2890200	2890205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304351
68483	NC_015966	CGT	2	6	2890235	2890240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68484	NC_015966	TGT	2	6	2890345	2890350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304352
68485	NC_015966	TCGC	2	8	2890399	2890406	0 %	25 %	25 %	50 %	345304352
68486	NC_015966	TCGT	2	8	2890433	2890440	0 %	50 %	25 %	25 %	345304352
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68488	NC_015966	TCA	2	6	2890484	2890489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304352
68489	NC_015966	CG	3	6	2890497	2890502	0 %	0 %	50 %	50 %	345304352
68490	NC_015966	GC	4	8	2890536	2890543	0 %	0 %	50 %	50 %	345304352
68491	NC_015966	CAG	2	6	2890557	2890562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304352
68492	NC_015966	CCA	2	6	2890578	2890583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304352
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68494	NC_015966	AT	3	6	2890745	2890750	50 %	50 %	0 %	0 %	345304353
68495	NC_015966	ACA	2	6	2890808	2890813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304353
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68497	NC_015966	CTT	2	6	2890833	2890838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304353
68498	NC_015966	TTC	2	6	2890867	2890872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68499	NC_015966	TAC	2	6	2890902	2890907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68500	NC_015966	GATGCA	2	12	2890941	2890952	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

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